Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MQLSWKDIPTVAPANDLLDIVLNRTQRKTPTVIRPGFKITRIRAFYMRKVKYTGEGFVEKFEDILKGFPNINDVHPFHRD
LMDTLYEKNHYKISLAAISRAKSLVEQVARDYVRLLKFGQSLFQCKQLKRAALGRMATIVKKLRDPLAYLEQVRQHIGRL
PSIDPNTRTLLICGYPNVGKSSFLRCITKSDVDVQPYAFTTKSLYVGHFDYKYLRFQAIDTPGILDRPTEEMNNIEMQSI
YAIAHLRSCVLYFMDLSEQCGFTIEAQVKLFHSIKPLFANKSVMVVINKTDIIRPEDLDEERAQLLESVKEVPGVEIMTS
SCQLEENVMEVRNKACEKLLASRIENNNVLNKIHVAQPQARDDVKRTPFIPESVKNLKKYDPEDPNRRKLARDIEAENGG
AGVFNVNLKDKYLLEDDEWKNDIMPEILDGKNVYDFLDPEIAAKLQALEEEEEKLENEGFYNSDDEEEIYDGFEASEVDD
IKEKAAWIRNRQKTMIAEARNRKSLKNKAIMPRSKLTKSFGKMEEHMSTLGHDMSALQDKQNRQTDRLLDGVADGSMRSK
ADRMAKMERRERNRHAKQGESDRHNAVSLSKHLFSGKRGVGKTDFR

The query sequence (length=606) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8hfr:rA 647 647 1.0000 0.9366 0.9366 0.0 7bt6:b, 7btb:b, 6c0f:W, 6ft6:b, 3jct:b, 5jcs:o, 6m62:b, 6n8j:b, 6n8k:b, 7nad:b, 7oh3:b, 7ohq:b, 7oht:b, 7r72:b, 7u0h:b, 7ug6:b, 7uoo:b, 7uqb:b, 7uqz:b, 7v08:b, 4v7f:o, 8v87:b, 6ylx:b, 6yly:b, 7z34:b
2 6ylg:b 613 638 0.9554 0.9445 0.9075 0.0 7nac:b, 7of1:b, 7r7a:b, 6ylh:b
3 8v83:b 423 461 0.6980 1.0000 0.9176 0.0 6elz:b, 6em1:b, 6em5:b, 7ohp:b, 7ohr:b, 7ohs:b, 7ohu:b, 7ohv:b, 8v84:b
4 7ohy:b 375 462 0.6188 1.0000 0.8117 0.0
5 8pv1:CH 627 638 0.5908 0.5710 0.5611 0.0 8i9r:CH, 8i9t:CH, 8i9v:CH, 8i9w:CH, 8i9x:CH, 8i9y:CH, 8i9z:CH, 8ia0:CH, 8pv2:CH, 8pv3:CH, 8pv4:CH, 8pv5:CH, 8pv6:CH, 8pv7:CH, 8pv8:CH, 8pvk:CH, 8pvl:CH
6 8ir1:4 620 628 0.4802 0.4694 0.4634 0.0 8fkt:SR, 8fku:SR, 8fkv:SR, 8fkw:SR, 8fkx:SR, 8fky:SR, 8fkz:SR, 8fl0:SR, 8fl2:SR, 8fl3:SR, 8fl6:SR, 8fl7:SR, 8fl9:SR, 8fla:SR, 8flb:SR, 8flc:SR, 8fld:SR, 8fle:SR, 8flf:SR, 8idt:4, 8idy:4, 8ie3:4, 8ine:4, 8inf:4, 8ink:4, 8ipd:4, 8ipx:4, 8ipy:4, 8ir3:4, 6lss:4, 6lu8:4
7 8etc:b 415 440 0.4307 0.6289 0.5932 0.0 8esq:b, 8etj:b
8 8eti:b 391 440 0.4125 0.6394 0.5682 2.13e-178 8esr:b, 8etg:b
9 8fl4:SR 593 622 0.4686 0.4789 0.4566 1.11e-177 8fkr:SR, 8fks:SR
10 6n8l:b 248 254 0.4092 1.0000 0.9764 1.65e-177
11 7ohw:b 259 373 0.3548 0.8301 0.5764 3.12e-116
12 7ohw:b 259 55 0.0875 0.2046 0.9636 5.05e-20
13 7ohx:b 248 327 0.3218 0.7863 0.5963 2.18e-108
14 7ohx:b 248 64 0.1040 0.2540 0.9844 1.30e-27
15 2e87:A 356 352 0.1766 0.3006 0.3040 1.35e-54
16 2qu8:A 194 189 0.1320 0.4124 0.4233 4.32e-42
17 8eup:b 151 146 0.1188 0.4768 0.4932 3.28e-35
18 8eup:b 151 37 0.0413 0.1656 0.6757 6.99e-11
19 8euy:b 120 129 0.0924 0.4667 0.4341 9.16e-23
20 8euy:b 120 37 0.0413 0.2083 0.6757 8.16e-11
21 7r7c:b 54 105 0.0891 1.0000 0.5143 3.04e-19
22 7naf:b 74 40 0.0627 0.5135 0.9500 7.32e-19
23 7naf:b 74 53 0.0528 0.4324 0.6038 5.33e-11
24 7rr5:R 355 124 0.0578 0.0986 0.2823 3.07e-06
25 7nrc:So 347 76 0.0462 0.0807 0.3684 4.34e-06
26 7o9k:G 337 90 0.0512 0.0920 0.3444 5.72e-06 7of5:x, 7of7:x
27 1xzq:A 449 133 0.0594 0.0802 0.2707 8.60e-05 1xzq:B
28 3iev:A 302 134 0.0759 0.1523 0.3433 1.49e-04 7c1o:A, 3r9w:A, 3r9x:A
29 7oi6:y 331 155 0.0644 0.1178 0.2516 1.59e-04 8pk0:t
30 1wf3:A 296 137 0.0627 0.1284 0.2774 2.22e-04
31 7bl2:9P1 338 146 0.0627 0.1124 0.2603 4.81e-04 7bl3:9P, 7bl4:9, 7bl5:9, 7bl6:9, 4csu:9, 5m04:A
32 2wjg:A 170 146 0.0561 0.2000 0.2329 7.89e-04 2wjg:B, 2wjh:A, 2wjh:B, 2wji:A, 2wji:B, 2wjj:A, 2wjj:B
33 8fl2:NC 511 102 0.0479 0.0568 0.2843 0.009 8fkz:NC, 8fl0:NC, 8fl3:NC, 8fl4:NC, 8idt:A, 8idy:A, 8ie3:A, 8ine:A, 8inf:A, 8ink:w, 8ipd:w, 8ipx:w, 8ipy:w, 8ir1:w, 8ir3:w
34 5m7h:A 420 151 0.0627 0.0905 0.2517 0.044 4dcs:A, 4dct:A, 4dcu:A, 2hjg:A, 5mbs:A, 5x4b:A, 5x4b:B
35 2j3e:A 249 113 0.0495 0.1205 0.2655 0.12 3bb3:A, 3bb4:A, 3def:A
36 6g0z:A 290 65 0.0330 0.0690 0.3077 0.12 6g0z:B, 6g12:A, 6g12:B, 6g14:B, 6g14:A, 6g15:A, 6g15:B
37 8pv1:Cd 462 98 0.0528 0.0693 0.3265 0.16 8pv2:Cd, 8pv3:Cd, 8pv4:Cd, 8pv5:Cd, 8pv6:Cd, 8pv7:Cd, 8pv8:Cd, 8pvk:Cd, 8pvl:Cd
38 1lnz:A 342 56 0.0281 0.0497 0.3036 0.23 1lnz:B
39 7zgz:X 753 83 0.0380 0.0305 0.2771 0.26 8c7f:B
40 3a1s:A 255 52 0.0297 0.0706 0.3462 0.28 3a1s:B, 3a1t:A, 3a1u:A, 3a1u:B
41 5ee3:B 364 30 0.0215 0.0357 0.4333 0.44 5ee3:A, 5ee9:A
42 7btb:m 469 89 0.0413 0.0533 0.2809 0.45 7bt6:m, 6ft6:m, 3jct:m, 6m62:m, 7oh3:m, 7ohq:m, 7oht:m, 7ug6:m, 7uoo:m, 7uqb:m, 7uqz:m, 7uui:m, 7v08:m, 6ylg:m, 6ylh:m
43 1puj:A 261 67 0.0330 0.0766 0.2985 0.50 6ppk:W
44 5lzb:z 614 141 0.0561 0.0554 0.2411 0.51 5lzc:z, 5lzd:z, 2pjp:A
45 2gj8:D 172 127 0.0594 0.2093 0.2835 0.61 2gj8:A, 2gj8:B, 2gj8:C, 2gj9:A, 2gj9:B, 2gj9:C, 2gj9:D, 2gja:A, 2gja:B
46 6n8j:m 378 89 0.0413 0.0661 0.2809 0.64
47 2dby:A 355 36 0.0231 0.0394 0.3889 0.64
48 1mky:A 407 78 0.0380 0.0565 0.2949 0.65
49 8kie:y 363 30 0.0198 0.0331 0.4000 0.70
50 8kab:h 430 69 0.0396 0.0558 0.3478 1.3
51 7of1:m 229 83 0.0446 0.1179 0.3253 1.6
52 2iw3:B 980 37 0.0231 0.0143 0.3784 1.7 7b7d:EF, 2iw3:A, 2iwh:A, 2iwh:B
53 3ieu:A 293 59 0.0380 0.0785 0.3898 1.7 3ieu:B
54 3w5j:A 194 55 0.0281 0.0876 0.3091 1.7
55 2qag:C 224 156 0.0545 0.1473 0.2115 2.2
56 7y9i:A 362 30 0.0198 0.0331 0.4000 2.5
57 6h96:B 216 75 0.0413 0.1157 0.3333 3.3 6et8:A, 6et8:B, 6h96:A, 6hai:A, 6hai:B
58 8h69:A 716 52 0.0297 0.0251 0.3462 3.4 4avg:A, 4avg:B, 4avg:C, 4avg:D, 4avl:A, 4avl:B, 4avl:C, 4avl:D, 4avq:A, 4avq:B, 4avq:C, 4avq:D, 4awf:A, 4awf:B, 4awf:C, 4awf:D, 4awg:A, 4awg:B, 4awg:C, 4awh:A, 4awh:B, 4awh:C, 4awh:D, 4awm:A, 8bek:A, 5ccy:A, 5cgv:A, 5cl0:A, 3cm8:A, 5cxr:A, 5czn:A, 5d2o:A, 5d42:A, 5d4g:A, 5d8u:A, 5d9j:A, 5dbs:A, 6dcz:A, 5deb:A, 5des:A, 8dip:A, 8dpj:A, 8dqs:A, 8dtw:A, 8dvo:A, 8e1q:A, 8e21:A, 8e4s:A, 4e5e:A, 4e5e:B, 4e5e:C, 4e5e:D, 4e5f:A, 4e5f:B, 4e5f:C, 4e5f:D, 4e5g:A, 4e5g:B, 4e5g:C, 4e5g:D, 4e5h:A, 4e5h:B, 4e5h:C, 4e5h:D, 4e5i:A, 4e5i:B, 4e5i:C, 4e5i:D, 4e5j:A, 4e5j:B, 4e5j:C, 4e5j:D, 4e5l:A, 4e5l:B, 4e5l:C, 4e5l:D, 8edz:A, 5ega:A, 7k0w:A, 7k77:A, 7k87:A, 7kaf:A, 7kbc:A, 4kil:A, 7kl3:A, 7knr:A, 7kny:A, 7kop:A, 7lm4:A, 4ln7:A, 7lp7:A, 7lp8:A, 7lw6:A, 7m0n:A, 7m0n:B, 7m0n:C, 7m0n:D, 4m4q:A, 4m5o:A, 4m5q:A, 4m5r:A, 4m5u:A, 4m5v:A, 4mk1:A, 4mk2:A, 4mk5:A, 7ml8:A, 7mpf:A, 7mty:A, 7mx0:A, 7my5:A, 7n47:A, 7n55:A, 7n68:A, 7n8f:A, 6nel:A, 6nem:A, 7nha:A, 7nhc:A, 7nhx:A, 7ni0:A, 7nik:A, 7nil:A, 7nir:A, 7nis:A, 7nj3:A, 7nj4:A, 7nj5:A, 7nj7:A, 7nk1:A, 7nk2:A, 7nk4:A, 7nk6:A, 7nk8:A, 7nka:A, 7nkc:A, 7nki:A, 7nkr:A, 7nug:A, 7nuh:A, 8pm0:A, 8pnp:A, 8pnq:A, 8poh:A, 8poh:E, 7qtl:A, 6qx3:A, 6qx8:A, 6qx8:E, 6qxe:A, 6qxe:E, 7r0e:A, 8r3k:A, 8r3l:A, 8r60:A, 8r65:A, 7rkp:A, 6rr7:A, 7umr:A, 7uuh:A, 6v53:A, 6v56:A, 6vbr:A, 6vg9:A, 6viv:A, 6vjh:A, 6vl3:A, 6vll:A, 5vp8:A, 5vpt:A, 5vpx:A, 5vqn:A, 5vrj:A, 5w44:A, 2w69:A, 2w69:B, 2w69:D, 5w73:A, 6w7a:A, 4w9s:A, 5wa7:A, 5wap:A, 5wb3:A, 5wcs:A, 5wct:A, 5wdn:A, 5wdw:A, 5we7:A, 5we9:A, 5web:A, 5wef:A, 5wei:A, 5wf3:A, 5wfm:A, 5wfw:A, 5wfz:A, 5wg9:A, 6whm:A, 6wij:A, 6wj4:A, 6ws3:A, 6ya5:A, 6yem:A, 7z4o:DDD, 7z4o:AAA, 7zpl:A, 7zpl:D
59 8fkt:NB 387 73 0.0314 0.0491 0.2603 3.9 8fkp:NB, 8fku:NB, 8fkv:NB, 8fkw:NB, 8fkx:NB, 8fky:NB, 8fkz:NB, 8fl0:NB, 8ink:u, 8ipd:u, 8ipx:u, 8ipy:u
60 5ub8:A 174 54 0.0264 0.0920 0.2963 4.0
61 7of4:C 422 179 0.0627 0.0900 0.2123 4.1 7of2:C, 7of6:C
62 3iq0:B 308 177 0.0726 0.1429 0.2486 4.3 3iq0:A
63 6evj:A 709 52 0.0314 0.0268 0.3654 4.4 6evj:D, 6evk:A, 9f2r:A, 9f37:A, 6fhh:A, 6fhi:A, 5m3h:A, 4nfz:A, 4nfz:B, 4nfz:C, 6szu:A, 6szv:A, 6t0n:A, 6t0r:A, 6t0s:A, 6t0u:A, 6t0v:A, 6t2c:A, 6tw1:A, 4wsb:A
64 6xrs:B 392 73 0.0347 0.0536 0.2877 4.6 6xrs:A, 6xrs:D, 6xrs:C
65 6lsr:1 247 59 0.0363 0.0891 0.3729 4.9
66 1h65:A 257 76 0.0330 0.0778 0.2632 5.5 3bb1:A, 3bb1:B, 3bb1:C, 3bb1:D, 3bb1:E, 3bb1:F, 3bb1:G, 3bb1:H, 1h65:B, 1h65:C
67 5dn8:A 405 88 0.0396 0.0593 0.2727 5.9
68 3geh:A 442 125 0.0512 0.0701 0.2480 5.9
69 5ady:6 426 44 0.0248 0.0352 0.3409 6.6 8g31:6, 8g34:6, 8g38:6, 7yla:6
70 7odt:t 316 89 0.0413 0.0791 0.2809 7.2
71 4k7r:A 429 67 0.0297 0.0420 0.2687 8.6
72 7p04:A 1353 60 0.0231 0.0103 0.2333 9.7 7p05:A
73 8c3a:h 70 26 0.0182 0.1571 0.4231 9.9 8c3a:DS, 8cq7:h, 8cq7:DS, 8cqw:h, 8cqw:DS, 8cre:h, 8cre:DS, 8oeq:h, 8oeq:DS, 7pzy:g, 7q08:g, 7q0f:g, 7q0p:g, 7q0r:g

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218