Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MLIPVVCFTCGFPIGTYAAIFDKARTEYIKTKMDGTLPQNIPLDASLQIELKDLITALGIPMRVCCRTHLITTLDYRKYY

The query sequence (length=80) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8q3b:J 80 80 1.0000 1.0000 1.0000 2.11e-55 8q3k:J
2 1ef4:A 55 74 0.2875 0.4182 0.3108 3.15e-04
3 7b0y:J 67 76 0.2875 0.3433 0.3026 0.007 8a3y:J, 7a6h:J, 7ae1:J, 7ae3:J, 7aea:J, 8b3d:J, 8b3f:J, 8bvw:J, 8byq:J, 8bz1:J, 7d58:J, 7d59:J, 7dn3:J, 6drd:J, 7du2:J, 7edx:x, 7eg7:x, 7eg8:x, 7eg9:x, 7ega:x, 7egb:x, 7egc:x, 7ena:PJ, 7enc:PJ, 6exv:J, 7f4g:J, 7fji:J, 7fjj:J, 5flm:J, 6gmh:J, 6gml:J, 8gxq:PJ, 8gxs:PJ, 8ity:J, 8iue:J, 8iuh:J, 5iy6:J, 5iy8:J, 5iy9:J, 5iya:J, 5iyb:J, 5iyc:J, 5iyd:J, 7lbm:J, 7nvr:J, 7nvs:J, 7nvt:J, 7nvu:J, 7nvy:J, 7nvz:J, 7nw0:J, 6o9l:J, 7ob9:J, 7oba:J, 7obb:J, 8oeu:J, 8oev:J, 8oew:J, 8of0:J, 5oik:J, 7okx:J, 7oky:J, 7ol0:J, 7oo3:J, 7oob:J, 7oop:J, 7opc:J, 7opd:J, 7ozn:J, 7ozn:V, 7ozo:J, 7ozo:V, 7ozp:J, 7ozp:V, 8p4a:J, 8p4b:J, 8p4e:J, 8p4f:J, 7pks:J, 8rbx:J, 8s51:J, 8s52:J, 8s54:J, 8s55:J, 8s5n:J, 6ted:J, 8uha:J, 8uhd:J, 8uhg:J, 8ui0:J, 8uis:J, 7unc:J, 7und:J, 7vba:J, 7vbb:J, 7vbc:J, 8wak:x, 8wal:x, 8wan:x, 8wao:x, 8wap:x, 8waq:x, 8war:x, 8was:x, 8wat:x, 8wau:x, 8wav:x, 8waw:x, 8wax:x, 8way:x, 8waz:x, 8wb0:x, 7ycx:8, 7zwd:J, 7zx7:J, 7zx8:J
4 8hil:J 64 76 0.2875 0.3594 0.3026 0.008 7eu0:J, 7eu1:J, 8him:J, 8hyj:J, 8xmc:J
5 8cro:N 65 75 0.2875 0.3538 0.3067 0.021 8oki:N, 8orq:N, 8p2i:N, 8rbo:N
6 7ok0:N 66 75 0.2750 0.3333 0.2933 0.065 7oq4:N
7 5vvr:J 70 75 0.2625 0.3000 0.2800 0.098 4a3b:J, 4a3c:J, 4a3d:J, 4a3e:J, 4a3f:J, 4a3g:J, 4a3i:J, 4a3j:J, 4a3k:J, 4a3l:J, 4a3m:J, 4a93:J, 2b63:J, 2b8k:J, 4bbr:J, 4bbs:J, 6blo:J, 6blp:J, 6bm2:J, 6bm4:J, 6bqf:J, 8bws:J, 4bxx:J, 4bxz:J, 4by1:J, 4by7:J, 4c2m:J, 4c2m:Y, 4c3h:J, 4c3i:J, 4c3j:J, 5c3e:J, 5c4a:J, 5c4j:J, 5c4x:J, 8cen:J, 8ceo:J, 6cnb:J, 6cnc:J, 6cnd:J, 6cnf:J, 3cqz:J, 2e2h:J, 2e2i:J, 2e2j:J, 6eu0:J, 6eu1:J, 6eu3:J, 6f40:J, 6f41:J, 6f42:J, 5fj8:J, 5fj9:J, 5fja:J, 3fki:J, 5fmf:J, 5fyw:J, 5fz5:J, 5g5l:J, 3gtg:J, 3gtj:J, 3gtk:J, 3gtl:J, 3gtm:J, 3gto:J, 3gtp:J, 3gtq:J, 6gyk:J, 6gyl:J, 6gym:J, 3h3v:K, 6h67:J, 6h68:J, 6hko:J, 6hls:J, 3hou:J, 3hou:V, 3hov:J, 3how:J, 3hox:J, 3hoy:J, 3hoz:J, 1i3q:J, 3i4m:J, 3i4n:J, 1i50:J, 1i6h:J, 6i84:J, 5ip7:J, 5ip9:J, 3j0k:J, 2ja5:J, 2ja6:J, 2ja7:J, 2ja7:V, 2ja8:J, 9ja1:J, 8jch:J, 3k1f:J, 8k5p:J, 3k7a:J, 1k83:J, 7ked:J, 7kee:J, 7kef:J, 5lmx:J, 3m3y:J, 5m3f:J, 5m3m:J, 3m4o:J, 5m5w:J, 5m5x:J, 5m5y:J, 5m64:J, 7mei:j, 7mei:J, 7mk9:J, 7mka:j, 7ml0:J, 7ml1:J, 7ml2:J, 7ml4:J, 5n5y:J, 5n5z:J, 5n60:J, 5n61:J, 1nik:J, 7nkx:J, 2nvq:J, 2nvt:J, 2nvx:J, 2nvy:J, 2nvz:J, 7o4i:J, 7o4j:J, 6o6c:H, 7o72:J, 7o73:J, 7o75:J, 5oa1:J, 5oqj:J, 5oqm:J, 5ot2:J, 3po2:J, 3po3:J, 3qt1:J, 1r5u:J, 2r7z:J, 1r9s:J, 1r9t:J, 2r92:J, 2r93:J, 7rim:J, 7rip:J, 7riq:J, 7riw:J, 7rix:J, 7riy:J, 6rqt:J, 6ruo:J, 6rwe:J, 3rzd:J, 3rzo:J, 3s14:J, 3s15:J, 3s16:J, 3s17:J, 3s1m:J, 3s1n:J, 3s1q:J, 3s1r:J, 3s2d:J, 3s2h:J, 1sfo:J, 5sva:J, 6tps:J, 6tut:J, 8tug:J, 8tvp:J, 8tvq:J, 8tvs:J, 8tvv:J, 8tvw:J, 8tvx:J, 1twa:J, 1twc:J, 1twf:J, 1twg:J, 1twh:J, 5u5q:J, 8u9r:J, 8u9x:J, 8ukq:J, 8ukr:J, 8uks:J, 8ukt:J, 8uku:J, 6upx:J, 6upy:J, 6upz:J, 6uq0:J, 6uq1:J, 6uq2:J, 6uq3:J, 4v1m:J, 4v1n:J, 4v1o:J, 2vum:J, 5vvs:J, 5w4u:J, 5w51:J, 5w5y:J, 5w64:J, 5w65:J, 5w66:J, 1wcm:J, 4x67:J, 4x6a:J, 1y1v:J, 1y1w:J, 4y52:J, 1y77:J, 4y7n:J, 4ym7:AJ, 4ym7:BJ, 4ym7:CJ, 4ym7:DJ, 4ym7:EJ, 4ym7:FJ, 2yu9:J, 7z0h:J, 7z1l:J, 7z1m:J, 7z1n:J, 7z1o:J, 7z2z:J, 7z30:J, 7z31:J, 7zs9:J, 7zsa:J, 7zsb:J
8 7xn7:J 67 75 0.2750 0.3284 0.2933 0.15 6a5l:J, 6a5o:J, 6a5p:J, 6a5r:J, 6a5t:J, 6a5u:J, 8h0v:J, 8h0w:J, 8he5:J, 6inq:J, 6ir9:J, 6j4w:J, 6j4x:J, 6j4y:J, 6j4z:J, 6j50:J, 6j51:J, 8jh2:J, 8jh3:J, 8jh4:J, 7wbv:J, 7wbw:J, 7wbx:J, 5x4z:J, 5x4z:V, 5x50:J, 5x51:J, 5x51:V, 5xog:J, 5xon:J, 7xse:J, 7xsx:J, 7xsz:J, 7xt7:J, 7xtd:J, 7xti:J, 8yfq:J, 8yfr:J
9 7aoc:J 68 31 0.1625 0.1912 0.4194 0.22 7aod:J, 7aod:V, 3h0g:J, 3h0g:V
10 4gcj:A 304 42 0.2125 0.0559 0.4048 0.33 2a0c:X, 5a14:A, 2a4l:A, 7ack:A, 7ack:C, 5ane:A, 5ang:A, 5ani:A, 5anj:A, 1b38:A, 1b39:A, 2b52:A, 2b53:A, 2b54:A, 8b54:A, 8b54:C, 7b7s:A, 7b7s:C, 4bck:A, 4bck:C, 4bcm:A, 4bcm:C, 4bcn:A, 4bcn:C, 4bco:A, 4bcp:A, 4bcq:A, 4bcq:C, 3bht:A, 3bhu:A, 3bhv:A, 2bkz:A, 2bkz:C, 2bpm:A, 2bpm:C, 2c4g:A, 2c4g:C, 2c5n:A, 2c5n:C, 2c5o:A, 2c5o:C, 2c5v:A, 2c5v:C, 2c5x:A, 2c5x:C, 2c5y:A, 2c68:A, 2c69:A, 2c6i:A, 2c6k:A, 2c6l:A, 2c6m:A, 2c6o:A, 2c6t:A, 2c6t:C, 2cch:A, 2cch:C, 2cci:A, 2cci:C, 4cfm:A, 4cfn:A, 4cfn:C, 4cfu:A, 4cfv:A, 4cfw:A, 4cfw:C, 4cfx:A, 4cfx:C, 2cjm:A, 2cjm:C, 1ckp:A, 2clx:A, 5cyi:A, 5cyi:C, 4d1x:A, 4d1z:A, 5d1j:A, 3ddp:A, 3ddp:C, 3ddq:A, 1di8:A, 3dog:A, 2ds1:A, 1e1v:A, 1e1x:A, 7e34:A, 1e9h:A, 1e9h:C, 3eid:A, 3ej1:A, 3ej1:C, 4ek4:A, 4ek5:A, 4ek8:A, 3eoc:A, 3eoc:C, 4eoi:A, 4eoi:C, 4eoj:A, 4eoj:C, 4eok:A, 4eok:C, 4eol:A, 4eol:C, 4eom:A, 4eon:A, 4eon:C, 4eoo:A, 4eoo:C, 4eop:A, 4eop:C, 4eoq:A, 4eor:A, 4eos:A, 4eos:C, 4erw:A, 8erd:A, 8ern:A, 2exm:A, 4ez3:A, 4ez7:A, 3f5x:A, 3f5x:C, 1fin:A, 1fin:C, 4fkg:A, 4fki:A, 4fkl:A, 4fko:A, 4fkp:A, 4fkq:A, 4fkr:A, 4fkt:A, 4fku:A, 4fkv:A, 4fkw:A, 8fow:A, 5fp6:A, 8fp5:A, 1fq1:B, 9fr2:A, 1fvt:A, 1fvv:A, 1fvv:C, 2fvd:A, 4fx3:A, 4fx3:C, 3fz1:A, 2g9x:A, 1gii:A, 6gub:A, 6gub:C, 6guc:A, 6guc:C, 6gue:A, 6gue:C, 6guf:A, 6guf:C, 6guh:A, 6gva:A, 1gy3:A, 1gy3:C, 1gz8:A, 1h00:A, 1h01:A, 1h07:A, 1h08:A, 1h0v:A, 1h0w:A, 1h1p:A, 1h1p:C, 1h1q:A, 1h1q:C, 1h1r:A, 1h1r:C, 1h1s:A, 1h1s:C, 8h6p:A, 8h6t:A, 1hck:A, 4i3z:A, 4i3z:C, 2i40:A, 2i40:C, 5iev:A, 5iex:A, 5iey:A, 3igg:A, 4ii5:A, 4ii5:C, 2iw6:A, 2iw6:C, 2iw8:A, 2iw9:A, 6jgm:A, 5jq5:A, 5jq8:A, 1jst:A, 1jst:C, 1jsv:A, 1jvp:P, 5k4j:A, 4kd1:A, 1ke5:A, 1ke6:A, 1ke7:A, 1ke8:A, 1ke9:A, 7kjs:A, 5l2w:A, 3le6:A, 3lfn:A, 3lfq:A, 3lfs:A, 5lmk:A, 4lyn:A, 7m2f:A, 5mhq:A, 7mkx:A, 7mkx:C, 3my5:A, 5nev:A, 5nev:C, 3ns9:A, 7nvq:A, 1ogu:A, 1oi9:A, 1oi9:C, 1oiq:A, 1oir:A, 1oit:A, 1oiu:A, 1oiy:A, 1oiy:C, 5oo0:A, 5oo1:A, 5oo3:A, 6oqi:A, 5osj:A, 5osm:A, 1p5e:A, 1p5e:C, 1pf8:A, 3pj8:A, 1pkd:A, 1pkd:C, 1pxi:A, 1pxj:A, 1pxk:A, 1pxl:A, 1pxm:A, 1pxn:A, 1pxo:A, 1pxp:A, 3pxf:A, 3pxq:A, 3pxy:A, 3pxz:A, 3py0:A, 3py1:A, 6q3b:A, 6q3c:A, 6q3f:A, 6q48:A, 6q49:A, 6q4a:A, 6q4b:A, 6q4c:A, 6q4d:A, 6q4e:A, 6q4f:A, 6q4g:A, 6q4h:A, 6q4i:A, 6q4j:A, 6q4k:A, 3qhr:C, 3qhr:A, 3qhw:A, 3qhw:C, 7qhl:A, 7qhl:C, 3ql8:A, 1qmz:A, 1qmz:C, 3qqf:A, 3qqg:A, 3qqh:A, 3qqj:A, 3qqk:A, 3qql:A, 3qrt:A, 3qru:A, 3qtq:A, 3qtr:A, 3qts:A, 3qtu:A, 3qtw:A, 3qtx:A, 3qtz:A, 3qu0:A, 3qwj:A, 3qwk:A, 3qx2:A, 3qx4:A, 3qxo:A, 3qxp:A, 3qzf:A, 3qzg:A, 3qzh:A, 3qzi:A, 3r1q:A, 3r1s:A, 3r1y:A, 3r28:A, 2r3f:A, 2r3g:A, 2r3h:A, 2r3i:A, 2r3j:A, 2r3m:A, 2r3o:A, 2r3p:A, 2r3q:A, 2r3r:A, 2r64:A, 3r6x:A, 3r71:A, 3r73:A, 3r7e:A, 3r7i:A, 3r7u:A, 3r7v:A, 3r7y:A, 3r83:A, 3r8l:A, 3r8m:A, 3r8p:A, 3r8u:A, 3r8v:A, 3r8z:A, 3r9d:A, 3r9h:A, 3r9n:A, 3r9o:A, 3rah:A, 3rai:A, 6rij:A, 6rij:C, 3rjc:A, 4rj3:A, 3rk5:A, 3rk7:A, 3rk9:A, 3rkb:A, 3rm6:A, 3rm7:A, 3rni:A, 3roy:A, 3rpo:A, 3rpr:A, 3rpv:A, 7rwe:A, 7rwf:A, 7rxo:A, 3rzb:A, 3s00:A, 3s0o:A, 3s2p:A, 7s4t:A, 7s7a:A, 7s84:A, 7s85:A, 7s9x:A, 7sa0:A, 3sqq:A, 3sw4:A, 3ti1:A, 3tiy:A, 3tiz:A, 3tnw:A, 3tnw:C, 7ug1:A, 3uli:A, 3unj:A, 3unk:A, 2uue:A, 2uue:C, 8uv0:A, 7uxi:A, 2uzb:A, 2uzb:C, 2uzd:A, 2uzd:C, 2uze:A, 2uze:C, 2uzl:A, 2uzl:C, 2uzn:A, 2uzo:A, 2v0d:A, 7vdu:A, 8vq3:A, 8vq4:A, 2vti:A, 2vtl:A, 2vtm:A, 2vto:A, 2vtp:A, 2vtr:A, 2vts:A, 2vu3:A, 2vv9:A, 1vyw:A, 1vyw:C, 1vyz:A, 1w0x:C, 2w06:A, 2w17:A, 2w1h:A, 1w8c:A, 3wbl:A, 1wcc:A, 2wev:A, 2wev:C, 2wih:A, 2wih:C, 2wip:A, 2wip:C, 2wmb:A, 2wpa:A, 2wpa:C, 2wxv:A, 2wxv:C, 2x1n:A, 2x1n:C, 2xmy:A, 2xnb:A, 1y8y:A, 1y91:A, 1ykr:A, 6yl1:A, 6ylk:A, 7zpc:A
11 8h4r:A 287 42 0.2125 0.0592 0.4048 0.52
12 5tsq:A 312 69 0.2250 0.0577 0.2609 1.1
13 4eom:C 276 42 0.2000 0.0580 0.3810 1.2 4bco:C, 4bcp:C, 3bht:C, 3bhu:C, 3bhv:C, 4cfm:C, 4cfu:C, 4cfv:C, 3ddq:C, 3dog:C, 4eoq:C, 4eor:C, 2g9x:C, 2iw8:C, 2iw9:C, 5lmk:C, 3my5:C, 1ogu:C, 1oiu:C, 7uxk:A
14 4ayb:N 65 75 0.2625 0.3231 0.2800 1.2 3hkz:N, 3hkz:W, 2pmz:N, 2pmz:Y, 4v8s:AO, 4v8s:BN, 2waq:N, 2wb1:N, 2wb1:O, 2y0s:N, 2y0s:O
15 5wvp:A 924 44 0.1750 0.0152 0.3182 2.6
16 8j8v:A 365 29 0.1375 0.0301 0.3793 2.8 8go9:A, 8go9:F, 8goc:A, 8goc:B, 8goc:C, 8goo:A, 8goo:B, 8goo:C, 8i0z:A, 8i0z:B, 8i0z:C, 8i10:A, 8i10:B, 8i10:C, 8j8r:A, 8j8r:B, 8j8r:C, 8j8v:F, 6k3f:A, 6k3f:B, 6k3f:C, 6k3f:D, 6k3f:E, 6k3f:F, 5tv1:A
17 9bct:N 65 75 0.2250 0.2769 0.2400 2.8 9bcu:N, 6kf4:N, 4qiw:N, 4qiw:V
18 1unl:A 292 42 0.1875 0.0514 0.3571 3.7 4au8:A, 4au8:B, 3o0g:B, 1ung:A, 1ung:B, 1unh:A, 1unh:B, 7vdp:A, 7vdp:B, 7vdq:A, 7vdq:B, 7vdr:A, 7vdr:B, 7vds:A
19 8h1c:B 983 48 0.1750 0.0142 0.2917 3.8 8h1c:A, 7xjz:A, 7xk0:A, 7xk1:A, 7xk1:C
20 5q0c:A 328 25 0.1500 0.0366 0.4800 4.7 5et6:A, 5et6:C, 5et6:B, 5et6:D, 4he0:A, 4he1:A, 4he2:A, 3ifa:A, 3ifa:B, 3ifa:C, 3ifa:D, 3ifc:A, 3ifc:B, 3ifc:C, 3ifc:D, 5k56:A, 5l0a:A, 5q0c:B, 5q0c:C, 5q0c:D, 5q0c:E, 5q0c:F, 5q0c:G, 5q0c:H
21 4kh6:B 596 23 0.1375 0.0185 0.4783 6.7 4a59:A, 4a59:B, 4a59:C, 4a59:D, 4a5a:A, 4a5a:B, 4a5a:C, 4a5a:D, 4kh4:A, 4kh4:B, 4kh5:A, 4kh5:B, 4kh6:A
22 5k55:A 290 25 0.1500 0.0414 0.4800 6.7 5et8:A
23 8k9e:A 218 26 0.1250 0.0459 0.3846 6.7 8k9f:A, 8x2j:A
24 6hua:A 296 44 0.1750 0.0473 0.3182 9.0 6hua:B
25 4jrf:A 479 39 0.1625 0.0271 0.3333 9.3

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218