BioLiP

>protein
MLIAFEGIDGSGKTTQAKKLYEYLKQKGYFVSLYREPGGTKVGEVLREILLTEELDERTELLLFEASRSKLIEEKIIPDL
KRDKVVILDAFVLSTIAYQGYGKGLDVEFIKNLNEFATRGVKPDITLLLDIPVDIALRRLKEKNRFENKEFLEKVRKGFL
ELAKEEENVVVIDASGEEEEVFKEILRALSVL

The query sequence (length=192) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5h56:B	195	190	0.9844	0.9692	0.9947	1.52e-130	5h56:A, 5h5k:A, 5h5k:B, 4s2e:A, 4s2e:B, 4s35:A, 4s35:B, 5xai:B, 5xai:A, 5xb2:B, 5xb2:A, 5xb3:A, 5xb3:B, 5xb5:A
2	3hjn:A	189	188	0.4792	0.4868	0.4894	9.80e-53	3hjn:B
3	5x7j:B	197	188	0.4479	0.4365	0.4574	2.09e-49	5x7j:A, 5x86:B, 5x86:A, 5x8a:B, 5x8b:A, 5x8b:B, 5x8c:A, 5x8c:B, 5x8d:B, 5x8d:A, 5x98:B, 5x98:A, 5x99:A, 5x99:B, 5xal:A, 5xal:B, 5xt8:A, 5xt8:B, 5zax:A, 5zax:B, 5zb0:A, 5zb0:B, 5zb4:A, 5zb4:B
4	4dwj:B	203	172	0.3750	0.3547	0.4186	7.73e-38	2ccg:A, 2ccg:B, 2ccj:A, 2ccj:B, 4dwj:A, 4dwj:C, 4dwj:D, 4dwj:F, 4dwj:G, 4dwj:H, 4eaq:A, 4eaq:B, 4gfd:A, 4gfd:B, 4gsy:A, 4gsy:B, 4hdc:A, 4hdc:B, 4hej:A, 4hlc:A, 4hlc:B, 4hld:A, 4hld:B, 4qg7:A, 4qg7:B, 4qga:A, 4qga:B, 4qgf:A, 4qgf:B, 4qgg:A, 4qgg:B, 4qgh:A, 4qgh:B, 4xwa:A, 4xwa:B
5	4edh:B	209	181	0.3802	0.3493	0.4033	1.60e-34	4e5u:A, 4e5u:B, 4edh:A, 4gmd:A, 4gmd:B, 4gmd:C, 4gmd:D, 3uwk:A, 3uwk:B, 3uwo:A, 3uwo:B, 3uxm:A, 3uxm:B, 3uxm:C, 3uxm:D
6	3lv8:A	204	194	0.4010	0.3775	0.3969	3.22e-33
7	4tmk:A	210	195	0.3594	0.3286	0.3538	6.30e-31	5tmp:A
8	1e2f:A	210	197	0.3281	0.3000	0.3198	1.73e-16	1e2d:A, 1e2e:A, 1e2g:A, 1e2q:A, 1e98:A, 1e99:A, 1e9a:A, 1e9b:A, 1e9c:A, 1e9d:A, 1e9e:A, 1e9f:A, 1nmx:A, 1nmy:A, 1nmz:A, 1nn0:A, 1nn1:A, 1nn3:A, 1nn5:A, 2xx3:A
9	2wwf:C	212	192	0.2917	0.2642	0.2917	2.22e-14	2wwf:A, 2wwf:B, 2wwg:A, 2wwg:B, 2wwg:C, 2wwh:A, 2wwh:B, 2wwh:C, 2wwi:A, 2wwi:B, 2wwi:C, 2yof:A, 2yof:B, 2yof:C, 2yog:A, 2yog:B, 2yoh:A, 2yoh:B
10	5h70:B	207	137	0.2448	0.2271	0.3431	1.08e-13	5h70:A
11	3tmk:A	216	189	0.2917	0.2593	0.2963	6.13e-13	1tmk:A, 1tmk:B, 2tmk:A, 2tmk:B, 3tmk:B, 3tmk:C, 3tmk:D, 3tmk:E, 3tmk:F, 3tmk:G, 3tmk:H
12	5nrn:B	211	156	0.2500	0.2275	0.3077	7.30e-08	1g3u:A, 1gsi:A, 1gtv:A, 1gtv:B, 1mrn:A, 1mrs:A, 1n5i:A, 1n5j:A, 1n5k:A, 1n5k:B, 1n5l:A, 1n5l:B, 5nrq:A, 1w2g:A, 1w2g:B, 1w2h:A, 1w2h:B, 6yt1:A, 6yt1:B
13	7fgq:A	190	189	0.2865	0.2895	0.2910	1.62e-07
14	5nq5:A	191	142	0.2396	0.2408	0.3239	8.62e-07	5nr7:A, 5nr7:B, 5nrn:A, 5nrq:B, 4unn:A, 4unn:B, 4unp:A, 4unq:A, 4unq:B, 4unr:A, 4unr:B, 4uns:A, 4uns:B
15	5uiv:A	225	195	0.2917	0.2489	0.2872	1.09e-06
16	2v54:A	204	201	0.2760	0.2598	0.2637	3.74e-05	2v54:B, 2w0s:A, 2w0s:B
17	3e70:C	307	30	0.0781	0.0489	0.5000	0.044
18	1qzw:A	432	32	0.0833	0.0370	0.5000	0.048	3kl4:A, 5l3s:A, 5l3s:C, 5l3s:E, 5l3s:G, 5l3v:A, 5l3v:B, 1qzw:C, 1qzw:E, 1qzw:G, 3zn8:M
19	6qp0:A	188	34	0.0833	0.0851	0.4706	0.048
20	3jaj:z	426	32	0.0781	0.0352	0.4688	0.052	6frk:x, 3jan:z, 7obq:x, 6r6g:AB
21	7obr:x	488	32	0.0781	0.0307	0.4688	0.062	2go5:W, 2j37:W, 5l3q:A, 5l3q:C, 1mfq:C, 7nfx:x, 7qwq:x, 1ry1:W, 4ue5:D, 6y2z:A, 6y32:A, 6y32:C, 6y32:E, 6y32:G
22	4ike:A	206	149	0.2344	0.2184	0.3020	0.10	4cf7:A, 4cf7:B, 4ike:B, 4jky:A, 4jky:B, 4jl5:A, 4jl5:B, 4jl6:A, 4jl6:B, 4jl8:A, 4jl8:B, 4jla:A, 4jla:B, 4jlb:A, 4jlb:B, 4jld:A, 4jld:B, 4jlo:A, 4jlo:B, 4jlp:A, 4jlp:B, 2rgx:A, 3sr0:A, 3sr0:B
23	3dm5:A	416	27	0.0729	0.0337	0.5185	0.11	3dm5:B
24	7epk:A	426	27	0.0781	0.0352	0.5556	0.14
25	3ndb:B	420	32	0.0781	0.0357	0.4688	0.22	2v3c:C, 2v3c:D, 4xco:D
26	7yq0:A	173	32	0.0781	0.0867	0.4688	0.46	7yq0:B, 7yq1:A, 7yq1:B, 7yq1:C, 7yq1:D, 7yq1:E, 7yq1:F
27	1np6:B	169	88	0.1510	0.1716	0.3295	0.52
28	2cdn:A	186	206	0.2969	0.3065	0.2767	0.59
29	2c03:B	297	22	0.0729	0.0471	0.6364	0.94	2c03:A, 2cnw:A, 2cnw:B, 2cnw:C, 2j7p:A, 2j7p:B, 1jpj:A, 1jpn:B, 1jpn:A, 1ls1:A, 1ng1:A, 2ng1:A, 1o87:A, 1o87:B, 1okk:A
30	8hf4:A	563	43	0.0833	0.0284	0.3721	1.4	8hf4:B, 8hf5:A, 8hf5:B, 8hf6:A, 8hf6:B, 8hf7:B, 8k4b:A, 8k4b:B, 8k7a:A, 8k7a:B
31	5fwg:A	217	133	0.1927	0.1705	0.2782	2.1	5fwg:B, 3fyg:A, 3fyg:B, 2gst:A, 2gst:B, 3gst:A, 3gst:B, 4gst:A, 4gst:B, 5gst:A, 5gst:B, 6gst:A, 6gst:B, 6gsu:A, 6gsu:B, 6gsv:A, 6gsv:B, 6gsw:A, 6gsw:B, 6gsx:A, 6gsx:B, 6gsy:A, 6gsy:B, 1mtc:A, 1mtc:B
32	5llf:D	266	67	0.1042	0.0752	0.2985	2.3	5ll0:A, 5ll0:B, 5ll0:C, 5ll0:D, 5llb:A, 5llb:B, 5llb:C, 5llb:D, 5llf:A, 5llf:B, 5llf:C
33	2x8u:A	399	55	0.0938	0.0451	0.3273	3.4	2x8u:B
34	4cw7:A	181	34	0.0833	0.0884	0.4706	3.4	4cvn:A, 4cvn:B, 4cvn:C, 4cvn:D, 4cw7:C, 4cw7:E, 4cw7:G
35	1lkx:C	679	44	0.0729	0.0206	0.3182	3.8	1lkx:A, 1lkx:B, 1lkx:D
36	6jq0:A	516	67	0.1042	0.0388	0.2985	4.6
37	4fxp:B	200	28	0.0677	0.0650	0.4643	4.8	4fxp:A, 4fxp:C, 3uie:A, 3uie:B, 3uie:C
38	6jq0:F	524	67	0.1042	0.0382	0.2985	5.0
39	1nt2:A	209	61	0.0990	0.0909	0.3115	5.4
40	5n6u:A	811	50	0.0885	0.0210	0.3400	5.8	5n6u:B, 5n6u:C, 5n6u:D
41	1b4p:A	217	83	0.1146	0.1014	0.2651	6.0
42	8hku:L14P	134	27	0.0625	0.0896	0.4444	6.4	8hkv:L14P, 8hky:L14P, 8hkz:L14P, 8hl1:L14P, 8hl2:L14P, 8hl3:L14P, 8hl4:L14P, 8hl5:L14P
43	4huz:A	317	36	0.0781	0.0473	0.4167	6.8
44	9bht:C	282	50	0.0938	0.0638	0.3600	8.5	9bht:D, 9bhw:A, 9bhw:D
45	3zuh:A	286	41	0.0781	0.0524	0.3659	8.7	3zuh:B, 3zuh:C, 3zuh:D, 3zuh:E, 3zuh:F

[Back]