Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MMQISSNGITRLKREEGERLKAYSDSRGIPTIGVGHTGKVDGNSVASGMTITAEKSSELLKEDLQWVEDAISSLVRVPLN
QNQYDAMCSLIFNIGKSAFAGSTVLRQLNLKNYQAAADAFLLWKKAGKDPDILLPRRRRERALFLS

The query sequence (length=146) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2anv:A 146 146 1.0000 1.0000 1.0000 6.22e-107 2anv:B, 2anx:A, 2anx:B
2 4xes:A 471 135 0.2808 0.0870 0.3037 1.15e-07 4buo:B, 8fmz:A, 8fn0:A, 8fn1:A, 7l0p:C, 7l0q:C, 7l0r:C, 7l0s:C, 4xee:A
3 5zty:A 449 136 0.2740 0.0891 0.2941 1.59e-07 6kpc:A
4 5yqz:R 558 138 0.2671 0.0699 0.2826 2.46e-07 5xez:A, 5xf1:A
5 4wtv:B 426 124 0.2534 0.0869 0.2984 2.71e-07
6 4w8f:B 2609 138 0.2671 0.0149 0.2826 3.28e-07 220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
7 6p5v:A 373 137 0.2808 0.1099 0.2993 4.48e-07 6b5q:A, 6b5q:B, 6bg3:A, 6bg5:A, 4i7p:A, 7kwa:A, 6p5w:A, 3tdu:B, 3tdu:A, 3tdz:A, 3tdz:B, 5ufi:A, 5ufi:B, 5ufi:C, 5ufi:D, 5v83:A, 5v86:A, 5v88:A, 6xol:A, 6xom:A, 6xon:A, 6xoo:A, 6xop:A, 6xoq:A
8 6e67:B 476 136 0.2740 0.0840 0.2941 4.80e-07 3d4s:A, 5d5a:A, 5d5b:A, 5d6l:A, 6e67:A, 3ny8:A, 3ny9:A, 3nya:A, 6oba:A, 3pds:A, 6prz:A, 6ps0:A, 6ps1:A, 6ps2:A, 6ps3:A, 6ps4:A, 6ps5:A, 6ps6:A, 2rh1:A, 5x7d:A
9 5ndd:A 567 134 0.2740 0.0705 0.2985 5.30e-07 5awi:A, 5awi:B, 2bc5:A, 2bc5:B, 2bc5:C, 2bc5:D, 3c62:A, 3c62:B, 3c62:C, 3c62:D, 3de8:A, 3de8:D, 3de8:B, 3de8:C, 3de9:A, 8drd:A, 8drd:B, 8drf:A, 8drj:C, 8drl:A, 8drm:A, 6dy4:D, 6dy4:A, 6dy6:A, 6dy6:B, 6dyb:A, 6dyb:C, 6dyc:A, 6dyc:B, 6dyd:A, 6dyd:C, 6dye:A, 6dye:B, 6dyi:B, 6dyj:A, 6dyj:E, 6dyj:C, 6dyj:G, 6dyk:A, 6dyk:E, 6dyk:C, 6dyk:G, 6dyl:A, 6dyl:E, 6dyl:C, 6dyl:G, 3foo:A, 3foo:B, 3foo:C, 3foo:D, 3foo:E, 3foo:F, 3foo:G, 3foo:H, 3foo:I, 3foo:J, 3foo:L, 3foo:K, 3fop:A, 3fop:B, 3l1m:A, 5ndz:A, 3nmi:A, 3nmi:B, 3nmi:C, 3nmi:D, 3nmi:E, 3nmi:F, 3nmj:A, 3nmj:C, 3nmj:B, 3nmj:D, 3nmk:A, 3nmk:C, 3nmk:B, 3nmk:D, 2qla:A, 2qla:B, 2qla:C, 2qla:D, 6wza:A, 6wza:B, 6wza:C, 6x8x:A
10 5t04:A 458 137 0.2740 0.0873 0.2920 5.99e-07 4grv:A
11 7e40:D 345 136 0.2808 0.1188 0.3015 7.56e-07 7e40:B
12 2qb0:B 241 138 0.2740 0.1660 0.2899 8.50e-07 2qb0:D
13 5zbh:A 461 127 0.2603 0.0824 0.2992 8.80e-07
14 5zbq:A 463 127 0.2603 0.0821 0.2992 8.81e-07 8k6m:D, 7vgx:R
15 3odu:A 466 133 0.2740 0.0858 0.3008 8.91e-07 3odu:B, 3oe0:A, 3oe8:A, 3oe8:B, 3oe8:C, 3oe9:A, 3oe9:B
16 5x33:A 439 133 0.2740 0.0911 0.3008 8.96e-07
17 4z9g:A 421 135 0.2808 0.0974 0.3037 9.40e-07 4k5y:A, 4k5y:B, 4z9g:B, 4z9g:C
18 4djh:B 448 135 0.2740 0.0893 0.2963 9.63e-07 4djh:A
19 5t1a:A 445 149 0.2945 0.0966 0.2886 1.11e-06
20 5i0n:A 489 134 0.2671 0.0798 0.2910 1.23e-06 4pla:A, 4yc4:A
21 6a73:A 290 137 0.2671 0.1345 0.2847 1.35e-06 6a73:B
22 7bvq:A 455 133 0.2671 0.0857 0.2932 1.46e-06 7bts:A, 7bu6:A, 7bu7:A, 7bvq:B
23 6kjv:B 424 135 0.2671 0.0920 0.2889 1.53e-06 6kjv:A, 6kk1:A, 6kk1:B, 6kk7:A, 6kk7:B, 5vew:A, 5vew:B, 5vex:A, 5vex:B
24 4u14:A 436 132 0.2808 0.0940 0.3106 1.59e-06 4daj:A, 4daj:B, 4daj:C, 4daj:D
25 3rze:A 428 133 0.2671 0.0911 0.2932 1.63e-06
26 8a5x:A 466 132 0.2671 0.0837 0.2955 1.71e-06 4wtv:A
27 6ol9:A 416 121 0.2397 0.0841 0.2893 1.75e-06
28 6zfz:A 446 133 0.2671 0.0874 0.2932 1.81e-06 5cxv:A, 6wjc:A, 6zg4:A, 6zg9:A
29 6fw2:A 444 127 0.2740 0.0901 0.3150 2.23e-06 7p41:D
30 6m9t:A 444 133 0.2671 0.0878 0.2932 2.65e-06
31 4lde:A 454 137 0.2671 0.0859 0.2847 2.79e-06 7bz2:R, 7dhi:R, 7dhr:R, 4ekp:A, 4ekp:B, 4ekq:A, 4ekq:B, 4ekr:A, 4ekr:B, 4eks:A, 4eks:B, 4gbr:A, 8gdz:R, 8ge1:R, 8ge2:R, 8ge3:R, 8ge4:R, 8ge5:R, 8ge6:R, 8ge7:R, 8ge8:R, 8ge9:R, 8gea:R, 8geb:R, 8gec:R, 8ged:R, 8gee:R, 8gef:R, 8geg:R, 8geh:R, 8gei:R, 8gfv:R, 8gfw:R, 8gfx:R, 8gfy:R, 8gfz:R, 8gg0:R, 8gg1:R, 8gg2:R, 8gg3:R, 8gg4:R, 8gg5:R, 8gg6:R, 8gg7:R, 8gg8:R, 8gg9:R, 8gga:R, 8ggb:R, 8ggc:R, 8ggi:R, 8ggj:R, 8ggk:R, 8ggl:R, 8ggm:R, 8ggn:R, 8ggo:R, 8ggp:R, 8ggq:R, 8ggr:R, 8ggs:R, 8ggt:R, 8ggu:R, 8ggv:R, 8ggw:R, 8ggx:R, 8ggy:R, 8ggz:R, 8gh0:R, 8gh1:R, 4i7m:A, 4i7m:B, 4i7n:A, 4i7n:B, 4i7o:A, 4i7o:B, 4i7p:B, 4i7q:A, 4i7q:B, 4i7r:A, 4i7r:B, 4i7s:A, 4i7s:B, 4i7t:A, 4i7t:B, 5jqh:A, 5jqh:B, 4ldl:A, 4ldo:A, 6mxt:A, 6n48:A, 6ni3:R, 3p0g:A, 4qkx:A, 7sj6:A, 7sj6:B, 3sn6:R, 8unl:R, 8unm:R, 8unn:R, 8uno:R, 8unp:R, 8unq:R, 8unr:R, 8uns:R, 8unt:R, 8unu:R, 8unv:R, 8unw:R, 8unx:R, 8uny:R, 8unz:R, 8uo0:R, 8uo1:R, 8uo2:R, 7xk9:A, 7xka:A
32 7f8x:A 443 132 0.2671 0.0880 0.2955 2.86e-06 7f8u:A, 7f8y:A
33 6xyr:A 348 127 0.2740 0.1149 0.3150 3.16e-06
34 3oe6:A 418 137 0.2671 0.0933 0.2847 3.17e-06
35 6igk:A 471 132 0.2671 0.0828 0.2955 3.19e-06 5glh:A, 6igl:A, 6lry:A
36 6ajf:A 901 132 0.2671 0.0433 0.2955 3.81e-06 6ajg:A, 6ajh:A, 6ajj:A, 7c2m:A, 7c2n:A, 6or2:A, 7wnx:A
37 4dkl:A 442 127 0.2534 0.0837 0.2913 3.96e-06
38 8w1v:A 441 127 0.2603 0.0862 0.2992 4.19e-06 8w1v:B
39 7joz:R 446 127 0.2603 0.0852 0.2992 4.20e-06 7ckw:R, 7ckx:R, 7cky:R, 7ckz:R, 7crh:R, 7f0t:F, 7f1o:F, 7f1z:F, 7f23:F, 7f24:F, 8irr:R, 7jv5:R, 7jvp:R, 7jvq:R, 8jxr:A, 8jxs:A, 7ljc:R, 7ljd:R, 7x2c:F, 7x2d:F, 7x2f:F
40 5tzr:A 437 133 0.2740 0.0915 0.3008 4.34e-06 5kw2:A, 4phu:A
41 6cm4:A 423 132 0.2671 0.0922 0.2955 4.39e-06 6luq:A
42 6aji:A 873 132 0.2671 0.0447 0.2955 4.43e-06
43 3v2y:A 455 134 0.2671 0.0857 0.2910 4.87e-06 3v2w:A
44 3vw7:A 442 178 0.3288 0.1086 0.2697 4.88e-06
45 3uon:A 438 132 0.2671 0.0890 0.2955 5.06e-06
46 8jwz:A 450 132 0.2671 0.0867 0.2955 6.11e-06 3eml:A, 8jwy:A, 3qak:A, 5wf5:A, 5wf6:A
47 3pbl:A 432 132 0.2671 0.0903 0.2955 6.35e-06 3pbl:B
48 7mwz:B 352 127 0.2534 0.1051 0.2913 6.76e-06 7mwz:A, 7mwz:C
49 6ffh:A 414 132 0.2671 0.0942 0.2955 7.76e-06 5cgc:A, 5cgd:A, 6ffi:A, 4oo9:A, 7p2l:A
50 6zx9:C 257 127 0.2534 0.1440 0.2913 7.94e-06
51 6d9m:A 326 127 0.2534 0.1135 0.2913 1.29e-05
52 4tn3:B 362 132 0.2603 0.1050 0.2879 1.42e-05 5k3q:A, 5k3q:B, 5k3q:C, 5k3q:D, 4tn3:A, 5w9a:A, 5w9a:B
53 4ej4:A 442 132 0.2603 0.0860 0.2879 1.49e-05
54 6iih:A 446 132 0.2603 0.0852 0.2879 2.51e-05 6iih:B, 6lb7:B, 6xqo:J
55 7z36:B 446 137 0.2740 0.0897 0.2920 2.60e-05 6h3a:A, 6h3a:F, 6qaj:A, 6qaj:B, 6qu1:A, 2yvr:A, 2yvr:B, 7z36:A
56 7mwz:D 301 121 0.2055 0.0997 0.2479 1.22e-04
57 5ewx:B 214 25 0.0959 0.0654 0.5600 0.016 5ewx:A
58 3smp:B 363 89 0.1849 0.0744 0.3034 0.14 2i7n:B, 3smp:A
59 2i7n:A 325 89 0.1849 0.0831 0.3034 0.15
60 7ale:A 419 66 0.1781 0.0621 0.3939 0.69 7ale:B, 6yb8:A, 6yb8:B, 6yb9:A, 6yb9:B
61 3ckg:A 236 84 0.1849 0.1144 0.3214 1.0
62 8e14:A 269 70 0.1096 0.0595 0.2286 3.4 1a5v:A, 1a5w:A, 1a5x:A, 8e14:E, 8e14:C, 8e14:G, 5ejk:A, 5ejk:E, 5ejk:C, 5ejk:H, 5ejk:D, 5ejk:G, 5ejk:B, 5ejk:F, 7jn3:A, 7jn3:G, 7jn3:C, 7jn3:E, 7ku7:A, 7ku7:G, 7ku7:C, 7ku7:E, 7kui:A, 7kui:G, 7kui:C, 7kui:E, 3o4n:A, 3o4n:B, 1vsd:A, 1vsf:A, 1vsh:A, 1vsi:A, 1vsj:A
63 1cle:A 534 90 0.1644 0.0449 0.2667 4.9 1cle:B, 1llf:A, 1llf:B
64 7bc4:B 2054 71 0.1438 0.0102 0.2958 5.6
65 7mq8:SP 1993 26 0.0822 0.0060 0.4615 5.9 7mq9:SP
66 7mqa:SP 2485 26 0.0822 0.0048 0.4615 6.3
67 4dbq:A 744 51 0.1096 0.0215 0.3137 7.4 4pjj:A, 2vas:A
68 7jil:j 159 26 0.0822 0.0755 0.4615 7.5
69 6hvg:A 1278 60 0.1233 0.0141 0.3000 9.5 6hvg:B, 6syq:A, 6syq:B, 6szi:A, 6szi:B, 6t16:B, 6t16:A, 6t18:A, 6t18:B, 6t1p:A, 6t1p:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218