Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MMYELGHFIDGKRVAGTSGRVSNIFNPATGEVQGTVALASDADLAAAVESAKAAQPKWAATNPQRRARVFMKFVQLLNDN
MNELAEMLSREHGKTIDDAKGDIVRGLEVCEFVIGIPHLQKSEFTEGAGPGIDMYSIRQPVGIGAGITPFNFPGMIPMWM
FAPAIACGNAFILKPSERDPSVPIRLAELMIEAGLPAGILNVVNGDKGAVDAILTHPDIAAVSFVGSTPIARYVYGTAAM
NGKRAQCFGGAKNHMIIMPDADLDQAANALIGAGYGSAGERCMAISVAVPVGEETANRLIDKLVPMVESLRIGPYTDEKA
DMGPVVTKEAEQRIRSLIDSGIEQGAKLVVDGRDFKLQGYENGHFIGGCLFDDVTPDMDIYKTEIFGPVLSVVRARNYEE
ALSLPMKHEYGNGVAIYTRDGDAARDFASRINIGMVGVNVPIPVPLAYHSFGGWKSSSFGDLNQHGTDSIKFWTRTKTIT
SRWPSGIKD

The query sequence (length=489) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4iym:C 491 489 1.0000 0.9959 1.0000 0.0 4iym:A, 4iym:B, 4iym:D, 4iym:E, 4iym:F, 4iym:G, 4iym:H, 4iym:I, 4iym:J, 4iym:K, 4iym:L, 4iym:M, 4iym:N, 4iym:O, 4iym:P
2 4zz7:A 489 489 0.5276 0.5276 0.5276 0.0 4zz7:C, 4zz7:D, 4zz7:E, 4zz7:I, 4zz7:L
3 5tjr:D 468 481 0.5235 0.5470 0.5322 0.0 5tjr:A, 5tjr:B, 5tjr:E, 5tjr:F
4 1t90:A 484 482 0.4172 0.4215 0.4232 2.39e-142 1t90:B, 1t90:C, 1t90:D
5 8skf:A 497 486 0.3517 0.3461 0.3539 4.01e-78 8skf:B, 8uzk:A, 8uzk:B, 8uzk:C, 8uzk:D, 8uzm:A, 8uzm:B, 8uzm:C, 8uzm:D, 8uzn:A, 8uzn:B, 8uzn:C, 8uzn:D, 8uzo:A, 8uzo:B, 8uzo:C, 8uzo:D, 8vj3:A, 8vj3:B, 8vj3:C, 8vj3:D, 8vqw:C, 8vqw:D, 8vqz:A, 8vqz:B, 8vqz:C, 8vqz:D, 8vr0:A, 8vr0:B, 8vr0:C, 8vr1:A, 8vr1:B, 8vr1:C, 8vr1:D
6 4caz:A 489 476 0.3211 0.3211 0.3298 2.43e-75 4caz:B, 2wme:A, 2wme:B, 2wme:C, 2wme:D, 2wme:E, 2wme:F, 2wme:G, 2wme:H, 2wox:A, 2wox:B, 2wox:C, 2wox:D, 2xdr:A, 2xdr:B, 2xdr:C, 2xdr:D, 3zqa:A, 3zqa:B, 3zqa:C, 3zqa:D
7 6wsb:A 489 479 0.3354 0.3354 0.3424 5.19e-74 6wsb:B
8 1bpw:A 503 483 0.2924 0.2843 0.2961 1.59e-69 1bpw:B, 1bpw:C, 1bpw:D
9 6vr6:D 493 465 0.2863 0.2840 0.3011 5.58e-69 6vr6:A, 6vr6:B, 6vr6:C, 6vr6:E, 6vr6:F, 6vr6:G, 6vr6:H
10 2d4e:C 515 484 0.3088 0.2932 0.3120 6.35e-67 2d4e:D
11 4pz2:B 494 468 0.3231 0.3198 0.3376 1.97e-66 4pz2:A, 4pz2:C, 4pz2:D
12 4o6r:A 489 475 0.3027 0.3027 0.3116 4.46e-66 4o6r:B, 4o6r:C, 4o6r:D
13 4go4:A 487 478 0.3006 0.3018 0.3075 1.57e-65 4go4:B, 4go4:C, 4go4:D, 4go4:E, 4go4:F, 4go4:G, 4go4:H
14 5gtk:A 491 491 0.3088 0.3075 0.3075 1.04e-64 5gtk:B, 5gtk:C, 5gtk:D, 5gtl:A, 5gtl:B, 5gtl:C, 5gtl:D
15 8rwk:A 495 480 0.2843 0.2808 0.2896 4.23e-63 8rwk:B, 8rwk:C, 8rwk:D
16 4pxl:A 486 486 0.3149 0.3169 0.3169 7.48e-62 4pxl:B
17 3iwk:H 497 484 0.3088 0.3038 0.3120 1.19e-61 3iwk:A, 3iwk:B, 3iwk:C, 3iwk:D, 3iwk:E, 3iwk:F, 3iwk:G, 3iwk:I, 3iwk:J, 3iwk:K, 3iwk:L
18 3jz4:A 481 460 0.2658 0.2703 0.2826 5.76e-61 3jz4:B, 3jz4:C, 3jz4:D
19 7mjc:A 493 484 0.3027 0.3002 0.3058 6.67e-60 7mjc:B, 7mjd:A, 7mjd:B, 7rad:A, 7rad:B
20 5izd:A 494 446 0.2536 0.2510 0.2780 1.88e-59 5izd:B, 5izd:C, 5izd:D, 5izd:G, 5izd:H
21 4nea:A 505 467 0.2658 0.2574 0.2784 2.63e-58 5dib:A, 5dib:B, 5dib:C, 5dib:D, 5eyu:A, 5eyu:B, 5eyu:C, 5eyu:D, 5ez4:A, 5ez4:B, 5ez4:C, 5ez4:D, 4mpy:A, 4mpy:B, 4mpy:C, 4mpy:D, 4mpy:E, 4mpy:F, 4mpy:G, 4mpy:H, 4nea:B, 4nea:C, 4nea:D, 4qn2:A, 4qn2:B, 4qn2:C, 4qn2:D, 4qn2:E, 4qn2:F, 4qn2:G, 4qn2:H, 4zwl:A, 4zwl:B, 4zwl:C, 4zwl:D, 4zwl:E, 4zwl:F, 4zwl:G, 4zwl:H, 4zxu:A, 4zxu:B, 4zxu:C, 4zxu:D, 4zxu:E, 4zxu:F, 4zxu:G, 4zxu:H
22 6vwf:A 450 461 0.2597 0.2822 0.2755 3.18e-58 6vwf:B
23 7a6q:A 489 479 0.2965 0.2965 0.3027 3.95e-58 7a6q:B, 5fhz:A, 5fhz:B, 5fhz:C, 5fhz:D, 5fhz:E, 5fhz:G, 5fhz:H, 7qk8:A, 7qk8:B, 7qk9:A, 7qk9:B, 6s6w:A, 6s6w:B, 6te5:A, 6te5:B, 6tgw:A, 6tgw:B, 6tgw:C, 6tgw:D, 6try:A, 6try:B
24 4fr8:C 496 490 0.3067 0.3024 0.3061 4.05e-58 1a4z:A, 1a4z:B, 1a4z:C, 1a4z:D, 1cw3:A, 1cw3:B, 1cw3:C, 1cw3:D, 1cw3:E, 1cw3:F, 1cw3:G, 1cw3:H, 8dr9:A, 8dr9:B, 4fqf:A, 4fqf:B, 4fqf:C, 4fqf:D, 4fr8:A, 4fr8:B, 4fr8:D, 4fr8:E, 4fr8:F, 4fr8:G, 4fr8:H, 3inj:A, 3inj:B, 3inj:C, 3inj:D, 3inj:E, 3inj:F, 3inj:G, 3inj:H, 3inl:A, 3inl:B, 3inl:C, 3inl:D, 3inl:E, 3inl:F, 3inl:G, 3inl:H, 4kwf:A, 4kwf:B, 4kwf:E, 4kwf:H, 4kwg:A, 4kwg:H, 5l13:A, 5l13:B, 5l13:C, 5l13:D, 5l13:E, 5l13:F, 5l13:G, 5l13:H, 3n82:A, 3n82:B, 3n82:C, 3n82:D, 3n82:E, 3n82:F, 3n82:G, 3n82:H, 3n83:A, 3n83:B, 3n83:C, 3n83:D, 3n83:E, 3n83:F, 3n83:G, 3n83:H, 1nzw:A, 1nzw:B, 1nzw:C, 1nzw:D, 1nzw:E, 1nzw:F, 1nzw:G, 1nzw:H, 1nzx:A, 1nzx:B, 1nzx:C, 1nzx:D, 1nzx:E, 1nzx:F, 1nzx:G, 1nzx:H, 1nzz:A, 1nzz:B, 1nzz:C, 1nzz:D, 1nzz:E, 1nzz:F, 1nzz:G, 1nzz:H, 1o00:A, 1o00:B, 1o00:C, 1o00:D, 1o00:E, 1o00:F, 1o00:G, 1o00:H, 1o01:A, 1o01:B, 1o01:C, 1o01:D, 1o01:E, 1o01:F, 1o01:G, 1o01:H, 1o02:A, 1o02:B, 1o02:C, 1o02:D, 1o02:E, 1o02:F, 1o02:G, 1o02:H, 1o04:A, 1o04:B, 1o04:C, 1o04:D, 1o04:E, 1o04:F, 1o04:G, 1o04:H, 2onm:A, 2onm:B, 2onm:C, 2onm:D, 2onm:E, 2onm:F, 2onm:G, 2onm:H, 2onm:I, 2onm:J, 2onm:K, 2onm:L, 2onp:A, 2onp:B, 2onp:C, 2onp:D, 2onp:E, 2onp:F, 2onp:G, 2onp:H, 3sz9:A, 3sz9:B, 3sz9:C, 3sz9:D, 3sz9:E, 3sz9:F, 3sz9:G, 3sz9:H, 2vle:A, 2vle:B, 2vle:C, 2vle:D, 2vle:E, 2vle:F, 2vle:G, 2vle:H
25 5iuv:A 495 496 0.3252 0.3212 0.3206 1.61e-57 5iuv:B, 5iuw:A, 5iuw:B, 7jso:A, 7jso:B, 7jso:C, 7jso:D, 7jso:E, 7jso:F, 7jso:G, 7jso:H
26 5abm:A 494 491 0.3108 0.3077 0.3096 1.23e-56 5abm:B, 5abm:C, 5abm:D, 5ac0:A, 5ac0:B, 5ac1:A, 5ac1:B, 5ac1:C, 5ac1:D, 5ac2:A, 1bxs:A, 1bxs:B, 1bxs:C, 1bxs:D, 6dum:A, 8ene:A, 8ene:B, 8ene:C, 8ene:D, 7jws:A, 7jwt:A, 7jwu:A, 7jwv:A, 7jww:A, 5l2m:A, 5l2n:A, 5l2o:A, 5l2o:B, 5l2o:C, 5l2o:D, 5l2o:E, 5l2o:F, 5l2o:G, 5l2o:H, 8t0n:A, 8t0t:A, 5tei:A, 7um9:A, 4wb9:A, 8wfq:A, 8wfq:B, 8wfq:C, 8wfq:D, 8wfq:E, 8wfq:F, 8wfq:G, 8wfq:H, 4wp7:A, 4wpn:A, 4x4l:A
27 6x9l:A 485 489 0.3333 0.3361 0.3333 2.49e-56 6x9l:B
28 3ty7:B 454 434 0.2618 0.2819 0.2949 3.13e-56
29 6alj:A 492 488 0.2986 0.2967 0.2992 7.58e-56 6alj:B, 6alj:C, 6alj:D, 6b5g:A, 6b5g:B, 6b5g:C, 6b5g:D, 6b5h:A, 6b5h:B, 6b5h:C, 6b5h:D, 6b5i:A, 6b5i:B, 6b5i:C, 6b5i:D, 1bi9:A, 1bi9:B, 1bi9:C, 1bi9:D, 4x2q:A, 4x2q:B, 4x2q:C, 4x2q:D
30 4v37:A 495 473 0.2699 0.2667 0.2791 1.52e-55 4a0m:A, 4a0m:B, 4a0m:C, 4a0m:D, 4v37:B, 4v37:C, 4v37:D
31 2esd:A 474 424 0.2720 0.2806 0.3137 3.15e-55 2esd:B, 2esd:C, 2esd:D, 2euh:A, 2euh:B, 2euh:C, 2euh:D, 2id2:A, 2id2:B, 2id2:C, 2id2:D, 2qe0:A, 2qe0:B, 2qe0:C, 2qe0:D, 1qi1:A, 1qi1:B, 1qi1:C, 1qi1:D
32 3iwj:A 500 474 0.2883 0.2820 0.2975 3.26e-55 3iwj:B
33 6pop:A 475 434 0.2720 0.2800 0.3065 4.93e-55 6pop:B, 6pop:C, 6pop:D, 6pop:E, 6pop:F
34 1wnb:A 474 475 0.2965 0.3059 0.3053 7.77e-55 1wnb:B, 1wnb:C, 1wnb:D, 1wnd:A, 1wnd:B, 1wnd:C, 1wnd:D
35 8hap:A 466 457 0.2618 0.2747 0.2801 2.07e-54 8hap:B
36 3rhh:D 480 459 0.2699 0.2750 0.2876 5.99e-54 3rhh:A, 3rhh:B, 3rhh:C
37 8of1:A 505 469 0.2658 0.2574 0.2772 8.68e-54 8of1:B, 8ofm:A, 8ofm:B
38 1o9j:A 494 485 0.2986 0.2955 0.3010 1.12e-53 1o9j:B, 1o9j:C, 1o9j:D
39 7rlu:A 583 497 0.2904 0.2436 0.2857 1.28e-53 4gnz:A, 4gnz:B, 4gnz:C, 4gnz:D, 4go0:A, 4go0:B, 4go0:C, 4go0:D, 4go2:A, 4go2:B, 4go2:C, 4go2:D, 2o2q:A, 2o2q:B, 2o2q:C, 2o2q:D, 2o2r:A, 2o2r:B, 2o2r:C, 2o2r:D, 3rhj:A, 3rhj:B, 3rhj:C, 3rhj:D, 3rhl:A, 3rhl:B, 3rhl:C, 3rhl:D, 3rho:A, 3rho:B, 3rho:C, 3rho:D, 3rhq:A, 3rhq:B, 3rhq:C, 3rhq:D, 3rhr:A, 3rhr:B, 3rhr:C, 3rhr:D, 7rlt:A, 7rlt:C, 7rlt:B, 7rlt:D, 7rlu:C, 7rlu:B, 7rlu:D, 7yjj:C, 7yjj:D
40 4i9b:A 496 454 0.2740 0.2702 0.2952 1.05e-52 4i8q:A, 4i9b:B
41 4f3x:A 476 462 0.2720 0.2794 0.2879 1.26e-52 4f3x:B, 4f3x:C, 4f3x:D
42 7w5n:A 492 484 0.2924 0.2907 0.2955 1.43e-51 7w5k:A, 7w5k:B, 7w5k:C, 7w5k:D, 7w5n:B, 7w5n:C, 7w5n:D
43 3rhd:A 456 445 0.2658 0.2851 0.2921 6.27e-51 3rhd:B, 3rhd:C, 3rhd:D
44 6j76:A 477 435 0.2454 0.2516 0.2759 6.49e-51 6j76:B
45 5x5t:A 476 474 0.2699 0.2773 0.2785 7.43e-51 5x5t:B, 5x5u:A, 5x5u:B
46 4ywe:A 476 487 0.3006 0.3088 0.3018 3.44e-50 4ywe:B, 4ywe:C, 4ywe:D, 4ywe:E, 4ywe:F, 4ywe:G, 4ywe:H
47 3efv:A 459 443 0.2536 0.2702 0.2799 3.77e-50 3efv:B, 3efv:C, 3efv:D
48 5ur2:B 959 474 0.2924 0.1491 0.3017 4.51e-50 5ur2:A, 5ur2:C, 5ur2:D
49 4i8p:A 500 474 0.2740 0.2680 0.2827 4.53e-50 4i8p:B
50 2bhp:A 516 491 0.3027 0.2868 0.3014 5.95e-50 2bhp:B, 2bhq:A, 2bhq:B, 2bja:A, 2bja:B, 2bjk:A, 2bjk:B, 2ehq:A, 2ehq:B, 2ehu:A, 2ehu:B, 2eii:A, 2eii:B, 2eit:A, 2eit:B, 2eiw:A, 2eiw:B, 2ej6:A, 2ej6:B, 2ejd:A, 2ejd:B, 2ejl:A, 2ejl:B, 2j40:A, 2j40:B, 2j5n:A, 2j5n:B
51 3b4w:A 483 476 0.2945 0.2981 0.3025 1.07e-49
52 6fku:A 511 475 0.2822 0.2701 0.2905 2.60e-49 6fku:B
53 2ilu:A 477 463 0.2577 0.2642 0.2721 8.37e-49 2imp:A, 2opx:A
54 6mvu:A 752 486 0.3006 0.1955 0.3025 3.25e-48 6mvs:A, 6mvt:A, 6mvu:B
55 6mvu:A 752 254 0.1268 0.0824 0.2441 6.76e-08 6mvs:A, 6mvt:A, 6mvu:B
56 5ekc:E 490 484 0.2536 0.2531 0.2562 4.52e-48 5ek6:A, 5ek6:B, 5ek6:C, 5ek6:D, 5ek6:E, 5ek6:F, 5ek6:G, 5ek6:H, 5ekc:A, 5ekc:B, 5ekc:C, 5ekc:D, 5ekc:F, 5ekc:G, 5ekc:H, 5euy:A, 5euy:B, 5euy:C, 5euy:D, 5euy:E, 5euy:F, 5euy:G, 5euy:H, 5exf:A, 5exf:B, 5exf:C, 5exf:D, 5exf:E, 5exf:F, 5exf:G, 5exf:H, 5f2c:A, 5f2c:B, 5f2c:C, 5f2c:D, 5f2c:E, 5f2c:F, 5f2c:G, 5f2c:H, 4h73:A, 4h73:B, 4h73:C, 4h73:D, 4h73:E, 4h73:F, 4h73:G, 4h73:H, 4nmj:A, 4nmj:B, 4nmj:C, 4nmj:D, 4nmj:E, 4nmj:F, 4nmj:G, 4nmj:H, 4nmk:A, 4nmk:B, 4nmk:C, 4nmk:D, 4nmk:E, 4nmk:F, 4nmk:G, 4nmk:H
57 7uyy:A 496 459 0.2863 0.2823 0.3050 5.10e-48 7uyy:B
58 3u4j:A 505 471 0.3047 0.2950 0.3163 8.91e-48
59 8c54:A 482 454 0.2577 0.2614 0.2775 3.26e-47 8c54:B, 8c54:C, 8c54:D
60 4jz6:A 484 479 0.2597 0.2624 0.2651 1.87e-45
61 5kj5:B 484 484 0.2638 0.2665 0.2665 4.21e-45 4i1w:A, 4i1w:B, 4i1w:C, 4i1w:D, 4i25:A, 4i25:B, 4i25:C, 4i25:D, 4i2r:A, 4i2r:B, 4i2r:C, 4i2r:D, 5kj5:A, 5kj5:D, 5kj5:C, 5klk:A, 5klk:B, 5klk:D, 5klk:C, 5kll:A, 5kll:B, 5kll:C, 5kll:D, 5klm:A, 5klm:B, 5klm:C, 5klm:D, 5kln:A, 5kln:D, 5kln:B, 5kln:C, 5klo:A, 5klo:B, 5klo:C, 5klo:D, 4npi:A, 4npi:B, 4npi:C, 4npi:D, 4oe2:A, 4oe2:B, 4oe2:C, 4oe2:D, 4ou2:A, 4ou2:B, 4ou2:C, 4ou2:D, 4oub:A, 4oub:B, 4oub:C, 4oub:D
62 4u3w:A 485 486 0.2822 0.2845 0.2840 4.50e-44 4u3w:B
63 5fhz:F 449 481 0.2761 0.3007 0.2807 9.24e-43
64 2jg7:A 509 471 0.2515 0.2417 0.2611 1.92e-42 2jg7:B, 2jg7:C, 2jg7:D, 2jg7:E, 2jg7:F, 2jg7:G, 2jg7:H
65 4pxn:A 498 476 0.2434 0.2390 0.2500 1.60e-40 4pxn:B
66 4itb:A 453 459 0.2352 0.2539 0.2505 3.47e-40 4ita:A, 4ita:B, 4itb:B, 3vz3:A, 3vz3:B
67 2w8q:A 485 454 0.2536 0.2557 0.2731 4.39e-40 2w8r:A
68 7na0:A 981 450 0.2720 0.1356 0.2956 7.02e-40 7na0:B, 4nm9:A, 4nm9:B, 4nma:A, 4nma:B, 4nmb:A, 4nmb:B, 4nmc:B, 4nmd:A, 4nmd:B, 4nme:A, 4nme:B, 4nmf:A, 4nmf:B
69 4nmc:A 941 450 0.2720 0.1413 0.2956 8.79e-40
70 3haz:A 983 391 0.2372 0.1180 0.2967 9.18e-39 6bsn:A, 6bsn:B, 3haz:B, 4q71:A, 4q71:B, 4q72:A, 4q72:B, 4q73:A, 4q73:B
71 5u0l:A 488 456 0.2536 0.2541 0.2719 1.09e-38 5u0m:A, 5u0m:B
72 6dbb:A 504 471 0.2413 0.2341 0.2505 6.37e-38 6dbb:B, 6dbb:C
73 4oht:A 455 450 0.2393 0.2571 0.2600 1.13e-37 4oht:B, 4ywu:A, 4ywu:B, 4ywv:A, 4ywv:B
74 1ky8:A 499 415 0.2311 0.2265 0.2723 1.70e-37 1uxn:A, 1uxp:A, 1uxq:A, 1uxr:A, 1uxt:A, 1uxu:A, 1uxv:A
75 5kf0:A 480 404 0.2229 0.2271 0.2698 3.34e-37 5jry:A, 5kf0:B, 5kf0:C, 5kf0:D
76 6rts:A 509 447 0.2474 0.2377 0.2707 9.65e-37 6rts:B, 6rtt:A, 6rtt:B, 6rtu:A
77 3ju8:A 486 467 0.2556 0.2572 0.2677 3.42e-36 3ju8:B
78 6o4d:B 510 471 0.2413 0.2314 0.2505 8.21e-36 2j6l:A, 2j6l:B, 2j6l:C, 2j6l:D, 2j6l:E, 2j6l:F, 2j6l:G, 2j6l:H, 6o4b:A, 6o4b:B, 6o4b:C, 6o4b:D, 6o4b:E, 6o4b:F, 6o4b:G, 6o4b:H, 6o4c:A, 6o4c:B, 6o4c:C, 6o4c:D, 6o4c:E, 6o4c:F, 6o4c:G, 6o4c:H, 6o4d:A, 6o4d:C, 6o4d:D, 6o4d:E, 6o4d:F, 6o4d:G, 6o4d:H, 6o4e:A, 6o4e:B, 6o4e:C, 6o4e:D, 6o4e:E, 6o4e:F, 6o4e:G, 6o4e:H, 6o4f:B, 6o4f:E, 6o4f:F, 6o4g:B, 6o4g:E, 6o4g:G, 6o4g:H, 6o4h:A, 6o4h:B, 6o4h:C, 6o4h:D, 6o4h:E, 6o4h:F, 6o4h:G, 6o4h:H, 6o4i:A, 6o4i:B, 6o4i:C, 6o4i:D, 6o4i:E, 6o4i:F, 6o4i:G, 6o4i:H, 6o4k:A, 6o4k:B, 6o4k:C, 6o4k:D, 6o4k:E, 6o4k:F, 6o4k:G, 6o4k:H, 6o4l:A, 6o4l:B, 6o4l:C, 6o4l:D, 6u2x:A, 6u2x:B, 6u2x:C, 6u2x:D, 6u2x:E, 6u2x:F, 6u2x:G, 6u2x:H, 6v0z:A, 6v0z:B, 6v0z:C, 6v0z:D, 6v0z:E, 6v0z:F, 6v0z:G, 6v0z:H, 4x0t:A, 4x0t:B, 4x0t:C, 4x0t:D, 4x0u:A, 4x0u:B, 4x0u:C, 4x0u:D, 4zuk:A, 4zuk:B, 4zuk:C, 4zuk:D, 4zuk:E, 4zuk:F, 4zuk:G, 4zuk:H, 4zul:A, 4zul:B, 4zul:C, 4zul:D, 4zul:E, 4zul:F, 4zul:G, 4zul:H, 4zvy:B
79 4i3x:A 476 481 0.2454 0.2521 0.2495 4.36e-34 4i3t:A, 4i3t:B, 4i3t:C, 4i3t:D, 4i3t:E, 4i3t:F, 4i3t:G, 4i3t:H, 4i3u:A, 4i3u:B, 4i3u:C, 4i3u:D, 4i3u:E, 4i3u:F, 4i3u:G, 4i3u:H, 4i3v:A, 4i3v:B, 4i3v:C, 4i3v:D, 4i3v:E, 4i3v:F, 4i3v:G, 4i3v:H, 4i3w:A, 4i3w:B, 4i3w:C, 4i3w:D, 4i3w:E, 4i3w:F, 4i3w:G, 4i3w:H, 4i3x:B, 4i3x:C, 4i3x:D, 4i3x:E, 4i3x:F, 4i3x:G, 4i3x:H
80 5j6b:A 481 450 0.2413 0.2453 0.2622 1.47e-33 5j6b:B, 5j6b:C, 5j6b:D
81 5n5s:B 481 401 0.2168 0.2204 0.2643 1.22e-32 5n5s:A, 5n5s:C, 5n5s:D
82 6x9d:A 1218 435 0.2434 0.0977 0.2736 5.10e-28 8dkq:A, 5kf6:A, 5kf6:B, 5kf7:A, 7my9:A, 7my9:B, 7mya:A, 7mya:B, 7myb:A, 7myb:B, 7myc:A, 7myc:B, 6ufp:A, 6ufp:B, 6vz9:A, 6vz9:B, 8w0k:A, 6x99:A, 6x99:B, 6x9a:A, 6x9a:B, 6x9b:A, 6x9b:B, 6x9c:A, 6x9c:B, 6x9d:B
83 5ux5:A 963 452 0.2311 0.1173 0.2500 1.34e-27 5ux5:B, 5ux5:C, 5ux5:D
84 5ucd:A 435 353 0.1963 0.2207 0.2720 2.16e-24 5ucd:B
85 4oe4:B 481 403 0.2168 0.2204 0.2630 7.80e-23 4oe4:A
86 8rkq:A 547 413 0.2065 0.1846 0.2446 5.11e-22 4e3x:A, 4e3x:B, 4lh0:A, 4lh0:B, 4lh3:A, 4lh3:B, 7mer:A, 7mer:B, 7mes:A, 7mes:B, 8rkq:D, 8rkr:A, 3v9h:A, 3v9h:B, 3v9h:C, 3v9h:D, 3v9j:A, 3v9j:B, 3v9k:A, 3v9k:B, 3v9l:A, 3v9l:B
87 4l1o:B 452 447 0.2168 0.2345 0.2371 1.00e-21 8bb8:A, 8bb8:B, 4h80:A, 4h80:B, 4h80:C, 4h80:D, 4h80:E, 4h80:F, 4h80:G, 4h80:H, 4l1o:A, 4l2o:A, 4l2o:B, 4l2o:E, 4l2o:G, 3szb:A, 3szb:B
88 4lem:C 544 401 0.2393 0.2151 0.2918 2.42e-21 4ihi:A, 4jdc:A, 4lem:A, 4lem:B, 4lem:D, 4lem:F, 4ns3:A, 4ns3:B, 4ns3:C, 4ns3:D, 4ns3:E, 4ns3:F
89 1ad3:A 446 349 0.1759 0.1928 0.2464 1.56e-19 1ad3:B
90 6d97:A 522 408 0.1922 0.1801 0.2304 8.35e-16 6d97:B, 6d97:C, 6d97:D
91 2y53:A 529 434 0.2188 0.2023 0.2465 4.37e-11 2vro:A, 2vro:B, 2y53:B, 2y5d:A, 2y5d:B
92 6jqm:A 678 295 0.1452 0.1047 0.2407 1.67e-10 6jqm:B, 6jqm:C, 6jqm:D, 6jqm:E, 6jqm:F, 6jqn:A, 6jqn:B, 6jqn:C, 6jqn:D, 6jqn:E, 6jqn:F, 6jqo:A, 6jqo:B, 6jqo:C, 6jqo:D, 6jqo:E, 6jqo:F
93 4c3s:A 435 453 0.1943 0.2184 0.2097 1.81e-08 5dbv:A
94 7bvp:A 869 255 0.1268 0.0713 0.2431 2.51e-08 7bvp:B, 7bvp:C, 7bvp:D, 7bvp:E, 7bvp:F, 6scg:A, 6scg:B, 6sci:A, 6sci:B, 6tqh:A, 6tqh:B, 6tqm:B, 6tqm:A
95 5nno:A 484 326 0.1452 0.1467 0.2178 1.30e-06 5nno:B
96 8cej:A 449 426 0.1963 0.2138 0.2254 2.47e-04 8cej:B, 8cej:C, 8cej:D, 8cek:A, 8cek:B, 8cek:C, 8cek:D
97 1eyy:A 504 261 0.1227 0.1190 0.2299 6.27e-04 1eyy:B, 1eyy:C, 1eyy:D, 1ez0:A, 1ez0:B, 1ez0:C, 1ez0:D
98 5j7i:B 456 175 0.0838 0.0899 0.2343 0.009 5j7i:C, 5j7i:D
99 6rqf:J 160 68 0.0429 0.1313 0.3088 0.91 7qrm:B, 7qrm:J, 6rqf:B, 7zyv:J, 7zyv:B
100 3s9c:A 234 161 0.0716 0.1496 0.2174 4.3 3sbk:A
101 8f2m:D 434 98 0.0511 0.0576 0.2551 7.0
102 1xbn:A 195 65 0.0348 0.0872 0.2615 7.3 6cww:A, 6cww:B, 3eee:A, 3eee:B, 3eee:C, 3eee:D, 4fdk:A, 4fdk:B, 3iqb:A, 4it2:A, 4it2:B, 5jru:A, 5jru:B, 5jru:C, 5jru:D, 5jru:E, 5jru:F, 5jrv:A, 5jrv:B, 5jrx:A, 5jrx:B, 3lah:A, 3lah:B, 3lai:A, 3lai:B, 3lai:C, 3m0b:A, 3nvr:A, 3nvr:B, 3nvu:A, 3nvu:B, 3sj5:A, 3sj5:B, 3tf0:A, 3tf0:B, 3tf1:A, 3tf1:B, 1u4h:A, 1u4h:B, 1u55:A, 1u55:B, 1u56:A, 1u56:B
103 7ood:j 122 42 0.0327 0.1311 0.3810 7.8 7p6z:j, 7pah:j, 7pai:j, 7paj:j, 7pak:j, 7pal:j, 7pam:j, 7pan:j, 7pao:j, 7paq:j, 7par:j, 7pas:j, 7pat:j, 7pau:j, 7ph9:j, 7pha:j, 7phb:j, 7phc:j, 7pi8:j, 7pi9:j, 7pia:j, 7pib:j, 7pic:j, 7pio:j, 7pip:j, 7piq:j, 7pir:j, 7pis:j, 7pit:j
104 2eh6:A 375 38 0.0286 0.0373 0.3684 7.8 2eh6:B
105 5foo:A 463 145 0.0798 0.0842 0.2690 8.1 5foo:B, 5foo:C, 5foo:D, 5foo:E, 5foo:F
106 8u5a:A 149 36 0.0307 0.1007 0.4167 8.3 8u5a:B
107 8vhu:A 743 33 0.0266 0.0175 0.3939 9.2 5cns:A, 5cns:B, 5cns:C, 5cns:D, 5cnt:A, 5cnt:B, 5cnt:C, 5cnt:D, 5cnu:A, 5cnu:B, 5cnu:C, 5cnu:D, 5cnv:A, 5cnv:B, 5cnv:C, 5cnv:D, 4erm:A, 4erm:B, 4erm:C, 4erm:D, 4erp:A, 4erp:B, 4erp:C, 4erp:D, 1r1r:A, 1r1r:B, 1r1r:C, 2r1r:A, 2r1r:B, 2r1r:C, 3r1r:A, 3r1r:B, 3r1r:C, 4r1r:A, 4r1r:B, 4r1r:C, 5r1r:A, 5r1r:B, 5r1r:C, 6r1r:A, 6r1r:B, 6r1r:C, 7r1r:A, 7r1r:B, 7r1r:C, 3uus:A, 3uus:B, 3uus:C, 3uus:D, 8vhn:A, 8vhn:B, 8vho:A, 8vho:B, 8vhp:A, 8vhp:B, 8vhp:C, 8vhp:D, 8vhp:E, 8vhp:F, 8vhp:G, 8vhp:H, 8vhq:A, 8vhq:B, 8vhq:C, 8vhq:D, 8vhr:A, 8vhr:B, 8vhr:C, 8vhr:D, 8vhu:B, 6w4x:A, 6w4x:B, 2x0x:A, 2x0x:B, 2x0x:C, 2xak:A, 2xak:B, 2xak:C, 2xap:A, 2xap:B, 2xap:C, 2xav:A, 2xav:B, 2xav:C, 2xaw:A, 2xaw:B, 2xaw:C, 2xax:A, 2xax:B, 2xax:C, 2xay:A, 2xay:B, 2xay:C, 2xaz:A, 2xaz:B, 2xaz:C, 2xo4:A, 2xo4:B, 2xo4:C, 2xo5:A, 2xo5:B, 2xo5:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218