Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MQEQYRPEEIESKVQLHWDEKRTFEVTEDESKEKYYCLSMLPYPSGRLHMGHVRNYTIGDVIARYQRMLGKNVLQPIGWD
AFGLPAEGAAVKNNTAPAPWTYDNIAYMKNQLKMLGFGYDWSRELATCTPEYYRWEQKFFTELYKKGLVYKKTSAVNWCP
NDQTVLANEQVIDGCCWRCDTKVERKEIPQWFIKITAYADELLNDLDKLDHWPDTVKTMQRNWIGRSEGVEITFNVNDYD
NTLTVYTTRPDAFMGCTYLAVAAGHPLAQKAAENNPELAAFIDECRNTEKKGVDTGFKAVHPLTGEEIPVWAANFVLMEY
GTGAVMAVPGHDQRDYEFASKYGLNIKPVILAADGSEPDLSQQALTEKGVLFNSGEFNGLDHEAAFNAIADKLTAMGVGE
RKVNYRLRDWGVSRQRYWGAPIPMVTLEDGTVMPTPDDQLPVILPEDVVMDGITSPIKADPEWAKTTVNGMPALRETDTF
DTFMESSWYYARYTCPQYKEGMLDSEAANYWLPVDIYIGGIEHAIMHLLYFRFFHKLMRDAGMVNSDEPAKQLLCQGMVL
ADAFYYVGENGERNWVSPVDAIVERDEKGRIVKAKDAAGHELVYTGMSKMSKSKNNGIDPQVMVERYGADTVRLFMMFAS
PADMTLEWQESGVEGANRFLKRVWKLVYEHTAKGDVAALNVDALTENQKALRRDVHKTIAKVTDDIGRRQTFNTAIAAIM
ELMNKLAKAPTDGEQDRALMQEALLAVVRMLNPFTPHICFTLWQELKGEGDIDNAPWPVADEKAMVEDSTLVVVQVNGKV
RAKITVPVDATEEQVRERAGQEHLVAKYLDGVTVRKVIYVPGKLLNLVVG

The query sequence (length=850) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3zgz:D 867 860 0.9988 0.9792 0.9872 0.0 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
2 4ari:A 821 850 0.9635 0.9976 0.9635 0.0 4arc:A, 4as1:A, 8pot:A, 3zjt:A, 3zju:A, 3zjv:A
3 7nu2:A 875 876 0.5753 0.5589 0.5582 0.0 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
4 6q89:A 852 875 0.5706 0.5692 0.5543 0.0 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
5 2bte:A 876 880 0.4671 0.4532 0.4511 0.0 2bte:D, 2byt:A, 2byt:D, 1h3n:A, 1obc:A, 2v0c:A, 2v0g:A, 2v0g:D
6 1obh:A 762 807 0.3953 0.4409 0.4164 0.0
7 5ah5:A 789 858 0.3753 0.4043 0.3718 0.0 5ah5:B
8 3ziu:A 621 242 0.1341 0.1836 0.4711 1.36e-63 3ziu:B
9 3ziu:A 621 444 0.1624 0.2222 0.3108 3.72e-50 3ziu:B
10 8pos:A 168 178 0.0812 0.4107 0.3876 1.02e-33 8por:A, 8pos:B
11 3pz0:B 211 177 0.0871 0.3507 0.4181 1.94e-32
12 7bzj:A 183 187 0.0859 0.3989 0.3904 3.37e-32 4k47:A
13 7n12:B 188 194 0.0859 0.3883 0.3763 8.24e-32 7n12:A
14 7pqk:A 195 187 0.0812 0.3538 0.3690 9.44e-28 5agr:A, 5ags:A, 5agt:A
15 1ffy:A 917 714 0.1894 0.1756 0.2255 4.22e-25 1qu2:A, 1qu3:A
16 8c9e:A 921 720 0.1847 0.1705 0.2181 7.42e-24 8c9f:A, 8c9g:A, 8c9g:B
17 1wz2:A 948 193 0.0765 0.0686 0.3368 1.27e-21 1wz2:B
18 1wz2:A 948 179 0.0635 0.0570 0.3017 3.16e-16 1wz2:B
19 1gax:A 862 617 0.1612 0.1589 0.2220 1.59e-18 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
20 1gax:A 862 187 0.0612 0.0603 0.2781 9.87e-13 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
21 1gax:A 862 53 0.0188 0.0186 0.3019 0.29 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
22 6ldk:A 813 900 0.2176 0.2276 0.2056 6.21e-15
23 1rqg:A 606 237 0.0706 0.0990 0.2532 7.43e-14
24 5k0s:C 497 177 0.0553 0.0946 0.2655 3.25e-11 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
25 5k0s:C 497 26 0.0165 0.0282 0.5385 1.8 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
26 7wpi:A 520 202 0.0659 0.1077 0.2772 1.61e-10 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
27 7wpi:A 520 198 0.0541 0.0885 0.2323 0.001 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
28 8wnf:A 918 328 0.0918 0.0850 0.2378 1.72e-10 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
29 8wnf:A 918 237 0.0541 0.0501 0.1941 0.39 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
30 6lpf:B 1006 90 0.0388 0.0328 0.3667 4.36e-10 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
31 6lpf:B 1006 190 0.0553 0.0467 0.2474 8.61e-05 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
32 8c8v:A 1032 152 0.0494 0.0407 0.2763 1.20e-09 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
33 8c8v:A 1032 450 0.1176 0.0969 0.2222 6.56e-08 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
34 8c8v:A 1032 42 0.0165 0.0136 0.3333 0.045 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
35 7d5c:A 919 181 0.0588 0.0544 0.2762 3.20e-08
36 7d5c:A 919 188 0.0529 0.0490 0.2394 4.59e-04
37 7d5c:A 919 62 0.0224 0.0207 0.3065 0.002
38 7d5c:A 919 22 0.0165 0.0152 0.6364 0.023
39 3kfl:A 530 178 0.0494 0.0792 0.2360 4.54e-08 6swx:A
40 5k0t:B 468 174 0.0506 0.0919 0.2471 7.53e-08
41 5k0t:B 468 24 0.0153 0.0278 0.5417 5.4
42 7wpt:A 483 121 0.0459 0.0807 0.3223 1.05e-07 7wpn:A
43 7wpt:A 483 47 0.0212 0.0373 0.3830 0.001 7wpn:A
44 2x1l:A 511 177 0.0494 0.0822 0.2373 2.26e-07 2x1m:A
45 2x1l:A 511 47 0.0200 0.0333 0.3617 0.17 2x1m:A
46 4eg7:B 536 178 0.0471 0.0746 0.2247 3.84e-07 6cml:A, 6cml:B, 4eg1:A, 4eg1:B, 4eg3:A, 4eg3:B, 4eg4:A, 4eg5:A, 4eg6:A, 4eg7:A, 4eg8:A, 4eg8:B, 4ega:A, 4ega:B, 5j58:A, 5j58:B, 5j59:A, 5j59:B, 5j5a:A, 5j5a:B, 6mes:A, 6mes:B, 4mvw:A, 4mvw:B, 4mvx:A, 4mvx:B, 4mvy:A, 4mvy:B, 4mw0:A, 4mw0:B, 4mw1:A, 4mw1:B, 4mw2:A, 4mw2:B, 4mw4:A, 4mw4:B, 4mw5:A, 4mw5:B, 4mw6:A, 4mw6:B, 4mw7:A, 4mw7:B, 4mw9:A, 4mw9:B, 4mwb:A, 4mwb:B, 4mwc:A, 4mwc:B, 4mwd:A, 4mwd:B, 4mwe:A, 4mwe:B, 5nfh:A, 5nfh:B, 5tqu:A, 5v49:A, 5v49:B, 4zt2:A, 4zt2:B, 4zt3:A, 4zt3:B, 4zt4:A, 4zt4:B, 4zt5:A, 4zt5:B, 4zt6:A, 4zt6:B, 4zt7:A, 4zt7:B
47 1pfu:A 547 141 0.0400 0.0622 0.2411 7.94e-07 8bru:A, 8brv:A, 8brw:A, 8brx:A, 1f4l:A, 3h97:A, 3h99:A, 3h9b:A, 3h9c:A, 1p7p:A, 1pfv:A, 1pfw:A, 1pfy:A, 1qqt:A, 6spn:A, 6spo:A, 6spp:A, 6spq:A, 6spr:A
48 1ile:A 821 433 0.1153 0.1194 0.2263 1.83e-06 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
49 1ile:A 821 231 0.0671 0.0694 0.2468 4.41e-06 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
50 1ile:A 821 77 0.0271 0.0280 0.2987 0.024 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
51 1ile:A 821 18 0.0129 0.0134 0.6111 1.0 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
52 6ax8:A 509 173 0.0494 0.0825 0.2428 5.75e-06 5xet:C
53 6ax8:A 509 43 0.0188 0.0314 0.3721 0.22 5xet:C
54 2ct8:A 465 118 0.0388 0.0710 0.2797 8.89e-06 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
55 2ct8:A 465 34 0.0176 0.0323 0.4412 0.25 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
56 2x1l:C 476 119 0.0353 0.0630 0.2521 2.27e-05 2x1l:B
57 2x1l:C 476 47 0.0200 0.0357 0.3617 0.15 2x1l:B
58 1a8h:A 500 164 0.0400 0.0680 0.2073 2.40e-05 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
59 1a8h:A 500 33 0.0153 0.0260 0.3939 0.32 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
60 5goy:A 598 143 0.0447 0.0635 0.2657 3.51e-05 5gl7:A
61 4eg6:B 515 137 0.0376 0.0621 0.2336 4.65e-05 4eg4:B, 4eg5:B, 5tqu:B
62 6wq6:A 547 143 0.0388 0.0603 0.2308 5.35e-05 6wqi:A, 6wqi:B, 6wqs:A, 6wqt:A
63 1pg0:A 492 113 0.0353 0.0610 0.2655 5.62e-05 1pg2:A
64 8qhp:A 410 176 0.0518 0.1073 0.2500 0.008 8qhp:B
65 2zue:A 628 30 0.0200 0.0271 0.5667 0.009 2zuf:A
66 5urb:A 546 57 0.0235 0.0366 0.3509 0.010 5urb:B
67 7ulz:A 521 50 0.0212 0.0345 0.3600 0.010
68 2vwt:A 256 89 0.0306 0.1016 0.2921 0.40 2vwt:B, 2vwt:C
69 3tqo:A 387 54 0.0235 0.0517 0.3704 0.94
70 2w2l:A 346 35 0.0165 0.0405 0.4000 1.4 2w2l:B, 2w2l:C, 2w2l:D
71 4lnj:A 332 114 0.0424 0.1084 0.3158 2.2 4lnj:B, 4lnl:A, 4lnl:B, 4lnm:B, 4lnm:A, 4rjy:A, 4rjy:C, 4rjy:D, 3wlx:B, 3wlx:A
72 1li7:B 375 22 0.0141 0.0320 0.5455 3.7 1li5:B
73 1u0b:B 461 22 0.0141 0.0260 0.5455 3.7 1li5:A, 1li7:A
74 1u0b:B 461 63 0.0224 0.0412 0.3016 8.2 1li5:A, 1li7:A
75 6ao8:A 569 34 0.0141 0.0211 0.3529 3.9
76 1k8d:A 274 28 0.0165 0.0511 0.5000 4.1
77 3qj4:A 335 37 0.0141 0.0358 0.3243 4.9 3qj4:B
78 4jyz:A 542 109 0.0329 0.0517 0.2569 5.4 1euq:A, 1euy:A, 1exd:A, 1gtr:A, 1gts:A, 4jxx:A, 4jxz:A, 1o0b:A, 1o0c:A, 1qrs:A, 1qrt:A, 1qru:A, 1qtq:A, 2rd2:A, 2re8:A, 1zjw:A
79 6vfv:A 222 76 0.0259 0.0991 0.2895 5.4
80 5b63:C 553 34 0.0141 0.0217 0.3529 6.1 5yyn:C
81 6fn0:A 496 109 0.0341 0.0585 0.2661 6.3 6fn2:A, 6fn3:A, 5zm0:A
82 5yym:A 581 34 0.0141 0.0207 0.3529 6.7 5b63:A, 4oby:A, 5yym:B, 5yyn:A
83 5upm:A 753 54 0.0188 0.0212 0.2963 8.9 5t4a:A, 5t4c:A, 5t4g:A, 5upi:A, 5upn:A, 5upo:A, 5v1w:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218