BioLiP

>protein
MNKVGMFYSYWSTEWMVDFPATAKRIAGLGFDLMEISLSEFHNLSDAKKRELKAVADDLGLTVMCCIGLKSEYDFASPDK
SVRDAGTEYVKRLLDDCHLLGAPVFAGLNFCAWPQHPPLDMVDKRPYVDRAIESVRRVIKVAEDYGIIYALEAVNRYEQW
LCNDAKEAIAFADAVDSPACKVHLDTFHMNIEENSFRDAILACKGKMGHFHLGEQNRLPPGEGRLPWDEIFGALKEIGYD
GTIVIEPFMRTGGSVSRAVCVWRDLSNGATDEEMDERARRSLQFVRDKLALEHHHHHH

The query sequence (length=298) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4pfh:A	298	292	0.9463	0.9463	0.9658	0.0	5j8l:A, 5j8l:B, 5j8l:C, 5j8l:D, 2ou4:A, 2ou4:B, 2ou4:C, 2ou4:D, 4pfh:B, 4pgl:A, 4pgl:B, 4pgl:C, 4pgl:D, 4q7i:A, 4q7i:B, 2qul:A, 2qul:B, 2qul:C, 2qul:D, 2qum:A, 2qum:B, 2qum:C, 2qum:D, 2qun:A, 2qun:B, 2qun:C, 2qun:D, 4xsl:A, 4xsl:B, 4xsl:C, 4xsl:D, 4xsm:A, 4xsm:B, 4xsm:C, 4xsm:D, 4ytq:A, 4ytq:B, 4ytq:C, 4ytq:D, 4ytr:A, 4ytr:B, 4ytr:C, 4ytr:D, 4yts:A, 4yts:B, 4yts:C, 4yts:D, 4ytt:A, 4ytt:B, 4ytt:C, 4ytt:D, 4ytu:A, 4ytu:B, 4ytu:C, 4ytu:D
2	3vnl:A	291	284	0.3993	0.4089	0.4190	3.33e-75	7e9w:A, 7e9w:B, 7e9w:C, 7e9w:D, 3vni:A, 3vni:B, 3vni:C, 3vni:D, 3vnj:A, 3vnj:B, 3vnj:C, 3vnj:D, 3vnk:A, 3vnk:B, 3vnk:C, 3vnk:D, 3vnl:B, 3vnl:C, 3vnl:D, 3vnm:A, 3vnm:B, 3vnm:C, 3vnm:D
3	2hk1:A	289	287	0.3859	0.3979	0.4007	2.95e-71	2hk1:B, 2hk1:C, 2hk1:D
4	7x7w:A	288	284	0.3725	0.3854	0.3908	2.25e-69	7x7w:B
5	7cj5:A	292	291	0.3121	0.3185	0.3196	1.63e-44	7cj4:A, 7cj4:B, 7cj5:B, 7cj6:A, 7cj6:B, 7cj7:A, 7cj7:B, 7cj8:A, 7cj8:B, 7cj8:C, 7cj8:D, 7cj8:E, 7cj8:F, 7cj9:A, 7cj9:B, 7cj9:C, 7cj9:D, 7cj9:E, 7cj9:F, 7cj9:G, 7cj9:H
6	5zfs:B	294	276	0.3121	0.3163	0.3370	9.22e-38	5zfs:A
7	7ern:C	284	295	0.3054	0.3204	0.3085	7.77e-37	7erm:A, 7erm:B, 7erm:C, 7erm:D, 7ern:A, 7ern:B, 7ern:D, 7ero:A, 7ero:B, 7ero:C, 7ero:D
8	3vyl:A	297	268	0.2852	0.2862	0.3172	4.09e-32	3vyl:B, 3vyl:C, 3vyl:D, 3vyl:E, 3vyl:F, 3vyl:G, 3vyl:H
9	7dz4:C	286	296	0.3087	0.3217	0.3108	7.40e-32	7dz2:A, 7dz2:B, 7dz2:C, 7dz2:D, 7dz3:A, 7dz3:B, 7dz3:C, 7dz3:D, 7dz4:A, 7dz4:B, 7dz4:D, 7dz5:A, 7dz5:B, 7dz5:C, 7dz5:D, 7dz6:A, 7dz6:B, 7dz6:C, 7dz6:D
10	5h1w:A	270	251	0.2315	0.2556	0.2749	1.87e-20	5b7y:A, 5b7y:B, 5b80:A, 5b80:B, 5h1w:B, 5h6h:A, 5h6h:B
11	6wn6:B	264	235	0.2181	0.2462	0.2766	5.86e-15	6wn6:A, 6wn6:C, 6wn6:D
12	3wqo:A	271	236	0.1946	0.2140	0.2458	2.01e-09	3wqo:B
13	3cqj:A	276	248	0.1913	0.2065	0.2298	5.95e-07	3cqj:B, 3cqk:A, 3cqk:B
14	1i6n:A	278	173	0.1342	0.1439	0.2312	2.98e-06
15	3ngf:B	260	128	0.1040	0.1192	0.2422	2.08e-05	3ngf:A
16	3kws:A	265	191	0.1544	0.1736	0.2408	8.68e-04	3kws:B
17	1k77:A	260	89	0.0805	0.0923	0.2697	0.005
18	6njw:A	208	19	0.0403	0.0577	0.6316	0.12	6njv:A
19	7exz:A	324	63	0.0671	0.0617	0.3175	1.5	7bvr:A, 7bvr:C, 7bvr:E, 7bvr:G, 7exz:C, 7exz:E, 7exz:G, 7xrf:A, 7xrf:C, 7xrf:E, 7xrf:G
20	4b3g:A	614	109	0.0973	0.0472	0.2661	2.0	4b3g:B
21	7lr8:B	415	45	0.0503	0.0361	0.3333	3.2	7lr8:A
22	6jzy:A	342	62	0.0570	0.0497	0.2742	4.4	6jzu:A, 6jzz:A
23	7nay:A	322	48	0.0503	0.0466	0.3125	4.5
24	4qez:B	231	34	0.0503	0.0649	0.4412	4.8	4qez:A, 4qez:C
25	4g8b:A	277	15	0.0336	0.0361	0.6667	5.3	4g8b:B, 4g8c:A, 4g8c:B, 4g9e:A, 4g9e:B

[Back]