BioLiP

>protein
MLGLKTSIIGRRVIYFQEITSTNEFAKTSYLEEGTVIVADKQTMGHGRLNAKWESPEGGLWLSIVLSPKVPQKDLPKIVF
LGAVGVVETLKEFSIDGRIKWPNDVLVNYKKIAGVLVEGKGDKIVLGIGLNVNNKVPNGATSMKLELGSEVPLLSVFRSL
ITNLDRLYLNFLKNPMDILNLVRDNMILGVRVKILGDGSFEGIAEDIDDFGRLIIRLDSGEVKKVIYGDVSLRFL

The query sequence (length=235) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2deq:A	235	235	0.9915	0.9915	0.9915	6.64e-166	2deq:B, 2djz:A, 2djz:B, 2dkg:A, 2dkg:B, 2dth:A, 2dth:B, 2dti:A, 2dti:B, 2dto:A, 2dto:B, 2dve:A, 2dve:B, 2dxt:A, 2dxt:B, 2dxu:A, 2dxu:B, 2dz9:A, 2dz9:B, 2e41:A, 2e41:B, 2ejf:A, 2ejf:B, 2ejg:A, 2ejg:B, 2fyk:A, 2fyk:B, 1wnl:A, 1wnl:B, 1wpy:A, 1wpy:B, 1wqw:A, 1wqw:B, 1x01:A, 1x01:B, 2zgw:A, 2zgw:B
2	6ndl:A	323	239	0.3064	0.2229	0.3013	2.96e-27	6apw:A, 6aqq:A, 4dq2:A, 8eni:A, 4ha8:A, 6oru:A, 3rir:A, 3rkw:A, 3rky:A, 3v7c:A, 3v7r:A, 3v7s:A, 3v8k:A, 3v8l:A
3	3efr:A	233	233	0.3319	0.3348	0.3348	2.51e-25	3efr:B, 3efs:A, 3efs:B
4	2ej9:A	237	203	0.3064	0.3038	0.3547	4.79e-24
5	7dbs:A	252	172	0.2128	0.1984	0.2907	6.70e-15	6jhu:A
6	8fi3:B	308	237	0.3234	0.2468	0.3207	2.16e-14	8fi3:A
7	2ewn:A	318	235	0.3191	0.2358	0.3191	2.52e-14	2ewn:B, 1hxd:A, 1hxd:B, 4wf2:A
8	4xtu:A	266	223	0.3021	0.2669	0.3184	2.81e-13	4op0:A, 4op0:B, 3rux:A, 3rux:B, 4xtu:B, 4xtv:A, 4xtv:B, 4xtw:A, 4xtw:B, 4xtx:A, 4xtx:B, 4xty:A, 4xty:B, 4xtz:A, 4xtz:B, 4xu0:A, 4xu0:B, 4xu1:A, 4xu1:B, 4xu2:A, 4xu2:B, 4xu3:A, 4xu3:B
9	9j8e:B	296	242	0.2809	0.2230	0.2727	3.52e-13	9j8e:A
10	1bib:A	294	220	0.2809	0.2245	0.3000	5.77e-12
11	6ck0:B	210	123	0.1787	0.2000	0.3415	4.68e-09	6ck0:A
12	4fns:A	718	56	0.0766	0.0251	0.3214	1.9	4fns:B, 4fns:C, 4fns:D, 4fnt:C, 4fnt:B, 4fnt:A, 4fnt:D, 4fnu:A, 4fnu:B, 4fnu:C, 4fnu:D
13	8em4:A	3818	60	0.0766	0.0047	0.3000	3.3	8em4:B
14	8em7:A	4378	60	0.0766	0.0041	0.3000	3.3	8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
15	6jmg:A	267	82	0.1021	0.0899	0.2927	4.7	6jmg:B
16	4kpp:A	395	67	0.0681	0.0405	0.2388	5.4	4kpp:B
17	4xiw:C	239	62	0.0979	0.0962	0.3710	5.8	4xiw:A, 4xiw:B, 4xiw:D, 4xiw:E, 4xiw:F, 4xiw:G, 4xiw:H, 4xix:A, 4xix:B, 4xix:C, 4xix:D, 4xix:E, 4xix:F, 4xix:G, 4xix:H
18	6idn:A	272	81	0.1064	0.0919	0.3086	7.1
19	5mgy:H	316	55	0.0809	0.0601	0.3455	9.2	5mgy:B, 5mgy:G, 5mgy:A, 5mgy:C, 5mgy:D, 5mgy:F

[Back]