BioLiP

>protein
MRCIGISNRDFVEGVSGGSWVDIVLEHGSCVTTMAKNKPTLDFELIKTEAKHPATLRKYCIEAKLTNTTTASRCPTQGEP
SLNEEQDKRFVCKHSMVDRGWGNGCGLFGKGGIVTCAMFTCKKNMEGKVVQPENLEYTIVITPHSGEENAVGNDTGKHGK
EIKVTPQSSITEAELTGYGTVTMECSPRTGLDFNEMVLLQMENKAWLVHRQWFLDLPLPWLPGADTQGSNWIQKETLVTF
KNPHAKKQDVVVLGSQEGAMHTALTGATEIQMSSGNLLFTGHLKCRLRMDKLQLKGMSYSMCTGKFKVVKEIAETQHGTI
VIRVQYEGDGSPCKIPFEIMDLEKRHVLGRLITVNPIVTEKDSPVNIEAEPPFGDSYIIIGVEPGQLKLSWFKKGSSIGQ
MFETTMRGAKRMAILGDTAWDFGSLGGVFTSIGKALHQVFGAIYGAAFSGVSWTMKILIGVVITWIGMNSTSLSVSLVLV
GVVTLYLGVMVQA

The query sequence (length=493) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7kv8:A	493	493	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7kv8:B, 7kv8:C, 5n09:A, 5n09:B, 5n0a:A, 5n0a:B, 1oan:A, 1oan:B, 1oke:A, 1oke:B, 4ut6:A, 4ut6:B, 4uta:A, 4utb:A, 4utb:B, 4utc:A, 4utc:B
2	7a3r:A	379	395	0.5254	0.6834	0.6557	0.0
3	7lcg:E	496	502	0.4746	0.4718	0.4661	5.16e-166	7lcg:A, 7lcg:C, 7lch:A, 7lch:C, 7lch:E
4	5lcv:B	405	406	0.4361	0.5309	0.5296	3.48e-160	7a3n:A, 5lbv:B
5	7z51:A	494	503	0.3996	0.3988	0.3917	8.22e-113	7z51:B, 7z51:C
6	8ttp:B	359	105	0.0609	0.0836	0.2857	1.2	3bls:A, 3bls:B, 3bm6:A, 3bm6:B, 1c3b:A, 1c3b:B, 9c6p:A, 9c6p:B, 9c81:A, 9c81:B, 9c83:A, 9c83:B, 9c84:A, 9c84:B, 9c8j:A, 9c8j:B, 7cin:A, 7cin:B, 6dpt:A, 6dpt:B, 6dpx:A, 6dpx:B, 6dpy:A, 6dpy:B, 6dpz:A, 6dpz:B, 4e3i:A, 4e3i:B, 4e3j:A, 4e3j:B, 4e3k:A, 4e3k:B, 4e3l:A, 4e3l:B, 4e3m:A, 4e3m:B, 4e3n:A, 4e3n:B, 4e3o:A, 4e3o:B, 5f1g:A, 1fcm:A, 1fcm:B, 1fcn:A, 1fcn:B, 1fco:A, 1fco:B, 2ffy:A, 2ffy:B, 3fkv:A, 3fkv:B, 1fsw:A, 1fsw:B, 1fsy:A, 1fsy:B, 1ga9:A, 1ga9:B, 3gqz:A, 3gr2:A, 3grj:A, 3grj:B, 3gsg:A, 3gsg:B, 3gtc:A, 3gtc:B, 3gv9:A, 3gv9:B, 3gvb:A, 5gzw:A, 5gzw:B, 2hdq:A, 2hdq:B, 2hdr:A, 2hdr:B, 2hds:A, 2hds:B, 2hdu:A, 2hdu:B, 1i5q:A, 1i5q:B, 2i72:A, 2i72:B, 1iel:A, 1iel:B, 1iem:A, 1iem:B, 3iwo:A, 3iwo:B, 3ixb:B, 3ixb:A, 3ixg:B, 3ixh:B, 4jxg:B, 4jxg:A, 4jxs:B, 4jxv:A, 4jxv:B, 4jxw:A, 4jxw:B, 1kds:A, 1kds:B, 1kdw:A, 1kdw:B, 1ke0:A, 1ke0:B, 1ke3:A, 1ke3:B, 4ken:B, 4kg2:B, 4kg2:A, 4kg5:B, 4kg5:A, 4kg5:C, 4kg5:D, 1kvl:A, 1kvl:B, 1kvm:B, 4kz3:A, 4kz3:B, 4kz4:B, 4kz5:A, 4kz5:B, 4kz6:B, 4kz7:A, 4kz7:B, 4kz8:A, 4kz8:B, 4kz9:A, 4kza:A, 4kza:B, 4kzb:A, 4kzb:B, 1l0g:A, 1l2s:A, 1l2s:B, 1ll5:A, 1ll5:B, 1ll9:B, 1llb:B, 4lv0:A, 4lv0:B, 4lv1:A, 4lv1:B, 4lv2:A, 4lv2:B, 4lv3:A, 4lv3:B, 1mxo:A, 1mxo:B, 1my8:A, 1my8:B, 1o07:A, 1o07:B, 3o86:A, 3o86:B, 3o87:A, 3o87:B, 3o88:A, 3o88:B, 4okp:B, 4old:A, 4old:B, 4olg:A, 4olg:B, 1pi4:A, 1pi4:B, 1pi5:A, 1pi5:B, 2pu2:A, 2pu2:B, 2pu4:A, 2pu4:B, 2r9w:A, 2r9w:B, 2r9x:A, 2r9x:B, 2rcx:A, 2rcx:B, 6t35:A, 6t5y:A, 6t7l:A, 6tbw:A, 6tpm:A, 8ttp:A, 6whf:A, 6whf:B, 6xfs:A, 6xfs:B, 6xfs:C, 6xfs:D, 1xgi:B, 1xgj:A, 1xgj:B, 6yen:A, 6yeo:A, 6yeo:B, 6yeo:C, 6yeo:D, 6ypd:A
7	6ywe:G	74	31	0.0203	0.1351	0.3226	9.0	6yws:G, 6ywx:G, 6ywy:G

[Back]