BioLiP

>protein
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGI
LLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIY
TEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTV
LRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK

The query sequence (length=265) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4m7x:A	273	267	1.0000	0.9707	0.9925	0.0	6avp:A, 6avp:C, 6avp:B, 6avp:D, 6awg:A, 6awg:B, 6awg:C, 6awg:D, 6awh:A, 6awh:B, 6awh:C, 6awh:D, 6awi:A, 6awi:B, 6awi:C, 6awi:D, 6awj:A, 6awj:B, 6awj:C, 6awj:D, 6ebv:A, 6ebv:B, 6ebv:C, 6ebv:D, 5elz:A, 2ews:A, 2ews:B, 5jic:A, 4m7y:A, 4m7y:B, 4nb4:A, 4nb4:B, 4nb4:C, 4nb4:D, 4nb4:E, 4nb4:F, 4nb4:G, 4nb4:H
2	5e26:B	362	178	0.1774	0.1298	0.2640	5.04e-11	5e26:A, 5e26:C, 5e26:D
3	5kqd:A	312	178	0.1849	0.1571	0.2753	5.53e-11
4	5kpr:A	359	178	0.1849	0.1365	0.2753	1.06e-10	6b3v:A, 2i7p:A, 2i7p:C, 2i7p:B, 2i7p:D, 5kpt:A, 5kpz:A, 5kq8:A, 3mk6:A, 3mk6:C, 3mk6:B, 3mk6:D, 6pe6:A, 3sms:A, 7ue3:A, 7ue4:A, 7ue5:A, 7ue6:A, 7ue7:A, 7ue8:A, 7ueo:A, 7uep:A, 7ueq:A, 7uer:A, 7ues:A, 7uet:A, 7ueu:A, 7uev:A, 7uex:A, 7uey:A, 6x4j:A, 6x4k:A, 6x4l:A
5	2i7n:A	325	178	0.1698	0.1385	0.2528	1.90e-09
6	3smp:B	363	178	0.1698	0.1240	0.2528	2.56e-09	2i7n:B, 3smp:A
7	7t1i:B	314	306	0.3019	0.2548	0.2614	6.63e-06	7t1g:B
8	7t1h:A	342	223	0.2302	0.1784	0.2735	0.018	7t1g:A, 7t1h:B, 7t1i:A, 6uj5:A
9	4fdg:B	592	50	0.0717	0.0321	0.3800	3.7	8eaf:A, 8eaf:B, 8eaf:C, 8eaf:D, 8eaf:E, 8eaf:F, 8eag:B, 8eag:C, 8eag:D, 8eag:E, 8eag:F, 8eag:A, 8eah:A, 8eah:B, 8eah:C, 8eah:D, 8eah:E, 8eah:F, 8eai:B, 8eai:C, 8eai:D, 8eai:E, 8eai:F, 8eai:A, 8eaj:A, 8eaj:B, 8eaj:C, 8eaj:D, 8eaj:E, 8eaj:F, 8eak:B, 8eak:C, 8eak:D, 8eak:E, 8eak:A, 8eak:F, 8eal:A, 8eal:B, 8eal:C, 8eal:D, 8eal:E, 8eal:F, 8eam:B, 8eam:C, 8eam:D, 8eam:E, 8eam:A, 8eam:F, 4fdg:A, 4fdg:C, 4fdg:D, 4fdg:E, 6mii:A, 6mii:B, 6mii:C, 6mii:D, 6mii:E, 6mii:F, 2vl6:A, 2vl6:B, 2vl6:C, 6wnz:B, 6wnz:A
10	3pp5:A	63	30	0.0377	0.1587	0.3333	4.5
11	8vjo:B	278	26	0.0491	0.0468	0.5000	4.9	9b9q:A, 9b9q:B, 9b9q:C, 7s2t:A, 7s2t:B, 7s2t:C, 7s4q:A, 7s4q:B, 7s4q:C, 8tk7:B, 8tk7:A, 8tk7:C, 8vjo:A, 8vjo:C
12	8ibv:R	279	30	0.0528	0.0502	0.4667	5.1	8ibu:R
13	7y38:Y	466	70	0.0717	0.0408	0.2714	5.9	6jim:A, 6jim:B
14	3lf5:A	87	35	0.0453	0.1379	0.3429	7.5	3lf5:B
15	4ke8:C	249	17	0.0377	0.0402	0.5882	8.6	4ke6:A, 4ke7:A, 4ke7:B, 4ke8:A, 4ke8:B, 4ke8:D, 4ke9:A, 4ke9:B, 4ke9:C, 4ke9:D

[Back]