BioLiP

>protein
MPAQTAPPTTANLNAWLNNFYNAEAKRKSTFPSSLPADAQPFELLVINICSLSWSDIEAAGLMSHPLWSHFDIEFKNFNS
ATSYSGPAAIRLLRASCGQTSHTNLYQPANNDCYLFDNLSKLGFTQHLMMGHNGQFGGFLKEVRENGGMQSELMDQTNLP
VILLGFDGSPVYDDTAVLNRWLDVTEKDKNSRSATFYNTLPLHDGNHYPGVSKTADYKARAQKFFDELDAFFTELEKSGR
KVMVVVVPEHGGALKGDRMQVSGLRDIPSPSITDVPVGVKFFGMKAPHQGAPIVIEQPSSFLAISDLVVRVLDGKIFTED
NVDWKKLTSGLPQTAPVSENSNAVVIQYQDKPYVRLNGGDWVPYPQ

The query sequence (length=366) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6pd0:A	366	366	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6pcz:A, 6pcz:B, 6pd0:B
2	5olt:A	383	366	0.8552	0.8172	0.8552	0.0	5ojh:A
3	5xwi:A	503	26	0.0355	0.0258	0.5000	2.2
4	5xwk:A	530	26	0.0355	0.0245	0.5000	2.4	3q3q:A
5	7r3e:A	545	33	0.0328	0.0220	0.3636	2.8	8b4a:A, 8b4a:B, 8b4a:C, 8b4a:D, 3dh8:A, 8dq0:C, 8dq0:D, 8dq1:C, 8dq1:D, 5hio:A, 5hip:A, 5hiq:A, 5his:A, 7kgw:A, 7kgx:A, 2q0i:A, 2q0j:A, 2q0j:B, 7r3e:B, 7r3f:A, 7r3j:A, 7r3j:B, 7r3j:C, 7r3j:D, 7tz9:A, 7tza:A, 7u6g:A, 2vw8:A
6	7aor:aw	160	19	0.0301	0.0688	0.5789	3.2
7	7bam:A	1904	92	0.0738	0.0142	0.2935	3.5	7bam:B, 7ban:A, 7ban:B, 7bao:A, 7plp:A, 7plp:B
8	8qp8:A	1918	52	0.0437	0.0083	0.3077	4.0
9	5z57:A	1978	52	0.0437	0.0081	0.3077	4.1
10	8i0p:A	2149	52	0.0437	0.0074	0.3077	4.1	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
11	7abg:A	2174	52	0.0437	0.0074	0.3077	4.2	7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
12	8c6j:A	2261	52	0.0437	0.0071	0.3077	4.3	6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
13	5z56:A	2232	52	0.0437	0.0072	0.3077	4.3	7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
14	8q7x:A	1914	52	0.0437	0.0084	0.3077	4.3
15	8y6o:C	2227	52	0.0437	0.0072	0.3077	4.4	8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
16	8h6k:5B	2253	52	0.0437	0.0071	0.3077	4.6	8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
17	1vrg:A	515	96	0.0710	0.0505	0.2708	5.6	1vrg:B, 1vrg:C, 1vrg:D, 1vrg:E, 1vrg:F
18	5dll:A	854	43	0.0437	0.0187	0.3721	5.8
19	4aay:A	843	104	0.0792	0.0344	0.2788	7.5	4aay:C, 4aay:E, 4aay:G, 8ccq:A, 8ccq:C, 8ccq:E, 8ccq:G, 8ed4:A, 8ed4:C, 8ed4:E, 8ed4:G, 5nqd:A, 5nqd:C, 5nqd:E, 5nqd:G
20	7xpt:A	375	34	0.0328	0.0320	0.3529	7.6	8hl8:A, 8hl8:C, 7xpr:A, 7xpr:B, 7xps:A, 7xps:B, 7xpt:B, 7xpu:A, 7xpu:B, 7xpv:A, 7xpv:B, 7yua:A, 7yua:B, 7yua:C, 7yua:D
21	7am2:BT	300	54	0.0437	0.0533	0.2963	8.8

[Back]