Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MQNGYTYEDYQDTAKWLLSHTEQRPQVAVICGSGLGGLVNKLTQAQTFDYSEIPNFPESTVPGHAGRLVFGILNGRACVM
MQGRFHMYEGYPFWKVTFPVRVFRLLGVETLVVTNAAGGLNPNFEVGDIMLIRDHINLPGFSGENPLRGPNEERFGVRFP
AMSDAYDRDMRQKAHSTWKQMGEQRELQEGTYVMLGGPNFETVAECRLLRNLGADAVGMSTVPEVIVARHCGLRVFGFSL
ITNKVIMDTESQGKANHEEVLEAGKQAAQKLEQFVSLLMASI

The query sequence (length=282) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1a9o:A 289 282 1.0000 0.9758 1.0000 0.0 1a9p:A, 1a9q:A, 1a9r:A, 1a9s:A, 1a9t:A, 2ai1:A, 2ai2:A, 2ai3:A, 1b8n:A, 1b8o:A, 3fuc:A, 3fuc:B, 3fuc:C, 1fxu:A, 1lv8:A, 1lv8:B, 1lv8:C, 1lv8:D, 1lv8:E, 1lv8:F, 1lvu:A, 1lvu:B, 1lvu:C, 1lvu:D, 1lvu:E, 1lvu:F, 2qpl:A, 1v48:A, 1vfn:A
2 3d1v:A 288 281 0.8794 0.8611 0.8826 0.0 2a0w:A, 2a0x:A, 2a0y:A, 3bgs:A, 4ear:A, 4ear:B, 4ear:C, 4eb8:A, 4eb8:B, 4eb8:C, 5etj:A, 5etj:B, 5etj:C, 5etj:D, 5etj:E, 5etj:F, 3gb9:A, 3gb9:B, 3gb9:C, 3ggs:A, 3ggs:B, 3ggs:C, 4gka:A, 4gka:B, 4gka:C, 4gka:D, 4gka:E, 4gka:F, 3iny:A, 3k8o:E, 3k8o:Q, 3k8o:S, 3k8o:T, 3k8o:U, 3k8o:Y, 3k8q:A, 2oc4:A, 2oc9:A, 2on6:A, 1pf7:E, 3phb:E, 3phb:Q, 3phb:S, 3phb:T, 3phb:U, 3phb:Y, 1pwy:E, 2q7o:E, 1rct:E, 1rfg:E, 1rr6:A, 1rsz:A, 1rt9:A, 5ugf:A, 5ugf:B, 5ugf:C, 5ugf:D, 5ugf:E, 5ugf:F, 1v2h:E, 1v3q:E, 1v41:E, 1v45:E, 1yry:E, 7zsl:A, 7zsl:B, 7zsl:C, 7zsl:D, 7zsl:E, 7zsl:F, 7zsm:A, 7zsn:A, 7zso:A, 7zso:B, 7zso:C, 7zsp:A
3 2p4s:A 282 278 0.5426 0.5426 0.5504 9.02e-112 2p4s:B, 2p4s:C
4 3e0q:C 285 267 0.4787 0.4737 0.5056 3.44e-100 3djf:A, 3djf:B, 3djf:C, 3e0q:A, 3e0q:B, 3e9r:B, 3e9z:A, 3e9z:C, 3f8w:A, 3f8w:B, 3f8w:C, 3faz:A, 3faz:B, 3faz:C, 3fb1:A, 3fb1:B, 3fb1:C, 3fnq:A, 3fnq:B, 3fnq:C, 3iex:A, 3iex:C, 1tcu:A, 1tcu:B, 1tcu:C, 1tcv:A, 1tcv:B, 1tcv:C, 1td1:A, 1td1:B, 1td1:C
5 3khs:B 270 276 0.4645 0.4852 0.4746 5.62e-95 3khs:A, 3khs:C, 3khs:D
6 8swq:A 302 277 0.4610 0.4305 0.4693 2.18e-87 5ifk:A, 5ifk:B, 5ifk:C, 8swp:A, 8swp:D, 8swp:E, 8swq:D, 8swr:A, 8swr:D, 8sws:A, 8sws:D, 8sws:E
7 8swt:A 278 275 0.4787 0.4856 0.4909 4.88e-87 8swt:B
8 8swu:A 269 269 0.4681 0.4907 0.4907 3.15e-86 8swu:B, 8swu:C
9 5ko6:A 285 269 0.4291 0.4246 0.4498 2.70e-85 6awe:A, 6axa:A, 6b2l:A, 6b37:A, 6b3l:A, 6b4q:A, 6b4t:A, 6b56:A, 6b6k:A, 6b71:A, 6b7i:A, 6bb7:A, 6bfv:A, 6bhb:A, 6bi1:A, 6bi9:A, 6bif:A, 6bj6:A, 6bj7:A, 5ko5:A, 5tbs:A, 5tbt:A, 5tbu:A, 5tbv:A
10 4m1e:B 273 272 0.4574 0.4725 0.4743 5.84e-80 4m1e:A, 4m1e:F, 4m1e:E, 4m1e:C, 4m1e:D
11 4lna:A 269 269 0.4433 0.4647 0.4647 2.20e-77
12 4nsn:A 273 276 0.4539 0.4689 0.4638 9.01e-75 4ns1:A, 4ns1:B, 4ns1:C, 4ns1:D, 4nsn:B, 4nsn:C
13 8swq:B 278 274 0.4078 0.4137 0.4197 8.34e-71 8swp:B, 8swq:E, 8swr:B, 8sws:B
14 3lba:A 260 232 0.3972 0.4308 0.4828 3.22e-69
15 3odg:A 273 259 0.4007 0.4139 0.4363 8.28e-69
16 1yqq:A 273 255 0.4007 0.4139 0.4431 1.59e-63 1yqq:B, 1yqq:C, 1yqu:A, 1yqu:B, 1yqu:C, 1yr3:A, 1yr3:B, 1yr3:C, 1yr3:D, 1yr3:E, 1yr3:F
17 4uc0:A 247 219 0.3298 0.3765 0.4247 4.69e-50
18 7zsq:C 268 256 0.3511 0.3694 0.3867 6.45e-46 8c25:A, 8c25:B, 1g2o:A, 1g2o:B, 1g2o:C, 1i80:A, 1i80:B, 1i80:C, 3iom:A, 3iom:B, 3ix2:A, 3ix2:B, 3ix2:C, 1n3i:A, 1n3i:B, 1n3i:C, 3scz:A, 3scz:B, 7zsq:A, 7zsq:B, 7zsr:A, 7zsr:B, 7zsr:C
19 1c3x:A 266 258 0.3369 0.3571 0.3682 2.34e-38 1c3x:B, 1c3x:C, 1qe5:A, 1qe5:B, 1qe5:C
20 5tc5:A 286 259 0.2376 0.2343 0.2587 3.21e-16 1cb0:A, 1cg6:A, 6dyz:A, 6dz0:A, 6dz2:A, 6dz2:B, 6dz2:C, 6dz3:A, 6dz3:B, 6dz3:C, 5eub:A, 1k27:A, 3ozc:A, 3ozd:A, 3ozd:B, 1sd1:A, 1sd2:A, 5tc5:B, 5tc5:C, 5tc6:A, 5tc7:A, 5tc8:A
21 3t94:A 270 194 0.1702 0.1778 0.2474 4.10e-11 2a8y:A, 2a8y:B, 2a8y:C, 2a8y:D, 2a8y:E, 2a8y:F, 2a8y:G, 2a8y:H, 2a8y:I, 2a8y:J, 2a8y:K, 2a8y:L, 3t94:B, 3t94:C, 3t94:D, 3t94:E, 3t94:F
22 3ozb:A 241 256 0.2305 0.2697 0.2539 3.61e-10 3ozb:B, 3ozb:C, 3ozb:D, 3ozb:E, 3ozb:F
23 9jd2:A 273 171 0.1454 0.1502 0.2398 3.22e-09 9jhv:A, 1wta:A
24 5f7j:B 291 196 0.1844 0.1787 0.2653 7.74e-09 5f76:A, 5f76:B, 5f76:C, 5f77:A, 5f77:B, 5f77:C, 5f7j:A, 5f7j:D, 5f7j:E, 5f7o:A, 5f7o:B, 5f7x:A, 5f7x:B, 5f7x:C, 5fak:A, 5fak:B, 5fak:D, 5fak:E, 4l5a:A, 4l5a:C, 4l5a:B, 4l5a:D, 4l5a:E, 4l5a:F, 4l5c:A, 4l5c:B, 4l5c:C, 4l5c:D, 4l5c:E, 4l5c:F, 4l6i:A, 4l6i:B, 4l6i:D, 4l6i:E
25 4glj:A 287 265 0.2128 0.2091 0.2264 1.09e-06
26 6ohr:A 576 43 0.0603 0.0295 0.3953 0.062 6ohr:B, 6ohr:C, 6ohr:D, 6ohr:E, 6u8z:A
27 6zw0:A 299 83 0.0780 0.0736 0.2651 0.37 6zw0:B
28 8djq:B 390 71 0.0816 0.0590 0.3239 0.68 8dj6:A, 8dj6:B, 8dj6:C, 8dj6:D, 8djq:A, 8djq:C, 8djq:D, 8dk9:A, 8dk9:B, 8dk9:C, 8dk9:D
29 3qpb:C 254 138 0.0993 0.1102 0.2029 1.2 3qpb:A, 3qpb:B, 3qpb:D, 3qpb:E, 3qpb:F, 3qpb:G, 3qpb:H, 3qpb:I, 3qpb:J, 3qpb:K, 3qpb:L, 3qpb:M, 3qpb:N, 3qpb:O, 3qpb:P, 3qpb:Q, 3qpb:R
30 5agv:B 393 43 0.0567 0.0407 0.3721 1.5 5agu:A, 5agu:B, 5agv:A, 6fvn:A, 6fvn:B, 6fvn:C, 6fvn:D, 6fvo:A, 6fvo:B, 6fvo:C, 6fvo:D
31 4dwo:A 268 78 0.0567 0.0597 0.2051 1.6 3niw:A
32 8asb:A 1715 83 0.0780 0.0128 0.2651 1.8 8as6:A, 8asg:A, 8r6u:A
33 7alp:U 1935 83 0.0780 0.0114 0.2651 1.9
34 8r6y:A 1991 83 0.0780 0.0110 0.2651 1.9 8as7:A, 8r6w:A, 6xya:B
35 8asd:A 1826 83 0.0780 0.0120 0.2651 1.9
36 8sr8:A 1353 85 0.0816 0.0170 0.2706 2.1 8sr8:B, 8sr8:C, 8sr8:D, 8sr9:A, 8sr9:B, 8sr9:C, 8sr9:D, 8sra:A, 8sra:B, 8sra:C, 8sra:D, 8srb:A, 8srb:B, 8srb:C, 8srb:D
37 8sre:A 1377 85 0.0816 0.0167 0.2706 2.2 8sr7:A, 8sr7:B, 8sr7:C, 8sr7:D, 8src:A, 8src:B, 8src:C, 8src:D, 8srd:A, 8srd:B, 8srd:C, 8srd:D, 8sre:B, 8sre:D, 8sre:C, 8srf:A, 8srf:B, 8srf:C, 8srf:D, 8srg:A, 8srg:B, 8srg:C, 8srg:D, 8srh:A, 8srh:B, 8srh:C, 8srh:D, 8sri:A, 8sri:B, 8sri:C, 8sri:D, 8srj:A, 8srj:B, 8srj:D, 8srj:C, 8srk:A, 8srk:B, 8srk:C, 8srk:D
38 7bxq:A 399 38 0.0532 0.0376 0.3947 2.5 7bxq:B, 7bxr:A, 7bxr:B, 7bxs:A, 7bxs:B
39 3sf6:A 387 41 0.0603 0.0439 0.4146 2.7
40 6ayo:A 229 25 0.0355 0.0437 0.4000 2.8 6ayo:B, 6ayq:A, 6ayq:B, 6ayr:A, 6ayr:B, 6ayr:C, 6ayr:D, 6ays:A, 6ays:B, 6ays:C, 6ays:G, 6ays:D, 6ays:H, 6ays:E, 6ays:F, 6ayt:A, 6ayt:B, 6ayt:C, 6ayt:D
41 4r2w:D 251 37 0.0426 0.0478 0.3243 3.0 7q2w:FFF, 4r2w:A, 4r2w:B, 4r2w:C, 4r2w:E, 4r2w:F, 4r2x:C, 4r2x:D, 4r2x:E, 4r2x:F, 4r2x:A, 4r2x:B, 4yjk:D, 4yjk:F, 4yjk:A
42 1xag:A 353 32 0.0426 0.0340 0.3750 3.9 1xah:A, 1xah:B, 1xai:A, 1xai:B, 1xaj:A, 1xaj:B, 1xal:A, 1xal:B
43 2hn9:A 253 37 0.0390 0.0435 0.2973 4.1 3c74:A, 3c74:F, 3c74:B, 3c74:C, 3c74:D, 3c74:E, 4e1v:A, 4e1v:E, 4e1v:F, 4e1v:D, 4e1v:C, 4e1v:B, 4e1v:H, 4e1v:G, 3fwp:B, 3fwp:D, 3fwp:C, 3fwp:E, 3fwp:A, 3fwp:F, 2hn9:B, 2hn9:D, 2hn9:F, 2hrd:A, 2hrd:B, 2hrd:C, 2hrd:D, 2hrd:E, 2hrd:F, 2hwu:A, 2hwu:B, 2hwu:C, 2hwu:D, 2hwu:E, 2hwu:F, 3kvv:A, 3kvv:B, 3kvv:C, 3kvv:D, 3kvv:E, 3kvv:F, 2oec:B, 2oec:F, 2pga:B, 2pga:D, 2pga:F, 2rj3:A, 2rj3:D, 2rj3:F, 2rj3:E, 2rj3:B, 1rxc:A, 1rxc:B, 1rxc:C, 1rxc:D, 1rxc:E, 1rxc:F, 1rxc:I, 1rxc:J, 1rxc:K, 1rxc:L, 1rxs:A, 1rxs:a, 1rxs:B, 1rxs:b, 1rxs:C, 1rxs:c, 1rxs:D, 1rxs:d, 1rxs:E, 1rxs:e, 1rxs:F, 1rxs:R, 1rxs:G, 1rxs:P, 1rxs:H, 1rxs:h, 1rxs:I, 1rxs:i, 1rxs:J, 1rxs:j, 1rxs:K, 1rxs:k, 1rxs:L, 1rxs:l, 1rxs:M, 1rxs:m, 1rxs:O, 1rxs:N, 1rxs:Q, 1rxs:o, 1rxu:A, 1rxu:B, 1rxu:C, 1rxu:D, 1rxu:E, 1rxu:F, 1rxu:G, 1rxu:H, 1rxu:I, 1rxu:J, 1rxu:K, 1rxu:L, 1rxu:M, 1rxu:N, 1rxu:O, 1rxu:P, 1rxu:Q, 1rxu:R, 1rxy:A, 1rxy:B, 1sj9:B, 1tgv:A, 1tgv:B, 1tgy:A, 1tgy:B, 1u1c:A, 1u1c:B, 1u1c:C, 1u1c:D, 1u1c:E, 1u1c:F, 1u1d:A, 1u1d:B, 1u1d:C, 1u1d:D, 1u1d:E, 1u1d:F, 1u1e:A, 1u1e:B, 1u1e:C, 1u1e:D, 1u1e:E, 1u1e:F, 1u1f:A, 1u1f:B, 1u1f:C, 1u1f:D, 1u1f:E, 1u1f:F, 1u1g:A, 1u1g:B, 1u1g:C, 1u1g:D, 1u1g:E, 1u1g:F, 1y1q:C, 1y1r:D, 1y1r:B, 1y1s:A, 1y1s:D, 1y1s:F, 1y1s:E, 1y1s:B, 1zl2:B, 1zl2:D, 1zl2:F
44 6dly:B 384 71 0.0816 0.0599 0.3239 7.2 6dly:A
45 5efo:B 253 37 0.0426 0.0474 0.3243 8.6 5c80:A, 5c80:B, 5c80:C, 5c80:D, 5c80:E, 5c80:F, 5efo:A, 5efo:C, 5efo:D, 5efo:E, 5efo:F, 5epu:A, 5epu:B, 5epu:C, 5epu:D, 5epu:E, 5epu:F, 4k6o:A, 4k6o:B, 4k6o:C, 4k6o:D, 4k6o:E, 4k6o:F, 5lhv:A, 5lhv:B, 5lhv:C, 5lhv:D, 5lhv:E, 5lhv:F, 5lok:A, 5lok:B, 5lok:C, 5lok:D, 5lok:E, 5lok:F, 5m2t:A, 5m2t:B, 5m2t:C, 5m2t:D, 5m2t:E, 5m2t:F, 5miw:A, 5miw:B, 5miw:C, 5miw:D, 5miw:E, 5miw:F, 4oeh:A, 4oeh:B, 4oeh:E, 4oeh:F, 4ogl:A, 4ogl:B, 4ogl:C, 4ogl:D, 4ogl:E, 4ogl:F, 3pns:B, 3pns:C, 3pns:D, 3pns:E, 3pns:F, 3pns:G, 3pns:H, 3pns:I, 3pns:J, 3pns:K, 3pns:L, 6rca:A, 6rca:B, 6rca:C, 6rca:D, 6rca:E, 6rca:F, 4u2k:B, 4u2k:D, 4u2k:F
46 5kag:D 423 82 0.0851 0.0567 0.2927 9.4 5kag:A, 5kag:B, 5kag:C, 5kag:E, 5kag:F, 5kag:G, 5kag:H, 5kag:I, 5kag:J, 5kag:K, 5kag:L, 5kah:A, 5kah:B, 5kah:C, 5kah:D, 5kah:E, 5kah:F, 5kah:G, 5kah:H, 5kah:I, 5kah:J, 5kah:K, 5kah:L, 5kaj:A, 5kaj:B, 5kaj:C, 5kaj:D, 5kaj:E, 5kaj:F, 5kaj:G, 5kaj:H, 5kaj:I, 5kaj:J, 5kaj:K, 5kaj:L, 2np9:A, 2np9:B, 2np9:C, 2pg8:A, 2pg8:B, 2pg8:C, 4ylh:A, 4ylh:B, 4ylh:C, 4ylh:D, 4ylh:E, 4ylh:F, 4ylh:G, 4ylh:H, 4ylh:I, 4ylh:J, 4ylh:K, 4ylh:L
47 6z8h:A 351 65 0.0674 0.0541 0.2923 9.9 6z8g:B, 6z8g:A, 6z8h:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218