BioLiP

>protein
MPHRTIHLFRKGLRLHDNPTLLAALESSETIYPVYVLDRRFLASAMHIGALRWHFLLQSLEDLHKNLSRLGARLLVIQGE
YESVLRDHVQKWNITQVTLDAEMEPFYKEMEANIRRLGAELGFEVLSRVGHSLYDTKRILDLNGGSPPLTYKRFLHILSQ
LGDPEVPVRNLTAEDFQRCMSPEPGLAERYRVPVPADLEIPPQSLSPWTGGETEGLRRLEQHLTDQGSTTGLSPYFSMGC
LSVRTFFQRLSNIYAQAKHHSLPPVSLQGQLLWREFFYTVASATQNFTQMAGNPICLQIHWYEDAERLHKWKTAQTGFPW
IDAIMTQLRQEGWIHHLARHAVACFLTRGDLWISWEEGMKVFEELLLDADYSINAGNWMWLSASAFFHHYTRIFCPVRFG
KRTDPEGQYIRKYLPVLKNFPTKYIYEPWTASEEEQRQAGCIIGRDYPFPMVNHKEASDRNLQLMRRVREEQRGTAQLTR

The query sequence (length=480) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6pu0:A	480	480	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6ptz:A
2	7d1c:A	491	483	0.5437	0.5316	0.5404	0.0	4ct0:A, 7d19:A, 7d19:B, 7dli:A, 7dli:B, 7dli:C, 6kx5:A, 6kx6:A, 6kx6:B, 6kx7:A, 6lue:A, 6lue:B, 7wva:A
3	4mlp:C	492	487	0.5229	0.5102	0.5154	0.0	7ej9:A, 7ej9:B, 4i6g:A, 4i6g:B, 6kx8:A, 6kx8:B, 4mlp:A, 4mlp:B, 4mlp:D, 4u8h:A, 4u8h:C, 7v8y:A, 7v8z:A
4	6fn0:A	496	489	0.5000	0.4839	0.4908	1.46e-163	6fn2:A, 6fn3:A, 5zm0:A
5	3cvv:A	519	490	0.4708	0.4355	0.4612	3.26e-152	7ayv:A, 7azt:A, 8c1u:A, 8c69:A, 8c6a:A, 8c6b:A, 8c6c:A, 8c6f:A, 8c6h:A, 3cvu:A, 3cvw:A, 3cvx:A, 3cvy:A, 7qut:A, 2wb2:A, 2wq6:A, 2wq7:A
6	3fy4:A	522	479	0.4583	0.4215	0.4593	4.87e-152	3fy4:B, 3fy4:C
7	8p4x:A	526	495	0.4271	0.3897	0.4141	2.96e-137	8p4x:B
8	6wtb:B	547	504	0.3875	0.3400	0.3690	1.69e-106	8dd7:A, 4gu5:A, 4gu5:B, 4jzy:A, 4jzy:B, 4k03:A, 4k03:B, 7ud0:A, 7ud0:B, 6wtb:A
9	4u63:A	482	481	0.2875	0.2863	0.2869	2.76e-57
10	6kii:A	485	492	0.3104	0.3072	0.3028	5.96e-55
11	1np7:A	483	480	0.3000	0.2981	0.3000	9.78e-54	1np7:B
12	2vtb:A	500	449	0.2604	0.2500	0.2784	4.68e-42	2ijg:X, 2j4d:A, 2j4d:B, 2vtb:B, 2vtb:C, 2vtb:D, 2vtb:E, 2vtb:F
13	6k8k:G	490	498	0.3021	0.2959	0.2912	2.02e-41	6k8i:A, 6k8i:B, 6k8k:A, 6k8k:B, 6k8k:D, 6m79:A, 6m79:B, 6m79:C, 6m79:D, 7x0x:D, 7x0x:B, 7x0x:C, 7x0x:A, 7x0y:B, 7x0y:D, 7x0y:C, 7x0y:A, 6x24:A, 6x24:B, 6x24:C, 6x24:D
14	1qnf:A	475	469	0.2729	0.2758	0.2793	2.65e-38	1owl:A, 1owm:A, 1own:A, 1owo:A, 1owp:A, 1tez:A, 1tez:B, 1tez:C, 1tez:D
15	1dnp:A	469	496	0.2875	0.2942	0.2782	5.50e-35	1dnp:B
16	2e0i:B	431	459	0.2458	0.2738	0.2571	1.28e-33	2e0i:A, 2e0i:C, 2e0i:D
17	6lz3:A	486	485	0.2771	0.2737	0.2742	1.52e-33	6lz3:B, 6lz3:C, 6lz3:D
18	1u3c:A	485	485	0.2687	0.2660	0.2660	6.73e-32	1u3d:A
19	6lz7:A	492	476	0.2771	0.2703	0.2794	2.78e-31
20	2j07:A	419	208	0.1271	0.1456	0.2933	1.29e-20	1iqr:A, 1iqu:A, 2j08:A, 2j09:A
21	7pua:Ff	623	533	0.2583	0.1990	0.2326	5.01e-15	7pub:Ff
22	1sli:A	679	101	0.0521	0.0368	0.2475	1.2	2sli:A, 3sli:A, 4sli:A
23	6tej:B	585	25	0.0271	0.0222	0.5200	4.3
24	4cdn:B	438	100	0.0479	0.0525	0.2300	4.7	8kcm:B, 8oet:B, 8oy3:B, 8oy4:B, 8oy5:B, 8oy6:B, 8oy7:B, 8oy8:B, 8oy9:B, 8oya:B, 8oyb:B, 8oyc:B, 2xrz:B, 7yc7:B, 7ycm:B, 7ycp:B, 7ycr:B, 7yd6:B, 7yd7:B, 7yd8:B, 7ydz:B, 7ye0:B, 7yeb:B, 7yec:B, 7yee:B, 7yei:B, 7yej:B, 7yek:B, 7yel:B, 7yem:B, 5zcw:B
25	4cdn:A	463	100	0.0479	0.0497	0.2300	5.2	4cdm:A, 7f8t:A, 8kcm:A, 5o86:A, 5o8d:A, 5o8e:A, 8oet:A, 8oy3:A, 8oy4:A, 8oy5:A, 8oy6:A, 8oy7:A, 8oy8:A, 8oy9:A, 8oya:A, 8oyb:A, 8oyc:A, 7viw:A, 7vix:A, 7viy:A, 7viz:A, 7vj0:A, 7vj1:A, 7vj2:A, 7vj3:A, 7vj4:A, 7vj5:A, 7vj6:A, 7vj7:A, 7vj8:A, 7vj9:A, 7vja:A, 7vjb:A, 7vjc:A, 7vje:A, 7vjg:A, 7vjh:A, 7vji:A, 7vjj:A, 7vjk:A, 2xry:A, 2xrz:A, 7yc7:A, 7ycm:A, 7ycp:A, 7ycr:A, 7yd6:A, 7yd7:A, 7yd8:A, 7ydz:A, 7ye0:A, 7yeb:A, 7yec:A, 7yee:A, 7yei:A, 7yej:A, 7yek:A, 7yel:A, 7yem:A, 5zcw:A
26	1esd:A	302	88	0.0479	0.0762	0.2614	5.9
27	8fpi:A	1357	84	0.0479	0.0169	0.2738	8.5
28	2f8k:A	84	18	0.0208	0.1190	0.5556	8.9	2b6g:A, 2d3d:A, 2ese:A
29	8sny:A	1388	84	0.0479	0.0166	0.2738	9.4	8fu3:A, 8snx:A
30	3qr0:A	781	25	0.0250	0.0154	0.4800	9.5	3qr1:A, 3qr1:D

[Back]