BioLiP

>protein
MPIVVTQAHIDRVGIAADLLDASPVSLQVLGRPTAINTVVIKTYIAAVMELASKQGGSLAGVDIRPSVLLKDTAIFTADV
ESDVDVLDTGIYSVPGLARKPVTHRWPSEGIYSGVTALMGATGSGKSITLNEKLRPDVLIRWGEVAEAYDELDTAVHIST
LDEMLIVCIGLGALGFNVAVDSVRPLLFRLKGAASAGGIVAVFYSLLTDISNLFTQYDCSVVMVVNPMVDAEKIEYVFGQ
VMASTVGAILCADGNVSRTMFRTNKGRIFN

The query sequence (length=270) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4blo:L	275	270	1.0000	0.9818	1.0000	0.0	4blo:A, 4blo:B, 4blo:C, 4blo:H, 4blo:D, 4blo:E, 4blo:F, 4blo:G, 4blo:I, 4blo:J, 4blo:K, 5muv:A, 5muv:L, 5muv:B, 5muv:I, 5muv:J, 5muv:K, 5muw:A, 5muw:L, 5muw:B, 5muw:I, 5muw:J, 5muw:K
2	4do4:B	400	58	0.0815	0.0550	0.3793	0.030	4do4:A, 4do5:A, 4do5:B, 4do6:A, 4do6:B, 3h55:A, 3h55:B, 3igu:A, 3igu:B
3	5hnw:K	329	77	0.0963	0.0790	0.3377	0.65	5hle:A, 5hny:K, 3x2t:B
4	3x2t:A	311	77	0.0963	0.0836	0.3377	0.81	2kin:A, 3kin:A, 3kin:C
5	4uy0:C	333	77	0.0889	0.0721	0.3117	1.6
6	2xt3:A	300	63	0.0815	0.0733	0.3492	1.9	4a14:A
7	5e9a:B	684	67	0.0778	0.0307	0.3134	2.6	5e9a:A, 5e9a:C, 5e9a:D, 5e9a:E, 5e9a:F
8	3r75:B	622	103	0.1074	0.0466	0.2816	2.6	3r75:A, 3r76:A, 3r76:B
9	8bx8:C	3947	51	0.0667	0.0046	0.3529	2.9	7k58:C, 7k5b:C, 7kek:C
10	8h52:A	398	55	0.0556	0.0377	0.2727	2.9
11	2px0:A	258	30	0.0481	0.0504	0.4333	3.4	2px0:B, 2px0:C, 2px0:D, 2px0:E, 2px0:F, 2px0:G, 2px0:H, 2px3:A, 3syn:A, 3syn:B, 3syn:C, 3syn:D
12	7mgm:A	2274	44	0.0556	0.0066	0.3409	3.5
13	8dzz:A	2363	44	0.0556	0.0063	0.3409	3.5	8dzz:D, 8e00:A
14	4w8f:B	2609	44	0.0556	0.0057	0.3409	3.6	220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
15	4ai6:A	2650	44	0.0556	0.0057	0.3409	3.6	4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
16	7dep:B	102	48	0.0704	0.1863	0.3958	3.6
17	7nac:n	425	30	0.0481	0.0306	0.4333	8.6	7btb:n, 6c0f:n, 6cb1:n, 6elz:n, 6em1:n, 6em3:n, 6em4:n, 6em5:n, 6ft6:n, 3jct:n, 6m62:n, 7ohq:n, 7ohr:n, 7ohs:n, 7ohv:n, 7ohw:n, 7r6q:n, 7r7a:n, 7u0h:n, 7uoo:n, 7uqb:n, 7uqz:n, 7v08:n, 8v83:n, 8v84:n, 8v87:n, 6ylx:n, 6yly:n, 5z3g:M

[Back]