BioLiP

>protein
MPKLQEMMTIVSQREVASNIFEMVLKGELVEEMDLPGQFLHLAVPNASMLLRRPISISSWDKVAKTCTILYRIGDETSGT
YEISKLQSGAKIDVMGPLGNGFPVDEVVSTDKILIVGGGIGVPPLYELAKQLEEKNCQMTILLGFASEKVKILEKEFAEL
KNVSLKIATDDGSYGTKGHVGMLMEEIDFEVDALYTCGAPAMLKAVAKKYEQLERLYISMESRMACGIGACYACVEHDKE
DENHALKVCEDGPVFLGKQLLL

The query sequence (length=262) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5ksw:B	262	262	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5ksw:D, 5ue9:B, 5ue9:D
2	1ep1:B	261	260	0.8855	0.8889	0.8923	1.85e-168	1ep2:B, 1ep3:B
3	4ylf:A	276	257	0.2977	0.2826	0.3035	1.00e-22	4ylf:C, 4yry:A, 4yry:C
4	5jca:S	279	260	0.2672	0.2509	0.2692	4.33e-11	5jfc:S
5	8x2l:B	525	102	0.1107	0.0552	0.2843	3.27e-06	7u8g:A
6	5vj7:B	282	268	0.2481	0.2305	0.2425	4.92e-06
7	8wej:B	569	110	0.1145	0.0527	0.2727	6.13e-05	8gz3:B, 8kei:B
8	1krh:A	337	185	0.1679	0.1306	0.2378	1.63e-04	1krh:B
9	8u87:A	621	102	0.0992	0.0419	0.2549	2.29e-04	8u7y:A, 8u7y:B, 8u85:A, 8u85:C, 8u86:A, 8u86:C, 8u87:C
10	2pia:A	321	209	0.1985	0.1620	0.2488	4.82e-04
11	7qty:A	279	150	0.1450	0.1362	0.2533	0.001	7qu0:A
12	5ogx:A	333	190	0.1718	0.1351	0.2368	0.001
13	5o0x:A	261	117	0.1069	0.1073	0.2393	0.002	8cak:A, 8cal:A, 8cao:A, 8cap:A, 8cap:E, 8cap:B, 8cap:C, 8cb0:A
14	8qq7:A	399	139	0.1260	0.0827	0.2374	0.009	8qq1:C, 8qq1:F, 8qq1:G, 8qq5:A, 8qq5:B, 8qq5:C, 8qt6:A, 8qt7:A, 8qt9:A, 8qta:A
15	4wqm:A	326	215	0.1832	0.1472	0.2233	0.057
16	6laa:A	753	137	0.1107	0.0385	0.2117	0.064	6gii:A, 6ldl:A
17	7rom:A	255	143	0.1298	0.1333	0.2378	0.086
18	7ylr:A	326	112	0.1069	0.0859	0.2500	0.097
19	6kbh:A	765	148	0.1183	0.0405	0.2095	0.22
20	7d3e:C	1380	170	0.1527	0.0290	0.2353	0.22	7d3e:A, 7d3f:C, 7d3f:A
21	2r6h:C	289	179	0.1794	0.1626	0.2626	0.36	2r6h:A, 2r6h:B, 2r6h:D
22	1ozv:B	441	104	0.0992	0.0590	0.2500	0.42	2h21:A, 2h21:B, 2h21:C, 2h23:A, 2h23:B, 2h23:C, 2h2e:A, 2h2e:B, 2h2e:C, 2h2j:A, 2h2j:B, 2h2j:C, 1mlv:A, 1mlv:B, 1mlv:C, 1ozv:A, 1ozv:C, 1p0y:A, 1p0y:B, 1p0y:C
23	5yly:B	269	145	0.1336	0.1301	0.2414	0.56	5yly:A
24	2eix:A	243	177	0.1489	0.1605	0.2203	2.0	2eix:B
25	6yw5:CC	438	74	0.0725	0.0434	0.2568	3.0	6ywe:CC, 6ywx:CC, 6ywy:CC
26	1cne:A	260	90	0.0802	0.0808	0.2333	3.8	1cnf:A, 2cnd:A
27	8dp2:A	446	57	0.0763	0.0448	0.3509	3.8	7u35:A, 7u35:B, 7u35:C
28	4yhb:B	262	55	0.0534	0.0534	0.2545	3.9	4yhb:A
29	5iz8:A	343	108	0.1145	0.0875	0.2778	4.7	5b6g:A, 7f6m:A, 7f7o:A, 8gsj:A, 5iz6:A, 5iz8:B, 5iz9:A, 5iza:A, 3nmx:A, 3nmx:B, 3nmx:C, 3qhe:A, 3qhe:C, 4yje:A, 4yjl:A, 4yjl:C, 4yjl:D, 4yjl:E, 4yjl:B, 4yjl:F, 4yk6:A, 5z8h:A
30	1n1e:A	349	38	0.0611	0.0458	0.4211	6.1	1evz:A, 1jdj:A, 1m66:A, 1m67:A, 1n1e:B, 1n1g:A
31	4g1b:A	398	135	0.1260	0.0829	0.2444	6.3	4g1b:B, 4g1b:C, 4g1b:D, 4g1v:A
32	5u4j:v	132	60	0.0687	0.1364	0.3000	6.8
33	7stm:A	801	133	0.1336	0.0437	0.2632	7.9	7stm:B, 7stn:A, 7stn:B, 7sto:B, 7sto:A
34	6c4i:v	362	65	0.0763	0.0552	0.3077	8.2	6c4h:v, 5czp:XY, 5czp:QY, 5dfe:QY, 5dfe:XY, 5h5u:4, 5mdv:7, 5mdw:7, 5mgp:z, 1ml5:Z, 7o1c:B9, 6og7:8, 6ogf:8, 6ogg:8, 7oj0:8, 6ost:7, 6ot3:A, 6ouo:A, 8p16:6, 8p17:6, 8p18:6, 8qk7:6, 5u4i:v, 5u9f:Z, 5u9g:Z
35	3q9o:A	605	121	0.1145	0.0496	0.2479	8.7	3ess:A, 3ki0:A, 3ki1:A, 3ki2:A, 3ki3:A, 3ki4:A, 3ki5:A, 3ki6:A, 3ki7:A, 3ny6:A, 2q6m:A

[Back]