BioLiP

>protein
MLGLKTSIIGRRVIYFQEITSTNEFAKTSYLEEGTVIVADKQTMGHGALNRKWESPEGGLWLSIVLSPKVPQKDLPKIVF
LGAVGVVETLKEFSIDGRIKWPNDVLVNYKAIAGVLVEGKGDKIVLGIGLNVNNKVPNGATSMKLELGSEVPLLSVFRSL
ITNLDRLYLNFLKNPMDILNLVRDNMILGVRVKILGDGSFEGIAEDIDDFGRLIIRLDSGEVKKVIYGDVSL

The query sequence (length=232) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2deq:A	235	232	0.9914	0.9787	0.9914	4.89e-164	2deq:B, 2djz:A, 2djz:B, 2dkg:A, 2dkg:B, 2dth:A, 2dth:B, 2dti:A, 2dti:B, 2dto:A, 2dto:B, 2dve:A, 2dve:B, 2dxt:A, 2dxt:B, 2dxu:A, 2dxu:B, 2dz9:A, 2dz9:B, 2e41:A, 2e41:B, 2ejf:A, 2ejf:B, 2ejg:A, 2ejg:B, 2fyk:A, 2fyk:B, 1wnl:A, 1wnl:B, 1wpy:A, 1wpy:B, 1wqw:A, 1wqw:B, 1x01:A, 1x01:B, 2zgw:A, 2zgw:B
2	6ndl:A	323	239	0.3060	0.2198	0.2971	1.42e-26	6apw:A, 6aqq:A, 4dq2:A, 8eni:A, 4ha8:A, 6oru:A, 3rir:A, 3rkw:A, 3rky:A, 3v7c:A, 3v7r:A, 3v7s:A, 3v8k:A, 3v8l:A
3	3efr:A	233	232	0.3319	0.3305	0.3319	3.06e-25	3efr:B, 3efs:A, 3efs:B
4	2ej9:A	237	202	0.3017	0.2954	0.3465	1.56e-23
5	7dbs:A	252	172	0.2155	0.1984	0.2907	3.36e-15	6jhu:A
6	8fi3:B	308	236	0.3190	0.2403	0.3136	7.58e-13	8fi3:A
7	2ewn:A	318	234	0.3147	0.2296	0.3120	8.46e-13	2ewn:B, 1hxd:A, 1hxd:B, 4wf2:A
8	4xtu:A	266	223	0.3017	0.2632	0.3139	2.88e-12	4op0:A, 4op0:B, 3rux:A, 3rux:B, 4xtu:B, 4xtv:A, 4xtv:B, 4xtw:A, 4xtw:B, 4xtx:A, 4xtx:B, 4xty:A, 4xty:B, 4xtz:A, 4xtz:B, 4xu0:A, 4xu0:B, 4xu1:A, 4xu1:B, 4xu2:A, 4xu2:B, 4xu3:A, 4xu3:B
9	9j8e:B	296	241	0.2759	0.2162	0.2656	1.14e-11	9j8e:A
10	1bib:A	294	219	0.2716	0.2143	0.2877	9.16e-10
11	6ck0:B	210	123	0.1767	0.1952	0.3333	8.41e-09	6ck0:A
12	4fns:A	718	56	0.0776	0.0251	0.3214	1.9	4fns:B, 4fns:C, 4fns:D, 4fnt:C, 4fnt:B, 4fnt:A, 4fnt:D, 4fnu:A, 4fnu:B, 4fnu:C, 4fnu:D
13	5zmm:A	530	120	0.1250	0.0547	0.2417	2.1	5zmm:B, 5zmm:C, 5zmm:E, 5zmm:F, 5zmn:A, 5zmo:A
14	5zmm:D	489	120	0.1250	0.0593	0.2417	2.3
15	3tii:B	313	56	0.0603	0.0447	0.2500	2.7	3tig:A, 3tii:A, 3tin:A
16	8em4:A	3818	60	0.0776	0.0047	0.3000	3.3	8em4:B
17	8em7:A	4378	60	0.0776	0.0041	0.3000	3.3	8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
18	6jmg:A	267	82	0.1034	0.0899	0.2927	3.8	6jmg:B
19	6idn:A	272	81	0.1078	0.0919	0.3086	7.2
20	4kpp:A	395	35	0.0388	0.0228	0.2571	9.1	4kpp:B
21	6w1k:A	312	29	0.0517	0.0385	0.4138	9.7	6w1k:B, 6w1k:C, 6w1k:D

[Back]