BioLiP

>protein
MLILAIISLITFVSMSKLSDNRAIIRLINIYLILVLVLDSFLYLLFLNNQTYTVMGELLIFNSFTFYIDMLIYFIMIVIS
SLYGYNLYNNNLYKTLFEPKKELIILFLINILGALLIVHSNDFITLFVAIELQSYSIYLITAIYNSSYKASKASMLYFFM
GGILSILIAYSINTYYSVLNSYTLHSLDSLIINTLDLNLILIALSLGLLFKIGIAPLHKWLISIYENTPILITIYISLIP
KISILSYLVLSNISINSLVISILAILTLLVGSVGGLLQIKIKRLLAFSGLTNAGYMMLLLLLNNNEFSYLYYITQYSISH
LAIFMIIIFSIYYINYINNQYNPIIYVNQLKGLIHDNAYLVLSMAIVVFSFIGIPPLLGFFGKLNILMSILNNGYYFISI
VLIVASLISALYYLYLLNVSIQDKNNILINSNETVSSVLSYILSSLIILITFGFIYNSLIIDIFNVYFN

The query sequence (length=469) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7o6y:2	469	469	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7o71:2, 6rfq:2, 6rfr:2, 6y79:2, 7zkp:2
2	7zkq:2	448	469	0.9552	1.0000	0.9552	0.0
3	7zmb:2	558	373	0.2857	0.2401	0.3592	4.33e-54	7zme:2, 7zmg:2, 7zmh:2
4	8qby:N	479	328	0.1898	0.1858	0.2713	1.03e-34
5	7aqq:N	488	342	0.1962	0.1885	0.2690	5.42e-34	7a23:I, 7a24:I, 7ar7:N, 7ar8:N, 8bef:N, 8bpx:N
6	6l7o:B	493	383	0.2111	0.2008	0.2585	1.55e-25	6l7p:B
7	8iaq:N	344	189	0.1109	0.1512	0.2751	1.33e-13	8ib6:N, 8ibb:N, 8ibf:N, 8ic4:N
8	5gup:i	347	209	0.1109	0.1499	0.2488	3.18e-11	7v2c:i, 7v2d:i, 7v2e:i, 7v2f:i, 7v2h:i, 7v2k:i, 7v2r:i, 7v30:i, 7v31:i, 7v32:i, 7v33:i, 7v3m:i, 7vbl:i, 7vbp:i, 7vc0:i, 7vwl:i, 7vxs:i, 7vy1:i, 7vy9:i, 7vye:i, 7vyg:i, 7vyi:i, 7vys:i, 7vz8:i, 7vzv:i, 7vzw:i, 7w00:i, 7w0h:i, 7w0r:i, 7w0y:i, 7w1o:i, 7w1p:i, 7w1t:i, 7w1u:i, 7w1v:i, 7w1z:i, 7w20:i, 7w2k:i, 7w2r:i, 7w2u:i, 7w2y:i, 7w31:i, 7w32:i, 7w35:i, 7w4c:i, 7w4d:i, 7w4e:i, 7w4f:i, 7w4g:i, 7w4j:i, 7w4k:i, 7w4l:i, 7w4m:i, 7w4n:i, 7w4q:i
9	7qso:N	347	313	0.1663	0.2248	0.2492	7.03e-11	7r41:N, 7r42:N, 7r44:N, 7r45:N, 7r47:N, 7r48:N, 7r4c:N, 7r4d:N, 7r4f:N, 7r4g:N, 6zkm:N, 6zkn:N, 6zku:N, 6zkv:N
10	5lnk:L	599	344	0.1812	0.1419	0.2471	2.42e-09
11	5xtc:i	347	204	0.1109	0.1499	0.2549	1.91e-08	5xtd:i, 5xth:i, 5xti:i, 5xti:Bi
12	7v2h:l	606	348	0.1706	0.1320	0.2299	9.97e-08	7vc0:l, 7vy1:l, 7vys:l, 7w0h:l, 7w2l:l, 7w2r:l, 7w2y:l, 7w32:l, 7w4q:l
13	3rko:L	612	360	0.1663	0.1275	0.2167	3.60e-07	3rko:B
14	8bpx:L	665	292	0.1493	0.1053	0.2397	6.06e-07	8bef:L
15	7a23:a	600	283	0.1386	0.1083	0.2297	7.79e-07
16	8e9g:L	625	189	0.1066	0.0800	0.2646	5.85e-05	8e9h:L, 8e9i:L
17	6tjv:F	600	207	0.1130	0.0883	0.2560	0.002
18	8e9i:M	518	214	0.1109	0.1004	0.2430	0.003	8e9g:M, 8e9h:M
19	6l7o:F	647	245	0.1194	0.0866	0.2286	0.009	6l7p:F
20	6rfq:4	486	342	0.1855	0.1790	0.2544	0.009	6rfr:4, 6y79:4
21	6rfq:5	654	283	0.1514	0.1086	0.2509	0.056	7o6y:5, 6rfr:5
22	7enc:0	306	37	0.0277	0.0425	0.3514	0.69	1g25:A, 8gxq:HD, 8gxs:HD, 6nmi:H, 7nvw:3, 7nvx:3, 7nvy:3, 7nvz:3, 8wak:0, 8wal:0, 8wan:0, 8wao:0, 8wap:0, 8waq:0, 8war:0, 8was:0
23	3rko:M	504	237	0.1023	0.0952	0.2025	0.77	3rko:C
24	6l7o:D	504	212	0.1002	0.0933	0.2217	1.0	6l7p:D
25	8gym:n5	709	222	0.1194	0.0790	0.2523	1.8	8gym:N5, 7tgh:5
26	8qby:L	659	89	0.0597	0.0425	0.3146	2.3	8qc1:L
27	8qby:M	503	342	0.1514	0.1412	0.2076	4.2	8qc1:M
28	8xxn:3B	536	89	0.0448	0.0392	0.2360	5.9	6zon:B, 6zp4:B, 6zvj:B
29	8iru:R	268	38	0.0192	0.0336	0.2368	7.2
30	5lnk:M	459	284	0.1386	0.1416	0.2289	7.4	8q0a:M, 8q0f:M, 8q0m:M, 8q0o:M, 8q1y:M, 8q25:M, 8q45:M, 8q48:M, 8q49:M, 8q4a:M, 7qso:M, 7r4f:M, 7r4g:M, 6zkm:M, 6zkn:M, 6zku:M, 6zkv:M
31	8pj1:1	588	89	0.0448	0.0357	0.2360	7.4	6fec:w, 2krb:A, 8oz0:I, 8pj2:1, 8pj3:1, 8pj5:1, 8pj6:1
32	5dzy:B	415	68	0.0469	0.0530	0.3235	7.8	5dzx:A, 5dzx:B, 5dzy:D, 5dzy:A, 5dzy:C, 5dzy:E, 5dzy:F
33	7zme:5	670	209	0.1087	0.0761	0.2440	8.1	7zmg:5

[Back]