BioLiP

>protein
MLIAIEGVDGAGKRTLVEKLSGAFRAAGRSVATLAFPRYGQSVAADIAAEALHGEHGDLASSVYAMATLFALDRAGAVHT
IQGLCRGYDVVILDRYVASNAAYSAARLHENAAGKAAAWVQRIEFARLGLPKPDWQVLLAVSAELADAELQQRTGAVYAE
LAAQGWGGRWLVVGADVDPGRLAATLAP

The query sequence (length=188) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5nrn:B	211	209	1.0000	0.8910	0.8995	2.97e-127	1g3u:A, 1gsi:A, 1gtv:A, 1gtv:B, 1mrn:A, 1mrs:A, 1n5i:A, 1n5j:A, 1n5k:A, 1n5k:B, 1n5l:A, 1n5l:B, 5nrq:A, 1w2g:A, 1w2g:B, 1w2h:A, 1w2h:B, 6yt1:A, 6yt1:B
2	5nq5:A	191	188	0.9681	0.9529	0.9681	6.11e-127	5nr7:A, 5nr7:B, 5nrn:A, 5nrq:B, 4unn:A, 4unn:B, 4unp:A, 4unq:A, 4unq:B, 4unr:A, 4unr:B, 4uns:A, 4uns:B
3	5h56:B	195	157	0.2606	0.2513	0.3121	1.26e-09	5h56:A, 5h5k:A, 5h5k:B, 4s2e:A, 4s2e:B, 4s35:A, 4s35:B, 5xai:B, 5xai:A, 5xb2:B, 5xb2:A, 5xb3:A, 5xb3:B, 5xb5:A
4	1e2f:A	210	148	0.2553	0.2286	0.3243	1.37e-08	1e2d:A, 1e2e:A, 1e2g:A, 1e2q:A, 1e98:A, 1e99:A, 1e9a:A, 1e9b:A, 1e9c:A, 1e9d:A, 1e9e:A, 1e9f:A, 1nmx:A, 1nmy:A, 1nmz:A, 1nn0:A, 1nn1:A, 1nn3:A, 1nn5:A, 2xx3:A
5	3tmk:A	216	149	0.2394	0.2083	0.3020	1.44e-06	1tmk:A, 1tmk:B, 2tmk:A, 2tmk:B, 3tmk:B, 3tmk:C, 3tmk:D, 3tmk:E, 3tmk:F, 3tmk:G, 3tmk:H
6	5uiv:A	225	140	0.2287	0.1911	0.3071	4.34e-06
7	2v54:A	204	191	0.2394	0.2206	0.2356	5.15e-05	2v54:B, 2w0s:A, 2w0s:B
8	5x7j:B	197	148	0.2447	0.2335	0.3108	1.05e-04	5x7j:A, 5x86:B, 5x86:A, 5x8a:B, 5x8b:A, 5x8b:B, 5x8c:A, 5x8c:B, 5x8d:B, 5x8d:A, 5x98:B, 5x98:A, 5x99:A, 5x99:B, 5xal:A, 5xal:B, 5xt8:A, 5xt8:B, 5zax:A, 5zax:B, 5zb0:A, 5zb0:B, 5zb4:A, 5zb4:B
9	2wwf:C	212	186	0.2447	0.2170	0.2473	1.52e-04	2wwf:A, 2wwf:B, 2wwg:A, 2wwg:B, 2wwg:C, 2wwh:A, 2wwh:B, 2wwh:C, 2wwi:A, 2wwi:B, 2wwi:C, 2yof:A, 2yof:B, 2yof:C, 2yog:A, 2yog:B, 2yoh:A, 2yoh:B
10	3hjn:A	189	169	0.2500	0.2487	0.2781	6.78e-04	3hjn:B
11	8j5f:A	238	185	0.2340	0.1849	0.2378	0.003	8j5e:A, 8j5g:A, 8j5h:A
12	4dwj:B	203	147	0.2340	0.2167	0.2993	0.011	2ccg:A, 2ccg:B, 2ccj:A, 2ccj:B, 4dwj:A, 4dwj:C, 4dwj:D, 4dwj:F, 4dwj:G, 4dwj:H, 4eaq:A, 4eaq:B, 4gfd:A, 4gfd:B, 4gsy:A, 4gsy:B, 4hdc:A, 4hdc:B, 4hej:A, 4hlc:A, 4hlc:B, 4hld:A, 4hld:B, 4qg7:A, 4qg7:B, 4qga:A, 4qga:B, 4qgf:A, 4qgf:B, 4qgg:A, 4qgg:B, 4qgh:A, 4qgh:B, 4xwa:A, 4xwa:B
13	7fgq:A	190	175	0.2340	0.2316	0.2514	0.018
14	4jyb:A	323	48	0.1011	0.0588	0.3958	1.0	8dpb:A, 8dpb:B, 4jyb:B, 4jyc:D, 4lc1:A, 4lc1:B, 2qm7:A, 2qm7:B
15	3lv8:A	204	146	0.1915	0.1765	0.2466	1.4
16	6aqe:B	266	37	0.0691	0.0489	0.3514	2.5	6aqe:A, 7nmj:A, 7nmj:B, 7nmj:C, 7nmj:D, 7plj:A, 7plj:B, 7plj:C, 7plj:D
17	3hwo:A	379	64	0.0957	0.0475	0.2812	2.9	3hwo:B, 5jxz:A, 5jxz:B, 5jy4:A, 5jy4:B, 5jy8:A, 5jy8:B, 5jzd:A, 5jzd:B
18	3b1v:A	264	63	0.1170	0.0833	0.3492	3.5	3b1w:A, 3b1w:B, 3b1w:C, 3b1w:D, 3b1x:A, 3b1x:B, 3b1y:A, 7bvu:A, 7bvu:B, 7bwv:A, 7bwv:B, 3lx5:A, 3lx8:A, 4non:A, 4non:B, 3ss8:A, 3ss8:B, 3tah:A, 3tah:B
19	6tmf:b	123	67	0.1064	0.1626	0.2985	4.3
20	7nhn:0	461	49	0.0851	0.0347	0.3265	4.6
21	6cvd:B	303	31	0.0691	0.0429	0.4194	4.8	4c7o:B, 4c7o:D, 6cs8:A, 6cs8:B, 6cvd:A, 6dlx:A, 6dlx:B, 6fqd:A, 6fqd:B, 5gad:l, 6n6n:B, 5nco:l, 6nc1:A, 6nc4:A, 6nc4:B, 5niy:A, 7o9h:A, 7o9h:B, 2xxa:D, 2xxa:B, 3zn8:D
22	6cy5:B	318	95	0.1277	0.0755	0.2526	4.9	6cy5:A
23	2uvq:A	211	62	0.0904	0.0806	0.2742	5.2
24	8twf:C	385	53	0.0745	0.0364	0.2642	5.7	8twf:D, 8twf:A, 8twf:B
25	4v0l:A	168	34	0.0585	0.0655	0.3235	5.8	4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
26	4tmk:A	210	183	0.2766	0.2476	0.2842	6.2	5tmp:A
27	5l3w:A	297	168	0.2234	0.1414	0.2500	7.3	5l3s:B, 5l3s:D, 5l3s:F, 5l3s:H

[Back]