Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MQQVGTVAQLWIYPVKSCKGVPVSEAECTAMGLRSGNLRDRFWLVINQEGNMVTARQEPRLVLISLTCDGDTLTLSAMNI
FEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAK
LKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYTK
DLLLPIKTPTTNAVHKCRVHGLEIEGRDCGEAAAQWITSFLKSQPYRLVHFEPHMRPRRPHQIADLFRPKDQIAYSDTSP
FLILSEASLADLNSRLEKKVKATNFRPNIVISGCDVYAEDSWDELLIGDVELKRVMACSRCILTTVDPDTGVMSRKEPLE
TLKSYRQCDPSERKLYGKSPLFGQYFVLENPGTIKVGDPVYLLG

The query sequence (length=444) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6fw2:A 444 444 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7p41:D
2 6xyr:A 348 160 0.3604 0.4598 1.0000 3.08e-114
3 6a73:A 290 160 0.3559 0.5448 0.9875 2.14e-112 6a73:B
4 3odu:A 466 205 0.3829 0.3648 0.8293 3.93e-112 3odu:B, 3oe0:A, 3oe8:A, 3oe8:B, 3oe8:C, 3oe9:A, 3oe9:B
5 6d9m:A 326 161 0.3559 0.4847 0.9814 1.39e-111
6 4tn3:B 362 161 0.3559 0.4365 0.9814 4.51e-111 5k3q:A, 5k3q:B, 5k3q:C, 5k3q:D, 4tn3:A, 5w9a:A, 5w9a:B
7 7mwz:B 352 162 0.3559 0.4489 0.9753 5.02e-111 7mwz:A, 7mwz:C
8 6kjv:B 424 171 0.3626 0.3797 0.9415 5.02e-111 6kjv:A, 6kk1:A, 6kk1:B, 6kk7:A, 6kk7:B, 5vew:A, 5vew:B, 5vex:A, 5vex:B
9 3uon:A 438 189 0.3671 0.3721 0.8624 2.23e-110
10 7e40:D 345 164 0.3559 0.4580 0.9634 2.36e-110 7e40:B
11 4ej4:A 442 182 0.3716 0.3733 0.9066 5.09e-110
12 6zx9:C 257 160 0.3536 0.6109 0.9812 6.89e-110
13 7f8x:A 443 167 0.3581 0.3589 0.9521 6.96e-110 7f8u:A, 7f8y:A
14 6cm4:A 423 163 0.3559 0.3735 0.9693 7.37e-110 6luq:A
15 6zfz:A 446 165 0.3604 0.3587 0.9697 7.72e-110 5cxv:A, 6wjc:A, 6zg4:A, 6zg9:A
16 6ffh:A 414 166 0.3604 0.3865 0.9639 7.93e-110 5cgc:A, 5cgd:A, 6ffi:A, 4oo9:A, 7p2l:A
17 3vw7:A 442 163 0.3559 0.3575 0.9693 8.84e-110
18 4dkl:A 442 182 0.3716 0.3733 0.9066 1.35e-109
19 5zty:A 449 164 0.3581 0.3541 0.9695 1.42e-109 6kpc:A
20 5x33:A 439 163 0.3581 0.3622 0.9755 1.59e-109
21 6p5v:A 373 162 0.3559 0.4236 0.9753 1.62e-109 6b5q:A, 6b5q:B, 6bg3:A, 6bg5:A, 4i7p:A, 7kwa:A, 6p5w:A, 3tdu:B, 3tdu:A, 3tdz:A, 3tdz:B, 5ufi:A, 5ufi:B, 5ufi:C, 5ufi:D, 5v83:A, 5v86:A, 5v88:A, 6xol:A, 6xom:A, 6xon:A, 6xoo:A, 6xop:A, 6xoq:A
22 4lde:A 454 163 0.3581 0.3502 0.9755 1.68e-109 7bz2:R, 7dhi:R, 7dhr:R, 4ekp:A, 4ekp:B, 4ekq:A, 4ekq:B, 4ekr:A, 4ekr:B, 4eks:A, 4eks:B, 4gbr:A, 8gdz:R, 8ge1:R, 8ge2:R, 8ge3:R, 8ge4:R, 8ge5:R, 8ge6:R, 8ge7:R, 8ge8:R, 8ge9:R, 8gea:R, 8geb:R, 8gec:R, 8ged:R, 8gee:R, 8gef:R, 8geg:R, 8geh:R, 8gei:R, 8gfv:R, 8gfw:R, 8gfx:R, 8gfy:R, 8gfz:R, 8gg0:R, 8gg1:R, 8gg2:R, 8gg3:R, 8gg4:R, 8gg5:R, 8gg6:R, 8gg7:R, 8gg8:R, 8gg9:R, 8gga:R, 8ggb:R, 8ggc:R, 8ggi:R, 8ggj:R, 8ggk:R, 8ggl:R, 8ggm:R, 8ggn:R, 8ggo:R, 8ggp:R, 8ggq:R, 8ggr:R, 8ggs:R, 8ggt:R, 8ggu:R, 8ggv:R, 8ggw:R, 8ggx:R, 8ggy:R, 8ggz:R, 8gh0:R, 8gh1:R, 4i7m:A, 4i7m:B, 4i7n:A, 4i7n:B, 4i7o:A, 4i7o:B, 4i7p:B, 4i7q:A, 4i7q:B, 4i7r:A, 4i7r:B, 4i7s:A, 4i7s:B, 4i7t:A, 4i7t:B, 5jqh:A, 5jqh:B, 4ldl:A, 4ldo:A, 6mxt:A, 6n48:A, 6ni3:R, 3p0g:A, 4qkx:A, 7sj6:A, 7sj6:B, 3sn6:R, 8unl:R, 8unm:R, 8unn:R, 8uno:R, 8unp:R, 8unq:R, 8unr:R, 8uns:R, 8unt:R, 8unu:R, 8unv:R, 8unw:R, 8unx:R, 8uny:R, 8unz:R, 8uo0:R, 8uo1:R, 8uo2:R, 7xk9:A, 7xka:A
23 7z36:B 446 165 0.3581 0.3565 0.9636 2.83e-109 6h3a:A, 6h3a:F, 6qaj:A, 6qaj:B, 6qu1:A, 2yvr:A, 2yvr:B, 7z36:A
24 3v2y:A 455 160 0.3559 0.3473 0.9875 4.16e-109 3v2w:A
25 6m9t:A 444 204 0.3806 0.3806 0.8284 4.77e-109
26 5t1a:A 445 180 0.3626 0.3618 0.8944 6.10e-109
27 8jwz:A 450 165 0.3581 0.3533 0.9636 1.13e-108 3eml:A, 8jwy:A, 3qak:A, 5wf5:A, 5wf6:A
28 3pbl:A 432 160 0.3559 0.3657 0.9875 1.23e-108 3pbl:B
29 2qb0:B 241 160 0.3514 0.6473 0.9750 2.08e-108 2qb0:D
30 5ndd:A 567 167 0.3581 0.2804 0.9521 2.19e-108 5awi:A, 5awi:B, 2bc5:A, 2bc5:B, 2bc5:C, 2bc5:D, 3c62:A, 3c62:B, 3c62:C, 3c62:D, 3de8:A, 3de8:D, 3de8:B, 3de8:C, 3de9:A, 8drd:A, 8drd:B, 8drf:A, 8drj:C, 8drl:A, 8drm:A, 6dy4:D, 6dy4:A, 6dy6:A, 6dy6:B, 6dyb:A, 6dyb:C, 6dyc:A, 6dyc:B, 6dyd:A, 6dyd:C, 6dye:A, 6dye:B, 6dyi:B, 6dyj:A, 6dyj:E, 6dyj:C, 6dyj:G, 6dyk:A, 6dyk:E, 6dyk:C, 6dyk:G, 6dyl:A, 6dyl:E, 6dyl:C, 6dyl:G, 3foo:A, 3foo:B, 3foo:C, 3foo:D, 3foo:E, 3foo:F, 3foo:G, 3foo:H, 3foo:I, 3foo:J, 3foo:L, 3foo:K, 3fop:A, 3fop:B, 3l1m:A, 5ndz:A, 3nmi:A, 3nmi:B, 3nmi:C, 3nmi:D, 3nmi:E, 3nmi:F, 3nmj:A, 3nmj:C, 3nmj:B, 3nmj:D, 3nmk:A, 3nmk:C, 3nmk:B, 3nmk:D, 2qla:A, 2qla:B, 2qla:C, 2qla:D, 6wza:A, 6wza:B, 6wza:C, 6x8x:A
31 4djh:B 448 160 0.3559 0.3527 0.9875 2.27e-108 4djh:A
32 6iih:A 446 161 0.3536 0.3520 0.9752 2.62e-108 6iih:B, 6lb7:B, 6xqo:J
33 6igk:A 471 165 0.3604 0.3397 0.9697 2.64e-108 5glh:A, 6igl:A, 6lry:A
34 4u14:A 436 161 0.3536 0.3601 0.9752 2.75e-108 4daj:A, 4daj:B, 4daj:C, 4daj:D
35 3rze:A 428 160 0.3559 0.3692 0.9875 2.81e-108
36 5tzr:A 437 160 0.3559 0.3616 0.9875 7.20e-108 5kw2:A, 4phu:A
37 7bvq:A 455 160 0.3559 0.3473 0.9875 8.13e-108 7bts:A, 7bu6:A, 7bu7:A, 7bvq:B
38 5zbh:A 461 160 0.3559 0.3427 0.9875 8.30e-108
39 8w1v:A 441 159 0.3536 0.3560 0.9874 9.18e-108 8w1v:B
40 7joz:R 446 165 0.3559 0.3543 0.9576 1.00e-107 7ckw:R, 7ckx:R, 7cky:R, 7ckz:R, 7crh:R, 7f0t:F, 7f1o:F, 7f1z:F, 7f23:F, 7f24:F, 8irr:R, 7jv5:R, 7jvp:R, 7jvq:R, 8jxr:A, 8jxs:A, 7ljc:R, 7ljd:R, 7x2c:F, 7x2d:F, 7x2f:F
41 6e67:B 476 160 0.3559 0.3319 0.9875 1.22e-107 3d4s:A, 5d5a:A, 5d5b:A, 5d6l:A, 6e67:A, 3ny8:A, 3ny9:A, 3nya:A, 6oba:A, 3pds:A, 6prz:A, 6ps0:A, 6ps1:A, 6ps2:A, 6ps3:A, 6ps4:A, 6ps5:A, 6ps6:A, 2rh1:A, 5x7d:A
42 4z9g:A 421 165 0.3536 0.3729 0.9515 1.57e-107 4k5y:A, 4k5y:B, 4z9g:B, 4z9g:C
43 5t04:A 458 181 0.3671 0.3559 0.9006 1.58e-107 4grv:A
44 4xes:A 471 160 0.3514 0.3312 0.9750 2.97e-107 4buo:B, 8fmz:A, 8fn0:A, 8fn1:A, 7l0p:C, 7l0q:C, 7l0r:C, 7l0s:C, 4xee:A
45 8a5x:A 466 163 0.3559 0.3391 0.9693 3.38e-107 4wtv:A
46 5i0n:A 489 160 0.3559 0.3231 0.9875 7.93e-107 4pla:A, 4yc4:A
47 5yqz:R 558 167 0.3581 0.2849 0.9521 9.43e-107 5xez:A, 5xf1:A
48 5ee7:A 416 164 0.3514 0.3750 0.9512 1.39e-105
49 6aji:A 873 161 0.3559 0.1810 0.9814 4.35e-105
50 6ajf:A 901 161 0.3559 0.1754 0.9814 1.02e-104 6ajg:A, 6ajh:A, 6ajj:A, 7c2m:A, 7c2n:A, 6or2:A, 7wnx:A
51 5zbq:A 463 161 0.3491 0.3348 0.9627 4.34e-104 8k6m:D, 7vgx:R
52 5ewx:B 214 211 0.3536 0.7336 0.7441 4.74e-101 5ewx:A
53 4w8f:B 2609 192 0.3694 0.0629 0.8542 7.15e-101 220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
54 3oe6:A 418 202 0.3536 0.3756 0.7772 6.51e-100
55 6ol9:A 416 189 0.3153 0.3365 0.7407 7.39e-86
56 4wtv:B 426 163 0.3018 0.3146 0.8221 1.59e-84
57 5tzy:A 418 160 0.3131 0.3325 0.8688 3.66e-84
58 5dsg:B 399 189 0.2613 0.2907 0.6138 9.82e-66 5dsg:A
59 5zhp:A 394 161 0.2545 0.2868 0.7019 7.20e-65 4u15:A, 4u15:B, 4u16:A, 4u16:B, 5zhp:B
60 6j20:A 398 108 0.2275 0.2538 0.9352 1.05e-64 6j21:A
61 6d26:A 447 168 0.2568 0.2550 0.6786 3.66e-64 6d27:A, 7m8w:A
62 5x93:A 430 106 0.2297 0.2372 0.9623 6.03e-64 6k1q:A, 5xpr:A
63 5zkq:B 399 99 0.2162 0.2406 0.9697 8.38e-61
64 7mwz:D 301 160 0.2545 0.3754 0.7063 6.12e-60
65 5xez:B 499 103 0.2140 0.1904 0.9223 8.70e-59 5xf1:B
66 2anv:A 146 127 0.0901 0.2740 0.3150 6.78e-06 2anv:B, 2anx:A, 2anx:B
67 7l6s:A 396 148 0.0923 0.1035 0.2770 0.097
68 8ivp:B 322 46 0.0315 0.0435 0.3043 0.22 8ivp:A, 8ivp:C, 8ivp:D
69 5x6a:A 229 61 0.0338 0.0655 0.2459 1.5 6h1z:A, 6h1z:B, 6ha5:A, 6ha5:B, 6haq:A, 6haq:B, 5x6a:B
70 5gyn:A 295 163 0.0923 0.1390 0.2515 5.3 5aes:A, 5aes:B, 4bx0:A, 4bx2:A, 4bx2:B, 4bx3:A, 4bx3:B, 2cfr:A, 2cfs:A, 2cft:A, 9em1:A, 2oyc:A, 2p27:A, 2p69:A, 8qfw:A, 8qfw:B, 8s8a:A
71 7vw3:A 1052 107 0.0653 0.0276 0.2710 7.0 5axw:A, 5czz:A, 7el1:A, 7eni:A, 7enr:A, 8jft:A, 8jg9:A, 8jg9:D
72 4nx1:A 308 109 0.0631 0.0909 0.2569 8.3 4nx1:B, 4ovp:A, 4ovp:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218