Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MLSVDDCFGMGRSAYNEGDYYHTVLWMEQVLKQLDAGEEATTTKSQVLDYLSYAVFQLGDLHRALELTRRLLSLDPSHER
AGGNLRYFEQLLEE

The query sequence (length=94) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6evm:A 95 94 1.0000 0.9895 1.0000 3.40e-66 6evl:A, 6evn:A, 6evo:A, 6evp:A
2 4bta:A 237 92 0.6064 0.2405 0.6196 1.74e-30 4bt9:A, 4btb:A, 2v5f:A
3 1na0:B 119 90 0.2447 0.1933 0.2556 2.92e-04 1na3:A, 1na3:B
4 1na0:B 119 83 0.2128 0.1681 0.2410 4.72e-04 1na3:A, 1na3:B
5 3kd7:A 102 79 0.2128 0.1961 0.2532 5.21e-04 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
6 3kd7:A 102 70 0.1809 0.1667 0.2429 0.050 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
7 3kd7:A 102 39 0.1489 0.1373 0.3590 0.059 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
8 8chy:A 272 83 0.2234 0.0772 0.2530 0.005 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
9 8chy:A 272 83 0.2234 0.0772 0.2530 0.005 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
10 8chy:A 272 83 0.2234 0.0772 0.2530 0.005 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
11 8chy:A 272 83 0.2234 0.0772 0.2530 0.005 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
12 8chy:A 272 83 0.2234 0.0772 0.2530 0.005 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
13 8chy:A 272 79 0.2128 0.0735 0.2532 0.014 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
14 8chy:A 272 74 0.1915 0.0662 0.2432 0.029 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
15 4dlq:A 353 52 0.1383 0.0368 0.2500 0.62
16 7aor:ab 1110 34 0.1596 0.0135 0.4412 1.2
17 8p0j:B 1155 33 0.1489 0.0121 0.4242 1.3 8p0k:B, 8p0n:B
18 7aoh:B 1134 33 0.1489 0.0123 0.4242 1.3 7amv:B, 7aof:B, 7aoz:B, 7ap8:B, 7ap9:B, 8c8h:B, 6rfl:B, 6ric:B, 6rid:B, 6rie:B
19 4ufc:B 788 58 0.1489 0.0178 0.2414 2.1 4ufc:A
20 5iko:A 807 36 0.1170 0.0136 0.3056 2.3 5ikp:A
21 7yeh:A 1020 64 0.2447 0.0225 0.3594 2.5 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
22 3gpb:A 833 36 0.1064 0.0120 0.2778 3.0 1a8i:A, 1abb:A, 1abb:B, 1abb:C, 1abb:D, 2amv:A, 3amv:A, 1axr:A, 1b4d:A, 3bcr:A, 3bcs:A, 3bd6:A, 3bd7:A, 3bd8:A, 3bda:A, 8bzs:A, 1c50:A, 1c8k:A, 1c8l:A, 4ctm:A, 4ctn:A, 4cto:A, 3cut:A, 3cuu:A, 3cuv:A, 3cuw:A, 3e3n:A, 3e3n:B, 3e3n:D, 3e3n:F, 3e3n:G, 3e3n:H, 3e3o:B, 3ebo:A, 3ebp:A, 4ej2:A, 4eke:A, 4eky:A, 4el0:A, 4el5:A, 2f3p:A, 2f3q:A, 2f3s:A, 2f3u:A, 6f3j:A, 6f3l:A, 6f3r:A, 6f3s:A, 6f3u:A, 2fet:A, 2ff5:A, 2ffr:A, 1fs4:A, 1ftq:A, 1ftw:A, 1fty:A, 1fu4:A, 1fu7:A, 1fu8:A, 3g2h:A, 3g2i:A, 3g2j:A, 3g2k:A, 3g2l:A, 3g2n:A, 2g9r:A, 2g9v:A, 1gfz:A, 1gg8:A, 1ggn:A, 1gpa:A, 1gpa:B, 1gpa:C, 1gpa:D, 1gpb:A, 1gpy:A, 2gpb:A, 4gpb:A, 5gpb:A, 6gpb:A, 7gpb:A, 7gpb:B, 7gpb:C, 7gpb:D, 8gpb:A, 9gpb:A, 9gpb:B, 9gpb:C, 9gpb:D, 1h5u:A, 1hlf:A, 5jtt:A, 5jtu:A, 1k06:A, 1k08:A, 1kti:A, 3l79:A, 3l7a:A, 3l7b:A, 3l7c:A, 3l7d:A, 5lrc:A, 5lrd:A, 5lre:A, 5lrf:A, 1lwn:A, 1lwo:A, 5mcb:A, 5mem:A, 4mho:A, 4mhs:A, 4mi3:A, 4mi6:A, 4mi9:A, 4mic:A, 3mqf:A, 3mrt:A, 3mrv:A, 3mrx:A, 4mra:A, 3ms2:A, 3ms4:A, 3ms7:A, 3msc:A, 3mt7:A, 3mt8:A, 3mt9:A, 3mta:A, 3mtb:A, 3mtd:A, 3nc4:A, 1noi:A, 1noi:B, 1noi:C, 1noi:D, 1noj:A, 1nok:A, 3np7:A, 3np9:A, 3npa:A, 5o50:A, 5o52:A, 5o54:A, 5o56:A, 2off:A, 7onf:A, 5owy:A, 5owz:A, 5ox0:A, 5ox1:A, 5ox3:A, 5ox4:A, 1p29:A, 1p2b:A, 1p2d:A, 1p2g:A, 1p4g:A, 1p4h:A, 1p4j:A, 2pri:A, 2prj:A, 2pyd:A, 2pyi:A, 7q5i:AAA, 6qa6:A, 6qa7:A, 6qa8:A, 2qlm:A, 2qln:A, 2qn1:A, 2qn2:A, 2qn3:A, 2qn7:A, 2qn8:A, 2qn9:A, 2qnb:A, 2qrg:A, 2qrh:A, 2qrm:A, 2qrp:A, 2qrq:A, 6r0h:A, 6r0i:A, 3s0j:A, 6s4h:A, 6s4k:A, 6s4o:A, 6s4p:A, 6s4r:A, 6s51:A, 6s52:A, 2skc:A, 2skd:A, 2ske:A, 3sym:A, 3syr:A, 3t3d:A, 3t3e:A, 3t3g:A, 3t3h:A, 3t3i:A, 1uzu:A, 1wut:A, 1wuy:A, 1wv0:A, 1wv1:A, 1ww2:A, 1ww3:A, 1xc7:A, 1xkx:A, 1xl0:A, 1xl1:A, 6y55:A, 6y5c:A, 6y5o:A, 4yi3:A, 4yi5:A, 4yua:A, 6yve:AAA, 4z5x:A, 1z62:A, 1z6p:A, 1z6q:A, 1z8d:A, 3zcp:A, 3zcq:A, 3zcr:A, 3zcs:A, 3zct:A, 3zcu:A, 3zcv:A
23 8k0e:A 646 48 0.1277 0.0186 0.2500 3.1 8k0f:A, 8k0m:A, 8k17:A, 8kc9:A
24 1e1y:A 813 36 0.1064 0.0123 0.2778 3.2 1bx3:A, 3e3n:C, 3e3n:E, 3e3o:A, 3e3o:C, 3e3o:D, 2g9q:A, 2g9u:A, 2gj4:A, 2gm9:A, 2gpa:A, 2ieg:A, 2ieg:B, 2iei:A, 2iei:B, 1pyg:A, 1pyg:B, 1pyg:C, 1pyg:D
25 6dwo:A 712 48 0.1702 0.0225 0.3333 3.3 6dwo:B, 6dwo:C, 6dwo:D, 7fe1:A, 7fe1:B, 7fe1:C, 7fe1:D, 7fe2:A, 7fe2:B, 7fe2:C, 7fe2:D
26 6pq1:A 320 38 0.1277 0.0375 0.3158 3.7
27 3fp2:A 483 31 0.1064 0.0207 0.3226 4.2 3fp4:A, 3lca:A
28 2qll:A 806 36 0.0957 0.0112 0.2500 6.8 1em6:A, 1em6:B, 1exv:A, 1exv:B
29 1fa9:A 834 36 0.0957 0.0108 0.2500 6.8 2ati:A, 2ati:B, 3ceh:A, 3ceh:B, 3cej:A, 3cej:B, 3cem:A, 3cem:B, 3dd1:A, 3dd1:B, 3dds:A, 3dds:B, 3ddw:A, 3ddw:B, 8ems:B, 8ems:A, 1fc0:A, 1fc0:B, 1l5q:A, 1l5q:B, 1l5r:A, 1l5r:B, 1l5s:A, 1l5s:B, 1l7x:A, 1l7x:B, 1xoi:A, 1xoi:B, 2zb2:A, 2zb2:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218