Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MPKRTDIKSILILGAGPIVIGQACEFDYSGAQACKALREEGYRVINVNSNPATIMTDPEMADATYIEPIHWEVVRKIIEK
ERPDAVLPTMGGQTALNCALELERQGVLEEFGVTMIGATADAIDKAEDRRRFDVAMKKIGLETARSGIAHTMEEALAVAA
DVGFPCIIRPSFTMGGSGGGIAYNREEFEEICARGLDLSPTKELLIDESLIGWKEYEMEVVRDKNDNCIIVCSIENFDAM
GIHTGDSITVAPAQTLTDKEYQIMRNASMAVLREIGVETGGSNVQFAVNPKNGRLIVIEMNPRVSRSSALASKATGFPIA
KVAAKLAVGYTLDELMNDITGGRTPASFEPSIDYVVTKIPRFNFEKFAGANDRLTTQMKSVGEVMAIGRTQQESLQKALR
GLEVGATGFDPKVSLDDPEALTKIRRELKDAGADRIWYIADAFRAGLSVDGVFNLTNIDRWFLVQIEELVRLEEKVAEVG
ITGLNADFLRQLKRKGFADARLAKLAGVREAEIRKLRDQYDLHPVYKRVDTCAAEFATDTAYMYSTYEEECEANPSTDRE
KIMVLGGGPNRIGQGIEFDYCCVHASLALREDGYETIMVNCNPETVSTDYDTSDRLYFEPVTLEDVLEIVRIEKPKGVIV
QYGGQTPLKLARALEAAGVPVIGTSPDAIDRAEDRERFQHAVERLKLKQPANATVTAIEMAVEKAKEIGYPLVVRPAMEI
VYDEADLRRYFQTAVLLDHFLDDAVEVDVDAICDGEMVLIGGIMEHIEQAGVHSGDSACSLPAYTLSQEIQDVMRQQVQK
LAFELQVRGLMNVQFAVKNNEVYLIEVNPRAARTVPFVSKATGVPLAKVAARVMAGKSLAEQGVTKEVIPPYYSVKEVVL
PFNKFPGVDPLLGPEMRSTGEVMGVGRTFAEAFAKAQLGSNSTMKKHGRALLSVREGDKERVVDLAAKLLKQGFELDATH
GTAIVLGEAGINPRLVNKVHEGRPHIQDRIKNGEYTYIINTTSGRRAIEDSRVIRRSALQYKVHYDTTLNGGFATAMALN
ADATEKVISVQEMHAQIK

The query sequence (length=1058) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1bxr:A 1073 1073 0.9991 0.9851 0.9851 0.0 1a9x:A, 1a9x:C, 1a9x:E, 1a9x:G, 1bxr:C, 1bxr:E, 1bxr:G, 1c30:A, 1c30:C, 1c30:E, 1c30:G, 1c3o:A, 1c3o:C, 1c3o:E, 1c3o:G, 1ce8:A, 1ce8:C, 1ce8:E, 1ce8:G, 1cs0:A, 1cs0:C, 1cs0:E, 1cs0:G, 1jdb:B, 1jdb:E, 1jdb:H, 1jdb:K, 1kee:A, 1kee:C, 1kee:E, 1kee:G, 1m6v:A, 1m6v:C, 1m6v:E, 1m6v:G, 1t36:A, 1t36:C, 1t36:E, 1t36:G
2 5dou:D 1430 1039 0.3960 0.2930 0.4033 0.0 5dou:A, 5dou:B, 5dou:C, 6w2j:A
3 6w2j:B 1364 832 0.3204 0.2485 0.4075 0.0
4 6w2j:B 1364 406 0.1115 0.0865 0.2906 2.74e-41
5 6w2j:B 1364 375 0.1125 0.0872 0.3173 2.00e-38
6 6w2j:B 1364 145 0.0586 0.0455 0.4276 7.94e-29
7 6uel:A 1333 832 0.3157 0.2506 0.4014 0.0 6uel:B
8 6uel:A 1333 406 0.1096 0.0870 0.2857 1.49e-37 6uel:B
9 6uel:A 1333 404 0.1134 0.0900 0.2970 7.19e-35 6uel:B
10 6uel:A 1333 142 0.0577 0.0458 0.4296 5.74e-30 6uel:B
11 7kct:A 453 243 0.0643 0.1501 0.2798 1.51e-12 7kbl:A, 7kbl:B, 7kc7:A, 7kct:B
12 7kct:A 453 243 0.0520 0.1214 0.2263 1.01e-05 7kbl:A, 7kbl:B, 7kc7:A, 7kct:B
13 3n6r:G 646 266 0.0605 0.0991 0.2406 2.30e-10 3n6r:I, 3n6r:K
14 3n6r:G 646 242 0.0529 0.0867 0.2314 3.27e-06 3n6r:I, 3n6r:K
15 2vqd:A 447 193 0.0491 0.1163 0.2694 6.14e-10
16 2vqd:A 447 332 0.0775 0.1834 0.2470 1.71e-09
17 7ybu:A 670 335 0.0794 0.1254 0.2507 2.03e-09 7ybu:B, 7ybu:D, 7ybu:F, 7ybu:H, 7ybu:J
18 7ybu:A 670 264 0.0567 0.0896 0.2273 1.72e-05 7ybu:B, 7ybu:D, 7ybu:F, 7ybu:H, 7ybu:J
19 1dv1:B 428 168 0.0388 0.0958 0.2440 1.68e-08
20 1dv1:B 428 239 0.0520 0.1285 0.2301 0.014
21 3bg5:A 1137 234 0.0539 0.0501 0.2436 3.03e-07 3bg5:C, 8gk8:A, 8gk8:B, 3hb9:A, 3hb9:C, 3hbl:A, 3hbl:C, 4hnt:A, 4hnt:C, 4hnu:A, 4hnu:C, 4hnv:A, 4hnv:C
22 3bg5:A 1137 264 0.0567 0.0528 0.2273 0.001 3bg5:C, 8gk8:A, 8gk8:B, 3hb9:A, 3hb9:C, 3hbl:A, 3hbl:C, 4hnt:A, 4hnt:C, 4hnu:A, 4hnu:C, 4hnv:A, 4hnv:C
23 5vyz:A 1144 189 0.0435 0.0402 0.2434 3.58e-06 5vyw:D, 5vyz:B, 5vyz:D, 5vz0:A, 5vz0:B, 5vz0:D, 7zyy:A, 7zyy:C, 7zyy:B, 7zyy:D, 7zyz:A, 7zz0:A, 7zz1:A, 7zz2:A, 7zz3:A, 7zz3:C, 7zz3:B, 7zz3:D, 7zz4:A, 7zz5:A, 7zz6:D, 7zz6:A, 7zz8:A, 7zz8:C, 7zz8:D, 7zz8:B
24 5vyz:A 1144 200 0.0406 0.0376 0.2150 0.001 5vyw:D, 5vyz:B, 5vyz:D, 5vz0:A, 5vz0:B, 5vz0:D, 7zyy:A, 7zyy:C, 7zyy:B, 7zyy:D, 7zyz:A, 7zz0:A, 7zz1:A, 7zz2:A, 7zz3:A, 7zz3:C, 7zz3:B, 7zz3:D, 7zz4:A, 7zz5:A, 7zz6:D, 7zz6:A, 7zz8:A, 7zz8:C, 7zz8:D, 7zz8:B
25 8sgx:X 657 248 0.0529 0.0852 0.2258 6.04e-06 8sgx:S, 8sgx:Z, 8sgx:V, 8sgy:V, 8sgy:B, 8sgy:S, 8sgy:Z, 8sgy:Y, 8sgz:V, 8sgz:Z, 8sgz:X, 8sgz:S, 8sgz:B, 8sgz:Y
26 8sgx:X 657 238 0.0463 0.0746 0.2059 0.22 8sgx:S, 8sgx:Z, 8sgx:V, 8sgy:V, 8sgy:B, 8sgy:S, 8sgy:Z, 8sgy:Y, 8sgz:V, 8sgz:Z, 8sgz:X, 8sgz:S, 8sgz:B, 8sgz:Y
27 4rzq:A 422 220 0.0473 0.1185 0.2273 1.64e-05 4mv6:A, 4mv7:A, 4mv9:A
28 4rzq:A 422 256 0.0577 0.1445 0.2383 6.01e-05 4mv6:A, 4mv7:A, 4mv9:A
29 3ouu:A 446 238 0.0463 0.1099 0.2059 2.50e-05 3ouu:B, 3ouz:A, 3ouz:B
30 3ouu:A 446 243 0.0520 0.1233 0.2263 5.72e-04 3ouu:B, 3ouz:A, 3ouz:B
31 1dv2:A 450 186 0.0378 0.0889 0.2151 2.84e-05 1dv1:A, 1dv2:B, 3g8c:A, 3g8c:B, 3g8d:B, 2j9g:A, 2j9g:B, 3jzf:B, 3jzi:A, 3jzi:B, 6oi9:A, 6oi9:B, 3rup:A, 3rup:B, 3rv3:A, 3rv3:B, 3rv4:A, 2v58:A, 2v58:B, 2v59:A, 2v59:B, 2v5a:A, 2vr1:A, 2w6m:A, 2w6m:B, 2w6n:A, 2w6n:B, 2w6o:A, 2w6o:C, 2w6p:A, 2w6q:A, 2w6q:B, 2w6z:A, 2w70:A, 2w70:B, 2w71:A, 2w71:C
32 1dv2:A 450 243 0.0529 0.1244 0.2305 0.15 1dv1:A, 1dv2:B, 3g8c:A, 3g8c:B, 3g8d:B, 2j9g:A, 2j9g:B, 3jzf:B, 3jzi:A, 3jzi:B, 6oi9:A, 6oi9:B, 3rup:A, 3rup:B, 3rv3:A, 3rv3:B, 3rv4:A, 2v58:A, 2v58:B, 2v59:A, 2v59:B, 2v5a:A, 2vr1:A, 2w6m:A, 2w6m:B, 2w6n:A, 2w6n:B, 2w6o:A, 2w6o:C, 2w6p:A, 2w6q:A, 2w6q:B, 2w6z:A, 2w70:A, 2w70:B, 2w71:A, 2w71:C
33 7wtb:B 1147 352 0.0699 0.0645 0.2102 4.55e-05 3bg3:A, 3bg3:B, 3bg3:C, 3bg3:D, 3bg9:A, 3bg9:B, 3bg9:C, 3bg9:D, 8j7o:A, 8j7o:B, 8j7o:C, 8j7o:E, 7wta:C, 7wta:B, 7wta:D, 7wta:A, 7wtb:C, 7wtb:A, 7wtb:D, 7wtc:C, 7wtc:A, 7wtc:B, 7wtc:D, 7wtd:C, 7wtd:D, 7wte:C, 7wte:D
34 7wtb:B 1147 325 0.0671 0.0619 0.2185 7.70e-04 3bg3:A, 3bg3:B, 3bg3:C, 3bg3:D, 3bg9:A, 3bg9:B, 3bg9:C, 3bg9:D, 8j7o:A, 8j7o:B, 8j7o:C, 8j7o:E, 7wta:C, 7wta:B, 7wta:D, 7wta:A, 7wtb:C, 7wtb:A, 7wtb:D, 7wtc:C, 7wtc:A, 7wtc:B, 7wtc:D, 7wtd:C, 7wtd:D, 7wte:C, 7wte:D
35 2vpq:B 448 241 0.0473 0.1116 0.2075 5.36e-05 2vpq:A
36 2vpq:B 448 246 0.0463 0.1094 0.1992 0.11 2vpq:A
37 6ojh:A 445 240 0.0482 0.1146 0.2125 7.09e-05 4mv1:A, 4mv3:A, 4mv4:A, 4mv8:A, 6oi8:A
38 6ojh:A 445 263 0.0586 0.1393 0.2357 1.86e-04 4mv1:A, 4mv3:A, 4mv4:A, 4mv8:A, 6oi8:A
39 3tw6:B 1129 227 0.0454 0.0425 0.2115 5.11e-04 4jx4:A, 4jx4:B, 4jx4:C, 4jx4:D, 4jx5:A, 4jx5:B, 4jx5:C, 4jx5:D, 4jx6:A, 4jx6:B, 4jx6:C, 4jx6:D, 4loc:A, 4loc:B, 4loc:C, 4loc:D, 4m6v:A, 4m6v:B, 4m6v:C, 4m6v:D, 4mfd:A, 4mfd:B, 4mfd:C, 4mfd:D, 4mfe:A, 4mfe:B, 4mfe:C, 4mfe:D, 4mim:A, 4mim:B, 4mim:C, 4mim:D, 3tw6:C, 3tw6:D
40 5csl:B 2072 227 0.0435 0.0222 0.2026 5.15e-04 5ctb:A, 5ctb:C, 5ctc:A, 5ctc:B, 5ctc:C, 5cte:B, 5cte:C, 3h0s:A, 3k8x:A, 3k8x:B, 3k8x:C, 1od2:A, 1od2:B, 3pgq:A, 3pgq:C, 3tv5:A, 3tv5:B, 3tv5:C, 3tvu:A, 3tvu:B, 3tvu:C, 3tvw:A, 3tvw:B, 3tvw:C, 3tz3:A, 3tz3:B, 3tz3:C, 1w96:A, 1w96:B, 1w96:C, 4wyo:B, 4wyo:C, 4wz8:B, 4wz8:C
41 3jzf:A 380 79 0.0227 0.0632 0.3038 5.67e-04
42 8hwl:A 941 241 0.0491 0.0553 0.2158 6.71e-04 8hwl:B, 8hwl:C, 8hwl:E
43 8hwl:A 941 253 0.0539 0.0606 0.2253 0.001 8hwl:B, 8hwl:C, 8hwl:E
44 8evy:B 317 98 0.0293 0.0978 0.3163 0.002 8evy:A, 8evy:C, 8evz:A, 8evz:B, 8evz:C
45 8evy:B 317 78 0.0217 0.0726 0.2949 2.4 8evy:A, 8evy:C, 8evz:A, 8evz:B, 8evz:C
46 3jrx:A 496 213 0.0416 0.0887 0.2066 0.003 5kkn:B, 5kkn:C
47 3r5x:C 284 259 0.0548 0.2042 0.2239 0.003
48 1uc9:A 256 71 0.0227 0.0938 0.3380 0.005 1uc9:B
49 1uc9:A 256 50 0.0142 0.0586 0.3000 0.82 1uc9:B
50 3vpd:A 281 71 0.0227 0.0854 0.3380 0.006 3vpd:B
51 3vpd:A 281 56 0.0151 0.0569 0.2857 0.94 3vpd:B
52 2dwc:B 409 95 0.0227 0.0587 0.2526 0.023 2dwc:A
53 1eyz:A 389 119 0.0265 0.0720 0.2353 0.025 1eyz:B, 1ez1:A, 1ez1:B, 1kj8:A, 1kj8:B, 1kj9:A, 1kj9:B, 1kji:A, 1kji:B, 1kjj:A, 1kjj:B, 1kjq:A, 1kjq:B
54 8evx:B 305 165 0.0397 0.1377 0.2545 0.044
55 8evx:B 305 181 0.0416 0.1443 0.2431 5.1
56 5vyz:C 1083 78 0.0217 0.0212 0.2949 0.10 5vyw:A, 5vyw:B, 5vyw:C, 5vz0:C
57 5vyz:C 1083 123 0.0293 0.0286 0.2520 0.22 5vyw:A, 5vyw:B, 5vyw:C, 5vz0:C
58 8evw:B 326 170 0.0425 0.1380 0.2647 0.12 8evw:A, 8evx:A
59 8evw:B 326 181 0.0416 0.1350 0.2431 5.9 8evw:A, 8evx:A
60 3ho8:D 934 125 0.0284 0.0321 0.2400 0.19
61 3ho8:D 934 75 0.0217 0.0246 0.3067 0.38
62 4hnv:B 1033 125 0.0284 0.0290 0.2400 0.23 8gk8:D
63 4hnv:B 1033 75 0.0217 0.0223 0.3067 0.49 8gk8:D
64 3bg5:B 1074 125 0.0284 0.0279 0.2400 0.24 3bg5:D, 8gk8:C, 3hb9:B, 3hb9:D, 3hbl:B, 3hbl:D, 4hnt:B, 4hnt:D, 4hnu:B, 4hnu:D, 4hnv:D, 3ho8:A, 3ho8:C, 3ho8:B
65 3bg5:B 1074 75 0.0217 0.0214 0.3067 0.47 3bg5:D, 8gk8:C, 3hb9:B, 3hb9:D, 3hbl:B, 3hbl:D, 4hnt:B, 4hnt:D, 4hnu:B, 4hnu:D, 4hnv:D, 3ho8:A, 3ho8:C, 3ho8:B
66 7lgm:A 719 99 0.0265 0.0389 0.2828 0.28 7lgm:B
67 7lgm:A 719 106 0.0236 0.0348 0.2358 0.63 7lgm:B
68 8j78:I 651 171 0.0369 0.0599 0.2281 0.29 8j78:C, 8j7d:D, 8j7d:F, 8j7d:I, 8j7d:L, 8jaw:A, 8jaw:C, 8jaw:E, 8jaw:F, 8jaw:H, 8jaw:K, 8k2v:A, 8k2v:B, 8k2v:C, 8k2v:D, 8k2v:E, 8k2v:F
69 3r5x:D 306 263 0.0539 0.1863 0.2167 0.29 3r5x:A, 3r5x:B
70 4qsh:C 1081 138 0.0293 0.0287 0.2246 0.32 4qsh:A, 4qsh:D, 4qsh:B, 4qsk:A, 4qsk:B
71 4qsh:C 1081 104 0.0227 0.0222 0.2308 1.4 4qsh:A, 4qsh:D, 4qsh:B, 4qsk:A, 4qsk:B
72 3vmm:A 471 144 0.0312 0.0701 0.2292 0.34 3wnz:A, 3wo0:A, 3wo1:A
73 3vmm:A 471 67 0.0189 0.0425 0.2985 2.3 3wnz:A, 3wo0:A, 3wo1:A
74 5csl:A 2050 210 0.0388 0.0200 0.1952 0.98
75 3va7:A 1130 97 0.0246 0.0230 0.2680 1.3
76 4qrn:A 352 87 0.0198 0.0597 0.2414 1.5 4inf:A, 4inf:B, 4inf:C, 4inf:D, 4qrn:B, 4qrn:C, 4qrn:D, 4qs5:A, 4qs5:B, 4qs5:C, 4qs5:D, 4qs6:A, 4qs6:B, 4qtg:A, 4qtg:B
77 1frv:A 262 52 0.0180 0.0725 0.3654 1.9 1frv:C, 2frv:S, 2frv:A, 2frv:C, 2frv:E, 2frv:G, 2frv:I, 1yq9:A, 1yq9:B
78 2yw2:A 423 116 0.0293 0.0733 0.2672 2.0 2yw2:B
79 3n6r:A 591 102 0.0255 0.0457 0.2647 2.4 3n6r:C, 3n6r:E
80 8fxi:C 630 63 0.0142 0.0238 0.2381 2.8 8fxi:D
81 8hz4:A 456 240 0.0454 0.1053 0.2000 3.2 8hz4:B, 8hz4:C, 8hz4:D
82 8rth:A 666 194 0.0378 0.0601 0.2062 3.5 8rth:C, 8rth:E, 8rth:G, 8rth:I, 8rth:K
83 2qf7:B 1017 112 0.0217 0.0226 0.2054 4.3 3tw7:A, 3tw7:B
84 2qf7:A 1076 112 0.0217 0.0214 0.2054 4.6 3tw6:A
85 7cvx:B 220 59 0.0198 0.0955 0.3559 5.0 7cvv:A, 7cvv:B, 7cvv:C, 7cvw:A, 7cvw:B, 7cvx:A
86 8hz5:A 350 238 0.0491 0.1486 0.2185 5.1
87 8apq:A 406 55 0.0170 0.0443 0.3273 6.3 8apq:B, 8apq:C, 8apq:D, 8apq:E, 8apq:F

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218