BioLiP

>protein
MQTSLFEFANVLITAVKEASYSISKFKEEVEIKYKSDGSEVTQVDTQSQQIIFSIIKNKYPTINIIGEEDVENGIPDNQL
PTITQLSFGSLENKIININDIIIYVDPLDGTDCYTHKQYDSVCVLVGVTYKGKPMIGIVSKPFYNNEITFAIENYISSIS
LQPLNDKIIFVCSKKNDIQHLIKSFPDPYEVKYKGGSGAKMMAIIHQEADIYYHPLIQSCTWDTLAAQVILEAQGGIVCD
IYGNPLCYPSSKKESMRHKKGVLCLSPRAKKYLPYMLSISKTILLLQH

The query sequence (length=288) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4qxd:B	289	288	1.0000	0.9965	1.0000	0.0	4qxd:A
2	2wef:A	303	226	0.2500	0.2376	0.3186	1.81e-25	1jp4:A
3	2bji:A	274	251	0.2222	0.2336	0.2550	1.52e-08	2bji:B
4	6giu:A	275	252	0.2188	0.2291	0.2500	1.87e-08	4as4:A, 4as4:B, 1awb:A, 1awb:B, 6giu:B, 6gj0:A, 6gj0:B, 2hhm:A, 2hhm:B, 1ima:A, 1ima:B, 1imb:A, 1imb:B, 1imc:A, 1imc:B, 1imd:A, 1imd:B, 1ime:A, 1ime:B, 6zk0:AAA, 6zk0:BBB
5	8wdq:A	273	260	0.2049	0.2161	0.2269	2.66e-08	8wdq:B
6	5dw8:A	260	257	0.2153	0.2385	0.2412	2.92e-08	5dw8:B, 5j16:A, 5j16:B, 5j16:C, 5j16:D
7	4as5:A	274	238	0.2014	0.2117	0.2437	1.18e-07	4as5:B, 4as5:C, 4as5:D
8	7kir:A	326	169	0.1632	0.1442	0.2781	2.88e-06	7kio:A
9	5djj:A	257	152	0.1319	0.1479	0.2500	3.52e-05	5djg:A, 5djh:A, 5dji:A, 5djk:A
10	2czi:A	259	225	0.1701	0.1892	0.2178	4.08e-05	2czh:B
11	4hxv:A	317	252	0.2049	0.1861	0.2341	1.01e-04	4o7i:A
12	8f9y:A	352	313	0.2188	0.1790	0.2013	2.81e-04
13	1inp:A	400	202	0.1701	0.1225	0.2426	6.91e-04
14	3lv0:A	258	142	0.1250	0.1395	0.2535	0.002	3luz:A, 3lv0:B
15	2p3n:A	256	217	0.1597	0.1797	0.2120	0.017	2p3n:B, 2p3n:C, 2p3n:D
16	5eq9:B	260	262	0.1910	0.2115	0.2099	0.020	5eq8:A, 5eq9:A, 5eq9:C, 5eq9:D, 5t3j:A
17	1k9y:A	354	152	0.1389	0.1130	0.2632	0.048	1k9z:A, 1ka0:A, 1ka1:A, 1qgx:A
18	3luz:B	234	243	0.1667	0.2051	0.1975	0.062
19	5eyg:B	265	99	0.0903	0.0981	0.2626	0.25	5eyg:A, 5eyh:A, 5eyh:B, 5f24:A, 5f24:B, 4g61:A, 4g61:B, 4i3e:A, 4i3e:B, 4i3y:A, 4i3y:B, 4i40:A, 4i40:B, 4ptk:A, 4ptk:B, 3ryd:A, 3ryd:C
20	5buo:A	185	68	0.0590	0.0919	0.2500	1.1	3umi:A, 3umk:A
21	8bdr:A	722	45	0.0590	0.0235	0.3778	4.7	8be0:A, 8bf5:A, 5epi:A, 5epi:E, 5epi:I, 5epi:M, 5epi:Q, 5epi:U, 6f5o:A, 5fml:B, 5fmz:D, 5fmz:A, 6fs8:B, 6fs8:A, 6fs9:A, 6fsb:A, 6fsb:B, 5m3j:A, 5msg:A, 6qcs:A, 6qct:A, 6qcv:A, 6qcw:A, 6qcx:A, 6qwl:E, 7r1f:A, 8rn1:A, 8rn3:A, 8rn4:A, 8rn4:D, 8rn5:A, 8rn7:A, 8rn9:A, 8rnc:A, 6t0w:A, 4wrt:A, 4wsa:A, 7z42:A, 7z42:D, 7z43:AAA
22	6xyw:Al	180	77	0.0833	0.1333	0.3117	6.3
23	5q0c:A	328	70	0.0556	0.0488	0.2286	8.4	5et6:A, 5et6:C, 5et6:B, 5et6:D, 4he0:A, 4he1:A, 4he2:A, 3ifa:A, 3ifa:B, 3ifa:C, 3ifa:D, 3ifc:A, 3ifc:B, 3ifc:C, 3ifc:D, 5k56:A, 5l0a:A, 5q0c:B, 5q0c:C, 5q0c:D, 5q0c:E, 5q0c:F, 5q0c:G, 5q0c:H

[Back]