Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MQEHYQPAAIEPAAQKKWDDARISNVSEDASKPKYYCLSMFPYPSGKLHMGHVRNYTIGDVLSRFKLLNGFNVMQPMGWD
AFGMPAENAAMKNNVAPAAWTYDNIEYMKTQLKSLGFAVDWEREVATCKPEYYRWEQWLFTKLFEKGIVYRKNGTVNWDP
VDQTVLANEQVIDGRGWRSGALIEKREIPMYYFKITDYAEELLNDLDKLEHWPEQVKTMQRNWIGKSRGMTVRFAVSDDS
KQGLEGDYAKFLQVYTTRPDTLMGATYVAVAAEHPLATAAAADKPELQAFIAECKAGSVAEADMATMEKKGVPTGRYVVN
PLNGDKLEVWIANYVLWGYGDGAVMAVPAHDERDFEFAAKYNLPKKQVIAVGDNAFDANRWQEWYGDKENGVLVNSGDLD
GLDFQTAFDAVAAKLQSQGAGEPKTQYRLRDWGISRQRYWGCPIPIVHCEKCGNVPVPADQLPVVLPENVVPDGMGSPLA
KMPEFYETSCPCCGGAAKRETDTMDTFIESSWYFFRYMSPKFSDGMVSAESAKYWGAVDQYIGGIEHAILHLLYARFFTK
LMRDEGLVNVDEPFERLLTQGMVVCETYYRENDKGGKDWINPADVELSAVLKADGLPVVISGTEKMSKSKNNGVDPQELI
NAYGADTARLFMMFAAPPEQSLEWSDSGVEGAHRFLRRLWRTVYEYLKQGGAVKAFAGNQDGLSKELKDLRHKLHSTTAK
VSDDYGRRQQFNTAIAAVMELLNQYDKTDTGSEQGRAVAQEVLEAAVRLLWPIVPHICETLWSELNGAKLWEAGWPTVDE
AALVKSEIEVMVQVNGKLRGKITVAADASKADLEAAALANEGAVKFMEGKPAKKIIVVPGRLVNIV

The query sequence (length=866) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7nu2:A 875 875 0.9988 0.9886 0.9886 0.0 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
2 6q89:A 852 866 0.9838 1.0000 0.9838 0.0 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
3 3zgz:D 867 875 0.5716 0.5709 0.5657 0.0 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
4 4ari:A 821 875 0.5404 0.5700 0.5349 0.0 4arc:A, 4as1:A, 8pot:A, 3zjt:A, 3zju:A, 3zjv:A
5 2bte:A 876 898 0.4758 0.4703 0.4588 0.0 2bte:D, 2byt:A, 2byt:D, 1h3n:A, 1obc:A, 2v0c:A, 2v0g:A, 2v0g:D
6 1obh:A 762 830 0.4134 0.4698 0.4313 0.0
7 5ah5:A 789 858 0.3868 0.4246 0.3904 0.0 5ah5:B
8 3ziu:A 621 228 0.1155 0.1610 0.4386 2.10e-54 3ziu:B
9 3ziu:A 621 454 0.1501 0.2093 0.2863 8.20e-48 3ziu:B
10 3pz0:B 211 198 0.0982 0.4028 0.4293 4.40e-37
11 7bzj:A 183 179 0.0878 0.4153 0.4246 2.77e-34 4k47:A
12 7n12:B 188 186 0.0924 0.4255 0.4301 1.29e-33 7n12:A
13 1wz2:A 948 375 0.1236 0.1129 0.2853 3.50e-31 1wz2:B
14 1wz2:A 948 215 0.0727 0.0665 0.2930 3.86e-12 1wz2:B
15 7pqk:A 195 189 0.0843 0.3744 0.3862 1.15e-28 5agr:A, 5ags:A, 5agt:A
16 1ffy:A 917 905 0.2402 0.2268 0.2298 2.18e-28 1qu2:A, 1qu3:A
17 8c9e:A 921 861 0.2263 0.2128 0.2276 4.50e-25 8c9f:A, 8c9g:A, 8c9g:B
18 8pos:A 168 196 0.0739 0.3810 0.3265 1.96e-24 8por:A, 8pos:B
19 1ile:A 821 914 0.2286 0.2412 0.2166 6.31e-22 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
20 8c8v:A 1032 407 0.1109 0.0930 0.2359 4.99e-17 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
21 8c8v:A 1032 339 0.0889 0.0746 0.2271 8.72e-09 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
22 1gax:A 862 532 0.1455 0.1462 0.2368 8.02e-15 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
23 1gax:A 862 184 0.0554 0.0557 0.2609 6.40e-13 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
24 6ldk:A 813 179 0.0577 0.0615 0.2793 8.07e-12
25 6ldk:A 813 17 0.0150 0.0160 0.7647 0.033
26 6ldk:A 813 83 0.0289 0.0308 0.3012 0.082
27 6ldk:A 813 91 0.0277 0.0295 0.2637 0.67
28 8wnf:A 918 693 0.1617 0.1525 0.2020 1.07e-11 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
29 5k0s:C 497 178 0.0543 0.0946 0.2640 1.34e-10 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
30 5k0s:C 497 38 0.0162 0.0282 0.3684 3.8 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
31 7wpi:A 520 208 0.0577 0.0962 0.2404 2.05e-09 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
32 7wpi:A 520 186 0.0543 0.0904 0.2527 3.25e-04 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
33 7d5c:A 919 155 0.0497 0.0468 0.2774 2.85e-09
34 7d5c:A 919 198 0.0531 0.0501 0.2323 0.003
35 7d5c:A 919 17 0.0139 0.0131 0.7059 0.050
36 1rqg:A 606 277 0.0785 0.1122 0.2455 3.82e-09
37 2x1l:A 511 179 0.0508 0.0861 0.2458 6.49e-09 2x1m:A
38 2x1l:A 511 85 0.0323 0.0548 0.3294 2.03e-04 2x1m:A
39 6lpf:B 1006 194 0.0600 0.0517 0.2680 1.56e-08 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
40 6lpf:B 1006 212 0.0589 0.0507 0.2406 4.28e-04 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
41 5k0t:B 468 128 0.0404 0.0748 0.2734 2.16e-08
42 2x1l:C 476 120 0.0358 0.0651 0.2583 3.07e-07 2x1l:B
43 2x1l:C 476 85 0.0323 0.0588 0.3294 1.79e-04 2x1l:B
44 3kfl:A 530 178 0.0508 0.0830 0.2472 6.38e-07 6swx:A
45 6ax8:A 509 176 0.0520 0.0884 0.2557 1.11e-06 5xet:C
46 6ax8:A 509 71 0.0289 0.0491 0.3521 0.010 5xet:C
47 4eg7:B 536 178 0.0473 0.0765 0.2303 3.44e-06 6cml:A, 6cml:B, 4eg1:A, 4eg1:B, 4eg3:A, 4eg3:B, 4eg4:A, 4eg5:A, 4eg6:A, 4eg7:A, 4eg8:A, 4eg8:B, 4ega:A, 4ega:B, 5j58:A, 5j58:B, 5j59:A, 5j59:B, 5j5a:A, 5j5a:B, 6mes:A, 6mes:B, 4mvw:A, 4mvw:B, 4mvx:A, 4mvx:B, 4mvy:A, 4mvy:B, 4mw0:A, 4mw0:B, 4mw1:A, 4mw1:B, 4mw2:A, 4mw2:B, 4mw4:A, 4mw4:B, 4mw5:A, 4mw5:B, 4mw6:A, 4mw6:B, 4mw7:A, 4mw7:B, 4mw9:A, 4mw9:B, 4mwb:A, 4mwb:B, 4mwc:A, 4mwc:B, 4mwd:A, 4mwd:B, 4mwe:A, 4mwe:B, 5nfh:A, 5nfh:B, 5tqu:A, 5v49:A, 5v49:B, 4zt2:A, 4zt2:B, 4zt3:A, 4zt3:B, 4zt4:A, 4zt4:B, 4zt5:A, 4zt5:B, 4zt6:A, 4zt6:B, 4zt7:A, 4zt7:B
48 4eg7:B 536 230 0.0624 0.1007 0.2348 7.0 6cml:A, 6cml:B, 4eg1:A, 4eg1:B, 4eg3:A, 4eg3:B, 4eg4:A, 4eg5:A, 4eg6:A, 4eg7:A, 4eg8:A, 4eg8:B, 4ega:A, 4ega:B, 5j58:A, 5j58:B, 5j59:A, 5j59:B, 5j5a:A, 5j5a:B, 6mes:A, 6mes:B, 4mvw:A, 4mvw:B, 4mvx:A, 4mvx:B, 4mvy:A, 4mvy:B, 4mw0:A, 4mw0:B, 4mw1:A, 4mw1:B, 4mw2:A, 4mw2:B, 4mw4:A, 4mw4:B, 4mw5:A, 4mw5:B, 4mw6:A, 4mw6:B, 4mw7:A, 4mw7:B, 4mw9:A, 4mw9:B, 4mwb:A, 4mwb:B, 4mwc:A, 4mwc:B, 4mwd:A, 4mwd:B, 4mwe:A, 4mwe:B, 5nfh:A, 5nfh:B, 5tqu:A, 5v49:A, 5v49:B, 4zt2:A, 4zt2:B, 4zt3:A, 4zt3:B, 4zt4:A, 4zt4:B, 4zt5:A, 4zt5:B, 4zt6:A, 4zt6:B, 4zt7:A, 4zt7:B
49 7wpt:A 483 121 0.0358 0.0642 0.2562 6.95e-06 7wpn:A
50 7wpt:A 483 186 0.0543 0.0973 0.2527 3.69e-04 7wpn:A
51 1pfu:A 547 120 0.0312 0.0494 0.2250 8.56e-05 8bru:A, 8brv:A, 8brw:A, 8brx:A, 1f4l:A, 3h97:A, 3h99:A, 3h9b:A, 3h9c:A, 1p7p:A, 1pfv:A, 1pfw:A, 1pfy:A, 1qqt:A, 6spn:A, 6spo:A, 6spp:A, 6spq:A, 6spr:A
52 1pfu:A 547 213 0.0589 0.0932 0.2394 8.5 8bru:A, 8brv:A, 8brw:A, 8brx:A, 1f4l:A, 3h97:A, 3h99:A, 3h9b:A, 3h9c:A, 1p7p:A, 1pfv:A, 1pfw:A, 1pfy:A, 1qqt:A, 6spn:A, 6spo:A, 6spp:A, 6spq:A, 6spr:A
53 4eg6:B 515 116 0.0346 0.0583 0.2586 1.37e-04 4eg4:B, 4eg5:B, 5tqu:B
54 4eg6:B 515 230 0.0624 0.1049 0.2348 8.2 4eg4:B, 4eg5:B, 5tqu:B
55 1pg0:A 492 117 0.0323 0.0569 0.2393 2.90e-04 1pg2:A
56 7ulz:A 521 199 0.0543 0.0902 0.2362 4.91e-04
57 1a8h:A 500 164 0.0404 0.0700 0.2134 7.15e-04 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
58 1a8h:A 500 84 0.0312 0.0540 0.3214 0.005 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
59 2ct8:A 465 173 0.0543 0.1011 0.2717 0.001 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
60 2ct8:A 465 117 0.0289 0.0538 0.2137 0.002 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
61 6wq6:A 547 133 0.0370 0.0585 0.2406 0.003 6wqi:A, 6wqi:B, 6wqs:A, 6wqt:A
62 8qhp:A 410 69 0.0277 0.0585 0.3478 0.011 8qhp:B
63 8qhp:A 410 41 0.0150 0.0317 0.3171 4.1 8qhp:B
64 2zue:A 628 30 0.0162 0.0223 0.4667 0.13 2zuf:A
65 2xcr:D 719 146 0.0416 0.0501 0.2466 0.14 8bp2:AAA, 8bp2:CCC, 5cdm:A, 5cdm:C, 5cdn:C, 5cdn:A, 5cdn:T, 5cdn:R, 5cdo:A, 5cdo:C, 5cdo:R, 5cdo:T, 5cdp:A, 5cdp:C, 5cdq:A, 5cdq:C, 5cdq:R, 5cdq:T, 5cdr:A, 5cdr:C, 6fqm:A, 6fqm:C, 6fqm:a, 6fqm:c, 6fqs:A, 6fqs:C, 6fqv:A, 6fqv:C, 6fqv:R, 6fqv:T, 5iwi:A, 5iwi:C, 5iwm:A, 5iwm:C, 6qtk:A, 6qtk:C, 6qtp:A, 6qtp:C, 6qx1:A, 6qx1:C, 6qx2:A, 6qx2:C, 6qx2:J, 6qx2:L, 6qx2:R, 6qx2:T, 6qx2:a, 6qx2:c, 6qx2:j, 6qx2:l, 6qx2:r, 6qx2:t, 2xcr:B, 2xcr:S, 2xcr:U
66 5urb:A 546 222 0.0543 0.0861 0.2117 0.14 5urb:B
67 6sau:B 442 202 0.0462 0.0905 0.1980 0.20 6sau:A
68 1u0b:B 461 63 0.0242 0.0456 0.3333 0.30 1li5:A, 1li7:A
69 8q6x:A 389 95 0.0323 0.0720 0.2947 0.67 8q6x:B, 8q6y:A, 8q6y:B
70 7mvs:B 675 115 0.0323 0.0415 0.2435 0.85 8bp2:BBB, 8bp2:DDD, 5bs3:B, 5bs3:D, 4bul:A, 4bul:C, 5cdm:B, 5cdm:D, 5cdn:D, 5cdn:B, 5cdn:U, 5cdn:S, 5cdo:B, 5cdo:D, 5cdo:S, 5cdo:U, 5cdp:B, 5cdp:D, 5cdq:B, 5cdq:D, 5cdq:S, 5cdq:U, 5cdr:B, 5cdr:D, 6fm4:B, 6fm4:D, 6fqm:D, 6fqs:B, 6fqs:D, 6fqv:B, 6fqv:D, 6fqv:S, 6fqv:U, 7fvs:A, 7fvs:B, 7fvt:A, 7fvt:B, 5iwi:B, 5iwi:D, 5iwm:B, 5iwm:D, 7mvs:A, 5npk:B, 5npk:D, 5npk:b, 5npk:d, 5npp:B, 5npp:D, 4plb:B, 4plb:D, 6qtk:B, 6qtk:D, 6qtp:B, 6qtp:D, 6qx1:B, 6qx1:D, 6qx2:B, 6qx2:D, 6qx2:K, 6qx2:M, 6qx2:S, 6qx2:U, 6qx2:b, 6qx2:d, 6qx2:k, 6qx2:m, 6qx2:s, 6qx2:u, 2xcs:B, 2xcs:D, 2xct:B, 2xct:D, 2xct:S, 2xct:U, 6z1a:B, 6z1a:D
71 3tqo:A 387 133 0.0393 0.0879 0.2556 1.6
72 6fqm:b 160 115 0.0323 0.1750 0.2435 3.9 6fqm:B, 6fqm:d
73 4q2t:A 590 34 0.0127 0.0186 0.3235 4.0 4q2t:B, 4q2x:A, 4q2x:B
74 7m4u:p 83 45 0.0185 0.1928 0.3556 4.0 7m4w:p, 7m4x:p, 7m4y:p, 7m4z:p, 7ryf:p, 7ryg:p, 7ryh:p, 7uvv:p, 7uvw:p, 7uvx:p, 7uvy:p, 7uvz:p, 7uw1:p, 6v39:p, 6v3a:p, 6v3b:p, 6v3e:p, 6ypu:q, 6yt9:q
75 8aaf:e 1527 43 0.0196 0.0111 0.3953 4.2 8agt:e, 8agu:e, 8agv:e, 8agw:e, 8agx:e, 8agz:e
76 1zos:A 230 112 0.0346 0.1304 0.2679 4.2 3mms:A, 1zos:B, 1zos:C, 1zos:D, 1zos:E, 1zos:F
77 1ui0:A 192 60 0.0219 0.0990 0.3167 9.2 1ui1:A
78 4lnj:A 332 81 0.0312 0.0813 0.3333 9.7 4lnj:B, 4lnl:A, 4lnl:B, 4lnm:B, 4lnm:A, 4rjy:A, 4rjy:C, 4rjy:D, 3wlx:B, 3wlx:A
79 4p7m:A 104 41 0.0173 0.1442 0.3659 9.8 4p7s:A, 4p7s:B, 4p7s:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218