BioLiP

>protein
MKVGQDKVVTIRYTLQVEGEVLDQGELSYLHGHRNLIPGLEEALEGREEGEAFQAHVPAEKAYGATGHPPHATLDFQVEV
VKVREATPEELLHGHAHPSGHHHHHH

The query sequence (length=106) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4odq:A	106	106	1.0000	1.0000	1.0000	3.10e-72	4odp:A, 4odr:A, 4odr:B, 7oxg:A, 7oxg:B
2	7oxj:A	156	144	0.8113	0.5513	0.5972	2.98e-44	3luo:A, 4odk:A, 4odl:B, 4odl:A, 4odm:A, 4odm:B, 4odm:C, 4odm:D, 4odn:A, 4odo:A, 4odo:C, 4odo:B, 7oxh:A, 7oxi:A, 7oxk:A
3	8xi9:A	201	61	0.2170	0.1144	0.3770	1.73e-06	1a7x:A, 1a7x:B, 1bkf:A, 1bl4:A, 1bl4:B, 8chi:A, 8chi:B, 8chj:A, 8chj:B, 8chj:C, 8chj:D, 8chk:A, 8chk:B, 8chk:C, 8chl:A, 8chl:B, 8chm:A, 1d7i:A, 1d7i:B, 1d7j:A, 1d7j:B, 2dg3:A, 2dg4:A, 2dg9:A, 4dh0:A, 8er6:A, 8er6:C, 8er6:E, 8er7:A, 8er7:C, 8er7:E, 8era:B, 1f40:A, 1fap:A, 2fap:A, 3fap:A, 4fap:A, 1fkb:A, 1fkd:A, 1fkf:A, 1fkg:A, 1fkh:A, 1fki:A, 1fki:B, 1fkj:A, 1fkl:A, 2fke:A, 1j4h:A, 1j4i:A, 1j4r:A, 1j4r:B, 1j4r:D, 6m4u:A, 6m4u:E, 6m4v:B, 6m4v:D, 6m4w:D, 6m4w:E, 6m4w:F, 1nsg:A, 6oqa:A, 6oqa:B, 6oqa:E, 6oqa:F, 8pdf:A, 8ppz:A, 1qpf:A, 1qpf:D, 1qpl:A, 1qpl:C, 1tco:C, 7u0t:B, 7u8d:A, 7u8d:B, 6vcu:A, 6vcu:C, 6vcu:D, 6vcu:B, 6yf0:A, 6yf1:A, 6yf2:A, 6yf3:A
4	8bjd:A	208	95	0.2736	0.1394	0.3053	2.31e-06	8bje:A, 8bk5:A, 2vcd:A
5	8bk4:A	163	54	0.1792	0.1166	0.3519	7.31e-06	8p3d:A, 8p42:A, 8p42:D
6	4nnr:A	102	60	0.2170	0.2255	0.3833	7.56e-06	4nnr:B
7	8p3c:B	126	87	0.2358	0.1984	0.2874	3.84e-05
8	5d75:A	120	62	0.2170	0.1917	0.3710	4.01e-05	5gpg:A, 3kz7:A, 1pbk:A
9	4giv:A	192	61	0.1887	0.1042	0.3279	1.38e-04	4dz2:A, 4dz2:B, 4dz3:A, 4dz3:B, 4fn2:A, 4fn2:B, 4g50:A, 4g50:B, 4ggq:C, 4ggq:A, 4ggq:B, 4ggq:D, 4giv:B, 5klx:A, 5klx:B, 5klx:D, 5klx:C, 2ko7:A, 2l2s:A, 6o49:A, 6o49:B, 6o4a:A, 6o4a:B, 6o4a:C, 6o4a:D, 3uf8:A, 3uqa:A, 3uqb:A, 5v8t:A, 5v8t:B, 3vaw:A
10	1c9h:A	107	61	0.1981	0.1963	0.3443	2.87e-04	5hkg:A
11	5hua:A	113	90	0.2736	0.2566	0.3222	3.55e-04	1yat:A
12	1q6i:A	210	86	0.2736	0.1381	0.3372	0.003	1q6i:B
13	5b8i:C	119	62	0.2170	0.1933	0.3710	0.003
14	6tz8:C	111	58	0.1887	0.1802	0.3448	0.005	6tz8:F
15	6vrx:A	108	52	0.1698	0.1667	0.3462	0.008	6vct:A, 6vrx:B, 6vrx:C, 6vrx:D
16	7d80:5	432	80	0.2453	0.0602	0.3250	0.026	7d6z:h, 1w2b:5
17	6mke:A	117	68	0.1604	0.1453	0.2500	0.069	6mke:B, 6mke:C, 6mke:D
18	4lax:A	237	65	0.1792	0.0802	0.2923	0.077	4drj:A, 4lay:A, 6rcy:A, 4tw8:A, 4tw8:B
19	4lax:A	237	67	0.1887	0.0844	0.2985	0.65	4drj:A, 4lay:A, 6rcy:A, 4tw8:A, 4tw8:B
20	8z38:B	113	59	0.1604	0.1504	0.2881	0.15	8z38:A
21	5mgx:G	266	96	0.2264	0.0902	0.2500	0.16	5mgx:F, 5mgx:E, 5mgx:H
22	1qz2:A	285	67	0.1887	0.0702	0.2985	0.75	1qz2:B
23	3gn5:A	132	69	0.1792	0.1439	0.2754	2.1	3ga8:A, 3gn5:B, 3hi2:A, 3hi2:C, 3o9x:A, 3o9x:B
24	5v8z:C	98	34	0.1132	0.1224	0.3529	3.9	5v8z:A, 5v90:A, 5v90:C
25	6j5y:A	233	49	0.1604	0.0730	0.3469	4.3
26	3ps5:A	529	70	0.1415	0.0284	0.2143	5.7	1fpr:A, 4gry:A, 4grz:A, 4gs0:B, 4hjq:A, 4hjq:B
27	7u0s:A	124	58	0.1509	0.1290	0.2759	6.3	5hwc:A, 6tz7:C, 7u0s:B, 7u0u:B, 6vcv:A, 6vcv:B
28	4n4w:A	457	75	0.1887	0.0438	0.2667	6.8	4jkv:A, 4jkv:B
29	4czm:A	336	47	0.1415	0.0446	0.3191	8.1	4czf:A, 4czg:A, 4czh:A, 4czj:A, 4czj:B, 4czk:A, 4czl:A, 4czm:B
30	7mq8:LH	746	12	0.0755	0.0107	0.6667	8.7	7mq9:LH, 7mqa:LH
31	1vdn:A	161	59	0.1509	0.0994	0.2712	9.2
32	1f12:A	293	46	0.1509	0.0546	0.3478	9.2	1f0y:A, 1f0y:B, 1f17:A, 1f17:B, 3had:A, 3had:B, 2hdh:A, 2hdh:B, 3hdh:A, 3hdh:B, 3hdh:C, 1il0:A, 1il0:B, 1lsj:A, 1lsj:B, 1lso:A, 1lso:B, 1m75:A, 1m75:B, 1m76:A, 1m76:B

[Back]