BioLiP

>protein
MLEAKFEEASLFKRIIDGFKDCVQLVNFQCKEDGIIAQAVDDSRVLLVSLEIGVEAFQEYRCDHPVTLGMDLTSLSKILR
CGNNTDTLTLIADNTPDSIILLFEDTKKDRIAEYSLKLMDIDADFLKIEELQYDSTLSLPSSEFSKIVRDLSQLSDSINI
MITKETIKFVADGDIGSGSVIIKPFVDMEHPETSIKLEMDQPVDLTFGAKYLLDIIKGSSLSDRVGIRLSSEAPALFQFD
LKSGFLQFFLAPKF

The query sequence (length=254) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6e49:C	254	254	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3v61:B
2	3k4x:A	758	253	0.9961	0.3338	1.0000	1.15e-176	6e49:B, 6e49:A, 2od8:A, 3v62:B, 3v62:E, 5zut:A
3	3k4x:A	758	253	0.9921	0.3325	0.9960	9.38e-176	6e49:B, 6e49:A, 2od8:A, 3v62:B, 3v62:E, 5zut:A
4	3k4x:A	758	252	0.9921	0.3325	1.0000	9.80e-176	6e49:B, 6e49:A, 2od8:A, 3v62:B, 3v62:E, 5zut:A
5	8gj5:B	257	254	0.4921	0.4864	0.4921	1.18e-88	8gj5:A, 8gj5:C, 8gjf:A, 8gjf:B, 8gjf:C
6	8q7i:A	257	254	0.4724	0.4669	0.4724	1.07e-83	7o1f:A, 7o1f:B, 7o1f:D, 7o1f:F, 8p9o:A
7	6qh1:C	242	252	0.4370	0.4587	0.4405	9.48e-76
8	6o09:F	262	254	0.4016	0.3893	0.4016	2.70e-70	6o09:C, 6o09:H, 6o09:A, 6o09:D, 6o09:K, 2zvv:B, 2zvv:A, 2zvw:A, 2zvw:B, 2zvw:C, 2zvw:D, 2zvw:E, 2zvw:F, 2zvw:G, 2zvw:H
9	1vyj:G	260	255	0.3504	0.3423	0.3490	7.06e-62	1axc:A, 1axc:C, 1axc:E, 6cbi:C, 6cbi:A, 6cbi:D, 6cbi:E, 8cob:A, 8cob:C, 8cob:E, 4d2g:C, 4d2g:B, 5e0u:A, 5e0u:B, 5e0u:C, 5e0v:A, 5e0v:B, 6eht:C, 6eht:B, 8f5q:A, 8f5q:C, 8f5q:E, 6gis:A, 8gl9:A, 8gl9:B, 8gla:A, 8gla:B, 6gws:C, 6gws:A, 6gws:B, 6hvo:B, 6hvo:C, 6hvo:A, 5iy4:A, 5iy4:C, 5iy4:E, 6k3a:A, 6k3a:C, 6k3a:E, 7kq0:A, 7kq0:C, 7kq0:E, 7kq1:A, 7kq1:C, 7kq1:E, 7m5l:A, 7m5l:B, 7m5l:C, 7m5m:A, 7m5m:B, 7m5n:B, 7m5n:A, 5mav:C, 5mav:A, 5mav:B, 5mav:F, 5mav:D, 5mav:E, 5mlo:A, 5mlo:C, 5mlo:E, 5mlw:A, 5mlw:C, 5mlw:E, 7nv0:D, 7nv1:D, 3p87:A, 3p87:D, 3p87:B, 3p87:C, 3p87:E, 3p87:F, 6qc0:A, 6qc0:C, 6qc0:E, 6qcg:C, 6qcg:B, 6qcg:F, 6qcg:A, 6qcg:D, 6qcg:E, 7qo1:F, 4rjf:A, 4rjf:C, 4rjf:E, 1u76:A, 1u76:C, 1u76:E, 1u7b:A, 3vkx:A, 1vyj:A, 1vyj:C, 1vyj:E, 1vyj:I, 1vyj:K, 3wgw:A, 3wgw:B, 5yco:A, 5yco:B, 5yco:C, 5yd8:Z, 5yd8:X, 5yd8:Y, 4ztd:B, 4ztd:A, 4ztd:C, 2zvk:A, 2zvk:B, 2zvk:C, 2zvl:A, 2zvl:B, 2zvl:C, 2zvl:D, 2zvl:E, 2zvl:F, 2zvm:A, 2zvm:B, 2zvm:C
10	6k2m:E	258	254	0.3583	0.3527	0.3583	1.09e-57	7wp3:A
11	1isq:A	240	249	0.2717	0.2875	0.2771	2.74e-20
12	5dai:A	247	253	0.2717	0.2794	0.2727	3.20e-20
13	6t7y:A	238	249	0.2559	0.2731	0.2610	1.14e-17
14	7rpw:C	245	253	0.2244	0.2327	0.2253	2.95e-13
15	1ud9:A	242	244	0.2047	0.2149	0.2131	9.47e-10	1ud9:B, 1ud9:C, 1ud9:D
16	1rxm:A	245	251	0.2323	0.2408	0.2351	2.46e-09	1rxz:A
17	2io4:B	246	255	0.2165	0.2236	0.2157	4.00e-09	2io4:D
18	2izo:C	244	262	0.2165	0.2254	0.2099	6.55e-04
19	3ppo:A	272	87	0.0906	0.0846	0.2644	0.61	3ppo:B, 3ppq:A, 3ppq:B, 3ppr:A, 3ppr:B
20	5hh9:A	390	53	0.0709	0.0462	0.3396	4.8	5hh9:B, 5i90:A, 5i90:B
21	6is1:B	121	51	0.0709	0.1488	0.3529	5.2	6is1:A, 6is1:C, 6is1:D, 6is1:E, 6is1:F, 6is1:G, 6is1:H, 6is2:A, 6is2:B, 6is2:C, 6is2:D, 6is3:C
22	2j17:B	145	56	0.0551	0.0966	0.2500	5.4	2j16:B, 2j17:A
23	4psx:B	361	41	0.0472	0.0332	0.2927	5.8	4psx:E
24	6djk:A	376	54	0.0551	0.0372	0.2593	6.9
25	4re6:A	577	32	0.0551	0.0243	0.4375	8.4	2hu5:A, 2hu5:B, 2hu7:A, 2hu7:B, 2hu8:A, 2hu8:B, 4re5:A, 4re5:B, 4re6:C, 1ve7:A, 1ve7:B
26	1z2m:A	152	80	0.0866	0.1447	0.2750	9.8	3phx:B
27	6ptr:B	372	135	0.1339	0.0914	0.2519	10.0	6ptr:A

[Back]