Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKTRITELLKIDYPIFQGGMAWVADGDLAGAVSKAGGLGIIGGGNAPKEVVKANIDKIKSLTDKPFGVNIMLLSPFVEDI
VDLVIEEGVKVVTTGAGNPSKYMERFHEAGIIVIPVVPSVALAKRMEKIGADAVIAEGMEAGGHIGKLTTMTLVRQVATA
ISIPVIAAGGIADGEGAAAGFMLGAEAVQVGTRFVVAKESNAHPNYKEKILKARDIDTTISAQHFGHAVRAIKNQLTRDF
ELAEKDAFKQEDPDLEIFEQMGAGALAKAVVHGDVDGGSVMAGQIAGLVSKEETAEEILKDLYYGAAKKIQEEASRWTGV
V

The query sequence (length=321) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2z6i:B 321 321 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 2z6i:A, 2z6j:A, 2z6j:B
2 7l00:C 315 304 0.5452 0.5556 0.5757 1.28e-121 7l00:A, 7l00:B, 7l00:D
3 5gvh:A 311 321 0.4891 0.5048 0.4891 1.60e-93
4 4iql:A 313 310 0.3956 0.4058 0.4097 1.96e-66 4iql:B
5 6e2a:A 326 322 0.3209 0.3160 0.3199 6.75e-47 2gjl:A, 2gjn:A
6 4q4k:A 351 287 0.3115 0.2849 0.3484 1.74e-37 4q4k:B, 4qis:A, 4qis:B, 4qit:A, 4qit:B, 4qiu:A, 4qiu:B
7 5lsm:A 339 325 0.3053 0.2891 0.3015 1.23e-30 5lsm:B, 5lsm:C, 5lsm:D, 5lsm:E, 5lsm:F, 5lsm:G, 5lsm:H
8 3bw2:A 347 325 0.2960 0.2738 0.2923 2.29e-23 3bw3:A, 3bw4:A
9 7e1q:A 366 282 0.2648 0.2322 0.3014 1.45e-15 7e1r:A, 7e1r:C, 7e1s:C, 7e1s:A
10 6bka:A 374 311 0.2461 0.2112 0.2540 1.24e-11
11 1eep:A 314 228 0.1745 0.1783 0.2456 8.06e-07
12 4myx:G 356 216 0.1776 0.1601 0.2639 1.04e-04 6mgu:A, 6mgu:B, 7mtu:A, 7mtu:C, 7mtu:B, 7mtu:D, 7mtu:E, 7mtu:G, 7mtu:F, 7mtu:H, 7mtx:A, 7mtx:C, 7mtx:B, 7mtx:D, 7mtx:E, 7mtx:G, 7mtx:F, 7mtx:H, 4my1:A, 4my1:C, 4my1:B, 4my1:D, 4my1:E, 4my1:F, 4my1:G, 4my1:H, 4my8:A, 4my8:B, 4my8:C, 4my8:D, 4my9:A, 4my9:C, 4my9:B, 4my9:D, 4my9:E, 4my9:F, 4my9:H, 4my9:G, 4mya:A, 4mya:B, 4myx:A, 4myx:C, 4myx:B, 4myx:D, 4myx:E, 4myx:F, 4myx:H, 4qm1:A, 4qm1:B, 4qm1:D, 4qm1:C, 5urs:A, 5urs:C, 5urs:B, 5urs:D, 5urs:E, 5urs:G, 5urs:F, 5urs:H, 5uuv:A, 5uuv:D, 5uuv:B, 5uuv:C, 5uuz:A, 5uuz:C, 5uuz:B, 5uuz:D, 5uuz:E, 5uuz:G, 5uuz:F, 5uuz:H
13 4qq3:A 302 234 0.1931 0.2053 0.2650 3.52e-04
14 4fo4:A 348 227 0.1838 0.1695 0.2599 3.63e-04 4fo4:B, 4ix2:A, 4ix2:B, 4ix2:C, 4ix2:D, 4qne:A, 4qne:B, 4x3z:A, 4x3z:B
15 3tsd:B 426 71 0.0748 0.0563 0.3380 4.56e-04
16 1h5y:B 253 73 0.0872 0.1107 0.3836 5.01e-04 1h5y:A
17 1h5y:B 253 52 0.0592 0.0751 0.3654 0.22 1h5y:A
18 1tyg:A 242 93 0.0935 0.1240 0.3226 0.001 1tyg:C
19 3usb:B 401 59 0.0685 0.0549 0.3729 0.001
20 3tsb:A 490 59 0.0685 0.0449 0.3729 0.002 3tsd:A, 3usb:A
21 3tsb:B 434 59 0.0685 0.0507 0.3729 0.002
22 1ep3:A 311 46 0.0592 0.0611 0.4130 0.002 1ep1:A, 1ep2:A, 5ksw:A, 5ksw:C, 5ue9:A, 5ue9:C
23 4af0:A 395 280 0.2087 0.1696 0.2393 0.003 4af0:B
24 3iiv:B 262 73 0.0810 0.0992 0.3562 0.003 7ac8:A, 7ac8:C, 7ac8:E, 6ct3:A, 5d2t:A, 5d2w:A, 6dc1:A, 6dc1:B, 6dc1:H, 6dc1:K, 6dkv:A, 6dnj:A, 1gpw:C, 1gpw:E, 6rtz:A, 6ru0:A, 6ru0:C, 6ru0:E, 2wjz:A, 2wjz:C
25 4jej:A 241 85 0.0748 0.0996 0.2824 0.004
26 2cu0:A 358 264 0.2087 0.1872 0.2538 0.009 2cu0:B
27 7oj2:A 353 192 0.1526 0.1388 0.2552 0.009
28 1b3o:A 304 218 0.1682 0.1776 0.2477 0.012
29 5uzc:B 347 188 0.1402 0.1297 0.2394 0.013 4q32:A, 4q32:C, 4q32:B, 4q32:D, 4q33:A, 4q33:C, 4q33:B, 4q33:D, 4q33:E, 4q33:G, 4q33:F, 4q33:H, 5uwx:A, 5uwx:B, 5uwx:C, 5uwx:D, 5uxe:A, 5uxe:C, 5uxe:B, 5uxe:D, 5uzc:A, 5uzc:D, 5uzc:C, 5uze:A, 5uze:C, 5uze:B, 5uze:D, 5uzs:A, 5uzs:C, 5uzs:B, 5uzs:D, 5vsv:A, 5vsv:C, 5vsv:B, 5vsv:D
30 4z38:B 439 239 0.1807 0.1321 0.2427 0.014 4z38:A
31 7qc8:A 250 71 0.0779 0.1000 0.3521 0.016 4ewn:D, 2wjz:E, 3zr4:E
32 4n6f:A 242 92 0.0903 0.1198 0.3152 0.019 4n6f:B
33 7oj1:A 401 59 0.0623 0.0499 0.3390 0.021
34 7oj1:B 425 59 0.0623 0.0471 0.3390 0.022
35 4qj1:D 346 223 0.1682 0.1561 0.2422 0.038 4ixh:A, 4ixh:D, 4ixh:B, 4ixh:C, 3khj:B, 3khj:C, 3khj:D, 3khj:H, 4qj1:A, 4qj1:B, 4qj1:C, 4rv8:A, 4rv8:D, 4rv8:B, 4rv8:C
36 3khj:A 302 223 0.1682 0.1788 0.2422 0.040 3khj:E, 3khj:F, 3khj:G
37 5upx:A 380 185 0.1620 0.1368 0.2811 0.041
38 4xp7:A 324 64 0.0623 0.0617 0.3125 0.090 6eza:A, 6eza:B, 6ezb:A, 6ezc:A, 4wfs:A
39 1zfj:A 476 41 0.0467 0.0315 0.3659 0.11
40 6uy4:A 354 53 0.0654 0.0593 0.3962 0.15
41 2iss:B 285 164 0.1526 0.1719 0.2988 0.19 2iss:A, 2iss:C
42 7pji:A 445 41 0.0467 0.0337 0.3659 0.21 4dqw:A, 4dqw:B, 6gk9:A, 6gk9:D, 7pji:B
43 5ahn:A 297 62 0.0654 0.0707 0.3387 0.21
44 4cw5:B 438 256 0.1900 0.1393 0.2383 0.35 4cw5:A
45 5upy:A 350 231 0.1745 0.1600 0.2424 0.58
46 8fuz:A 390 240 0.1807 0.1487 0.2417 0.63 8foz:A, 8foz:B, 8foz:C, 8foz:D, 8foz:E, 8foz:F, 8foz:G, 8foz:H, 8fuz:B, 8fuz:C, 8fuz:D, 8fuz:E, 8fuz:F, 8fuz:G, 8fuz:H, 1jr1:B, 6u8e:A, 6u8e:B, 6u8e:C, 6u8e:D, 6u8e:E, 6u8e:F, 6u8e:G, 6u8e:H, 6u8s:A, 6u8s:B, 6u8s:C, 6u8s:D, 6u8s:E, 6u8s:F, 6u8s:G, 6u8s:H, 6ua5:A, 6ua5:B, 6ua5:C, 6ua5:D, 6ua5:E, 6ua5:F, 6ua5:G, 6ua5:H, 6udp:A, 6udp:B, 6udp:C, 6udp:D, 6udp:E, 6udp:F, 6udp:G, 6udp:H
47 4lv8:A 360 59 0.0530 0.0472 0.2881 0.71 4lv5:A, 3q60:A
48 4fxs:A 467 41 0.0405 0.0278 0.3171 0.73
49 4z0g:B 390 244 0.1776 0.1462 0.2336 0.90 4xtd:A, 4xtd:B, 4xti:A, 4xti:B, 4z0g:A
50 2a1y:A 301 47 0.0561 0.0598 0.3830 1.0
51 6nke:A 249 79 0.0685 0.0884 0.2785 1.2
52 3qh2:B 196 119 0.0997 0.1633 0.2689 1.5 3qh2:A, 3qh2:C, 3qh2:D
53 4jdy:A 264 69 0.0841 0.1023 0.3913 1.5 4jdy:B, 4jdy:C
54 3tdm:A 120 67 0.0592 0.1583 0.2836 1.8 3tdm:B, 3tdm:C, 3tdm:D
55 9c4m:A 335 41 0.0405 0.0388 0.3171 1.8 9c4m:B, 9c4m:C, 9c4m:D, 9c4m:E, 9c4m:F, 9c4m:G, 9c4m:H
56 2bsl:A 311 68 0.0685 0.0707 0.3235 1.8 2bsl:B, 2bx7:A, 2bx7:B, 1dor:A, 1dor:B, 2dor:A, 2dor:B, 1jqv:A, 1jqv:B, 1jqx:A, 1jqx:B, 1jrb:A, 1jrb:B, 1jrc:A, 1jrc:B, 1jub:A, 1jub:B, 1jue:A, 1jue:B, 1ovd:A, 1ovd:B
57 8ps2:G 2036 119 0.1059 0.0167 0.2857 1.8 3hmj:G, 3hmj:H, 3hmj:I, 8prv:G, 8prw:G, 8prw:J, 8prw:I, 8prw:H, 8prw:K, 8prw:L, 8ps1:G, 8ps9:G, 8psa:G, 8psf:G, 8psg:G, 8psj:G, 8psk:G, 8psl:G, 8psm:G, 8psp:G, 6ql5:I, 6ql5:G, 6ql5:H, 6ql5:L, 6ql5:J, 6ql5:K, 6ql6:G, 6ql6:H, 6ql6:I, 6ql6:J, 6ql6:K, 6ql6:L, 6ql9:G, 6ql9:H, 6ql9:I, 6ql9:J, 6ql9:K, 6ql9:L, 6ta1:G, 6ta1:C, 6ta1:E, 6ta1:L, 6ta1:H, 6ta1:J, 6u5t:G, 6u5u:G, 2uv8:G, 2uv8:H, 2uv8:I, 2vkz:G, 2vkz:H, 2vkz:I
58 4f9b:A 318 96 0.0685 0.0692 0.2292 1.9 4f99:A, 4f9a:A, 4f9a:C, 4f9b:C, 4f9c:A
59 5mcp:H 321 52 0.0436 0.0436 0.2692 2.1
60 6jig:A 480 39 0.0405 0.0271 0.3333 2.5 6lk4:A
61 4ori:A 355 61 0.0685 0.0620 0.3607 2.6 1uum:A, 1uum:B, 1uuo:A
62 7rer:A 389 235 0.1713 0.1414 0.2340 2.7 7rer:D, 7rer:C, 7rer:B, 7rer:E, 7rer:H, 7rer:G, 7rer:F, 8u8y:A, 8u8y:B, 8u8y:C, 8u8y:D, 8u8y:E, 8u8y:F, 8u8y:G, 8u8y:H
63 6gjc:A 2770 250 0.1838 0.0213 0.2360 2.9 6gjc:B, 6gjc:C, 6gjc:D, 6gjc:E, 6gjc:F
64 4wy0:B 260 45 0.0561 0.0692 0.4000 2.9 4wy0:D, 4wy0:E, 4wy0:G, 4wy0:I, 4wy0:J, 4wy0:K, 1znn:A, 1znn:B, 1znn:C, 1znn:D, 1znn:E, 1znn:F
65 1ox4:B 538 93 0.0779 0.0465 0.2688 3.0 1jvn:B, 1ox4:A, 1ox5:A, 1ox5:B, 1ox6:B
66 4kl8:S 279 64 0.0623 0.0717 0.3125 3.0 1cc1:S, 4kl8:T, 4kn9:S, 4kn9:T, 4ko1:S, 4ko1:T, 4ko2:S, 4ko2:T, 4ko3:S, 4ko3:T, 4ko4:S, 4ko4:T
67 6hwm:E 195 42 0.0374 0.0615 0.2857 3.1 6hwm:A, 6hwm:B, 6hwm:C, 6hwm:D, 6hwm:F, 6hwm:G, 6hwn:A, 6hwn:B, 6hwn:C, 6hwn:D, 6hwn:E, 6hwn:F, 6hwn:G
68 1jcn:A 395 76 0.0623 0.0506 0.2632 3.2 1jcn:B
69 6ya7:A 350 92 0.0685 0.0629 0.2391 3.5 6ya6:A, 6ya8:A
70 3o05:A 261 63 0.0623 0.0766 0.3175 4.2 3o05:B, 3o05:C
71 8u7j:L 267 49 0.0561 0.0674 0.3673 4.3 8u7j:K, 8u7j:I, 8u9e:B
72 7rfh:H 451 76 0.0623 0.0443 0.2632 4.4 7rfh:A, 7rfh:B, 7rfh:C, 7rfh:D, 7rfh:E, 7rfh:F, 7rfh:G
73 8u7m:A 451 76 0.0623 0.0443 0.2632 4.8 8u7m:B, 8u7m:C, 8u7m:D, 8u7m:E, 8u7m:F, 8u7m:G, 8u7m:H
74 1nfb:A 396 157 0.1246 0.1010 0.2548 4.9 1nfb:B
75 7rgd:A 519 76 0.0623 0.0385 0.2632 5.0 7res:A, 7res:B, 7res:C, 7res:D, 7res:E, 7res:F, 7res:G, 7res:H, 7rfe:A, 7rfe:B, 7rfe:C, 7rfe:D, 7rfe:E, 7rfe:F, 7rfe:G, 7rfe:H, 7rfg:A, 7rfg:B, 7rfg:C, 7rfg:D, 7rfg:E, 7rfg:F, 7rfg:G, 7rfg:H, 7rgd:B, 7rgd:C, 7rgd:D, 7rgd:E, 7rgd:F, 7rgd:G, 7rgd:H, 7rgm:A, 7rgm:B, 7rgm:C, 7rgm:D, 7rgm:E, 7rgm:F, 7rgm:G, 7rgm:H, 7rgq:A, 7rgq:B, 7rgq:C, 7rgq:D, 7rgq:E, 7rgq:F, 7rgq:G, 7rgq:H, 8u7q:A, 8u7q:B, 8u7q:C, 8u7q:D, 8u7q:E, 8u7q:F, 8u7q:G, 8u7q:H, 8u7v:A, 8u7v:B, 8u7v:C, 8u7v:D, 8u7v:E, 8u7v:F, 8u7v:G, 8u7v:H, 8u8o:A, 8u8o:B, 8u8o:C, 8u8o:D, 8u8o:E, 8u8o:F, 8u8o:G, 8u8o:H
76 1nf7:A 454 138 0.1153 0.0815 0.2681 5.2 1jr1:A, 1nf7:B
77 8g8f:A 491 138 0.1153 0.0754 0.2681 5.4 8g8f:B, 8g8f:C, 8g8f:D, 8g8f:E, 8g8f:F, 8g8f:G, 8g8f:H, 8g9b:A, 8g9b:B, 8g9b:C, 8g9b:D, 8g9b:E, 8g9b:F, 8g9b:G, 8g9b:H, 6i0m:A, 6i0o:B, 6u8n:A, 6u8n:B, 6u8n:C, 6u8n:D, 6u8n:E, 6u8n:F, 6u8n:G, 6u8n:H, 6u8r:D, 6u8r:A, 6u8r:B, 6u8r:C, 6u8r:H, 6u8r:E, 6u8r:F, 6u8r:G, 6u9o:A, 6u9o:B, 6u9o:C, 6u9o:D, 6u9o:E, 6u9o:F, 6u9o:G, 6u9o:H, 6ua2:B, 6ua2:A, 6ua2:D, 6ua2:C, 6ua2:F, 6ua2:E, 6ua2:H, 6ua2:G, 6ua4:B, 6ua4:A, 6ua4:D, 6ua4:C, 6ua4:F, 6ua4:E, 6ua4:H, 6ua4:G, 6uaj:A, 6uaj:B, 6uaj:C, 6uaj:D, 6uaj:E, 6uaj:F, 6uaj:G, 6uaj:H, 6udo:A, 6udo:B, 6udo:C, 6udo:D, 6udo:E, 6udo:F, 6udo:G, 6udo:H, 6udq:A, 6udq:B, 6udq:C, 6udq:D, 6udq:E, 6udq:F, 6udq:G, 6udq:H
78 1huv:A 349 101 0.0935 0.0860 0.2970 6.2
79 1b3o:B 410 138 0.1153 0.0902 0.2681 6.2
80 6et4:A 367 58 0.0654 0.0572 0.3621 6.2 2b0m:A, 9bkm:A, 9bkn:A, 9bko:A, 2bxv:A, 6cjf:A, 6cjf:B, 6cjg:A, 1d3g:A, 1d3h:A, 8dhf:A, 8dhg:A, 8dhh:A, 3f1q:A, 3fj6:A, 3fjl:A, 6fmd:A, 2fpt:A, 2fpv:A, 2fpy:A, 2fqi:A, 3g0u:A, 3g0x:A, 6gk0:A, 5h2z:A, 5h73:A, 5hin:A, 5hqe:A, 6idj:A, 4igh:A, 6j3b:A, 6j3c:A, 4jgd:A, 6jmd:A, 6jme:A, 4js3:A, 4jts:A, 4jtt:A, 4jtu:A, 7k2u:A, 8k4f:A, 5k9c:A, 5k9d:A, 3kvj:A, 3kvk:A, 3kvl:A, 3kvm:A, 6lp6:A, 6lp7:A, 6lp8:A, 4ls0:A, 4ls1:A, 4ls2:A, 6lzl:A, 6m2b:A, 5mut:A, 5mvc:A, 5mvd:A, 6oc0:A, 6oc1:A, 4oqv:A, 2prh:A, 2prl:A, 2prm:A, 6qu7:A, 8rak:A, 4rk8:A, 4rka:A, 4rli:A, 4rr4:A, 6syp:AAA, 3u2o:A, 8vhl:A, 8vhm:A, 6vnd:A, 3w7r:A, 2wv8:A, 8yhr:A, 4ylw:A, 7z6c:A, 5zf4:A, 5zf7:A, 5zf8:A, 5zf9:A, 5zfa:A, 5zfb:A, 4zl1:A, 4zmg:A, 3zws:A, 3zwt:A
81 6uc2:A 453 133 0.1090 0.0773 0.2632 6.3 6i0m:B, 6i0o:A, 6uc2:B, 6uc2:C, 6uc2:D, 6uc2:E, 6uc2:F, 6uc2:G, 6uc2:H
82 6bfg:A 373 101 0.0935 0.0804 0.2970 7.3 2a7n:A, 2a7p:A, 2a85:A, 6bfg:B, 3giy:A, 1p4c:A, 1p5b:A
83 8qqv:A 356 63 0.0436 0.0393 0.2222 7.8 8qqv:B, 8qqv:D, 8qqv:C, 8qqv:E, 8qqv:F, 8qqv:G, 8qqv:H, 8qqx:A, 8qqx:B, 8qqx:C, 8qqx:D, 8qqx:E, 8qqx:F, 8qqx:G, 8qqx:H
84 3oix:A 310 31 0.0405 0.0419 0.4194 8.0 3oix:B, 3oix:C, 3oix:D
85 7ou2:B 650 32 0.0405 0.0200 0.4062 8.1
86 8qqp:A 464 40 0.0312 0.0216 0.2500 8.2 8q65:A, 8q65:E, 8qqp:B, 8qqp:C, 8qqp:D, 8qqp:E, 8qqp:F, 8qqp:G, 8qqp:H, 8qqq:A, 8qqq:B, 8qqq:C, 8qqq:D, 8qqq:E, 8qqq:F, 8qqq:G, 8qqq:H, 8qqr:A, 8qqr:B, 8qqr:C, 8qqr:D, 8qqr:E, 8qqr:F, 8qqr:G, 8qqr:H, 8qqt:A, 8qqt:B, 8qqt:C, 8qqt:D, 8qqt:E, 8qqt:F, 8qqt:G, 8qqt:H
87 5dn1:A 240 40 0.0498 0.0667 0.4000 8.2
88 5mrc:Q 284 56 0.0592 0.0669 0.3393 9.0 3j6b:Q, 5mre:Q, 5mrf:Q

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218