BioLiP

>protein
MLLAHISDTHFRSRGEKLYGFIDVNAANADVVSQLNALRERPDAVVVSGDIVNCGRPEEYQVARQILGSLNYPLYLIPGN
HDDKALFLEYLQPLCPQLGSDANNMRCAVDDFATRLLFIDSSRAGTSKGWLTDETISWLEAQLFEGGDKPATIFMHHPPL
PLGNAQMDPIACENGHRLLALVERFPSLTRIFCGHNHSLTMTQYRQALISTLPGTVHQVPYCHADTDPYYDLSPASCLMH
RQVGEQWVSYQHSLAHYAGPWLYDENISCPT

The query sequence (length=271) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3d03:A	274	271	1.0000	0.9891	1.0000	0.0	3d03:B, 3d03:C, 3d03:D, 3d03:E, 3d03:F, 2dxl:A, 2dxl:B, 2dxn:A, 2dxn:B, 2zo9:B, 2zo9:C, 2zoa:A, 2zoa:B
2	3ib7:A	295	218	0.2251	0.2068	0.2798	3.64e-20	2hy1:A, 2hyo:A, 2hyp:A, 3ib8:A
3	7dog:A	319	52	0.0664	0.0564	0.3462	0.020	7dog:B
4	5dny:A	352	89	0.0996	0.0767	0.3034	0.029	3auz:A, 5dny:C, 5f3w:A, 5f3w:C, 4tug:A, 4tug:B, 4tug:C, 4tug:D, 4tug:E, 4tug:F, 4tui:B, 4tui:A
5	5ik2:E	462	71	0.0701	0.0411	0.2676	0.43	5hkk:D, 5hkk:E, 5hkk:F, 5hkk:L, 5hkk:M, 5hkk:N, 5ik2:D, 5ik2:F, 5ik2:L, 5ik2:M, 5ik2:N
6	8hh1:D	471	71	0.0701	0.0403	0.2676	0.52	8hh1:E, 8hh1:F, 8hh2:D, 8hh2:E, 8hh2:F, 8hh3:D, 8hh3:E, 8hh3:F, 8hh4:D, 8hh4:E, 8hh4:F, 8hh5:D, 8hh5:E, 8hh5:F, 8hh6:D, 8hh6:E, 8hh6:F, 8hh7:D, 8hh7:F, 8hh8:D, 8hh8:F, 8hh9:D, 8hh9:F, 8hha:D, 8hha:F, 8hhb:D, 8hhb:F, 8hhc:D, 8hhc:F, 7l1q:D, 7l1q:E, 7l1q:F, 7l1r:D, 7l1r:E, 7l1r:F, 7l1s:D, 7l1s:F, 6n2y:E, 6n2y:F, 6n2z:F, 6n2z:D, 6n30:D, 6n30:E, 8spw:D, 8spw:E, 8spx:D, 8spx:E, 8spx:F, 8u1h:D, 8u1h:F, 4xd7:F, 7xkp:F, 7xkq:D, 7xkq:E, 7xkq:F, 7xkr:D, 7xkr:E, 7xkr:F
7	2xmo:A	409	46	0.0443	0.0293	0.2609	0.58	2xmo:B
8	1qh3:A	260	60	0.0590	0.0615	0.2667	0.75	1qh3:B, 1qh5:A, 1qh5:B
9	8bp6:B	370	66	0.0775	0.0568	0.3182	1.7	8bp6:A, 5d5m:A, 5d5m:C, 5d7i:A, 5d7i:C, 5d7j:C, 5d7j:E, 5d7l:A, 4gup:A, 4gup:C, 4l4t:A, 4l4t:C, 4l4v:A, 4l4v:C, 4lcw:A, 4lcw:C, 7lli:C, 7lli:A, 7llj:C, 7llj:E, 6mwr:A, 4nqc:A, 4nqc:C, 4nqd:A, 4nqd:C, 4nqe:A, 4nqe:C, 4pj5:A, 4pj5:C, 4pj7:A, 4pj7:C, 4pj8:A, 4pj9:A, 4pja:A, 4pja:C, 4pjb:A, 4pjb:C, 4pjc:A, 4pjc:C, 4pjd:A, 4pjd:C, 4pje:A, 4pje:C, 4pjf:A, 4pjf:C, 4pjg:A, 4pjg:C, 4pjh:A, 4pjh:C, 4pji:A, 4pji:C, 4pjx:A, 4pjx:C, 6puc:A, 6puc:C, 6pud:A, 6pud:C, 6pue:A, 6pue:C, 6puf:A, 6puf:C, 6pug:A, 6pug:C, 6puh:A, 6puh:C, 6pui:A, 6pui:C, 6puj:A, 6puj:C, 6puk:A, 6puk:C, 6pul:A, 6pul:C, 6pum:A, 6pum:C, 6pvc:A, 6pvc:C, 6pvd:A, 6pvd:C, 7rno:A, 5u16:A, 5u16:C, 5u17:A, 5u17:C, 5u1r:C, 5u1r:A, 5u2v:A, 5u2v:C, 5u6q:C, 5u6q:A, 5u72:C, 7ufj:A, 7ufj:C, 7umg:A, 6w9u:A, 6w9u:C, 6xqp:A, 6xqp:C, 7zt2:A, 7zt4:A, 7zt5:A, 7zt7:A, 7zt8:A, 7zt9:A
10	6s6v:A	386	102	0.1033	0.0725	0.2745	1.8	4m0v:A, 4m0v:B, 4m0v:C, 4m0v:D, 6s6v:B, 6s85:A, 7yzo:A, 7yzo:B, 7yzp:A, 7z03:A, 7z03:B
11	1qhw:A	300	81	0.0849	0.0767	0.2840	2.2	1qfc:A
12	3dsc:A	333	51	0.0554	0.0450	0.2941	2.4	3dsd:A, 3dsd:B, 4hd0:A, 4hd0:B, 1ii7:A, 1ii7:B, 1s8e:A, 1s8e:B
13	4g7e:B	833	56	0.0812	0.0264	0.3929	2.4
14	3b1n:B	320	151	0.1292	0.1094	0.2318	3.3	3b1n:A, 3b1p:A, 3b1q:A, 3b1q:B, 3b1q:C, 3b1q:D, 3b1q:E, 3b1q:F, 3b1r:A, 3b1r:B, 3b1r:C, 3b1r:D, 3b1r:E, 3b1r:F
15	4ysb:A	225	89	0.0886	0.1067	0.2697	4.3	4ysb:B
16	4gct:C	190	18	0.0443	0.0632	0.6667	6.1	4gct:A, 4gct:B, 4gct:D, 5haw:A, 5haw:B
17	2gl0:B	163	41	0.0406	0.0675	0.2683	6.6	2gl0:C, 2gl0:A, 2gl0:E, 2gl0:F, 2gl0:D, 2jb7:A, 2jb7:C, 2jb7:B

[Back]