Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MPLCLKINKKHGEQTRRILIENNLLNKDYKITSEGNYLYLPIKDVDEDILKSILNIEFELVDKELEEKKIIKKPSFREII
SKKYRKEIDEGLISLSYDVVGDLVILQISDEVDEKIRKEIGELAYKLIPCKGVFRRKSEVKGEFRVRELEHLAGENRTLT
IHKENGYRLWVDIAKVYFSPRLGGERARIMKKVSLNDVVVDMFAGVGPFSIACKNAKKIYAIDINPHAIELLKKNIKLNK
LEHKIIPILSDVREVDVKGNRVIMNLPKFAHKFIDKALDIVEEGGVIHYYTIGKDFDKAIKLFEKKCDCEVLEKRIVKSY
APREYILALDFKINKK

The query sequence (length=336) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2zzn:A 336 336 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 3ay0:A, 2yx1:A, 2zzm:A, 2zzn:B
2 3ay0:B 314 335 0.9345 1.0000 0.9373 0.0 2yx1:B
3 5hji:A 349 354 0.3274 0.3152 0.3107 1.75e-29 5hjk:A, 5hjm:A, 5wt1:A, 5wt1:B, 5wt3:A
4 3a27:A 219 191 0.2232 0.3425 0.3927 3.04e-27
5 3a25:A 264 277 0.2679 0.3409 0.3249 7.38e-27 3a26:A
6 2vs1:A 398 113 0.0982 0.0829 0.2920 7.11e-06 2jjq:A
7 5xj2:A 454 49 0.0476 0.0352 0.3265 0.001 5xj2:B, 5xj2:C, 5xj2:D, 5zq0:A, 5zq1:A, 5zq8:B, 5zq8:A, 5zth:A
8 8x3w:A 270 108 0.1131 0.1407 0.3519 0.002 8x3w:B, 8x41:A, 8x41:B, 8x44:A, 8x44:B, 8x45:A, 8x45:B, 8x46:A, 8x46:B, 8x47:A, 8x4i:A, 8x4l:A, 8x4l:B, 8x4o:A, 8x4o:B, 8x4p:A, 8x4p:B
9 1l3i:A 186 61 0.0565 0.1022 0.3115 0.016 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
10 3gdh:A 211 56 0.0655 0.1043 0.3929 0.065 3egi:A, 3egi:B, 3egi:C, 3egi:D, 3gdh:B, 3gdh:C
11 7qos:A 352 154 0.1131 0.1080 0.2468 0.093 7qos:B
12 2bh2:A 418 107 0.0833 0.0670 0.2617 0.13 2bh2:B, 1uwv:A
13 7wm6:A 240 69 0.0655 0.0917 0.3188 0.26 7wm6:C, 7wm6:D
14 5u1e:A 321 98 0.0714 0.0748 0.2449 0.43 5tyq:A, 5u0n:A, 5u0t:A, 5u18:A, 5u19:A, 5u1i:A, 5u4t:A
15 3grr:A 263 160 0.1190 0.1521 0.2500 0.51 3gru:A, 3grv:A, 3gry:A
16 6wvv:K 440 136 0.1131 0.0864 0.2794 1.4
17 3axs:A 387 77 0.0685 0.0594 0.2987 1.8 3axt:A
18 3dlc:A 219 92 0.0714 0.1096 0.2609 1.8
19 5hfj:C 204 23 0.0327 0.0539 0.4783 2.5 5hfj:A, 5hfj:B, 5hfj:D, 5hfj:E, 5hfj:F, 5hfj:G, 5hfj:H
20 5bp9:A 237 37 0.0387 0.0549 0.3514 2.8
21 8if3:A 917 74 0.0536 0.0196 0.2432 3.4
22 7c9k:B 233 49 0.0417 0.0601 0.2857 3.5 7c9k:A
23 6dzi:O 118 24 0.0357 0.1017 0.5000 3.5 6dzp:O, 7f0d:N, 8fr8:J, 8kab:O, 7kgb:N, 7msc:N, 7msh:N, 7msm:N, 7msz:N, 7mt2:N, 7mt3:N, 7mt7:N, 5o60:O, 5o61:O, 7s0s:P, 7sfr:N, 5v7q:N, 5v93:N, 8v9j:P, 8v9k:P, 8v9l:P, 8whx:Q, 8why:Q, 8wi7:Q, 8wi8:Q, 8wib:Q, 8wic:Q, 7xam:O, 5xym:N, 8xz3:O, 7y41:O, 5zeb:O, 5zep:O, 5zet:O
24 1f3l:A 321 82 0.0774 0.0810 0.3171 4.7 2fyt:A, 8g2f:A, 8g2g:A, 8g2g:B, 4hsg:A, 4qqn:A, 4ryl:A, 8shb:A, 8shr:A, 8sio:A, 8sio:B, 3smq:A
25 5aa0:BZ 605 108 0.0952 0.0529 0.2963 6.9 5a9z:CA, 4zck:A, 4zcl:A, 4zcl:B, 4zcm:A, 4zcm:B
26 5eku:B 347 57 0.0476 0.0461 0.2807 7.3 5eku:A, 4m37:A, 4m38:A, 4m38:B
27 3lby:A 176 133 0.0982 0.1875 0.2481 8.2
28 3nzp:B 591 62 0.0655 0.0372 0.3548 8.3 3nzp:A
29 7bo7:AAA 625 64 0.0565 0.0304 0.2969 8.9 7boc:A, 5c9z:A, 6ckc:A, 8csg:A, 8ctb:A, 8cyi:A, 5emj:A, 5emk:A, 5eml:A, 5emm:A, 9eyu:A, 9eyv:A, 9eyw:A, 9eyx:A, 5fa5:A, 8g1u:A, 8g1u:E, 8g1u:I, 8g1u:M, 4gqb:A, 6k1s:A, 7kib:A, 7kic:A, 7kid:A, 7l1g:A, 7m05:A, 7m05:C, 7m05:E, 7m05:G, 7mx7:A, 7mxa:A, 7mxc:A, 7mxg:A, 7mxg:C, 7mxn:A, 6rll:A, 6rlq:A, 7s0u:A, 7s1p:A, 7s1q:A, 7s1r:A, 7s1s:A, 7ser:A, 7ses:A, 7u30:A, 7uoh:A, 6uxx:A, 6uxy:A, 7uy1:A, 7uyf:A, 6v0n:A, 6v0o:A, 6v0p:A, 8veo:A, 8vet:A, 8veu:A, 8vew:A, 8vex:A, 8vey:A, 4x60:A, 4x61:A, 4x63:A, 7zup:A, 7zuq:A, 7zuu:A, 7zuy:A, 7zv2:A, 7zvl:A, 7zvu:A
30 5fad:A 160 77 0.0655 0.1375 0.2857 9.4 5fa8:A
31 5dhi:A 536 32 0.0327 0.0205 0.3438 9.8 5dhk:A, 4di5:A, 5eas:A, 5eat:A, 5eau:A, 1hx9:A, 1hxa:A, 1hxc:A, 1hxg:A, 5ik0:A, 5ik6:A, 5ik9:A, 5ika:A, 5ikh:A, 5il3:A, 5il8:A, 5ild:A, 5ilh:A, 5ili:A, 5ily:A, 3lz9:A, 3m00:A, 3m01:A, 3m02:A, 4rnq:A
32 2ejt:A 371 73 0.0625 0.0566 0.2877 9.9 2eju:A, 2ytz:A, 2ytz:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218