Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MQIQTDVVLPSCKKKAPAETPVKERLFIVFNPHPLPLDVLEDIFCRFGNLIEVYLVSGKNVGYAKYADRISANDAIATLH
GKILNGVRLKVMLADSPRE

The query sequence (length=99) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8wq5:A 99 99 1.0000 1.0000 1.0000 2.17e-70 8wq5:B, 8wq5:C, 8wq5:D
2 7uj1:B 270 70 0.2222 0.0815 0.3143 1.42e-04 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
3 7q4l:A 227 55 0.2626 0.1145 0.4727 2.00e-04
4 7qde:B 169 77 0.2626 0.1538 0.3377 2.25e-04 7qdd:B
5 2adb:A 127 70 0.2323 0.1811 0.3286 2.30e-04 3zzy:A, 3zzy:B, 3zzz:A, 3zzz:B
6 2leb:A 101 63 0.1616 0.1584 0.2540 3.22e-04 2lec:A
7 2rqc:A 115 87 0.2626 0.2261 0.2989 0.002
8 2mb0:B 95 65 0.2121 0.2211 0.3231 0.002
9 5m8i:A 114 87 0.2626 0.2281 0.2989 0.004
10 6r5k:H 394 88 0.2424 0.0609 0.2727 0.006 6r5k:D, 6r5k:F
11 1fnx:H 174 78 0.2323 0.1322 0.2949 0.017 1fxl:A, 1g2e:A
12 1fnx:H 174 89 0.1919 0.1092 0.2135 0.025 1fxl:A, 1g2e:A
13 6rks:D 200 46 0.2020 0.1000 0.4348 0.036 6rks:B
14 5ifm:C 256 72 0.1919 0.0742 0.2639 0.036 5ifm:A
15 6hpj:B 84 66 0.1818 0.2143 0.2727 0.038
16 4ed5:B 169 88 0.2020 0.1183 0.2273 0.053 4ed5:A
17 4ed5:B 169 79 0.2222 0.1302 0.2785 0.62 4ed5:A
18 9gbv:B 782 36 0.1717 0.0217 0.4722 0.077 1aj6:A, 7c7n:A, 7c7o:A, 7dor:A, 7dor:B, 7dpr:A, 7dpr:B, 7dps:A, 7dps:B, 7dqf:A, 7dqf:B, 7dqh:A, 7dqh:B, 7dqi:A, 7dqi:B, 7dqj:A, 7dqj:B, 7dql:A, 7dql:B, 7dqm:A, 7dqm:B, 7dqs:A, 7dqs:B, 7dqu:A, 7dqu:B, 7dqw:A, 7dqw:B, 4duh:A, 4duh:B, 1ei1:A, 1ei1:B, 6eng:A, 6eng:B, 6f86:A, 6f8j:A, 6f94:A, 6f96:A, 3g7e:A, 9gbv:D, 9ggq:D, 9ggq:B, 4hyp:A, 4hyp:B, 4hyp:C, 4hyp:D, 6j90:A, 4kfg:A, 4kfg:B, 1kzn:A, 6kzv:A, 6kzx:A, 6kzz:A, 6l01:A, 5l3j:A, 5mmn:A, 5mmo:A, 5mmp:A, 7p2m:A, 7p2n:A, 7p2w:A, 7p2x:A, 4prv:A, 4prx:A, 4pu9:A, 8qdx:B, 8qdx:D, 8qqi:D, 8qqi:B, 8qqs:B, 8qqs:D, 8qqu:D, 6rku:D, 6rku:B, 6rkv:D, 6rkv:B, 6rkw:D, 6rkw:B, 4wub:A, 4wuc:A, 4wud:A, 4xtj:A, 6yd9:A, 5z4h:A, 5z4h:B, 5z4o:A, 5z4o:B, 5z9b:A, 5z9b:B, 5z9e:A, 5z9e:B, 5z9f:A, 5z9f:B, 5z9l:A, 5z9l:B, 5z9m:A, 5z9m:B, 5z9n:A, 5z9q:A, 5z9q:B, 7z9c:D, 7z9c:B, 7z9g:D, 7z9g:B, 7z9k:B, 7z9k:D, 7z9m:B, 7z9m:D, 4zvi:A, 5zxm:A, 5zxm:B
19 2xco:A 636 34 0.1515 0.0236 0.4412 0.16
20 7mvs:B 675 34 0.1515 0.0222 0.4412 0.16 8bp2:BBB, 8bp2:DDD, 5bs3:B, 5bs3:D, 4bul:A, 4bul:C, 5cdm:B, 5cdm:D, 5cdn:D, 5cdn:B, 5cdn:U, 5cdn:S, 5cdo:B, 5cdo:D, 5cdo:S, 5cdo:U, 5cdp:B, 5cdp:D, 5cdq:B, 5cdq:D, 5cdq:S, 5cdq:U, 5cdr:B, 5cdr:D, 6fm4:B, 6fm4:D, 6fqm:D, 6fqs:B, 6fqs:D, 6fqv:B, 6fqv:D, 6fqv:S, 6fqv:U, 7fvs:A, 7fvs:B, 7fvt:A, 7fvt:B, 5iwi:B, 5iwi:D, 5iwm:B, 5iwm:D, 7mvs:A, 5npk:B, 5npk:D, 5npk:b, 5npk:d, 5npp:B, 5npp:D, 4plb:B, 4plb:D, 6qtk:B, 6qtk:D, 6qtp:B, 6qtp:D, 6qx1:B, 6qx1:D, 6qx2:B, 6qx2:D, 6qx2:K, 6qx2:M, 6qx2:S, 6qx2:U, 6qx2:b, 6qx2:d, 6qx2:k, 6qx2:m, 6qx2:s, 6qx2:u, 2xcs:B, 2xcs:D, 2xct:B, 2xct:D, 2xct:S, 2xct:U, 6z1a:B, 6z1a:D
21 2xcr:D 719 34 0.1515 0.0209 0.4412 0.16 8bp2:AAA, 8bp2:CCC, 5cdm:A, 5cdm:C, 5cdn:C, 5cdn:A, 5cdn:T, 5cdn:R, 5cdo:A, 5cdo:C, 5cdo:R, 5cdo:T, 5cdp:A, 5cdp:C, 5cdq:A, 5cdq:C, 5cdq:R, 5cdq:T, 5cdr:A, 5cdr:C, 6fqm:A, 6fqm:C, 6fqm:a, 6fqm:c, 6fqs:A, 6fqs:C, 6fqv:A, 6fqv:C, 6fqv:R, 6fqv:T, 5iwi:A, 5iwi:C, 5iwm:A, 5iwm:C, 6qtk:A, 6qtk:C, 6qtp:A, 6qtp:C, 6qx1:A, 6qx1:C, 6qx2:A, 6qx2:C, 6qx2:J, 6qx2:L, 6qx2:R, 6qx2:T, 6qx2:a, 6qx2:c, 6qx2:j, 6qx2:l, 6qx2:r, 6qx2:t, 2xcr:B, 2xcr:S, 2xcr:U
22 2n7c:A 89 78 0.2020 0.2247 0.2564 0.19
23 2fy1:A 108 64 0.1919 0.1759 0.2969 0.21
24 3smz:A 280 82 0.2424 0.0857 0.2927 0.51
25 6xlv:A 203 77 0.2626 0.1281 0.3377 0.75 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
26 2f8j:A 335 40 0.1111 0.0328 0.2750 0.79 2f8j:B, 2f8j:C, 2f8j:D, 1h1c:A, 1h1c:B, 1h1c:C, 1h1c:D, 1uu0:A, 1uu0:B, 1uu0:C, 1uu0:D, 1uu1:A, 1uu1:B, 1uu1:C, 1uu1:D, 1uu2:A, 1uu2:B
27 7ohx:o 112 35 0.1212 0.1071 0.3429 1.1
28 7lhz:C 714 46 0.1717 0.0238 0.3696 1.2 5eix:A, 5eix:B, 7lhz:A, 6waa:B, 6waa:F
29 7q33:A 93 60 0.1919 0.2043 0.3167 1.2 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
30 7lhz:B 631 46 0.1717 0.0269 0.3696 1.2
31 6waa:H 656 46 0.1717 0.0259 0.3696 1.3 6waa:D
32 5eix:J 679 46 0.1717 0.0250 0.3696 1.3 5eix:G, 7lhz:D
33 6c0f:o 133 35 0.1212 0.0902 0.3429 1.3 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
34 6gau:A 1088 34 0.1414 0.0129 0.4118 1.8 5bs8:A, 5bs8:B, 5bs8:C, 5bs8:D, 5bta:A, 5bta:B, 5bta:C, 5bta:D, 5btc:A, 5btc:B, 5btc:C, 5btc:D, 5btd:A, 5btd:B, 5btd:C, 5btd:D, 5btf:A, 5btf:B, 5btf:C, 5btf:D, 5btg:A, 5btg:B, 5btg:C, 5btg:D, 5bti:A, 5bti:B, 5bti:C, 5bti:D, 5btl:A, 5btl:B, 5btl:C, 5btl:D, 5btn:A, 5btn:B, 5btn:C, 5btn:D, 9foy:A, 9foy:B, 6gau:B, 7ugw:A, 7ugw:B, 7ugw:C, 7ugw:D
35 8c41:A 720 40 0.1414 0.0194 0.3500 2.6 8c41:B
36 8pv1:CI 152 50 0.1313 0.0855 0.2600 2.6 8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
37 4i3h:A 1037 40 0.1414 0.0135 0.3500 3.2 3foe:D, 3foe:C, 3fof:C, 3fof:D, 4i3h:B, 4juo:A, 4juo:C, 3k9f:A, 3k9f:C, 3k9f:D, 3k9f:B, 4koe:A, 4koe:C, 4koe:D, 4koe:B, 4kpe:A, 4kpe:C, 4kpe:D, 4kpe:B, 4kpf:A, 4kpf:C, 4kpf:D, 4kpf:B, 3ksa:A, 3ksa:C, 3ksa:D, 3ksa:B, 3ksb:A, 3ksb:B, 3ksb:C, 3ksb:D, 3ltn:A, 3ltn:C, 3ltn:D, 3ltn:B, 3rad:A, 3rad:C, 3rad:D, 3rad:B, 3rae:A, 3rae:C, 3rae:D, 3rae:B, 3raf:A, 3raf:C, 3raf:D, 3raf:B, 4z3o:B, 4z3o:A, 4z4q:A, 4z4q:B, 4z53:A, 4z53:B
38 1l8x:B 354 20 0.0808 0.0226 0.4000 4.0
39 7dco:R 261 42 0.1111 0.0421 0.2619 4.8 7b9v:M, 6bk8:G, 6exn:M, 5gm6:R, 5gmk:R, 6j6g:R, 6j6h:R, 6j6n:R, 6j6q:R, 5lj3:M, 5lj5:M, 5mps:M, 5mq0:M, 3tp2:A, 3tp2:B, 3u1l:A, 3u1m:A, 5wsg:R, 5y88:N, 5ylz:N
40 7dco:X 128 66 0.2020 0.1562 0.3030 4.9 5gm6:V, 5zwm:X
41 5lqw:F 218 42 0.1111 0.0505 0.2619 5.1
42 2mkc:A 118 66 0.2020 0.1695 0.3030 5.6 2my3:A
43 8zjd:R 285 20 0.1010 0.0351 0.5000 6.2 8zje:R
44 8xxm:3G 84 48 0.1515 0.1786 0.3125 7.0 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
45 2afh:E 289 34 0.1111 0.0381 0.3235 7.1 2afh:F, 2afi:E, 2afi:F, 2afi:G, 2afi:H, 2afi:M, 2afi:N, 2afi:O, 2afi:P, 2c8v:A, 1de0:A, 1de0:B, 8dfc:E, 8dfc:F, 8dfd:E, 8dfd:F, 8dfd:G, 8dfd:H, 1fp6:A, 1fp6:B, 1fp6:C, 1fp6:D, 1g1m:A, 1g1m:B, 1g20:E, 1g20:F, 1g20:G, 1g20:H, 1g21:E, 1g21:F, 1g21:G, 1g21:H, 1g5p:A, 1g5p:B, 1m1y:E, 1m1y:F, 1m1y:G, 1m1y:H, 1m1y:M, 1m1y:N, 1m1y:O, 1m1y:P, 1m34:E, 1m34:F, 1m34:G, 1m34:H, 1m34:M, 1m34:N, 1m34:O, 1m34:P, 1n2c:E, 1n2c:F, 1n2c:G, 1n2c:H, 6n4j:A, 6n4j:B, 6n4k:A, 6n4k:B, 6n4l:A, 6n4m:A, 1nip:B, 1nip:A, 2nip:A, 2nip:B, 6o0b:A, 6o0b:B, 6q93:A, 6q93:B, 6q93:C, 6q93:D, 6q93:E, 6q93:F, 6q93:G, 6q93:H, 1rw4:A, 7t4h:A, 8tc3:A, 8tc3:B, 7tne:A, 7tpn:A, 7tpo:A, 7tpv:A, 7tpw:A, 7tpx:A, 7tpy:A, 7tpz:A, 7tq0:A, 7tq9:A, 7tqc:A, 7tqe:A, 7tqf:A, 7tqh:A, 7tqi:A, 7tqj:A, 7tqk:A, 7ut8:E, 7ut8:F, 7ut9:E, 7ut9:F, 7uta:E, 7uta:F, 7uta:G, 7uta:H, 4wza:E, 4wza:F, 4wza:G, 4wza:H, 4wzb:E, 4wzb:F, 4wzb:G, 4wzb:H, 1xcp:A, 1xcp:B, 1xcp:C, 1xcp:D, 1xd8:A, 1xd8:B, 1xd9:A, 1xd9:B, 1xdb:A, 1xdb:B
46 1bih:A 391 38 0.1111 0.0281 0.2895 7.1 1bih:B
47 8oh5:B 584 46 0.1414 0.0240 0.3043 8.3 8oh5:E, 8oh5:H, 8oh5:K, 8oh9:B, 8oh9:E, 8oh9:H, 8oh9:K

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218