BioLiP

>protein
MLKIISANVNGIRSAYKKGFYEYIAASGADIVCVQELKAQEADLSADMKNPHGMHGHWHCAEKRGYSGVAVYSKRKPDNV
QIGMGIEEFDREGRFVRCDFGRLSVISLYLPSGSSAEERQQVKYRFLDAFYPMLEAMKNEGRDIVVCGDWNIAHQNIDLK
NWKGNQKNSGFLPEEREWIGKVIHKLGWTDMWRTLYPDVPGYTWWSNRGQAYAKDVGWRIDYQMVTPELAAKAVSAHVYK
DEKFSDHAPLVVEYDYAAE

The query sequence (length=259) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4b5g:A	259	259	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4b5f:A, 4b5g:B, 4b5g:C, 4b5h:A, 4b5i:A, 4b5j:A, 4b5m:A, 4b5m:B, 4b5m:C, 2jc5:A
2	5j8n:A	258	254	0.4286	0.4302	0.4370	1.78e-73
3	3fzi:A	258	255	0.4015	0.4031	0.4078	8.16e-68	3g00:A, 3g00:B, 3g0a:A, 3g0r:A, 3g0r:B, 3g1k:A, 3g1k:B, 3g2c:A, 3g2c:B, 3g2d:A, 3g2d:B, 3g38:A, 3g3c:A, 3g3c:B, 3g3y:B, 3g3y:A, 3g4t:A, 3g4t:B, 3ga6:A, 3ga6:B, 3w2x:A, 3w2y:A, 3w2y:D
4	8bvh:H	262	255	0.3668	0.3626	0.3725	2.53e-62	8bvh:I, 8bvh:B, 8bvh:G, 8bvj:Q, 8bvj:G, 8bvj:C, 8bvj:A, 8bvm:A, 8bvm:H, 8bvm:N, 6o1k:A, 6o1k:B, 6o1l:A, 6o1l:B, 6o1l:R, 6o1m:A, 6o1m:B, 6o1m:S, 6o1m:R
5	8igi:A	251	254	0.3784	0.3904	0.3858	7.11e-62	8igi:B
6	5cfe:A	252	251	0.3707	0.3810	0.3825	1.54e-58
7	6mkk:A	282	254	0.3514	0.3227	0.3583	6.33e-56	6boq:A, 6bor:A, 6bos:A, 6bot:A, 6bou:A, 6bov:A, 6bow:A, 7cd5:A, 7cd6:A, 5cfg:A, 1de8:B, 1de8:A, 1de9:A, 1de9:B, 1dew:B, 1dew:A, 5dff:A, 5dfh:A, 5dfi:A, 5dfj:A, 5dg0:A, 4iem:A, 4iem:B, 4iem:C, 4iem:D, 2isi:A, 2isi:B, 2isi:C, 4lnd:A, 4lnd:B, 4lnd:C, 7lpg:D, 7lph:D, 7lpi:D, 7lpj:D, 7mcr:A, 7mev:A, 6p93:A, 6p94:A, 4qh9:A, 4qhe:A, 7suv:B, 7svb:B, 7tc2:A, 7tc2:B, 7tc2:C, 7tc2:D, 7tr7:A, 7u50:K, 3u8u:A, 3u8u:B, 3u8u:C, 3u8u:D, 3u8u:E, 3u8u:F, 6w0q:A, 6w2p:A, 6w3l:B, 6w3n:B, 6w3q:B, 6w3u:B, 6w43:A, 6w4i:A, 6w4i:B, 6w4t:A, 6w4t:B, 5wn0:A, 5wn1:A, 5wn2:A, 5wn3:B, 5wn4:B, 5wn5:B, 5wn5:A
8	8ka5:A	297	259	0.3359	0.2929	0.3359	6.27e-41	8ka3:A, 8ka4:B, 8ka4:C
9	2voa:A	257	264	0.3243	0.3268	0.3182	7.18e-29	2voa:B
10	6fk4:A	257	266	0.2819	0.2840	0.2744	7.48e-26	6fk5:A, 6fke:A, 2jc4:A
11	6wcd:A	314	289	0.2896	0.2389	0.2595	1.48e-17
12	7n3z:A	379	347	0.2973	0.2032	0.2219	5.27e-07	7n3y:B, 7n3y:C, 7n3y:A, 7n3y:D
13	8uw3:A	1265	257	0.1969	0.0403	0.1984	2.07e-05	7n8s:A, 7n94:A, 7n94:B, 8sp5:A, 8sp5:B, 8sp7:A, 8sxt:A, 8sxu:A, 1vyb:B
14	2eb0:B	307	77	0.0888	0.0749	0.2987	0.22	2eb0:A
15	4ruw:A	386	111	0.1081	0.0725	0.2523	0.60
16	6p24:B	793	116	0.1236	0.0404	0.2759	0.60
17	7wdq:A	336	116	0.1081	0.0833	0.2414	1.1	7wdq:B, 7wdq:C, 7wdw:A, 7wdw:B, 7wdw:C, 7wdw:D
18	6ful:A	478	66	0.0695	0.0377	0.2727	1.4	5a1l:A, 5a1l:B, 3avr:A, 3avs:A, 6fuk:A, 5fxv:A, 5fxv:B, 5fxw:A, 5fxw:B, 5fxx:A, 5fxx:B, 5fxz:A, 5fxz:B, 5fy0:A, 5fy0:B, 5fy1:A, 5fy1:B, 5fy7:A, 5fy7:B, 5fym:A, 5fym:B, 6g8f:A, 4uf0:A, 4uf0:B, 3zli:A, 3zli:B, 3zpo:A, 3zpo:B
19	3lku:E	291	63	0.0734	0.0653	0.3016	2.1	3lku:A
20	6ks6:E	536	34	0.0502	0.0243	0.3824	2.2	6ks6:e, 4v81:E, 4v81:M, 4v81:e, 4v81:m, 4v8r:AE, 4v8r:Ae, 4v8r:BE, 4v8r:Be, 4v94:E, 4v94:M, 4v94:e, 4v94:m, 7ylw:E, 7ylw:e, 7ylx:E, 7ylx:e, 7yly:E, 7yly:e
21	3s9c:A	234	32	0.0463	0.0513	0.3750	3.6	3sbk:A
22	8h7g:K	352	25	0.0425	0.0312	0.4400	5.7
23	8wr4:B	1442	34	0.0463	0.0083	0.3529	5.8
24	8wmm:B	1212	34	0.0463	0.0099	0.3529	6.1	8iyq:A, 8wmh:A, 8wmm:A, 8wmn:A, 8wmn:B, 8wr4:A
25	4zm6:A	844	41	0.0579	0.0178	0.3659	6.3	4zm6:B
26	8w53:B	479	51	0.0541	0.0292	0.2745	8.1	8w53:A
27	6ldk:A	813	47	0.0656	0.0209	0.3617	9.4

[Back]