Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MQEQYRPEEIESKVQLHWDEKRTFEVTEDESKEKYYCLSMLPYPSGRLHMGHVRNYTIGDVIARYQRMLGKNVLQPIGWD
AFGLPAEGAAVKNNTAPAPWTYDNIAYMKNQLKMLGFGYDWSRELATCTPEYYRWEQKFFTELYKKGLVYKKTSAVEIPQ
WFIKITAYADELLNDLDKLDHWPDTVKTMQRNWIGRSEGVEITFNVNDYDNTLTVYTTRPDTFMGCTYLAVAAGHPLAQK
AAENNPELAAFIDECRNTMEKKGVDTGFKAVHPLTGEEIPVWAANFVLMEYGTGAVMAVPGHDQRDYEFASKYGLNIKPV
ILAADGSEPDLSQQALTEKGVLFNSGEFNGLDHEAAFNAIADKLTAMGVGERKVNYRLRDWGVSRQRYWGAPIPMVTLED
GTVMPTPDDQLPVILPEDVVMDGITSPIKADPEWAKTTVNGMPALRETDTFDTFMESSWYYARYTCPQYKEGMLDSEAAN
YWLPVDIYIGGIEHAIMHLLYFRFFHKLMRDAGMVNSDEPAKQLLCQGMVLADAFYYVGENGERNWVSPVDAIVERDEKG
RIVKAKDAAGHELVYTGMSKMSKSKNNGIDPQVMVERYGADTVRLFMMFASPADMTLEWQESGVEGANRFLKRVWKLVYE
HTAKGDVAALNVDALTENQKALRRDVHKTIAKVTDDIGRRQTFNTAIAAIMELMNKLAKAPTDGEQDRALMQEALLAVVR
MLNPFTPHICFTLWQELKGEGDIDNAPWPVADEKAMVEDSTLVVVQVNGKVRAKITVPVDATEEQVRERAGQEHLVAKYV
IYVPGKLLNLVVG

The query sequence (length=813) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4ari:A 821 821 0.9988 0.9890 0.9890 0.0 4arc:A, 4as1:A, 8pot:A, 3zjt:A, 3zju:A, 3zjv:A
2 3zgz:D 867 860 1.0000 0.9377 0.9453 0.0 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
3 7nu2:A 875 876 0.5843 0.5429 0.5422 0.0 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
4 6q89:A 852 875 0.5781 0.5516 0.5371 0.0 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
5 2bte:A 876 880 0.4625 0.4292 0.4273 0.0 2bte:D, 2byt:A, 2byt:D, 1h3n:A, 1obc:A, 2v0c:A, 2v0g:A, 2v0g:D
6 1obh:A 762 777 0.4145 0.4423 0.4337 0.0
7 5ah5:A 789 860 0.3788 0.3904 0.3581 0.0 5ah5:B
8 3ziu:A 621 246 0.1279 0.1675 0.4228 9.04e-51 3ziu:B
9 3ziu:A 621 444 0.1685 0.2206 0.3086 4.71e-50 3ziu:B
10 1wz2:A 948 865 0.2558 0.2194 0.2405 1.30e-36 1wz2:B
11 3pz0:B 211 177 0.0972 0.3744 0.4463 4.12e-34
12 8pos:A 168 178 0.0849 0.4107 0.3876 7.25e-34 8por:A, 8pos:B
13 7bzj:A 183 187 0.0910 0.4044 0.3957 2.25e-33 4k47:A
14 7n12:B 188 196 0.0923 0.3989 0.3827 9.21e-33 7n12:A
15 1gax:A 862 825 0.2251 0.2123 0.2218 1.90e-28 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
16 7pqk:A 195 187 0.0898 0.3744 0.3904 3.13e-28 5agr:A, 5ags:A, 5agt:A
17 1ffy:A 917 709 0.1956 0.1734 0.2243 4.38e-24 1qu2:A, 1qu3:A
18 8c9e:A 921 692 0.1931 0.1705 0.2269 2.84e-23 8c9f:A, 8c9g:A, 8c9g:B
19 6ldk:A 813 871 0.2263 0.2263 0.2113 1.50e-21
20 7d5c:A 919 351 0.1058 0.0936 0.2450 2.83e-11
21 7d5c:A 919 188 0.0554 0.0490 0.2394 5.85e-04
22 7d5c:A 919 22 0.0172 0.0152 0.6364 0.019
23 5k0t:B 468 150 0.0517 0.0897 0.2800 5.26e-11
24 5k0t:B 468 24 0.0160 0.0278 0.5417 5.3
25 6lpf:B 1006 90 0.0406 0.0328 0.3667 3.19e-10 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
26 6lpf:B 1006 190 0.0578 0.0467 0.2474 9.40e-05 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
27 8wnf:A 918 298 0.0898 0.0795 0.2450 6.54e-10 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
28 8wnf:A 918 237 0.0566 0.0501 0.1941 0.26 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
29 7wpt:A 483 166 0.0615 0.1035 0.3012 8.76e-10 7wpn:A
30 7wpt:A 483 47 0.0221 0.0373 0.3830 0.001 7wpn:A
31 2ct8:A 465 146 0.0504 0.0882 0.2808 4.83e-09 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
32 2ct8:A 465 34 0.0185 0.0323 0.4412 0.24 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
33 2x1l:C 476 142 0.0455 0.0777 0.2606 4.00e-08 2x1l:B
34 2x1l:C 476 47 0.0209 0.0357 0.3617 0.14 2x1l:B
35 8c8v:A 1032 450 0.1230 0.0969 0.2222 5.57e-08 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
36 8c8v:A 1032 316 0.0861 0.0678 0.2215 4.41e-07 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
37 1rqg:A 606 122 0.0431 0.0578 0.2869 7.80e-08
38 7wpi:A 520 121 0.0480 0.0750 0.3223 1.03e-07 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
39 7wpi:A 520 47 0.0221 0.0346 0.3830 0.001 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
40 5k0s:C 497 120 0.0394 0.0644 0.2667 2.97e-07 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
41 5k0s:C 497 26 0.0172 0.0282 0.5385 1.8 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
42 1ile:A 821 231 0.0701 0.0694 0.2468 4.73e-06 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
43 1ile:A 821 407 0.1082 0.1072 0.2162 1.82e-04 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
44 1ile:A 821 18 0.0135 0.0134 0.6111 0.93 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
45 3kfl:A 530 116 0.0381 0.0585 0.2672 1.02e-05 6swx:A
46 2x1l:A 511 119 0.0369 0.0587 0.2521 2.07e-05 2x1m:A
47 2x1l:A 511 47 0.0209 0.0333 0.3617 0.16 2x1m:A
48 4eg7:B 536 116 0.0369 0.0560 0.2586 5.23e-05 6cml:A, 6cml:B, 4eg1:A, 4eg1:B, 4eg3:A, 4eg3:B, 4eg4:A, 4eg5:A, 4eg6:A, 4eg7:A, 4eg8:A, 4eg8:B, 4ega:A, 4ega:B, 5j58:A, 5j58:B, 5j59:A, 5j59:B, 5j5a:A, 5j5a:B, 6mes:A, 6mes:B, 4mvw:A, 4mvw:B, 4mvx:A, 4mvx:B, 4mvy:A, 4mvy:B, 4mw0:A, 4mw0:B, 4mw1:A, 4mw1:B, 4mw2:A, 4mw2:B, 4mw4:A, 4mw4:B, 4mw5:A, 4mw5:B, 4mw6:A, 4mw6:B, 4mw7:A, 4mw7:B, 4mw9:A, 4mw9:B, 4mwb:A, 4mwb:B, 4mwc:A, 4mwc:B, 4mwd:A, 4mwd:B, 4mwe:A, 4mwe:B, 5nfh:A, 5nfh:B, 5tqu:A, 5v49:A, 5v49:B, 4zt2:A, 4zt2:B, 4zt3:A, 4zt3:B, 4zt4:A, 4zt4:B, 4zt5:A, 4zt5:B, 4zt6:A, 4zt6:B, 4zt7:A, 4zt7:B
49 1pfu:A 547 135 0.0418 0.0622 0.2519 5.86e-05 8bru:A, 8brv:A, 8brw:A, 8brx:A, 1f4l:A, 3h97:A, 3h99:A, 3h9b:A, 3h9c:A, 1p7p:A, 1pfv:A, 1pfw:A, 1pfy:A, 1qqt:A, 6spn:A, 6spo:A, 6spp:A, 6spq:A, 6spr:A
50 4eg6:B 515 116 0.0369 0.0583 0.2586 6.09e-05 4eg4:B, 4eg5:B, 5tqu:B
51 1pg0:A 492 113 0.0369 0.0610 0.2655 6.11e-05 1pg2:A
52 6wq6:A 547 117 0.0357 0.0530 0.2479 5.46e-04 6wqi:A, 6wqi:B, 6wqs:A, 6wqt:A
53 5goy:A 598 117 0.0394 0.0535 0.2735 8.38e-04 5gl7:A
54 8qhp:A 410 176 0.0541 0.1073 0.2500 0.007 8qhp:B
55 8qhp:A 410 56 0.0234 0.0463 0.3393 9.9 8qhp:B
56 7ulz:A 521 50 0.0221 0.0345 0.3600 0.008
57 2zue:A 628 30 0.0209 0.0271 0.5667 0.009 2zuf:A
58 5urb:A 546 57 0.0246 0.0366 0.3509 0.009 5urb:B
59 6ax8:A 509 50 0.0221 0.0354 0.3600 0.034 5xet:C
60 6ax8:A 509 43 0.0197 0.0314 0.3721 0.21 5xet:C
61 2vwt:A 256 90 0.0308 0.0977 0.2778 0.15 2vwt:B, 2vwt:C
62 1a8h:A 500 33 0.0160 0.0260 0.3939 0.31 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
63 1a8h:A 500 86 0.0258 0.0420 0.2442 0.44 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
64 3tqo:A 387 54 0.0246 0.0517 0.3704 0.90
65 2w2l:A 346 35 0.0172 0.0405 0.4000 1.3 2w2l:B, 2w2l:C, 2w2l:D
66 3qj4:A 335 38 0.0160 0.0388 0.3421 1.4 3qj4:B
67 4lnj:A 332 114 0.0443 0.1084 0.3158 2.0 4lnj:B, 4lnl:A, 4lnl:B, 4lnm:B, 4lnm:A, 4rjy:A, 4rjy:C, 4rjy:D, 3wlx:B, 3wlx:A
68 6s1s:A 367 65 0.0197 0.0436 0.2462 2.3 4hef:A, 6i30:A, 4nk3:A, 4ooy:A, 3s1y:A, 3s22:A, 8sdr:A, 8sds:A, 8sdt:A, 8sdv:A, 6uqs:A, 6uqt:A, 6uqu:A, 6ur3:A, 4wyy:A, 2wzx:A, 2wzz:A, 4wz4:A, 4x68:A, 4x68:B
69 1k8d:A 274 28 0.0172 0.0511 0.5000 3.5
70 1li7:B 375 22 0.0148 0.0320 0.5455 3.5 1li5:B
71 6ao8:A 569 34 0.0148 0.0211 0.3529 3.6
72 1u0b:B 461 22 0.0148 0.0260 0.5455 3.6 1li5:A, 1li7:A
73 1u0b:B 461 63 0.0234 0.0412 0.3016 8.8 1li5:A, 1li7:A
74 4jyz:A 542 109 0.0344 0.0517 0.2569 5.2 1euq:A, 1euy:A, 1exd:A, 1gtr:A, 1gts:A, 4jxx:A, 4jxz:A, 1o0b:A, 1o0c:A, 1qrs:A, 1qrt:A, 1qru:A, 1qtq:A, 2rd2:A, 2re8:A, 1zjw:A
75 5b63:C 553 34 0.0148 0.0217 0.3529 5.8 5yyn:C
76 6bq1:E 1510 117 0.0332 0.0179 0.2308 5.9 6bq1:A
77 6vfv:A 222 76 0.0271 0.0991 0.2895 6.1
78 5yym:A 581 34 0.0148 0.0207 0.3529 6.7 5b63:A, 4oby:A, 5yym:B, 5yyn:A
79 2gv8:A 442 111 0.0332 0.0611 0.2432 8.0 2gv8:B, 2gvc:A, 2gvc:B, 2gvc:D, 2gvc:E, 1vqw:A, 1vqw:B
80 5upm:A 753 54 0.0197 0.0212 0.2963 8.4 5t4a:A, 5t4c:A, 5t4g:A, 5upi:A, 5upn:A, 5upo:A, 5v1w:A
81 6fn0:A 496 73 0.0258 0.0423 0.2877 8.8 6fn2:A, 6fn3:A, 5zm0:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218