Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MLLFCPGCGNGLIVEEGQRCHRFACNTCPYVHNITRKVTNRKYPKLKEVDDVLGGAAAWENVDSTAESCPKCEHPRAYFM
QLQTRSADEPMTTFYKCCNAQCGHRWR

The query sequence (length=107) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7d59:I 108 107 0.9907 0.9815 0.9907 2.17e-79 7a6h:I, 7ae1:I, 7ae3:I, 7aea:I, 7dn3:I, 7du2:I, 7fji:I, 7fjj:I, 8ity:I, 8iue:I, 8iuh:I
2 7z0h:I 110 112 0.5514 0.5364 0.5268 6.24e-31 8bws:I, 6cnb:I, 6cnc:I, 6cnd:I, 6cnf:I, 6eu0:I, 6eu1:I, 6eu2:I, 6eu3:I, 6f40:I, 6f41:I, 6f42:I, 5fj8:I, 6tut:I, 7z1l:I, 7z1m:I, 7z1o:I, 7z2z:I, 7z30:I, 7z31:I
3 5fj9:I 92 111 0.4486 0.5217 0.4324 3.20e-22 5fja:I
4 7eu0:I 113 111 0.3551 0.3363 0.3423 5.02e-11 7eu1:I, 8xmb:I, 8xmc:I, 8xmd:I, 8xme:I
5 1qyp:A 57 48 0.2150 0.4035 0.4792 1.14e-10
6 6hlq:I 111 106 0.2991 0.2883 0.3019 7.38e-09 5g5l:I, 6hls:I
7 5iy6:I 125 110 0.2804 0.2400 0.2727 1.72e-08 8a3y:I, 8a40:I, 7b0y:I, 8b3d:I, 8b3f:I, 7b7u:I, 8bvw:I, 8byq:I, 8bz1:I, 6drd:I, 7edx:w, 7eg7:w, 7eg8:w, 7eg9:w, 7ega:w, 7egb:w, 7egc:w, 7ena:PI, 7enc:PI, 6exv:I, 7f4g:I, 5flm:I, 6gmh:I, 6gml:I, 8gxq:PI, 8gxs:PI, 5iy7:I, 5iy8:I, 5iy9:I, 5iya:I, 5iyb:I, 5iyc:I, 5iyd:I, 7lbm:I, 7nvr:I, 7nvs:I, 7nvt:I, 7nvu:I, 7nvy:I, 7nvz:I, 7nw0:I, 8oeu:I, 8oev:I, 8oew:I, 8of0:I, 5oik:I, 7okx:I, 7oky:I, 7ol0:I, 7oo3:I, 7oob:I, 7oop:I, 7opc:I, 7opd:I, 7ozn:I, 7ozn:U, 7ozo:I, 7ozo:U, 7ozp:I, 7ozp:U, 8p4a:I, 8p4b:I, 8p4e:I, 8p4f:I, 7pks:I, 8rbx:I, 8s51:I, 8s52:I, 8s54:I, 8s55:I, 8s5n:I, 6ted:I, 8uha:I, 8uhd:I, 8uhg:I, 8ui0:I, 8uis:I, 7unc:I, 7und:I, 8w8e:I, 8w8f:I, 8wak:w, 8wal:w, 8wan:w, 8wao:w, 8wap:w, 8waq:w, 8war:w, 8was:w, 8wat:w, 8wau:w, 8wav:w, 8waw:w, 8wax:w, 8way:w, 8waz:w, 8wb0:w, 6xre:I, 7ycx:7, 7zwd:I, 7zx7:I, 7zx8:I
8 8hil:I 99 44 0.2056 0.2222 0.5000 3.75e-08 8him:I, 8hyj:I
9 5iy6:U 170 40 0.1963 0.1235 0.5250 1.19e-07 5iy7:U, 5iy8:U, 5iya:U, 5iyb:U, 5iyc:U, 6o9l:U, 1tfi:A
10 5fmf:2 174 40 0.1963 0.1207 0.5250 1.25e-07 3po3:S, 1y1v:S
11 5xon:U 155 58 0.2243 0.1548 0.4138 2.43e-06
12 1i3q:I 122 107 0.2804 0.2459 0.2804 4.16e-06 4a3b:I, 4a3c:I, 4a3d:I, 4a3e:I, 4a3f:I, 4a3g:I, 4a3i:I, 4a3j:I, 4a3k:I, 4a3l:I, 4a3m:I, 4a93:I, 2b8k:I, 4bbr:I, 4bbs:I, 6blo:I, 6blp:I, 6bm2:I, 6bm4:I, 6bqf:I, 4bxx:I, 4bxz:I, 4by1:I, 4by7:I, 5c3e:I, 5c4a:I, 5c4j:I, 5c4x:I, 8cen:I, 8ceo:I, 3cqz:I, 2e2h:I, 2e2i:I, 2e2j:I, 3fki:I, 5fmf:I, 5fyw:I, 5fz5:I, 3gtg:I, 3gtj:I, 3gtk:I, 3gtl:I, 3gtm:I, 3gto:I, 3gtp:I, 3gtq:I, 6gyk:I, 6gyl:I, 6gym:I, 3h3v:J, 3hou:I, 3hou:U, 3hov:I, 3how:I, 3hox:I, 3hoy:I, 3hoz:I, 3i4m:I, 3i4n:I, 1i50:I, 1i6h:I, 6i84:I, 5ip7:I, 5ip9:I, 3j0k:I, 2ja5:I, 2ja6:I, 2ja7:I, 2ja7:U, 2ja8:I, 8jch:I, 3k1f:I, 8k5p:I, 3k7a:I, 1k83:I, 7ked:I, 7kee:I, 7kef:I, 3m3y:I, 3m4o:I, 7mei:i, 7mei:I, 7mk9:I, 7mka:i, 7ml0:I, 7ml1:I, 7ml2:I, 7ml4:I, 1nik:I, 7nkx:I, 7nky:I, 2nvq:I, 2nvt:I, 2nvx:I, 2nvy:I, 2nvz:I, 7o4i:I, 7o4j:I, 6o6c:G, 7o72:I, 7o73:I, 7o75:I, 5oqj:I, 5oqm:I, 5ot2:I, 3po2:I, 3po3:I, 1r5u:I, 1r9s:I, 1r9t:I, 2r92:I, 7rim:I, 7rip:I, 7riq:I, 7riw:I, 7rix:I, 7riy:I, 3rzd:I, 3rzo:I, 3s14:I, 3s15:I, 3s16:I, 3s17:I, 3s1m:I, 3s1n:I, 3s1q:I, 3s1r:I, 3s2d:I, 3s2h:I, 1sfo:I, 5sva:I, 8tug:I, 8tvp:I, 8tvq:I, 8tvs:I, 8tvv:I, 8tvw:I, 8tvx:I, 8tvy:I, 1twa:I, 1twc:I, 1twf:I, 1twg:I, 1twh:I, 5u5q:I, 8u9r:I, 8u9x:I, 8ukq:I, 8ukr:I, 8uks:I, 8ukt:I, 8uku:I, 6upx:I, 6upy:I, 6upz:I, 6uq0:I, 6uq1:I, 6uq2:I, 6uq3:I, 4v1m:I, 4v1n:I, 4v1o:I, 2vum:I, 5vvr:I, 5vvs:I, 5w4u:I, 5w51:I, 1wcm:I, 4x67:I, 4x6a:I, 1y1v:I, 1y1w:I, 4y52:I, 1y77:I, 4y7n:I, 2yu9:I, 7zs9:I, 7zsa:I, 7zsb:I
13 4c2m:I 124 118 0.2804 0.2419 0.2542 1.07e-05 4c2m:X, 4c3h:I, 4c3i:I, 4c3j:I, 6h67:I, 6h68:I, 6hko:I, 6hlr:I, 5lmx:I, 5m3f:I, 5m3m:I, 5m5x:I, 5n61:I, 5oa1:I, 6rqt:I, 6ruo:I, 6rwe:I, 6tps:I, 5w5y:I, 5w64:I, 5w65:I, 5w66:I, 4ym7:AI, 4ym7:BI, 4ym7:CI, 4ym7:DI, 4ym7:EI, 4ym7:FI
14 5x4z:I 113 99 0.2523 0.2389 0.2727 2.36e-05 6a5l:I, 6a5o:I, 6a5p:I, 6a5r:I, 6a5t:I, 6a5u:I, 8h0v:I, 8h0w:I, 8he5:I, 6inq:I, 6ir9:I, 6j4w:I, 6j4x:I, 6j4y:I, 6j4z:I, 6j50:I, 6j51:I, 8jh2:I, 8jh3:I, 8jh4:I, 7wbv:I, 7wbw:I, 7wbx:I, 5x4z:U, 5x50:I, 5x51:I, 5x51:U, 7xn7:I, 5xog:I, 5xon:I, 7xse:I, 7xsx:I, 7xsz:I, 7xt7:I, 7xtd:I, 7xti:I, 8yfq:I, 8yfr:I
15 3h0g:I 111 104 0.2710 0.2613 0.2788 1.16e-04 3h0g:U
16 7oba:I 105 98 0.3084 0.3143 0.3367 0.002 7ob9:I, 7obb:I
17 4zyn:B 385 83 0.2150 0.0597 0.2771 0.34 4k7d:A, 4k7d:B, 4k7d:C, 4k95:A, 4k95:B, 4k95:C, 4k95:D, 4k95:E, 4k95:F, 4k95:G, 4k95:H, 4k95:I, 4k95:J, 4k95:K, 4k95:L, 7us1:A, 8w31:A, 4zyn:A
18 1zt2:A 327 50 0.1402 0.0459 0.3000 0.67 5of3:A, 5of3:D, 5ofn:A, 1zt2:C
19 6o3p:B 320 46 0.1495 0.0500 0.3478 0.81
20 6scx:A 328 46 0.1495 0.0488 0.3478 1.00 6o3p:A, 6scx:B, 6scx:C
21 5caw:C 315 115 0.2897 0.0984 0.2696 2.8 5caw:A
22 2k4x:A 55 28 0.1028 0.2000 0.3929 2.9
23 6tmf:Z 50 29 0.1028 0.2200 0.3793 5.1
24 6m0q:A 504 47 0.1308 0.0278 0.2979 5.9 4fas:A, 4fas:C, 4fas:B, 1fgj:A, 1fgj:B, 6m0p:A, 6m0p:C, 6m0p:E, 6m0q:C, 6m0q:E, 6m0q:G, 6m0q:I, 6m0q:K, 4n4n:A, 4n4n:C, 4n4n:E, 4n4o:A, 4n4o:C, 4n4o:E
25 3e80:C 747 25 0.0841 0.0120 0.3600 6.3 3e7j:A, 3e7j:B, 3e80:A, 3e80:B, 2fuq:B, 2fuq:A, 2fut:A, 2fut:B
26 5jb3:Y 50 29 0.1028 0.2200 0.3793 7.3 5jbh:Y, 6sw9:Y, 6swc:Y, 6swe:Y, 4v4n:BY, 4v6u:AY, 7zag:Y, 7zah:Y, 7zai:Y, 7zhg:Y
27 5c1z:A 384 76 0.2243 0.0625 0.3158 7.4 4bm9:A, 5c1z:B, 5c23:A, 5c23:B, 5c9v:A, 6glc:A, 6hue:A, 6hue:B, 4i1f:A, 4i1h:A, 8ik6:C, 8ikm:A, 8ikt:A, 8ikv:C, 8ikv:A, 8jwv:A, 5n2w:A, 5n38:A, 8wzn:A, 8wzo:A
28 3ala:D 711 60 0.1589 0.0239 0.2833 7.7 3ala:A, 3ala:B, 3ala:C, 3ala:E, 3ala:F, 3ala:G, 4btw:A, 4btw:B, 4btx:A, 4btx:B, 4bty:A, 4bty:B, 2c10:A, 2c10:B, 2c10:C, 2c10:D, 2c11:A, 2c11:B, 2c11:C, 2c11:D, 1pu4:A, 1pu4:B, 1us1:A, 1us1:B, 2y73:A, 2y73:B, 2y74:A, 2y74:B
29 7oqy:Y 92 33 0.1121 0.1304 0.3636 8.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218