Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MLTQKTKDIVKATAPVLAEHGYDIIKCFYQRMFEAHPELKNVFNMAHQEQGQQQQALARAVYAYAENIEDPNSLMAVLKN
IANKHASLGVKPEQYPIVGEHLLAAIKEVLGNAATDDIISAWAQAYGNLADVLMGMESELYERSAEQPGGWKGWRTFVIR
EKRPESDVITSFILEPADGGPVVNFEPGQYTSVAIDVPALGLQQIRQYSLSDMPNGRSYRISVKREGGGPQPPGYVSNLL
HDHVNVGDQVKLAAPYGSFHIDVDAKTPIVLISGGVGLTPMVSMLKVALQAPPRQVVFVHGARNSAVHAMRDRLREAAKT
YENLDLFVFYDQPLPEDVQGRDYDYPGLVDVKQIEKSILLPDADYYICGPIPFMRMQHDALKNLGIHEARIHYEVFGPDL
FAE

The query sequence (length=403) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1cqx:A 403 403 0.9975 0.9975 0.9975 0.0 1cqx:B, 3ozu:A, 3ozv:B, 3ozv:A, 3ozw:A, 3ozw:B
2 1gvh:A 396 399 0.4442 0.4520 0.4486 8.01e-117
3 4g1b:A 398 414 0.3797 0.3844 0.3696 3.09e-74 4g1b:B, 4g1b:C, 4g1b:D, 4g1v:A
4 4eh1:A 237 245 0.2556 0.4346 0.4204 8.01e-57 4eh1:B
5 6o0a:A 383 404 0.3201 0.3368 0.3193 7.69e-56
6 3tm9:A 146 146 0.1811 0.5000 0.5000 8.83e-44 3tld:A, 3tld:B, 3tm3:A, 1vhb:A, 1vhb:B, 2vhb:A, 2vhb:B, 3vhb:A, 3vhb:B, 4vhb:A, 4vhb:B
7 7dih:A 139 141 0.1340 0.3885 0.3830 1.50e-25 7dih:B
8 6wk3:D 146 145 0.1315 0.3630 0.3655 1.95e-25 6wk3:A, 6wk3:B, 6wk3:C
9 2wy4:A 139 142 0.1414 0.4101 0.4014 1.10e-23
10 5ogx:A 333 222 0.1737 0.2102 0.3153 7.50e-17
11 1krh:A 337 238 0.1563 0.1869 0.2647 7.72e-17 1krh:B
12 3wfw:A 138 108 0.0769 0.2246 0.2870 2.42e-14 3wfx:A, 3wfx:B
13 2r6h:C 289 296 0.1787 0.2491 0.2432 1.87e-13 2r6h:A, 2r6h:B, 2r6h:D
14 3s1i:A 131 132 0.0868 0.2672 0.2652 1.80e-12 3s1i:B, 3s1i:C, 3s1j:A, 3s1j:B, 3s1j:C, 3ubc:A, 3ubc:D, 3ubc:G, 3ubv:A, 3ubv:D, 3ubv:G
15 2pia:A 321 232 0.1638 0.2056 0.2845 2.19e-11
16 1tvc:A 250 222 0.1464 0.2360 0.2658 3.62e-11
17 7qty:A 279 201 0.1315 0.1900 0.2637 3.07e-09 7qu0:A
18 8a1y:F 408 205 0.1390 0.1373 0.2732 9.10e-09 8a1t:F, 8a1u:F, 8a1v:F, 8a1w:F, 8a1x:F, 8acw:F, 8acy:F, 8ad0:F, 8ad3:A, 8ad3:B, 8ad4:A, 8ad4:B, 8ad5:A, 8ad5:B, 4u9u:A, 4u9u:B, 4uaj:A, 7xk3:F, 7xk4:F, 7xk5:F, 7xk6:F, 7xk7:F
19 4wqm:A 326 225 0.1638 0.2025 0.2933 9.77e-09
20 7qu5:A 280 209 0.1414 0.2036 0.2727 1.13e-08 7qu3:A
21 2eix:A 243 239 0.1439 0.2387 0.2427 1.74e-08 2eix:B
22 6laa:A 753 124 0.0893 0.0478 0.2903 2.04e-08 6gii:A, 6ldl:A
23 5yly:B 269 172 0.1117 0.1673 0.2616 3.11e-08 5yly:A
24 6mv2:A 356 222 0.1390 0.1573 0.2523 6.05e-08 6mv1:A
25 7ylr:A 326 249 0.1588 0.1963 0.2570 9.18e-08
26 1gdi:A 153 58 0.0620 0.1634 0.4310 2.03e-07 1gdj:A, 1gdk:A, 1gdl:A, 2gdm:A, 1lh1:A, 1lh2:A, 1lh3:A, 1lh5:A, 1lh6:A, 1lh7:A, 2lh1:A, 2lh2:A, 2lh3:A, 2lh5:A, 2lh6:A, 2lh7:A
27 7ohd:B 134 115 0.0794 0.2388 0.2783 4.87e-07
28 6h6c:A 151 127 0.0794 0.2119 0.2520 5.50e-07 5eet:A, 5eoh:A, 5eqm:A, 5eu2:A, 5ev5:A, 5eyj:A, 5eys:A, 6eye:A, 5f0b:A, 5f2a:A, 3gk9:A, 3gkt:A, 3gln:A, 8grz:A, 6h5z:A, 6h6i:A, 6h6j:A, 6i3t:A, 6i40:A, 5mjc:A, 5mjd:A, 4mpm:A, 4mpm:B, 4mu5:A, 5nvi:A, 5nw6:A, 4nzi:A, 4o1t:A, 5o17:A, 5o18:A, 5o1k:A, 4o2g:A, 5o27:A, 4o35:A, 4o4t:A, 4o4z:A, 7ohd:A, 1oj6:A, 1oj6:B, 1oj6:C, 1oj6:D, 1q1f:A, 6r1q:A, 6ra6:A, 7vqg:A, 2vry:A, 1w92:A
29 6kbh:A 765 133 0.0943 0.0497 0.2857 1.23e-06
30 6l2u:A 103 110 0.0868 0.3398 0.3182 2.43e-05 6l2u:B
31 7rom:A 255 162 0.0868 0.1373 0.2160 5.25e-05
32 8qq7:A 399 164 0.1042 0.1053 0.2561 5.79e-05 8qq1:C, 8qq1:F, 8qq1:G, 8qq5:A, 8qq5:B, 8qq5:C, 8qt6:A, 8qt7:A, 8qt9:A, 8qta:A
33 4u8u:D 141 117 0.0720 0.2057 0.2479 1.67e-04 4u8u:H, 4u8u:L, 4u8u:S, 4u8u:W, 4u8u:a, 4u8u:h, 4u8u:l, 4u8u:p, 4wch:D
34 7c3b:C 334 220 0.1365 0.1647 0.2500 1.75e-04 7c3a:A, 7c3a:B, 7c3a:C, 7c3b:A
35 2xnj:A 255 240 0.1365 0.2157 0.2292 3.38e-04 1fdr:A, 2xnj:B
36 1hlm:A 158 142 0.0868 0.2215 0.2465 4.75e-04
37 4hrr:A 149 108 0.0571 0.1544 0.2130 5.27e-04 4hrr:C, 4hrr:E, 4hrr:G, 4hrt:A, 4hrt:C, 4hrt:E, 4hrt:G
38 1hlb:A 157 142 0.0968 0.2484 0.2746 0.002
39 7z1u:A 147 134 0.0720 0.1973 0.2164 0.004 7z1u:B, 7zos:A
40 6rr3:A 257 224 0.1290 0.2023 0.2321 0.004 6rra:A
41 2gtl:D 140 110 0.0645 0.1857 0.2364 0.005 2gtl:H, 2gtl:L, 5m3l:D, 5m3l:H, 5m3l:L, 1x9f:D, 1x9f:H, 1x9f:L
42 1v75:A 141 136 0.0794 0.2270 0.2353 0.009 1wmu:A, 2z6n:A
43 8u87:A 621 136 0.0596 0.0386 0.1765 0.012 8u7y:A, 8u7y:B, 8u85:A, 8u85:C, 8u86:A, 8u86:C, 8u87:C
44 1i7p:A 272 164 0.0993 0.1471 0.2439 0.013 1ib0:A, 1qx4:A, 1qx4:B
45 1bin:A 143 110 0.0744 0.2098 0.2727 0.015 1bin:B, 1fsl:A, 1fsl:B
46 3crz:A 257 244 0.1489 0.2335 0.2459 0.032 2qdx:A
47 3zhw:A 154 141 0.0744 0.1948 0.2128 0.041 3zhw:B
48 7d3e:C 1380 128 0.0720 0.0210 0.2266 0.047 7d3e:A, 7d3f:C, 7d3f:A
49 3qqq:A 150 142 0.0794 0.2133 0.2254 0.064 3qqq:B, 3qqr:A, 3qqr:B
50 8wej:B 569 106 0.0645 0.0457 0.2453 0.068 8gz3:B, 8kei:B
51 2olp:A 151 103 0.0521 0.1391 0.2039 0.070 2olp:B, 6otw:A, 6otx:A, 6oty:A, 3pi1:A, 3pi1:B, 3pi2:A, 3pi2:B, 3pi3:A, 3pi3:B, 3pi4:A, 3pi4:B, 3pt7:A, 3pt8:A
52 3vre:A 141 139 0.0769 0.2199 0.2230 0.11 3vre:C, 3vrf:A, 3vrg:A
53 6wxv:A 1091 109 0.0645 0.0238 0.2385 0.11 6wxr:A, 6wxu:C, 6wxu:A
54 6t1t:A 635 130 0.0720 0.0457 0.2231 0.12 6t1t:B, 6t1u:A, 6t1u:B
55 8x2l:B 525 101 0.0571 0.0438 0.2277 0.15 7u8g:A
56 5gv7:A 272 173 0.1042 0.1544 0.2428 0.23 5gv8:A, 1ndh:A, 7thg:A, 7tnv:A, 7tsw:A, 7tsw:B, 7tsw:C, 7tsw:D, 7tsw:E, 7tsw:F, 1umk:A, 3w2e:A, 3w2f:A, 3w2g:A, 3w2h:A, 3w2i:A, 7w3o:A, 7w3o:B, 7w3o:C, 7w3o:D, 3w5h:A
57 1tll:A 630 145 0.0918 0.0587 0.2552 0.27 1f20:A, 1tll:B
58 5d1v:A 121 91 0.0695 0.2314 0.3077 0.29 5d1v:B
59 7vlc:B 144 55 0.0397 0.1111 0.2909 0.34 7vlc:F, 7vld:B, 7vld:F, 7vle:B, 7vle:F, 7vlf:B, 7vlf:F, 3wct:B, 3wct:F, 3wcu:B, 3wcu:F, 3wcv:B, 3wcv:F, 3wcw:B, 3wcw:F
60 3op4:A 247 110 0.0720 0.1174 0.2636 0.35 4i08:A, 4i08:B, 3op4:B, 3rsh:A, 3rsh:B, 4wk6:A, 4wk6:B, 4wk6:C, 4wk6:D
61 1cne:A 260 115 0.0744 0.1154 0.2609 0.36 1cnf:A, 2cnd:A
62 4jxy:A 311 75 0.0596 0.0772 0.3200 0.69
63 3hf4:A 141 83 0.0596 0.1702 0.2892 0.94 3dht:A, 3hf4:E
64 7suz:A 389 118 0.0819 0.0848 0.2797 0.96 7sux:A, 7sv0:A
65 8dos:A 247 216 0.1216 0.1984 0.2269 1.2 8dos:B
66 4avd:A 110 20 0.0248 0.0909 0.5000 1.3 4ave:A, 4f68:A, 4f69:A, 4f6b:A, 4f6d:A, 4f6f:A, 4f6g:A, 4f6i:A, 4f6j:A, 1kr7:A, 1v07:A, 2vyy:A, 2vyz:A, 2xkg:A, 2xkh:A, 2xki:A
67 6efv:A 530 125 0.0744 0.0566 0.2400 1.3 1ddg:A, 1ddg:B, 1ddi:A, 1ykg:A
68 5o0x:A 261 44 0.0372 0.0575 0.3409 1.6 8cak:A, 8cal:A, 8cao:A, 8cap:A, 8cap:E, 8cap:B, 8cap:C, 8cb0:A
69 1cg5:B 141 82 0.0447 0.1277 0.2195 2.4 1cg8:B
70 5gxu:A 552 178 0.1141 0.0833 0.2584 2.9 5gxu:B
71 6jqh:B 513 73 0.0496 0.0390 0.2740 3.0 6jqh:A
72 1a4f:A 141 80 0.0496 0.1418 0.2500 3.2 1c40:A, 3eok:A, 1faw:A, 1faw:C, 1hv4:A, 1hv4:C, 1hv4:E, 1hv4:G
73 3wr1:A 141 83 0.0546 0.1560 0.2651 3.4
74 2dc3:A 172 138 0.0744 0.1744 0.2174 3.4 3ag0:A, 4b3w:A, 4b3w:B, 2dc3:B, 1umo:A, 1umo:B, 1urv:A, 1urv:B, 1ury:A, 1ury:B, 1ut0:A, 1ut0:B, 1ux9:A, 1ux9:B, 1v5h:A
75 2qtl:A 448 30 0.0248 0.0223 0.3333 4.7 2qtz:A
76 8dme:A 1034 94 0.0546 0.0213 0.2340 4.7 5b2u:A, 5b2u:B, 5b2v:A, 5b2v:B, 5b2w:A, 5b2w:B, 5b2x:A, 5b2x:B, 5b2y:A, 5b2y:B, 3ben:A, 3ben:B, 2bmh:A, 2bmh:B, 1bu7:A, 1bu7:B, 1bvy:A, 1bvy:F, 1bvy:B, 3cbd:A, 3cbd:B, 7ckn:A, 7ckn:B, 7con:A, 7con:B, 7coo:A, 7coo:B, 7cp8:A, 7cp8:B, 7cvr:A, 7cvr:B, 7cx6:A, 7cx6:B, 7cx8:A, 7cx8:B, 7czi:A, 7czi:B, 7d0t:A, 7d0t:B, 7d0u:A, 7d0u:B, 7d1f:A, 7d1f:B, 3dgi:A, 8dme:B, 8dmg:A, 8dmg:B, 4dqk:A, 4dqk:B, 4dql:A, 4dql:B, 8dsg:A, 8dsg:B, 8dsg:C, 8dsg:D, 4dtw:B, 4dtw:A, 4dty:B, 4dty:A, 4dtz:A, 4dtz:B, 4du2:B, 4du2:A, 4dua:A, 4dua:B, 4dub:A, 4dub:B, 4duc:A, 4duc:B, 4dud:A, 4dud:B, 4due:A, 4due:B, 4duf:A, 4duf:B, 4duf:C, 4duf:D, 5dyp:A, 5dyp:C, 5dyz:A, 5dyz:C, 7e46:A, 7e46:B, 5e78:A, 5e78:B, 5e7y:A, 5e7y:B, 5e9z:A, 5e9z:B, 5e9z:C, 5e9z:D, 7egn:A, 7egn:B, 3ekb:A, 3ekb:B, 3ekd:A, 3ekd:B, 3ekf:A, 3ekf:B, 1fag:A, 1fag:B, 1fag:C, 1fag:D, 1fah:A, 1fah:B, 6h1l:A, 6h1l:B, 6h1o:A, 6h1o:B, 6h1s:A, 6h1s:B, 6h1t:A, 6h1t:B, 6h1t:C, 6h1t:D, 4h23:A, 4h23:B, 4h24:A, 4h24:B, 4h24:C, 4h24:D, 4hgf:A, 4hgf:B, 4hgg:A, 4hgg:B, 4hgh:A, 4hgh:B, 4hgi:A, 4hgi:B, 4hgj:A, 4hgj:B, 6hn8:A, 6hn8:B, 8hon:A, 8hon:B, 8hoo:A, 8hoo:B, 8hop:A, 8hop:B, 8hoq:A, 8hoq:B, 8hor:A, 8hor:B, 8hos:A, 8hos:B, 8hot:A, 8hot:B, 8hou:A, 8hou:B, 2hpd:A, 2hpd:B, 6iao:A, 6iao:B, 6iao:C, 6iao:D, 2ij2:A, 2ij2:B, 2ij3:A, 2ij3:B, 2ij4:A, 2ij4:B, 2j1m:A, 2j1m:B, 2j4s:A, 2j4s:B, 8jc3:B, 8jc3:A, 8jc4:A, 8jc4:B, 6jlv:A, 6jlv:B, 1jme:A, 1jme:B, 6jmh:A, 6jmh:B, 6jmw:A, 6jmw:B, 6jo1:A, 6jo1:B, 1jpz:A, 1jpz:B, 5jq2:A, 5jq2:B, 5jqu:A, 5jqu:B, 5jqu:C, 5jqu:D, 5jqu:E, 5jqu:F, 5jqu:G, 5jqu:H, 5jqv:A, 5jqv:B, 5jqv:C, 5jqv:D, 5jqv:E, 5jqv:F, 5jqv:G, 5jqv:H, 6js8:A, 6js8:B, 5jtd:A, 5jtd:B, 6jvc:A, 6jvc:C, 6jzs:A, 6jzs:C, 6k24:A, 6k24:B, 6k3q:A, 6k3q:B, 6k58:A, 6k58:B, 6k9s:A, 6k9s:B, 4kew:A, 4kew:B, 4key:A, 4key:B, 4kf0:A, 4kf0:B, 4kf2:A, 4kf2:B, 4kpa:A, 4kpb:A, 4kpb:B, 3kx3:A, 3kx3:B, 3kx4:A, 3kx4:B, 3kx5:A, 3kx5:B, 6l1a:A, 6l1a:B, 6l1b:A, 6l1b:B, 6ly4:A, 3m4v:A, 3m4v:B, 2nnb:A, 2nnb:B, 3npl:A, 3npl:B, 4o4p:A, 4o4p:B, 5og9:A, 5og9:B, 1p0v:A, 1p0v:B, 1p0w:A, 1p0w:B, 1p0x:A, 1p0x:B, 3qi8:B, 8qze:A, 8qze:B, 8qzf:A, 8qzf:B, 4rsn:A, 4rsn:B, 1smi:A, 1smi:B, 1smj:A, 1smj:B, 1smj:C, 1smj:D, 5ucw:A, 5ucw:B, 2uwh:A, 2uwh:B, 2uwh:C, 2uwh:D, 2uwh:E, 2uwh:F, 7w97:A, 7w97:B, 7w9d:A, 7w9d:B, 7w9j:A, 7w9j:B, 7wdd:A, 7wdd:B, 7wde:A, 7wde:B, 7wdg:A, 7wdg:B, 7wdh:A, 7wdh:B, 7wdi:A, 7wdi:B, 4wg2:A, 4wg2:B, 4wg2:C, 7wg0:A, 7wg0:B, 3wsp:A, 3wsp:B, 7wy1:A, 7wy1:B, 7wy2:A, 7wy2:B, 7wy3:A, 7wy3:B, 7wy4:A, 7wy4:B, 2x7y:A, 2x7y:B, 2x80:A, 2x80:B, 5xa3:A, 5xa3:B, 5xa3:C, 5xa3:D, 5xhj:A, 5xhj:B, 7xzk:A, 7xzk:B, 7y0p:B, 7y0p:A, 7y0q:A, 7y0q:B, 7y0r:A, 7y0r:B, 7y0s:B, 7y0s:A, 7y0t:B, 7y0t:A, 7y0u:A, 7y0u:B, 7y9j:A, 7y9j:B, 7y9k:A, 7y9k:B, 7y9l:A, 7y9l:B, 7y9m:A, 7yd9:A, 7yd9:B, 7yda:A, 7yda:B, 7ydb:A, 7ydb:B, 7ydc:A, 7ydc:B, 7ydd:A, 7ydd:B, 7yde:A, 7yde:B, 7ydl:A, 7ydl:B, 7yft:A, 7yft:B, 7yjd:A, 7yjd:B, 7yje:A, 7yje:B, 7yjf:A, 7yjf:B, 7yjg:A, 7yjg:B, 7yjh:A, 7yjh:B, 1yqo:A, 1yqo:B, 1yqp:A, 1yqp:B, 4zf6:A, 4zf8:A, 4zfa:A, 4zfb:A, 5zis:A, 5zis:B, 5zis:C, 5zis:D, 5zlh:A, 5zlh:B, 5zlh:C, 5zlh:D, 1zo4:A, 1zo4:B, 1zo9:A, 1zo9:B, 1zoa:A, 1zoa:B
77 6q6p:B 157 153 0.0769 0.1975 0.2026 4.8 6q6p:A
78 4hrr:B 151 126 0.0596 0.1589 0.1905 5.7 4hrr:D, 4hrr:F, 4hrr:H, 4hrt:B, 4hrt:D, 4hrt:F, 4hrt:H
79 2wmg:A 553 107 0.0744 0.0542 0.2804 5.8 2wmh:A
80 3gg7:A 243 73 0.0447 0.0741 0.2466 6.0
81 3bcq:A 142 123 0.0720 0.2042 0.2358 6.0 3bcq:C
82 1hbr:A 141 140 0.0769 0.2199 0.2214 6.5 1hbr:C
83 7c3b:B 306 216 0.1166 0.1536 0.2176 8.0

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218