BioLiP

>protein
MPTLLRVYIDGPHGMGKTTTTQLLRDDIVYVPEPMTYWRVLGASETIANIYTTQHRLDQGEISAGDAAVVMTSAQITMGM
PYAVTDAVLAPHIGGEAGSPPALTLIFDRHPIAALLCYPAARYLMGSMTPQAVLAFVALIPPTLPGTNIVLGALPEDRHI
DRLAKRQRPGERLDLAMLAAIRRVYGLLANTVRYLQCGGSWREDWGQLSGPRPHIGDTLFTLFRAPELLAPNGDLYNVFA
WALDVLAKRLRSMHVFILDYDQSPAGCRDALLQLTSGMVQTHVTTPGSIPTICDLARTFAREMGE

The query sequence (length=305) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3rdp:B	320	320	1.0000	0.9531	0.9531	0.0	1e2i:A, 1e2i:B, 1e2j:A, 1e2j:B, 1e2k:A, 1e2k:B, 1e2l:A, 1e2l:B, 1e2m:A, 1e2m:B, 1e2n:A, 1e2n:B, 1e2p:A, 1e2p:B, 3f0t:A, 3f0t:B, 4ivp:A, 4ivp:B, 4ivq:A, 4ivq:B, 4ivr:A, 4ivr:B, 4jbx:A, 4jbx:B, 4jby:A, 4jby:B, 1ki2:A, 1ki2:B, 1ki3:A, 1ki3:B, 1ki4:A, 1ki4:B, 1ki6:A, 1ki6:B, 1ki7:A, 1ki7:B, 1ki8:A, 1ki8:B, 1kim:A, 1kim:B, 2ki5:A, 2ki5:B, 1of1:A, 1of1:B, 4oql:A, 4oql:B, 4oqm:A, 4oqm:B, 4oqn:A, 4oqn:B, 4oqx:A, 4oqx:B, 1p7c:A, 1p7c:B, 1qhi:A, 1qhi:B, 3rdp:A, 1vtk:A, 2vtk:A, 3vtk:A
2	1p6x:A	333	331	0.4131	0.3784	0.3807	1.76e-72	1p6x:B, 1p72:A, 1p72:B, 1p73:A, 1p73:B, 1p73:C, 1p73:D, 1p75:A, 1p75:B, 1p75:C, 1p75:D
3	1osn:A	325	313	0.3016	0.2831	0.2939	8.21e-45	1osn:B, 1osn:C, 1osn:D
4	2cks:B	306	75	0.0721	0.0719	0.2933	4.4	2ckr:B, 2ckr:A, 2cks:A
5	8arv:A	255	86	0.0754	0.0902	0.2674	6.3	8arv:B
6	4mrn:A	600	59	0.0623	0.0317	0.3220	7.5	4mrn:B, 4mrp:A, 4mrp:B, 4mrr:A, 4mrr:B, 4mrs:A, 4mrs:B, 4mrv:A, 4mrv:B, 6pam:A, 6pam:B, 6pam:C, 6pam:D, 6pam:E, 6pam:F, 6pam:G, 6pam:H, 6pan:A, 6pan:B, 6pao:A, 6pao:B, 6paq:A, 6paq:B, 6par:A, 6par:B, 6par:C, 6par:D, 6par:E, 6par:F, 6vqt:A, 6vqt:B
7	1g29:1	372	166	0.1213	0.0995	0.2229	7.6	1g29:2
8	7x5h:R	274	38	0.0492	0.0547	0.3947	8.0	7um4:A, 7um5:A, 7um6:A, 7um7:A
9	6ybh:D	219	48	0.0492	0.0685	0.3125	8.4	1j90:A, 1j90:B, 2jcs:A, 2jcs:B, 2jj8:A, 2jj8:B, 2jj8:C, 2jj8:D, 1oe0:A, 1oe0:B, 1oe0:C, 1oe0:D, 1ot3:A, 1ot3:B, 1ot3:C, 1ot3:D, 1ot3:E, 1ot3:F, 1ot3:G, 1ot3:H, 2vp0:A, 2vp0:B, 2vp2:A, 2vp2:B, 2vp4:A, 2vp4:B, 2vp4:C, 2vp4:D, 2vp5:A, 2vp5:B, 2vp6:A, 2vp6:B, 2vp6:C, 2vp6:D, 2vp6:E, 2vp6:F, 2vp6:G, 2vp6:H, 2vp9:A, 2vp9:B, 2vp9:C, 2vp9:D, 2vp9:E, 2vp9:F, 2vp9:G, 2vp9:H, 2vpp:A, 2vpp:B, 2vqs:A, 2vqs:B, 2vqs:C, 2vqs:D, 6ybh:A, 6ybh:B, 6ybh:C, 6ybh:E, 6ybh:F, 1zm7:A, 1zm7:B, 1zm7:C, 1zm7:D, 1zmx:A, 1zmx:B, 1zmx:C, 1zmx:D, 1zmx:E, 1zmx:F, 1zmx:G, 1zmx:H
10	2b51:A	444	61	0.0557	0.0383	0.2787	8.5	2b56:A

[Back]