BioLiP

>protein
MKVGQDKVVTIRYTLQVEGEVLDQGELSYLHGHRNLIPGLEEALEGREEGEAFQAHVPAEKAIPPHATLDFQVEVVKVRE
ATPEELLHGHAHPSGHHHHHH

The query sequence (length=101) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4odq:A	106	106	0.9901	0.9434	0.9434	4.91e-65	4odp:A, 4odr:A, 4odr:B, 7oxg:A, 7oxg:B
2	7oxj:A	156	144	0.8218	0.5321	0.5764	1.96e-41	3luo:A, 4odk:A, 4odl:B, 4odl:A, 4odm:A, 4odm:B, 4odm:C, 4odm:D, 4odn:A, 4odo:A, 4odo:C, 4odo:B, 7oxh:A, 7oxi:A, 7oxk:A
3	7oxj:A	156	25	0.2475	0.1603	1.0000	5.02e-04	3luo:A, 4odk:A, 4odl:B, 4odl:A, 4odm:A, 4odm:B, 4odm:C, 4odm:D, 4odn:A, 4odo:A, 4odo:C, 4odo:B, 7oxh:A, 7oxi:A, 7oxk:A
4	8bjd:A	208	95	0.2574	0.1250	0.2737	5.46e-04	8bje:A, 8bk5:A, 2vcd:A
5	8p3c:B	126	87	0.2277	0.1825	0.2644	0.006
6	8bk4:A	163	55	0.1584	0.0982	0.2909	0.009	8p3d:A, 8p42:A, 8p42:D
7	7d80:5	432	52	0.1881	0.0440	0.3654	0.018	7d6z:h, 1w2b:5
8	5d75:A	120	62	0.2079	0.1750	0.3387	0.020	5gpg:A, 3kz7:A, 1pbk:A
9	4giv:A	192	61	0.1782	0.0938	0.2951	0.027	4dz2:A, 4dz2:B, 4dz3:A, 4dz3:B, 4fn2:A, 4fn2:B, 4g50:A, 4g50:B, 4ggq:C, 4ggq:A, 4ggq:B, 4ggq:D, 4giv:B, 5klx:A, 5klx:B, 5klx:D, 5klx:C, 2ko7:A, 2l2s:A, 6o49:A, 6o49:B, 6o4a:A, 6o4a:B, 6o4a:C, 6o4a:D, 3uf8:A, 3uqa:A, 3uqb:A, 5v8t:A, 5v8t:B, 3vaw:A
10	4nnr:A	102	60	0.1980	0.1961	0.3333	0.033	4nnr:B
11	5hua:A	113	90	0.2673	0.2389	0.3000	0.054	1yat:A
12	8xi9:A	201	61	0.1782	0.0896	0.2951	0.070	1a7x:A, 1a7x:B, 1bkf:A, 1bl4:A, 1bl4:B, 8chi:A, 8chi:B, 8chj:A, 8chj:B, 8chj:C, 8chj:D, 8chk:A, 8chk:B, 8chk:C, 8chl:A, 8chl:B, 8chm:A, 1d7i:A, 1d7i:B, 1d7j:A, 1d7j:B, 2dg3:A, 2dg4:A, 2dg9:A, 4dh0:A, 8er6:A, 8er6:C, 8er6:E, 8er7:A, 8er7:C, 8er7:E, 8era:B, 1f40:A, 1fap:A, 2fap:A, 3fap:A, 4fap:A, 1fkb:A, 1fkd:A, 1fkf:A, 1fkg:A, 1fkh:A, 1fki:A, 1fki:B, 1fkj:A, 1fkl:A, 2fke:A, 1j4h:A, 1j4i:A, 1j4r:A, 1j4r:B, 1j4r:D, 6m4u:A, 6m4u:E, 6m4v:B, 6m4v:D, 6m4w:D, 6m4w:E, 6m4w:F, 1nsg:A, 6oqa:A, 6oqa:B, 6oqa:E, 6oqa:F, 8pdf:A, 8ppz:A, 1qpf:A, 1qpf:D, 1qpl:A, 1qpl:C, 1tco:C, 7u0t:B, 7u8d:A, 7u8d:B, 6vcu:A, 6vcu:C, 6vcu:D, 6vcu:B, 6yf0:A, 6yf1:A, 6yf2:A, 6yf3:A
13	6vrx:A	108	16	0.0990	0.0926	0.6250	0.26	6vct:A, 6vrx:B, 6vrx:C, 6vrx:D
14	6tz8:C	111	19	0.0990	0.0901	0.5263	1.3	6tz8:F
15	5v8z:C	98	34	0.1188	0.1224	0.3529	3.6	5v8z:A, 5v90:A, 5v90:C
16	5b8i:C	119	62	0.1980	0.1681	0.3226	3.8
17	3gn5:A	132	66	0.1881	0.1439	0.2879	7.4	3ga8:A, 3gn5:B, 3hi2:A, 3hi2:C, 3o9x:A, 3o9x:B
18	4czm:A	336	47	0.1485	0.0446	0.3191	7.4	4czf:A, 4czg:A, 4czh:A, 4czj:A, 4czj:B, 4czk:A, 4czl:A, 4czm:B
19	7mq8:LH	746	12	0.0792	0.0107	0.6667	7.8	7mq9:LH, 7mqa:LH

[Back]