BioLiP

>protein
MQGVNIYNISAGTSVDLAAPVTTGDIVTFFSSALNLNAGAGNPNNTTLNLFAENGAYLLHIAFRLQENVIIFNSRQPDGP
WLVEQRVSDVANQFAGIDGKAMVTVFDHGDKYQVVINEKTVIQYTKQISGLTSSLSYNATEETSIFSTVVEAVTYTGLA

The query sequence (length=159) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3afk:A	167	159	1.0000	0.9521	1.0000	2.35e-115	3afk:B, 3m3c:A, 3m3c:B, 3m3e:A, 3m3e:B, 3m3e:C, 3m3e:D, 3m3o:A, 3m3q:A, 3m3q:B, 2zgm:A, 2zgm:B, 2zgn:B, 2zgo:A, 2zgo:B
2	3wg3:A	163	156	0.8805	0.8589	0.8974	2.09e-100	3wg1:A, 3wg1:B, 3wg3:B, 3wg4:A, 3wg4:B, 1ww4:A, 1ww4:B, 1ww4:C, 1ww4:D, 1ww5:A, 1ww5:B, 1ww5:C, 1ww5:D, 1ww6:A, 1ww6:B, 1ww6:C, 1ww6:D, 1ww7:A, 1ww7:B, 1ww7:C, 5xfd:A, 5xfd:B
3	1ulc:A	150	145	0.3082	0.3267	0.3379	6.18e-18	1ulc:B, 1uld:A, 1uld:B, 1uld:C, 1uld:D, 1ule:A, 1ule:B, 1ulf:A, 1ulf:B, 1ulg:A, 1ulg:B, 1ulg:C, 1ulg:D, 2wkk:A, 2wkk:B, 2wkk:C, 2wkk:D
4	5glt:A	278	70	0.1258	0.0719	0.2857	0.002	5glt:B, 5glu:A, 5glu:B, 5glw:A, 5glz:A, 5glz:B, 5glz:C, 5gm0:A, 5gm0:B
5	5glt:A	278	39	0.0943	0.0540	0.3846	7.9	5glt:B, 5glu:A, 5glu:B, 5glw:A, 5glz:A, 5glz:B, 5glz:C, 5gm0:A, 5gm0:B
6	2wt0:A	300	95	0.1824	0.0967	0.3053	0.011	2wsv:A, 2wt1:A, 2wt2:A, 2wt2:B
7	7df6:A	139	100	0.1761	0.2014	0.2800	0.076	7cxb:A, 7cxc:A, 7cxc:B, 7cxd:A, 7cxd:B, 7cxd:D, 7cxd:E, 7df6:B, 8ilu:A, 8ilu:B, 8iu1:A
8	6fof:A	153	98	0.1698	0.1765	0.2755	0.85	1a3k:A, 3aya:A, 3aya:B, 3ayc:B, 3ayd:A, 3aye:A, 3aye:B, 6b8k:A, 4bli:A, 4blj:A, 4bm8:A, 8bz3:A, 7cxa:A, 7cxa:B, 7df5:A, 5e88:A, 5e89:A, 5e8a:A, 6eog:A, 6eol:A, 5exo:A, 6exy:A, 6eym:A, 6f6y:A, 6fk2:A, 6fof:C, 6fof:D, 6fof:E, 6fof:G, 6fof:B, 6fof:F, 6fof:H, 6fof:I, 6fof:J, 6fof:K, 6fof:L, 6g0v:A, 6h64:A, 6h64:F, 6h64:B, 6h64:E, 6h64:C, 6h64:D, 5h9p:A, 5h9r:A, 6i74:A, 6i75:A, 6i76:A, 6i77:A, 6i78:A, 8itx:A, 8itx:B, 8itz:A, 5iuq:A, 4jc1:A, 4jck:A, 1kjl:A, 1kjr:A, 6kxa:A, 6kxb:A, 4lbj:A, 4lbk:A, 4lbl:A, 4lbm:A, 4lbn:A, 4lbo:A, 5nf7:A, 5nf9:A, 5nfa:A, 5nfb:A, 2nmn:A, 2nmo:A, 2nn8:A, 5oax:A, 5ody:A, 8oji:A, 8ojk:A, 8ojm:A, 8ojo:A, 8pbf:A, 8pf9:A, 8pff:A, 8ppn:A, 6q0q:A, 6q17:A, 6qge:A, 6qgf:A, 6qln:A, 6qlo:A, 6qlp:A, 6qlq:B, 6qlr:A, 6qls:A, 6qlt:A, 6qlu:A, 4r9a:A, 4r9b:A, 4r9c:A, 4r9d:A, 7rdo:A, 7rdp:A, 7rgx:A, 7rgy:A, 7rgz:A, 6rhl:A, 6rhm:A, 7rh0:A, 7rh1:A, 7rh3:A, 7rh4:A, 4rl7:A, 6rzf:A, 6rzg:A, 6rzh:A, 6rzi:A, 6rzj:A, 6rzk:A, 6rzl:A, 6rzm:A, 3t1l:A, 3t1m:A, 6tf6:A, 6tf7:A, 4xbn:A, 7xfa:A, 2xg3:A, 6y4c:A, 6y78:A, 7zqx:A, 3zsj:A, 3zsk:A
9	6otf:B	521	25	0.0818	0.0250	0.5200	1.9	6otf:A, 6otf:C, 6ouc:A
10	3pa1:A	315	25	0.0755	0.0381	0.4800	2.3	5bsx:A, 5bsy:A, 6gw1:A, 6gw1:B, 6gw2:A, 6gw2:B, 6gy9:A, 6gy9:B, 5hza:A, 5hza:B, 5hzb:B, 5hzb:A, 3ony:A, 3ony:B, 3ony:C, 3pa1:B, 3pa2:A, 3pa2:B, 3q38:A, 3q39:A, 3q39:B, 3q3a:B, 3q3a:A, 3ry8:A, 8y6c:B, 8y6c:A, 8y6d:B, 8y6d:A, 4z4r:A, 4z4r:B, 4z4s:A, 4z4s:B, 4z4t:A, 4z4t:B, 4z4u:A, 4z4u:B, 4z4v:A, 4z4v:B, 4z4w:A, 4z4w:B, 4z4y:A, 4z4z:A, 4z4z:B
11	6lkx:A	441	59	0.1132	0.0408	0.3051	2.4	6jdr:A, 6jds:A, 6jdu:A, 6lkx:B
12	3mnd:A	152	43	0.1006	0.1053	0.3721	3.1	3mnd:B
13	2ymz:B	130	77	0.1447	0.1769	0.2987	3.6	2ymz:D
14	8cb2:CCC	143	24	0.0692	0.0769	0.4583	4.2
15	1u05:A	243	25	0.0629	0.0412	0.4000	5.4	7f3v:A, 7f3v:B, 7f3v:C, 7f3v:D, 1u05:B, 7w1g:A, 7w1g:B, 7w1g:C, 7w1g:D, 1xaf:A, 1xaf:B
16	5mgy:H	316	59	0.1006	0.0506	0.2712	5.9	5mgy:B, 5mgy:G, 5mgy:A, 5mgy:C, 5mgy:D, 5mgy:F
17	6zz6:D	1050	39	0.0881	0.0133	0.3590	6.5
18	4chu:B	127	36	0.0692	0.0866	0.3056	7.9
19	5ta9:A	369	42	0.0881	0.0379	0.3333	8.6	5ta9:B, 5ta9:C, 5ta9:D
20	6nd4:H	834	32	0.0755	0.0144	0.3750	9.9	7ajt:UQ, 7aju:UQ, 7d4i:AG, 7d5s:AG, 7d5t:AG, 7d63:AG, 6ke6:AG, 6lqp:AG, 6lqq:AG, 6lqr:AG, 6lqs:AG, 6lqt:AG, 6lqu:AG, 6lqv:AG, 7suk:LH, 5wlc:LH, 6zqa:UQ, 6zqb:UQ, 6zqc:UQ, 6zqd:UQ, 6zqe:UQ

[Back]