Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKVEELIIDGFKSYATRTVITDWDPQFNAITGLNGSGKSNILDAICFVLGIASMSTVRASSLQDLIYKRGQAGVTKASVT
IVFDNTDKSNSPIGFTNSPQISVTRQVVLGGTSKYLINGHRAPQQSVLQLFQSVQLNINNPNFLIMQGKITKVLNMKPSE
ILSLIEEAAGTKMFEDRREKAERTMSKKETKLQENRTLLTEEIEPKLEKLRNEKRMFLEFQSTQTDLESKQLNEKFQELR
KKVNPNIMNMIENVEKKEAALKTMIKTIEKDKMKIQETISKLNEYKRETLVKTWEKVTLDFGNIFADLLPNSFAKLVPCE
GKDVTQGLEVKVKLGNIWKESLIELSGGQRSLIALSLIMALLQFRPAPMYILDEVDAALDLSHTQNIGHLIKTRFKGSQF
IVVSLKEGMFANANRVFRTRFQDGTSVVSIM

The query sequence (length=431) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7q2x:A 431 431 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7q2y:A
2 7qen:A 465 465 0.9977 0.9247 0.9247 0.0
3 6zz6:B 423 434 0.3039 0.3097 0.3018 1.73e-51
4 8rol:A 411 435 0.2877 0.3017 0.2851 1.09e-49 8roi:A, 8roj:A, 8rok:C
5 6wge:B 490 481 0.3063 0.2694 0.2744 1.44e-49
6 6yuf:C 456 455 0.3132 0.2961 0.2967 3.28e-46
7 4ux3:A 436 455 0.2877 0.2844 0.2725 2.62e-45
8 8rok:A 381 431 0.2691 0.3045 0.2691 4.70e-44 8pq5:B
9 6qpw:C 377 430 0.2854 0.3263 0.2860 7.86e-44
10 7w1m:B 528 520 0.3109 0.2538 0.2577 2.61e-42
11 7qen:B 419 424 0.2599 0.2673 0.2642 4.04e-37
12 5xg3:B 374 435 0.2715 0.3128 0.2690 4.42e-34 5h67:A, 5xg3:A
13 7w1m:A 399 428 0.2668 0.2882 0.2687 4.28e-33 6wge:A
14 1xex:A 166 168 0.1462 0.3795 0.3750 2.78e-27 3kta:A, 3kta:C
15 6wg3:B 693 271 0.1879 0.1169 0.2989 6.18e-27
16 6wg3:B 693 259 0.1601 0.0996 0.2664 2.07e-19
17 3kta:B 171 147 0.1253 0.3158 0.3673 1.08e-26
18 5h68:B 332 175 0.1462 0.1898 0.3600 2.94e-21 5h68:A
19 5h68:B 332 142 0.0928 0.1205 0.2817 6.12e-15 5h68:A
20 7q2x:B 388 201 0.1346 0.1495 0.2886 1.51e-20 7q2y:B
21 7q2x:B 388 79 0.0766 0.0851 0.4177 9.65e-16 7q2y:B
22 8roa:C 364 227 0.1508 0.1786 0.2863 1.86e-18 8p0a:A, 8pq5:A, 8rob:A, 8roe:A, 8rof:A, 8rog:A
23 8roa:C 364 86 0.0719 0.0852 0.3605 2.83e-11 8p0a:A, 8pq5:A, 8rob:A, 8roe:A, 8rof:A, 8rog:A
24 6wg3:A 561 208 0.1462 0.1123 0.3029 2.62e-18 6wg6:A, 6wg6:C
25 6wg3:A 561 86 0.0719 0.0553 0.3605 3.62e-11 6wg6:A, 6wg6:C
26 8p0a:B 314 167 0.1230 0.1688 0.3174 3.12e-18
27 8p0a:B 314 188 0.1137 0.1561 0.2606 3.21e-17
28 8roa:A 339 162 0.1230 0.1563 0.3272 6.06e-17
29 8roa:A 339 86 0.0719 0.0914 0.3605 2.78e-11
30 6qpw:A 183 162 0.1206 0.2842 0.3210 6.60e-16
31 6zz6:A 360 242 0.1555 0.1861 0.2769 2.86e-15
32 6zz6:A 360 171 0.1160 0.1389 0.2924 3.69e-13
33 6yuf:A 384 216 0.1346 0.1510 0.2685 4.29e-14
34 6yuf:A 384 91 0.0719 0.0807 0.3407 3.12e-12
35 1w1w:B 327 162 0.1067 0.1407 0.2840 4.55e-14 1w1w:C, 1w1w:D
36 1w1w:B 327 166 0.1160 0.1529 0.3012 7.07e-14 1w1w:C, 1w1w:D
37 1w1w:A 274 90 0.0789 0.1241 0.3778 3.34e-13
38 1w1w:A 274 156 0.1067 0.1679 0.2949 6.93e-11
39 6qpw:E 198 68 0.0673 0.1465 0.4265 4.32e-12
40 7tve:D 445 390 0.2297 0.2225 0.2538 9.02e-09
41 7tve:E 461 386 0.2111 0.1974 0.2358 1.42e-08
42 3auy:A 366 416 0.2367 0.2787 0.2452 1.13e-06 3aux:A, 3auy:B, 3av0:B, 5dny:D, 5dny:B, 5f3w:D, 5f3w:B
43 3qku:A 359 203 0.1299 0.1560 0.2759 2.85e-06 1f2u:A, 1f2u:D, 1f2u:C, 1f2u:B, 3qks:A, 3qks:B
44 3qku:A 359 49 0.0441 0.0529 0.3878 0.015 1f2u:A, 1f2u:D, 1f2u:C, 1f2u:B, 3qks:A, 3qks:B
45 7yzp:C 448 188 0.1137 0.1094 0.2606 1.65e-04 7yzp:D
46 6s85:D 375 154 0.0928 0.1067 0.2597 1.87e-04 6s6v:C, 6s6v:D, 6s85:C, 7yzo:C, 7yzo:D, 7z03:D, 7z03:C
47 3qkt:B 319 188 0.1090 0.1473 0.2500 4.99e-04 4ncj:A, 4ncj:B, 3qkt:D, 3qku:B
48 3qkt:B 319 46 0.0441 0.0596 0.4130 0.014 4ncj:A, 4ncj:B, 3qkt:D, 3qku:B
49 3qkt:A 339 49 0.0441 0.0560 0.3878 0.015 4ncj:C, 4ncj:D, 3qkt:C
50 6tmf:d 582 71 0.0580 0.0430 0.3521 0.027 3ozx:A, 3ozx:B
51 8sq0:A 1402 72 0.0464 0.0143 0.2778 0.082 8sq0:B, 8sql:A, 8sqm:A
52 3qf7:A 357 175 0.1044 0.1261 0.2571 0.13 3qf7:B, 3tho:A, 4w9m:C, 4w9m:I, 4w9m:E, 4w9m:K
53 3qf7:A 357 71 0.0487 0.0588 0.2958 0.15 3qf7:B, 3tho:A, 4w9m:C, 4w9m:I, 4w9m:E, 4w9m:K
54 8hw2:A 1375 73 0.0557 0.0175 0.3288 0.16 8hw4:A
55 7o80:Bz 595 84 0.0603 0.0437 0.3095 0.17 7a09:J, 6hcf:k1, 6hcm:k1, 3jag:jj, 3jah:jj, 3jai:jj, 5lzv:jj, 8p03:k, 8p09:k, 8scb:jj, 6yal:k, 6yam:k, 6zme:CI, 6zvj:1
56 7ph3:A 577 47 0.0510 0.0381 0.4681 0.21 3b5y:A, 3b5y:C, 3b60:A, 3b60:B, 3b60:C, 3b60:D, 7bcw:A, 7bcw:B, 6bpl:A, 6bpl:B, 6bpp:A, 6bpp:B, 8dmm:A, 8dmm:B, 7mew:A, 7mew:B, 7ph2:A, 7ph2:B, 7ph3:B, 7ph4:A, 7ph4:B, 7ph7:A, 7ph7:B, 7sel:A, 7sel:B, 8tso:A, 8tso:B
57 3bcq:B 146 82 0.0510 0.1507 0.2683 0.22 3bcq:D
58 5z68:C 373 67 0.0487 0.0563 0.3134 0.22 5z68:A, 5z68:B, 5z68:D, 5z69:A
59 4crm:P 608 84 0.0487 0.0345 0.2500 0.23 7a1g:x, 8cah:x, 3j16:B
60 8cas:k 579 84 0.0487 0.0363 0.2500 0.23 5ll6:h, 6zce:k, 6zu9:k
61 9csi:A 569 74 0.0580 0.0439 0.3378 0.23 8gk7:A, 8gk7:B, 7met:A
62 5lj7:A 592 117 0.0673 0.0490 0.2479 0.25
63 5lil:A 615 113 0.0626 0.0439 0.2389 0.29 5lil:B, 5lj6:A, 5lj7:B
64 7met:B 455 74 0.0580 0.0549 0.3378 0.30
65 4uwq:A 548 60 0.0418 0.0328 0.3000 0.31 4uwq:D, 4uwq:G, 4uwq:J, 2wdc:A, 2wdd:A, 2wde:A, 2wdf:A
66 8glb:D 374 84 0.0603 0.0695 0.3095 0.37 8gi7:A, 8gi7:B, 8gi7:C, 8gi7:D, 8giw:A, 8giw:B, 8giw:C, 8giw:D, 8glb:A, 8glb:B, 8glb:C, 8gmi:A, 8gmi:B, 8gmi:C, 8gmi:D, 8gmi:E, 8gmi:F, 8gmi:G, 8gmi:H, 8gmk:A, 8gmk:B, 8s9d:A
67 8f4b:A 1182 72 0.0557 0.0203 0.3333 0.69
68 8vsi:B 579 102 0.0719 0.0535 0.3039 0.80
69 2hvw:A 147 48 0.0325 0.0952 0.2917 0.89 5c2o:A, 5c2o:B, 2hvv:A, 2hvv:B, 2hvw:B, 2hvw:C
70 4u00:A 241 87 0.0626 0.1120 0.3103 0.90
71 8dk2:C 723 75 0.0557 0.0332 0.3200 1.1 8dk2:D
72 6bhu:A 1328 72 0.0534 0.0173 0.3194 1.6 5uja:A, 6uy0:A
73 1mv5:A 242 135 0.0626 0.1116 0.2000 1.7 1mv5:B, 1mv5:C, 1mv5:D
74 8dk3:A 455 75 0.0557 0.0527 0.3200 1.8 8dk3:B
75 8hf4:A 563 37 0.0441 0.0337 0.5135 2.3 8hf4:B, 8hf5:A, 8hf5:B, 8hf6:A, 8hf6:B, 8hf7:B, 8k4b:A, 8k4b:B, 8k7a:A, 8k7a:B
76 3bk7:A 593 63 0.0510 0.0371 0.3492 2.6 3j15:B, 5lw7:B, 1yqt:A, 5yv5:A
77 5eg1:B 576 72 0.0510 0.0382 0.3056 3.1 5eg1:A, 5ofr:A, 5ofr:B, 4pl0:A, 4pl0:B, 8px9:A, 8px9:B
78 8is7:A 275 26 0.0278 0.0436 0.4615 3.2 8is8:A, 8is9:A, 8isa:A
79 6tej:B 585 73 0.0487 0.0359 0.2877 3.3
80 4ymu:J 240 104 0.0673 0.1208 0.2788 3.4 4ymu:A, 4ymv:J, 4ymv:A
81 4ac8:A 311 82 0.0487 0.0675 0.2561 3.4 4ac8:B, 4ac8:C, 4ac8:D, 3ee4:A
82 1g6h:A 254 94 0.0557 0.0945 0.2553 3.6 1g9x:A, 1g9x:B, 1g9x:C
83 7v5c:A 572 37 0.0394 0.0297 0.4595 3.6 7v5c:B, 7vfi:A, 7vfi:B
84 6shm:A 339 101 0.0534 0.0678 0.2277 4.9 6y8f:A
85 8azw:r 386 70 0.0510 0.0570 0.3143 5.4 8b2l:r3, 7qiw:E, 7qiz:E
86 8buu:9 573 83 0.0580 0.0436 0.3012 5.5
87 5olw:A 224 53 0.0394 0.0759 0.3208 5.7 4c4r:A, 4c4s:A, 4c4t:A, 3fm9:A, 6h8u:A, 6h8v:A, 6h8v:B, 6h8w:A, 6h8x:A, 6h8x:B, 6h8y:A, 6h8z:A, 6h90:A, 6h91:A, 6h91:B, 6h92:A, 6h92:B, 6h93:A, 6h93:B, 6h94:A, 6hdg:A, 6hdh:A, 6hdh:B, 6hdi:A, 6hdi:B, 6hdj:A, 6hdk:A, 6hdl:A, 6hdm:A, 6i03:A, 1lvh:A, 1lvh:B, 1o03:A, 1o08:A, 5o6p:A, 5o6r:A, 5ojz:A, 5ok0:A, 5ok1:A, 5ok2:A, 5olw:B, 5olx:A, 5oly:A, 5oly:G, 8q1c:A, 8q1c:B, 8q1d:A, 8q1e:A, 8q1f:A, 8q1f:B, 6qzg:A, 6qzg:B, 2wf5:A, 2wf6:A, 2wf7:A, 2wf8:A, 2wf9:A, 2wfa:A, 2whe:A, 6ydj:A, 6ydk:A, 6ydl:A, 6ydm:A, 6ydm:B, 1z4n:A, 1z4n:B, 1z4o:A, 1z4o:B, 3zi4:A, 1zol:A
88 1xmi:C 270 42 0.0394 0.0630 0.4048 5.8 2bbo:A, 2bbs:A, 2bbt:A, 2bbt:B, 4wz6:A, 1xmi:A, 1xmi:B, 1xmi:E, 1xmi:D, 1xmj:A
89 8jxu:A 1410 72 0.0534 0.0163 0.3194 6.3 8jxq:A
90 1r0z:C 277 45 0.0371 0.0578 0.3556 6.9 1q3h:A, 1q3h:B, 1q3h:C, 1q3h:D, 1r0x:A, 1r0x:B, 1r0x:C, 1r0x:D, 1r0y:A, 1r0y:B, 1r0y:C, 1r0y:D, 1r0z:A, 1r0z:B, 1r0z:D, 1r10:A, 1r10:B, 3si7:A, 3si7:B, 3si7:C, 3si7:D, 1xf9:A, 1xf9:B, 1xf9:C, 1xf9:D, 1xfa:A, 1xfa:B
91 8cub:C 588 71 0.0510 0.0374 0.3099 7.9 8cub:A, 7r8a:A, 7r8b:A
92 8ojl:A 777 136 0.0789 0.0438 0.2500 8.1 9cc0:A, 9cc0:C, 9cc0:E, 9cc0:B, 9cc0:D, 9cc0:F, 9cc3:B, 9cc3:C, 9cc3:D, 9cc3:E, 7krz:A, 7krz:C, 7krz:B, 7krz:D, 7krz:E, 7krz:F, 7ksl:B, 7ksl:A, 7ksl:F, 7ksm:B, 7ksm:A, 7ksm:C, 7ksm:D, 7ksm:E, 7ksm:F, 7nfy:A, 7nfy:B, 7nfy:C, 7nfy:E, 7nfy:D, 7nfy:F, 7ng4:B, 7ng4:C, 7ng4:D, 7ng4:A, 7ng4:E, 7ng4:F, 7ng5:A, 7ng5:D, 7ng5:B, 7ng5:C, 7ng5:E, 7ng5:F, 7ngc:A, 7ngc:B, 7ngc:C, 7ngc:D, 7ngc:E, 7ngc:F, 7ngf:A, 7ngf:F, 7ngf:B, 7ngf:C, 7ngf:D, 7ngf:E, 7ngl:A, 7ngl:B, 7ngl:C, 7ngl:D, 7ngl:E, 7ngl:F, 7ngp:A, 7ngp:B, 7ngp:C, 7ngp:D, 7ngp:E, 7ngp:F, 7ngq:A, 7ngq:B, 7ngq:C, 7ngq:D, 7ngq:E, 7ngq:F, 8ojl:B, 8ojl:C, 8ojl:D, 8ojl:E, 8ojl:F, 8oka:A, 8oka:B, 8oka:C, 8oka:D, 8oka:E, 8oka:F, 8om7:A, 8om7:B, 8om7:C, 8om7:D, 8om7:E, 8om7:F, 8ovf:A, 8ovf:B, 8ovf:C, 8ovf:D, 8ovf:E, 8ovf:F, 7oxo:A, 7oxo:B, 7oxo:C, 7oxo:D, 7oxo:E, 7oxo:F, 7p09:A, 7p09:B, 7p09:D, 7p09:C, 7p09:E, 7p0b:A, 7p0b:B, 7p0b:C, 7p0b:D, 7p0b:E, 7p0b:F, 7p0m:A, 7p0m:B, 7p0m:C, 7p0m:D, 7p0m:E, 6wzv:A, 6wzv:B, 6x1m:A, 6x1m:B, 6x27:A, 6x27:B, 6x27:C, 6x27:D, 6x27:E, 6x27:F, 6x27:G, 6x27:H, 6x27:I, 6x27:J, 6x27:K, 6x27:L
93 7sgr:E 700 72 0.0487 0.0300 0.2917 8.2 3b5j:A, 8dck:A, 8dck:B, 8dck:I, 8dck:J, 8dck:E, 8dck:F, 2ff7:A, 2ffa:A, 2ffb:A, 2fgj:A, 2fgj:B, 2fgj:C, 2fgj:D, 2fgk:A, 2fgk:B, 2fgk:C, 2fgk:D, 2pmk:A, 7sgr:J, 7sgr:A, 7sgr:F, 1xef:A, 1xef:B, 1xef:C, 1xef:D
94 2hyd:A 578 42 0.0371 0.0277 0.3810 9.6 2hyd:B, 2onj:A, 2onj:B
95 6qex:A 1182 81 0.0510 0.0186 0.2716 9.6 7a65:A, 7a69:A, 7a6c:A, 7a6e:A, 7a6f:A, 6c0v:A, 7o9w:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218