Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MLQLWSKFDVGDWLESIHLGEHRDRFEDHEIEGAHLPALTKEDFVELGVTRVGHRENIERALRQL

The query sequence (length=65) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2f44:A 65 65 1.0000 1.0000 1.0000 1.10e-42 2f44:B, 2f44:C
2 8atj:AAA 70 64 0.6615 0.6143 0.6719 5.33e-28
3 6brh:B 502 66 0.3231 0.0418 0.3182 7.52e-04 6brg:A, 6brg:B, 6brg:C, 6brg:D, 6brh:A, 6brk:A
4 7kjc:A 376 54 0.2308 0.0399 0.2778 0.74 8bin:A, 8bio:A, 8bk0:A, 8bm8:A, 8boc:A, 8bod:A, 8bof:A, 8bog:A, 8boh:A, 8boi:A, 8bok:A, 8bom:A, 6fnf:A, 6fng:A, 6fnh:A, 6fnh:B, 6fnh:C, 6hes:A, 6het:A, 6heu:A, 6hev:A, 6hew:A, 6hex:A, 6hey:A, 5i9v:A, 5i9w:A, 5i9x:A, 5i9y:A, 5i9z:A, 5ia0:A, 5ia0:B, 5ia0:C, 5ia1:A, 5ia2:A, 5ia3:A, 5ia4:A, 5ia5:A, 7kja:A, 7kja:B, 7kjc:B, 1mqb:A, 1mqb:B, 5njz:A, 5nk0:A, 5nk1:A, 5nk2:A, 5nk3:A, 5nk4:A, 5nk5:A, 5nk6:A, 5nk7:A, 5nk8:A, 5nk9:A, 5nka:A, 5nkb:A, 5nkc:A, 5nkd:A, 5nke:A, 5nkf:A, 5nkg:A, 5nkh:A, 5nki:A, 6q7b:A, 6q7c:A, 6q7d:A, 6q7e:A, 6q7f:A, 6q7g:A, 8qqy:A, 8xpv:A
5 2ywc:A 475 22 0.1846 0.0253 0.5455 2.6 2ywc:B, 2ywc:C, 2ywc:D
6 8hj4:C 130 43 0.2308 0.1154 0.3488 4.2
7 7cm7:A 620 29 0.1077 0.0113 0.2414 4.7 7cm6:A, 7cm6:B, 7cm6:C, 7cm6:D, 7cm6:E, 7cm6:F, 7cm6:G, 7cm6:H, 7cm7:B, 7cm7:C, 7cm7:D, 7cm7:E, 7cm7:F, 7cm7:G, 7cm7:H
8 8aly:E 259 58 0.2000 0.0502 0.2241 4.9 6a84:A, 5adq:A, 5adr:A, 5ads:A, 5adt:A, 8aly:J, 8aly:I, 8aly:H, 8aly:G, 8aly:F, 8aly:D, 8aly:C, 8aly:B, 8aly:A, 8aly:O, 8aly:T, 8aly:S, 8aly:R, 8aly:Q, 8aly:N, 8aly:M, 8aly:L, 8aly:K, 8b6m:C, 5c5p:A, 5c5q:A, 5c5r:A, 7ce4:A, 4hki:A, 4hki:H, 4hkk:A, 4hkk:C, 4hkn:A, 4hl5:A, 4hlf:A, 4hlf:B, 4hlg:A, 4hlg:B, 4hlh:A, 4hlh:B, 4hlk:A, 4hlk:B, 4hlm:A, 4hlm:B, 4hmh:A, 6kro:A, 4kzl:A, 4kzl:B, 4kzq:A, 4kzq:B, 4kzu:A, 4kzu:B, 4l09:A, 4l09:B, 4l0b:A, 4l0b:B, 4l0i:A, 4l0i:B, 4l0s:A, 4l0s:B, 4l0t:A, 4l0t:B, 4l0v:A, 4l0v:B, 4l10:A, 4l10:B, 4l2f:A, 4l2f:B, 4l2g:A, 4l2g:B, 4l2k:A, 4l2k:B, 4l31:A, 4l31:B, 4l32:A, 4l32:B, 4l33:A, 4l33:B, 4l34:A, 4l34:B, 5nob:B, 5nsp:A, 5nsp:B, 5nsx:A, 5nsx:B, 5nt0:A, 5nt0:B, 5nt4:A, 5nt4:B, 5nvc:A, 5nvc:B, 5nve:A, 5nve:B, 5nvf:A, 5nvf:B, 5nvh:A, 5nvh:B, 5nwb:A, 5nwb:B, 5nwc:A, 5nwc:B, 5nwd:A, 5nwd:B, 5nwg:B, 5nxe:A, 5nxe:B, 7o6x:AAA, 7olj:AAA, 7olj:BBB, 7om1:AAA, 7om1:BBB, 7omc:AAA, 7omc:BBB, 4pnq:D, 4pns:D, 4pnt:D, 7pox:AAA, 7r3z:C, 7r5x:AAA, 7r5x:BBB, 6tg4:BBB, 4tju:D, 4tjw:D, 4tkf:D, 6tkp:BBB, 6tkq:BBB, 4ui3:A, 4ui3:B, 4ui4:A, 4ui4:B, 4ui5:A, 4ui5:B, 4ui6:A, 4ui6:B, 4ui7:A, 4ui7:B, 4ui8:A, 4ui8:B, 4uvp:A, 4uvp:C, 5zqo:A, 5zqp:A, 5zqq:A, 5zqr:A
9 7anw:A 645 29 0.1077 0.0109 0.2414 5.1 7anw:B, 7anw:C, 7anw:D, 7anw:E, 7anw:F, 7anw:G, 7anw:H, 8d0c:A, 8d0c:B, 8d0d:A, 8d0d:B, 8d0e:A, 8d0e:B, 8d0f:A, 8d0f:B, 8d0g:A, 8d0g:B, 8d0h:A, 8d0h:B, 8d0i:A, 8d0i:B, 7djt:A, 7djt:B, 7djt:C, 7djt:D, 7djt:E, 7djt:F, 7djt:G, 7djt:H, 8gni:A, 8gnj:A, 7nag:A, 7nag:B, 7nah:A, 7nah:B, 7nai:A, 7nai:B, 7naj:A, 7naj:B, 7nak:D, 7nak:C, 7nak:H, 7nak:G, 7nak:B, 7nak:A, 7nak:E, 7nak:F, 7nal:A, 7nal:B, 7nal:C, 7nal:D, 7nal:E, 7nal:F, 7nal:G, 7nal:H, 6o0q:A, 6o0q:B, 8p2l:A, 8p2l:B, 8p2l:C, 8p2l:D, 8p2l:E, 8p2l:F, 8p2l:G, 8p2l:H, 6zfx:A, 6zfx:B, 6zfx:C, 6zfx:D, 6zfx:E, 6zfx:F, 6zfx:G, 6zfx:H
10 3spa:A 941 21 0.1846 0.0128 0.5714 6.2 7a8p:A
11 9bdc:E 990 21 0.1846 0.0121 0.5714 6.5 9bdd:E, 4boc:A, 5ola:E, 5ola:F, 8u8u:E, 8u8v:E
12 6erp:A 1011 21 0.1846 0.0119 0.5714 6.5 6erp:B, 6erq:A, 6erq:B
13 6z1p:BI 1413 36 0.1846 0.0085 0.3333 7.3
14 7bew:A 330 23 0.1385 0.0273 0.3913 7.8 7bex:A
15 6dxp:A 206 38 0.1538 0.0485 0.2632 7.9 6dxp:C, 6dxp:B, 6dxp:D, 8h4j:A, 8h4j:B, 8h4j:C, 8h4j:D, 8h4j:E, 8h4j:F, 8h4j:G, 8h4j:H, 7n2w:A, 7n2w:B, 7n2w:C, 7n2w:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218