Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILR
NAKLKPVYDSLDAVRRCAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDA
YK

The query sequence (length=162) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6xyr:A 348 161 0.9877 0.4598 0.9938 4.70e-118
2 6fw2:A 444 161 0.9877 0.3604 0.9938 1.61e-115 7p41:D
3 6a73:A 290 160 0.9691 0.5414 0.9812 4.15e-115 6a73:B
4 4tn3:B 362 162 0.9753 0.4365 0.9753 4.77e-115 5k3q:A, 5k3q:B, 5k3q:C, 5k3q:D, 4tn3:A, 5w9a:A, 5w9a:B
5 6d9m:A 326 161 0.9691 0.4816 0.9752 2.28e-114
6 6zx9:C 257 161 0.9691 0.6109 0.9752 4.23e-114
7 7mwz:B 352 161 0.9691 0.4460 0.9752 4.84e-114 7mwz:A, 7mwz:C
8 6ffh:A 414 161 0.9753 0.3816 0.9814 1.23e-113 5cgc:A, 5cgd:A, 6ffi:A, 4oo9:A, 7p2l:A
9 7e40:D 345 160 0.9630 0.4522 0.9750 2.69e-113 7e40:B
10 7z36:B 446 160 0.9691 0.3520 0.9812 3.50e-113 6h3a:A, 6h3a:F, 6qaj:A, 6qaj:B, 6qu1:A, 2yvr:A, 2yvr:B, 7z36:A
11 6p5v:A 373 162 0.9753 0.4236 0.9753 3.84e-113 6b5q:A, 6b5q:B, 6bg3:A, 6bg5:A, 4i7p:A, 7kwa:A, 6p5w:A, 3tdu:B, 3tdu:A, 3tdz:A, 3tdz:B, 5ufi:A, 5ufi:B, 5ufi:C, 5ufi:D, 5v83:A, 5v86:A, 5v88:A, 6xol:A, 6xom:A, 6xon:A, 6xoo:A, 6xop:A, 6xoq:A
12 3vw7:A 442 160 0.9630 0.3529 0.9750 4.48e-113
13 6cm4:A 423 161 0.9691 0.3712 0.9752 5.32e-113 6luq:A
14 5zty:A 449 160 0.9691 0.3497 0.9812 7.30e-113 6kpc:A
15 2qb0:B 241 161 0.9630 0.6473 0.9689 8.13e-113 2qb0:D
16 5x33:A 439 160 0.9691 0.3576 0.9812 1.04e-112
17 7f8x:A 443 161 0.9691 0.3544 0.9752 1.13e-112 7f8u:A, 7f8y:A
18 4djh:B 448 161 0.9691 0.3504 0.9752 1.39e-112 4djh:A
19 8jwz:A 450 162 0.9691 0.3489 0.9691 1.45e-112 3eml:A, 8jwy:A, 3qak:A, 5wf5:A, 5wf6:A
20 3v2y:A 455 160 0.9691 0.3451 0.9812 1.67e-112 3v2w:A
21 6kjv:B 424 162 0.9691 0.3703 0.9691 1.82e-112 6kjv:A, 6kk1:A, 6kk1:B, 6kk7:A, 6kk7:B, 5vew:A, 5vew:B, 5vex:A, 5vex:B
22 3uon:A 438 162 0.9691 0.3584 0.9691 1.84e-112
23 3pbl:A 432 160 0.9691 0.3634 0.9812 1.86e-112 3pbl:B
24 4u14:A 436 161 0.9630 0.3578 0.9689 2.48e-112 4daj:A, 4daj:B, 4daj:C, 4daj:D
25 5t1a:A 445 161 0.9691 0.3528 0.9752 3.49e-112
26 6zfz:A 446 160 0.9691 0.3520 0.9812 4.33e-112 5cxv:A, 6wjc:A, 6zg4:A, 6zg9:A
27 3rze:A 428 160 0.9691 0.3668 0.9812 5.10e-112
28 4lde:A 454 160 0.9691 0.3458 0.9812 5.78e-112 7bz2:R, 7dhi:R, 7dhr:R, 4ekp:A, 4ekp:B, 4ekq:A, 4ekq:B, 4ekr:A, 4ekr:B, 4eks:A, 4eks:B, 4gbr:A, 8gdz:R, 8ge1:R, 8ge2:R, 8ge3:R, 8ge4:R, 8ge5:R, 8ge6:R, 8ge7:R, 8ge8:R, 8ge9:R, 8gea:R, 8geb:R, 8gec:R, 8ged:R, 8gee:R, 8gef:R, 8geg:R, 8geh:R, 8gei:R, 8gfv:R, 8gfw:R, 8gfx:R, 8gfy:R, 8gfz:R, 8gg0:R, 8gg1:R, 8gg2:R, 8gg3:R, 8gg4:R, 8gg5:R, 8gg6:R, 8gg7:R, 8gg8:R, 8gg9:R, 8gga:R, 8ggb:R, 8ggc:R, 8ggi:R, 8ggj:R, 8ggk:R, 8ggl:R, 8ggm:R, 8ggn:R, 8ggo:R, 8ggp:R, 8ggq:R, 8ggr:R, 8ggs:R, 8ggt:R, 8ggu:R, 8ggv:R, 8ggw:R, 8ggx:R, 8ggy:R, 8ggz:R, 8gh0:R, 8gh1:R, 4i7m:A, 4i7m:B, 4i7n:A, 4i7n:B, 4i7o:A, 4i7o:B, 4i7p:B, 4i7q:A, 4i7q:B, 4i7r:A, 4i7r:B, 4i7s:A, 4i7s:B, 4i7t:A, 4i7t:B, 5jqh:A, 5jqh:B, 4ldl:A, 4ldo:A, 6mxt:A, 6n48:A, 6ni3:R, 3p0g:A, 4qkx:A, 7sj6:A, 7sj6:B, 3sn6:R, 8unl:R, 8unm:R, 8unn:R, 8uno:R, 8unp:R, 8unq:R, 8unr:R, 8uns:R, 8unt:R, 8unu:R, 8unv:R, 8unw:R, 8unx:R, 8uny:R, 8unz:R, 8uo0:R, 8uo1:R, 8uo2:R, 7xk9:A, 7xka:A
29 5tzr:A 437 160 0.9691 0.3593 0.9812 5.79e-112 5kw2:A, 4phu:A
30 4ej4:A 442 161 0.9630 0.3529 0.9689 8.13e-112
31 4dkl:A 442 161 0.9630 0.3529 0.9689 1.22e-111
32 5zbh:A 461 160 0.9691 0.3406 0.9812 1.30e-111
33 8a5x:A 466 161 0.9753 0.3391 0.9814 1.40e-111 4wtv:A
34 6m9t:A 444 160 0.9630 0.3514 0.9750 1.44e-111
35 7joz:R 446 159 0.9630 0.3498 0.9811 1.73e-111 7ckw:R, 7ckx:R, 7cky:R, 7ckz:R, 7crh:R, 7f0t:F, 7f1o:F, 7f1z:F, 7f23:F, 7f24:F, 8irr:R, 7jv5:R, 7jvp:R, 7jvq:R, 8jxr:A, 8jxs:A, 7ljc:R, 7ljd:R, 7x2c:F, 7x2d:F, 7x2f:F
36 3odu:A 466 160 0.9691 0.3369 0.9812 1.78e-111 3odu:B, 3oe0:A, 3oe8:A, 3oe8:B, 3oe8:C, 3oe9:A, 3oe9:B
37 6iih:A 446 161 0.9630 0.3498 0.9689 1.79e-111 6iih:B, 6lb7:B, 6xqo:J
38 6igk:A 471 160 0.9691 0.3333 0.9812 2.10e-111 5glh:A, 6igl:A, 6lry:A
39 6e67:B 476 160 0.9691 0.3298 0.9812 2.14e-111 3d4s:A, 5d5a:A, 5d5b:A, 5d6l:A, 6e67:A, 3ny8:A, 3ny9:A, 3nya:A, 6oba:A, 3pds:A, 6prz:A, 6ps0:A, 6ps1:A, 6ps2:A, 6ps3:A, 6ps4:A, 6ps5:A, 6ps6:A, 2rh1:A, 5x7d:A
40 7bvq:A 455 160 0.9691 0.3451 0.9812 2.25e-111 7bts:A, 7bu6:A, 7bu7:A, 7bvq:B
41 8w1v:A 441 159 0.9630 0.3537 0.9811 2.50e-111 8w1v:B
42 5ndd:A 567 160 0.9691 0.2769 0.9812 3.36e-111 5awi:A, 5awi:B, 2bc5:A, 2bc5:B, 2bc5:C, 2bc5:D, 3c62:A, 3c62:B, 3c62:C, 3c62:D, 3de8:A, 3de8:D, 3de8:B, 3de8:C, 3de9:A, 8drd:A, 8drd:B, 8drf:A, 8drj:C, 8drl:A, 8drm:A, 6dy4:D, 6dy4:A, 6dy6:A, 6dy6:B, 6dyb:A, 6dyb:C, 6dyc:A, 6dyc:B, 6dyd:A, 6dyd:C, 6dye:A, 6dye:B, 6dyi:B, 6dyj:A, 6dyj:E, 6dyj:C, 6dyj:G, 6dyk:A, 6dyk:E, 6dyk:C, 6dyk:G, 6dyl:A, 6dyl:E, 6dyl:C, 6dyl:G, 3foo:A, 3foo:B, 3foo:C, 3foo:D, 3foo:E, 3foo:F, 3foo:G, 3foo:H, 3foo:I, 3foo:J, 3foo:L, 3foo:K, 3fop:A, 3fop:B, 3l1m:A, 5ndz:A, 3nmi:A, 3nmi:B, 3nmi:C, 3nmi:D, 3nmi:E, 3nmi:F, 3nmj:A, 3nmj:C, 3nmj:B, 3nmj:D, 3nmk:A, 3nmk:C, 3nmk:B, 3nmk:D, 2qla:A, 2qla:B, 2qla:C, 2qla:D, 6wza:A, 6wza:B, 6wza:C, 6x8x:A
43 5i0n:A 489 161 0.9753 0.3231 0.9814 3.48e-111 4pla:A, 4yc4:A
44 5t04:A 458 161 0.9568 0.3384 0.9627 9.41e-111 4grv:A
45 4xes:A 471 160 0.9568 0.3291 0.9688 1.31e-110 4buo:B, 8fmz:A, 8fn0:A, 8fn1:A, 7l0p:C, 7l0q:C, 7l0r:C, 7l0s:C, 4xee:A
46 4z9g:A 421 160 0.9506 0.3658 0.9625 3.58e-110 4k5y:A, 4k5y:B, 4z9g:B, 4z9g:C
47 5yqz:R 558 161 0.9691 0.2814 0.9752 6.12e-110 5xez:A, 5xf1:A
48 6aji:A 873 162 0.9691 0.1798 0.9691 7.84e-109
49 5ee7:A 416 161 0.9506 0.3702 0.9565 1.39e-108
50 6ajf:A 901 162 0.9691 0.1743 0.9691 2.23e-108 6ajg:A, 6ajh:A, 6ajj:A, 7c2m:A, 7c2n:A, 6or2:A, 7wnx:A
51 5zbq:A 463 161 0.9506 0.3326 0.9565 9.62e-108 8k6m:D, 7vgx:R
52 4w8f:B 2609 160 0.9691 0.0602 0.9812 2.42e-104 220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
53 5ewx:B 214 211 0.9630 0.7290 0.7393 5.62e-104 5ewx:A
54 3oe6:A 418 152 0.8951 0.3469 0.9539 3.48e-101
55 4wtv:B 426 161 0.8272 0.3146 0.8323 1.08e-88
56 6ol9:A 416 161 0.8148 0.3173 0.8199 2.11e-88
57 5tzy:A 418 160 0.8519 0.3301 0.8625 4.10e-88
58 6j20:A 398 105 0.6173 0.2513 0.9524 6.74e-68 6j21:A
59 5zhp:A 394 161 0.6914 0.2843 0.6957 9.26e-68 4u15:A, 4u15:B, 4u16:A, 4u16:B, 5zhp:B
60 5dsg:B 399 162 0.6790 0.2757 0.6790 1.41e-67 5dsg:A
61 6d26:A 447 161 0.6852 0.2483 0.6894 2.53e-67 6d27:A, 7m8w:A
62 5x93:A 430 160 0.6852 0.2581 0.6937 1.53e-66 6k1q:A, 5xpr:A
63 5zkq:B 399 161 0.6790 0.2757 0.6832 1.34e-64
64 7mwz:D 301 160 0.6914 0.3721 0.7000 1.48e-62
65 5xez:B 499 99 0.5802 0.1884 0.9495 1.17e-61 5xf1:B
66 2anv:A 146 127 0.2346 0.2603 0.2992 3.53e-06 2anv:B, 2anx:A, 2anx:B
67 4nx1:A 308 52 0.1111 0.0584 0.3462 0.38 4nx1:B, 4ovp:A, 4ovp:B
68 1scu:A 288 60 0.1481 0.0833 0.4000 1.8 1cqi:A, 1cqi:D, 1cqj:A, 1cqj:D, 1jkj:A, 1jkj:D, 1jll:A, 1jll:D, 2nu6:A, 2nu6:D, 2nu7:A, 2nu7:D, 2nu8:A, 2nu8:D, 2nu9:A, 2nu9:D, 2nu9:F, 2nu9:H, 2nua:A, 2nua:D, 1scu:D, 2scu:A, 2scu:D
69 4wri:A 187 64 0.1420 0.1230 0.3594 2.0
70 5kj5:B 484 85 0.1296 0.0434 0.2471 3.0 4i1w:A, 4i1w:B, 4i1w:C, 4i1w:D, 4i25:A, 4i25:B, 4i25:C, 4i25:D, 4i2r:A, 4i2r:B, 4i2r:C, 4i2r:D, 5kj5:A, 5kj5:D, 5kj5:C, 5klk:A, 5klk:B, 5klk:D, 5klk:C, 5kll:A, 5kll:B, 5kll:C, 5kll:D, 5klm:A, 5klm:B, 5klm:C, 5klm:D, 5kln:A, 5kln:D, 5kln:B, 5kln:C, 5klo:A, 5klo:B, 5klo:C, 5klo:D, 4npi:A, 4npi:B, 4npi:C, 4npi:D, 4oe2:A, 4oe2:B, 4oe2:C, 4oe2:D, 4ou2:A, 4ou2:B, 4ou2:C, 4ou2:D, 4oub:A, 4oub:B, 4oub:C, 4oub:D
71 7vw3:A 1052 107 0.1728 0.0266 0.2617 3.3 5axw:A, 5czz:A, 7el1:A, 7eni:A, 7enr:A, 8jft:A, 8jg9:A, 8jg9:D
72 4uhm:A 435 46 0.1049 0.0391 0.3696 3.7 4uhn:A, 4uho:A
73 2e37:C 310 27 0.0864 0.0452 0.5185 4.5 2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
74 5c3m:B 411 44 0.0864 0.0341 0.3182 6.7 5c3m:A, 5c3m:C, 5c3m:D
75 8fxi:C 630 41 0.0926 0.0238 0.3659 6.9 8fxi:D
76 3qe3:A 351 55 0.0988 0.0456 0.2909 7.8
77 8hf0:A 1561 59 0.1049 0.0109 0.2881 9.1 8hf0:D, 8hf1:A, 8hf1:D, 8hf1:G, 7w0a:A, 7w0a:E, 7w0c:A, 7w0d:A, 7w0e:A, 7w0f:A
78 7w0b:A 1586 59 0.1049 0.0107 0.2881 9.1 7w0d:F
79 7v6c:A 1540 59 0.1049 0.0110 0.2881 9.5

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218