BioLiP

>protein
MNKVGMFYTYWSTEWMVDFPATAKRIAGLGFDLMEISLGEFHNLSDAKKRELKAVADDLGLTVMCSIGLKSEYDFASPDK
SVRDAGTEYVKRLLDDCHLLGAPVFAGLTFCAWPQSPPLDMKDKRPYVDRAIESVRRVIKVAEDYGIIYALEVVNRFEQW
LCNDAKEAIAFADAVDSPACKVQLDTFHMNIEETSFRDAILACKGKMGHFHLGEANRLPPGEGRLPWDEIFGALKEIGYD
GTIVMEPFMRKGGSVSRAVGVWRDMSNGATDEEMDERARRSLQFVRDKLAGSRSHHH

The query sequence (length=297) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4pfh:A	298	290	0.9226	0.9195	0.9448	0.0	5j8l:A, 5j8l:B, 5j8l:C, 5j8l:D, 2ou4:A, 2ou4:B, 2ou4:C, 2ou4:D, 4pfh:B, 4pgl:A, 4pgl:B, 4pgl:C, 4pgl:D, 4q7i:A, 4q7i:B, 2qul:A, 2qul:B, 2qul:C, 2qul:D, 2qum:A, 2qum:B, 2qum:C, 2qum:D, 2qun:A, 2qun:B, 2qun:C, 2qun:D, 4xsl:A, 4xsl:B, 4xsl:C, 4xsl:D, 4xsm:A, 4xsm:B, 4xsm:C, 4xsm:D, 4ytq:A, 4ytq:B, 4ytq:C, 4ytq:D, 4ytr:A, 4ytr:B, 4ytr:C, 4ytr:D, 4yts:A, 4yts:B, 4yts:C, 4yts:D, 4ytt:A, 4ytt:B, 4ytt:C, 4ytt:D, 4ytu:A, 4ytu:B, 4ytu:C, 4ytu:D
2	3vnl:A	291	284	0.4074	0.4158	0.4261	4.67e-77	7e9w:A, 7e9w:B, 7e9w:C, 7e9w:D, 3vni:A, 3vni:B, 3vni:C, 3vni:D, 3vnj:A, 3vnj:B, 3vnj:C, 3vnj:D, 3vnk:A, 3vnk:B, 3vnk:C, 3vnk:D, 3vnl:B, 3vnl:C, 3vnl:D, 3vnm:A, 3vnm:B, 3vnm:C, 3vnm:D
3	2hk1:A	289	291	0.3939	0.4048	0.4021	9.48e-73	2hk1:B, 2hk1:C, 2hk1:D
4	7x7w:A	288	287	0.3872	0.3993	0.4007	6.98e-72	7x7w:B
5	7cj5:A	292	292	0.3064	0.3116	0.3116	6.08e-41	7cj4:A, 7cj4:B, 7cj5:B, 7cj6:A, 7cj6:B, 7cj7:A, 7cj7:B, 7cj8:A, 7cj8:B, 7cj8:C, 7cj8:D, 7cj8:E, 7cj8:F, 7cj9:A, 7cj9:B, 7cj9:C, 7cj9:D, 7cj9:E, 7cj9:F, 7cj9:G, 7cj9:H
6	5zfs:B	294	280	0.3199	0.3231	0.3393	1.31e-38	5zfs:A
7	7ern:C	284	300	0.3064	0.3204	0.3033	6.86e-36	7erm:A, 7erm:B, 7erm:C, 7erm:D, 7ern:A, 7ern:B, 7ern:D, 7ero:A, 7ero:B, 7ero:C, 7ero:D
8	3vyl:A	297	268	0.2828	0.2828	0.3134	4.54e-33	3vyl:B, 3vyl:C, 3vyl:D, 3vyl:E, 3vyl:F, 3vyl:G, 3vyl:H
9	7dz4:C	286	296	0.3030	0.3147	0.3041	4.35e-31	7dz2:A, 7dz2:B, 7dz2:C, 7dz2:D, 7dz3:A, 7dz3:B, 7dz3:C, 7dz3:D, 7dz4:A, 7dz4:B, 7dz4:D, 7dz5:A, 7dz5:B, 7dz5:C, 7dz5:D, 7dz6:A, 7dz6:B, 7dz6:C, 7dz6:D
10	5h1w:A	270	239	0.2222	0.2444	0.2762	3.96e-21	5b7y:A, 5b7y:B, 5b80:A, 5b80:B, 5h1w:B, 5h6h:A, 5h6h:B
11	6wn6:B	264	235	0.2189	0.2462	0.2766	2.83e-15	6wn6:A, 6wn6:C, 6wn6:D
12	3wqo:A	271	236	0.1919	0.2103	0.2415	8.22e-09	3wqo:B
13	1i6n:A	278	173	0.1313	0.1403	0.2254	6.03e-06
14	3ngf:B	260	127	0.1077	0.1231	0.2520	7.04e-06	3ngf:A
15	3cqj:A	276	231	0.1751	0.1884	0.2251	7.63e-05	3cqj:B, 3cqk:A, 3cqk:B
16	1k77:A	260	89	0.0842	0.0962	0.2809	8.63e-04
17	3kws:A	265	181	0.1515	0.1698	0.2486	8.79e-04	3kws:B
18	7exz:A	324	55	0.0606	0.0556	0.3273	2.0	7bvr:A, 7bvr:C, 7bvr:E, 7bvr:G, 7exz:C, 7exz:E, 7exz:G, 7xrf:A, 7xrf:C, 7xrf:E, 7xrf:G
19	7lr8:B	415	45	0.0505	0.0361	0.3333	2.6	7lr8:A
20	3t7v:A	337	57	0.0539	0.0475	0.2807	3.2
21	6r9n:A	233	36	0.0505	0.0644	0.4167	4.4	6r9n:B
22	1e5q:A	449	55	0.0673	0.0445	0.3636	6.4	1e5q:B, 1e5q:C, 1e5q:D, 1e5q:E, 1e5q:F, 1e5q:G, 1e5q:H
23	6bcu:A	2204	198	0.1481	0.0200	0.2222	6.4	6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
24	3jbz:A	960	198	0.1481	0.0458	0.2222	7.3
25	8rch:A	2036	198	0.1481	0.0216	0.2222	8.0	8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
26	2ood:A	463	107	0.0943	0.0605	0.2617	8.2
27	7wdo:A	445	90	0.0707	0.0472	0.2333	8.3	7wdn:A, 7wdp:A, 7wdr:A, 7wds:A, 7wdv:A
28	6zwm:B	2185	192	0.1414	0.0192	0.2188	8.7	6zwm:A

[Back]