BioLiP

>protein
MQQDDDFQNFVATLESFKDLKSGISGSRIKKLTTYALDHIDIESKIISLIIDYSRLCPDSHKLGSLYIIDSIGRAYLDET
RSNSNSSSNKPGTCAHAINTLGEVIQELLSDAIAKSNQDHKEKIRMLLDIWDRSGLFQKSYLNAIRSKCFAMDLEHHHHH
H

The query sequence (length=161) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2mow:A	161	161	1.0000	1.0000	1.0000	5.90e-118	6gc3:A, 2lo6:A, 6o3w:A, 6o3w:B, 6o3x:A, 6o3x:B, 6o3x:C, 6o3y:A, 6o3y:B, 6o3y:C
2	3d9k:B	141	150	0.2236	0.2553	0.2400	2.57e-07	3d9k:A, 3d9l:A, 3d9l:B, 3d9m:A, 3d9m:B, 3d9n:A, 3d9n:B, 3d9o:B, 3d9p:A, 3d9p:B
3	6xkb:C	139	141	0.2112	0.2446	0.2411	5.96e-06	6xkb:B, 6xkb:A, 6xkb:E, 6xkb:D
4	8hkb:A	302	81	0.1429	0.0762	0.2840	0.31	8hka:A
5	2zkt:A	330	30	0.0683	0.0333	0.3667	0.55
6	2zkt:B	381	30	0.0683	0.0289	0.3667	0.57
7	8paq:A	159	82	0.1242	0.1258	0.2439	2.2
8	3doe:A	189	18	0.0683	0.0582	0.6111	3.2	3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
9	7dlk:A	363	14	0.0621	0.0275	0.7143	3.7	7dlk:B, 7dlk:C, 7dlk:D, 7dlk:E, 7dlk:F, 7e5q:A, 7e5q:B, 6kmm:A, 6kmm:B, 6kmm:C, 6kmm:D, 6kmm:E, 6kmm:F, 6kmn:A, 6kmn:B, 6kmn:C, 6kmn:D, 7pkx:A, 7pkx:B, 7pl0:A, 7pl0:B, 7pl0:C, 7pl0:D
10	4lwp:B	342	63	0.1056	0.0497	0.2698	3.9	4lwp:A
11	7nf4:A	504	48	0.0932	0.0298	0.3125	5.9	8crd:A, 6ev3:A, 6ev4:A, 6ev5:A, 6ev6:A, 6ev7:A, 6ev8:A, 6ev9:A, 6eva:A, 6evb:A, 6evc:A, 6evd:A, 7nf3:A, 7nf4:B, 8oed:A, 8oeh:A, 8oeo:A, 6r2p:A, 6r2r:A, 6r2t:A, 6r2z:A, 6r30:A, 6r32:A, 6r33:A, 6r34:A, 6r3f:A, 6r3g:A, 6r3i:A, 6r3j:A, 6r3l:A, 6r3n:A, 6r3o:A, 6tib:AAA, 6tic:AAA, 6tie:AAA, 6tih:AAA, 6tij:AAA, 6til:AAA, 6tin:AAA, 6tio:AAA, 4za4:A, 4za5:A, 4za7:A, 4za8:A, 4za9:A, 4zaa:A, 4zab:A
12	7qjt:A	267	29	0.0932	0.0562	0.5172	6.8

[Back]