BioLiP

>protein
MMKKIDVKILDPRVGKEFPLPTYATSGSAGLDLRACLNDAVELAPGDTTLVPTGLAIHIADPSLAAMMLPRSGLGHKHGI
VLGNLVGLIDSDYHGQLMISVWNRGQDSFTIQPGERIAQMIFVPVVQAEFNLVEDFRGEGGFGHSGRQ

The query sequence (length=148) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6hde:B	152	152	1.0000	0.9737	0.9737	7.62e-106	1eu5:A, 1euw:A, 6hde:A, 6hde:C, 2hrm:A, 1rn8:A, 1rnj:A, 1seh:A, 1syl:A
2	6mao:A	137	132	0.5878	0.6350	0.6591	1.51e-64
3	7n6s:C	147	147	0.4189	0.4218	0.4218	1.77e-29	7n6s:A, 7n6s:B, 7n6s:F, 7n6s:D, 7n6s:E
4	8hrv:B	145	131	0.3041	0.3103	0.3435	4.21e-18	8hrv:A, 8hrv:C
5	4oop:B	142	131	0.3311	0.3451	0.3740	6.84e-18	4oop:A, 4oop:C
6	4gcy:A	163	148	0.3311	0.3006	0.3311	2.93e-14	8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
7	6mjk:A	144	130	0.3243	0.3333	0.3692	1.40e-13
8	6ljj:A	150	128	0.2973	0.2933	0.3438	1.98e-13	3ara:A, 3ara:C, 3ara:B, 3arn:A, 3arn:C, 3arn:B, 3ehw:A, 3ehw:B, 3ehw:C, 3ehw:X, 3ehw:Y, 3ehw:Z, 5h4j:A, 2hqu:A, 2hqu:B, 2hqu:C
9	5cct:A	169	165	0.3176	0.2781	0.2848	4.75e-13	5cco:A, 5nyz:A, 5nz2:A, 3zez:A, 3zf0:A, 3zf1:A, 3zf4:A, 3zf5:A, 3zf6:A
10	3f4f:A	138	135	0.3041	0.3261	0.3333	7.72e-13	3f4f:B, 3f4f:C, 3p48:A, 3p48:C, 3p48:B
11	2ol1:C	125	117	0.2568	0.3040	0.3248	3.82e-12	2oke:A, 2oke:C, 2oke:B, 2ol1:A, 2ol1:B
12	2y8c:C	136	119	0.2568	0.2794	0.3193	1.40e-11	2y8c:B
13	5f9k:B	130	110	0.2703	0.3077	0.3636	1.62e-10	5f9k:A, 5f9k:C
14	3t64:A	153	131	0.2838	0.2745	0.3206	2.28e-10	3t60:A, 3t60:B, 3t60:C, 3t64:B, 3t64:C, 3t6y:A, 3t6y:B, 3t6y:C, 3t70:A, 3t70:B, 3t70:C, 1vyq:A, 1vyq:B, 1vyq:C, 2y8c:A
15	1f7r:A	133	125	0.2500	0.2782	0.2960	6.59e-10	1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
16	4wrk:A	158	144	0.2365	0.2215	0.2431	3.76e-07	4gv8:A, 4gv8:C, 4gv8:B, 4gv8:D, 4gv8:F, 4gv8:E, 4wrk:B, 4wrk:C, 4wrk:D, 4wrk:E, 4wrk:F
17	3tp1:A	114	111	0.2500	0.3246	0.3333	2.68e-06	2d4n:A, 3tpn:A, 3tps:A, 3tpw:A, 3tpy:A, 3tq3:A, 3tq4:A, 3tq5:A, 3trl:A, 3trn:A, 3ts6:A, 3tsl:A, 3tta:A
18	5y5p:D	171	117	0.2365	0.2047	0.2991	2.38e-05	5y5p:A, 5y5p:B, 5y5p:C, 5y5p:E, 5y5p:F, 5y5q:A, 5y5q:B, 5y5q:C
19	4aoo:A	143	124	0.2432	0.2517	0.2903	3.35e-04	4ao5:A, 4ao5:B, 4ao5:C, 4ao5:D, 4ao5:E, 4ao5:F, 4aoo:B, 4aoo:C, 4aoo:D, 4aoz:A, 4aoz:B, 4aoz:C, 4apz:1, 4apz:Y, 4apz:2, 4apz:3, 4apz:4, 4apz:5, 4apz:7, 4apz:6, 4apz:8, 4apz:9, 4apz:a, 4apz:A, 4apz:C, 4apz:B, 4apz:D, 4apz:E, 4apz:F, 4apz:G, 4apz:I, 4apz:H, 4apz:J, 4apz:K, 4apz:L, 4apz:M, 4apz:N, 4apz:O, 4apz:P, 4apz:R, 4apz:Q, 4apz:S, 4apz:U, 4apz:T, 4apz:V, 4apz:W, 4apz:X, 4apz:Z, 4apz:b, 4apz:d, 4apz:c, 4apz:e, 4apz:g, 4apz:f, 4apz:h, 4apz:j, 4apz:i, 4apz:k, 4apz:m, 4apz:l, 4b0h:A, 4b0h:B, 4b0h:C, 2xce:A, 2xce:B, 2xce:C, 2xce:D, 2xce:E, 2xce:F, 2xy3:A, 2xy3:B, 2xy3:C, 2xy3:D, 2xy3:E, 2xy3:F
20	6lj3:A	164	101	0.1959	0.1768	0.2871	0.002	6ky9:A, 6ky9:B, 6ky9:C, 6kz6:C, 6kz6:B, 6kz6:A, 6lis:A, 6lis:B, 6lis:C, 6lis:D, 6lis:F, 6lis:E, 6lj3:C, 6lj3:B
21	4xjc:A	177	89	0.1554	0.1299	0.2584	0.027	4xjc:E, 4xjc:C, 4xjc:B, 4xjc:F, 4xjc:D
22	2zxi:B	606	31	0.0946	0.0231	0.4516	1.4	2zxh:A, 2zxh:B, 2zxi:A, 2zxi:C, 2zxi:D
23	6cj0:A	253	25	0.0743	0.0435	0.4400	3.7	6cj0:B, 6d3w:A, 6d3w:B
24	2v9x:A	193	166	0.2568	0.1969	0.2289	5.2	2j4h:A, 2j4h:B, 2j4q:A, 2j4q:B, 2v9x:C, 2v9x:B, 2v9x:D, 2v9x:F, 2v9x:E, 2v9x:G, 2v9x:I, 2v9x:H, 2v9x:J, 2v9x:L, 2v9x:K, 1xs1:A, 1xs1:C, 1xs1:B, 1xs1:D, 1xs1:F, 1xs1:E, 1xs4:A, 1xs4:C, 1xs4:B, 1xs4:D, 1xs4:F, 1xs4:E, 1xs6:A, 1xs6:C, 1xs6:B, 1xs6:D, 1xs6:F, 1xs6:E

[Back]