Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKRILVVDDEPNIRELLKEELQEEGYEIDTAENGEEALKKFFSGNYDLVILDIEMPGISGLEVAGEIRKKKKDAKIILLT
AYSHYRSDLSSWAADEYVVKSFNFDELKEKVKKLL

The query sequence (length=115) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3a10:A 116 115 0.9913 0.9828 0.9913 7.43e-79 3a0u:A
2 6is1:B 121 115 0.3826 0.3636 0.3826 4.04e-23 6is1:A, 6is1:C, 6is1:D, 6is1:E, 6is1:F, 6is1:G, 6is1:H, 6is2:A, 6is2:B, 6is2:C, 6is2:D, 6is3:C
3 2a9r:A 118 115 0.4261 0.4153 0.4261 3.32e-22 2a9o:A, 2a9p:A, 6eb7:A, 6ebr:A, 1nxp:A, 1nxt:A
4 1mvo:A 121 116 0.4000 0.3802 0.3966 8.57e-21
5 5ed4:E 224 115 0.3826 0.1964 0.3826 5.88e-20 5ed4:A, 5ed4:B, 5ed4:F, 2pmu:E
6 6ifh:A 119 119 0.3826 0.3697 0.3697 5.27e-18
7 4h60:A 120 119 0.3304 0.3167 0.3193 8.70e-18
8 3nnn:A 119 115 0.3391 0.3277 0.3391 1.14e-17 3nnn:B
9 1srr:C 121 115 0.3565 0.3388 0.3565 1.47e-17 1f51:E, 2ftk:E, 2ftk:F, 2ftk:G, 2ftk:H, 1pey:A, 1pey:B, 1pey:C, 3q15:C, 1srr:A
10 1j56:A 124 117 0.3391 0.3145 0.3333 4.26e-16 1krx:A
11 7cci:B 134 116 0.3478 0.2985 0.3448 2.22e-15 7cci:A, 5xjp:A
12 3q15:D 100 113 0.3391 0.3900 0.3451 5.13e-15
13 1s8n:A 190 111 0.4000 0.2421 0.4144 8.50e-15
14 6ont:A 121 114 0.2957 0.2810 0.2982 1.11e-14
15 6swl:A 133 119 0.3913 0.3383 0.3782 1.11e-14 6swl:B
16 8jo2:H 219 115 0.3130 0.1644 0.3130 1.93e-14 8jo2:I, 4s04:A, 4s04:B, 4s04:E, 4s04:F, 4s05:A, 4s05:B, 3w9s:A, 3w9s:B
17 6c40:D 118 116 0.3304 0.3220 0.3276 5.74e-14 6c40:B, 4iga:A, 3tmy:A, 3tmy:B, 4tmy:A, 4tmy:B
18 6rgz:D 122 118 0.3739 0.3525 0.3644 6.22e-14 6azr:B, 6azr:D, 3gl9:A, 3gl9:B, 3gl9:C, 3gl9:D, 4ja2:A, 4jas:B, 4jav:C, 4jav:D, 6rfv:C, 6rfv:D, 6rgy:C, 6rgy:D, 6rgz:C, 6rh0:C, 6rh0:D, 5uht:B, 5uht:D
19 6qrj:A 463 111 0.3130 0.0778 0.3243 1.19e-13 6qrl:A, 6qrl:B
20 7lza:A 219 106 0.3130 0.1644 0.3396 2.45e-13 7lz9:A
21 6br7:B 125 117 0.3130 0.2880 0.3077 3.19e-13 6br7:A, 6vbf:A, 6vbf:B
22 2iyn:B 124 118 0.3043 0.2823 0.2966 4.75e-13 2iyn:A, 2iyn:C, 1zes:A, 1zes:B, 1zes:C
23 3rvr:B 131 118 0.3391 0.2977 0.3305 5.40e-13 1a0o:A, 1a0o:C, 1a0o:E, 1a0o:G, 2b1j:A, 2b1j:B, 1bdj:A, 1chn:A, 2che:A, 3chy:A, 5chy:A, 5d2c:A, 5d2c:B, 5dgc:A, 5dgc:B, 5dkf:A, 5dkf:B, 1f4v:A, 1f4v:B, 1f4v:C, 3f7n:A, 3f7n:B, 1ffg:A, 1ffg:C, 1ffs:A, 1ffs:C, 1ffw:A, 1ffw:C, 3fft:A, 3fft:B, 3ffw:A, 3ffw:B, 3ffx:A, 3ffx:B, 3fgz:A, 3fgz:B, 2fka:A, 2flk:A, 2flw:A, 2fmf:A, 2fmh:A, 2fmi:A, 2fmk:A, 1fqw:A, 1fqw:B, 1kmi:Y, 1mih:A, 1mih:B, 3myy:A, 3myy:B, 3olv:A, 3olv:B, 3olw:A, 3olw:B, 3olx:A, 3olx:B, 3oly:A, 3oly:B, 3oo0:A, 3oo0:B, 3oo1:A, 3oo1:B, 2pl9:A, 2pl9:B, 2pl9:C, 2pmc:A, 2pmc:B, 3rvj:A, 3rvj:B, 3rvk:A, 3rvl:A, 3rvl:B, 3rvm:A, 3rvn:A, 3rvn:B, 3rvo:A, 3rvp:A, 3rvp:B, 3rvq:A, 3rvr:A, 3rvs:A, 3rvs:B, 6tg7:A, 1u8t:A, 1u8t:B, 1ymv:A, 1zdm:A, 1zdm:B
24 2pl1:A 121 115 0.3043 0.2893 0.3043 5.45e-13
25 3nns:A 117 117 0.3652 0.3590 0.3590 6.05e-13 3nns:B
26 2oqr:A 226 114 0.2957 0.1504 0.2982 1.23e-12
27 7w9h:B 122 114 0.2957 0.2787 0.2982 1.68e-12 7w9h:A
28 1xhf:B 122 115 0.3391 0.3197 0.3391 2.22e-12 1xhf:A
29 4b09:A 218 116 0.3217 0.1697 0.3190 2.84e-12 4b09:B, 4b09:C, 4b09:D, 4b09:E, 4b09:F, 4b09:G, 4b09:I, 4b09:K
30 4hnq:A 124 118 0.3130 0.2903 0.3051 3.10e-12 4hns:A, 4jp1:A, 4lx8:A, 3to5:A
31 8tef:A 516 78 0.2783 0.0620 0.4103 5.61e-12 8p6f:A, 8p6f:B, 8ted:A, 8ted:B, 8tef:B, 8tef:C, 8tef:D, 8tff:A, 8tff:B, 8tfm:A, 8tfm:B, 8thp:A, 8thp:B
32 4qpj:D 121 117 0.2870 0.2727 0.2821 8.04e-12
33 1ys6:B 227 109 0.3130 0.1586 0.3303 1.05e-11 1ys6:A, 1ys7:A, 1ys7:B
34 2gwr:A 225 103 0.2957 0.1511 0.3301 1.78e-11 3nhz:B, 3nhz:C, 3nhz:D
35 6ww6:B 192 104 0.3043 0.1823 0.3365 2.93e-10 6wsh:A, 6wsh:B, 6ww6:A
36 3dzd:A 368 108 0.3043 0.0951 0.3241 3.20e-10 3dzd:B
37 3hzh:A 134 113 0.3043 0.2612 0.3097 3.30e-10
38 4zmr:A 207 117 0.2957 0.1643 0.2906 3.50e-10 4e7o:A, 4e7o:B, 4e7p:A, 4e7p:B, 4zmr:B, 4zms:A, 4zms:B
39 7qz2:B 132 119 0.2957 0.2576 0.2857 4.27e-10 7qz2:A
40 3gwg:A 123 119 0.3304 0.3089 0.3193 5.62e-10 3h1e:A, 3h1g:A
41 8uvx:A 222 117 0.2870 0.1486 0.2821 6.38e-10 8uvk:A, 8uvk:B, 8uvx:B
42 4kny:B 226 117 0.2957 0.1504 0.2906 6.66e-10 4kfc:A, 4kfc:B, 4kny:A, 1zh2:A, 1zh2:B, 1zh4:A, 1zh4:B
43 7od9:B 129 117 0.3043 0.2713 0.2991 7.32e-10 6ekg:Y, 6ekh:Y, 7od9:A
44 7p8e:A 126 122 0.3304 0.3016 0.3115 8.83e-10
45 3cg4:A 126 114 0.3130 0.2857 0.3158 1.25e-09
46 7p8d:A 139 126 0.3565 0.2950 0.3254 2.96e-09 7p8d:B
47 3rqi:A 170 108 0.2609 0.1765 0.2778 3.12e-09
48 4euk:A 136 133 0.3217 0.2721 0.2782 3.81e-09
49 1l5y:B 151 112 0.2348 0.1788 0.2411 4.39e-09 1l5y:A
50 1yio:A 198 101 0.2348 0.1364 0.2673 4.50e-09 1zn2:A
51 8svz:A 120 117 0.2957 0.2833 0.2906 5.10e-09 8svz:B
52 5m7o:A 448 108 0.3043 0.0781 0.3241 5.11e-09 4d6y:A, 4d6y:B, 5m7n:A, 5m7o:B, 5m7p:A, 5m7p:B
53 1mav:A 117 114 0.2783 0.2735 0.2807 2.55e-08 1mb0:A, 1mb3:A
54 2v0n:A 459 85 0.3130 0.0784 0.4235 3.03e-08 2v0n:B, 1w25:A, 1w25:B, 2wb4:A, 2wb4:B
55 3hdg:A 124 81 0.2261 0.2097 0.3210 3.97e-08 3hdg:B, 3hdg:D, 3hdg:E
56 1qmp:A 126 119 0.2870 0.2619 0.2773 5.25e-08 1qmp:B, 1qmp:C, 1qmp:D
57 7cfw:A 123 114 0.2522 0.2358 0.2544 5.47e-08 7c1j:A
58 5m7n:B 428 106 0.2957 0.0794 0.3208 7.11e-08
59 7pv7:C 514 117 0.2870 0.0642 0.2821 1.12e-07 7pv7:D, 7pv7:B, 7pv7:A, 7pva:A, 7pva:B, 7pva:C, 7pva:D, 7pvk:A, 7pvk:D, 7pvk:B, 7pvk:C
60 5lwk:A 122 117 0.2522 0.2377 0.2479 1.35e-07 5lwk:B
61 4uhk:A 130 118 0.3478 0.3077 0.3390 2.55e-07 4uhj:A, 4uhj:B, 4uhj:C, 4uhk:B, 4uhk:C, 4uhs:B, 4uhs:C
62 2jk1:A 138 88 0.2261 0.1884 0.2955 3.45e-07 2vui:B
63 8t85:A 335 80 0.2261 0.0776 0.3250 4.77e-07 7lcm:A
64 8pdc:A 122 119 0.2870 0.2705 0.2773 4.91e-07
65 8phx:C 130 124 0.3217 0.2846 0.2984 1.66e-06 8phx:A, 8phx:B, 8phx:D
66 2r25:B 133 88 0.2609 0.2256 0.3409 2.18e-06
67 8phn:A 124 119 0.2609 0.2419 0.2521 2.42e-06
68 6oec:L 162 104 0.2870 0.2037 0.3173 3.25e-06 6oec:B, 6oec:C, 6oec:E, 6oec:F, 6oec:G, 6oec:I
69 3m6m:D 118 66 0.1913 0.1864 0.3333 6.87e-06 3m6m:E, 3m6m:F
70 2m98:A 123 81 0.2348 0.2195 0.3333 2.73e-05
71 1ny5:B 385 114 0.2522 0.0753 0.2544 3.20e-05 4bs1:A, 4bs1:B, 4bt0:A, 4bt0:B, 4bt1:A, 4bt1:B, 4ly6:A, 4ly6:B, 4ly6:C, 4ly6:D, 4ly6:E, 4ly6:G, 4ly6:H, 4ly6:I, 4ly6:J, 4ly6:K, 4ly6:L, 4ly6:M, 4ly6:N, 4ly6:O, 4ly6:P, 4ly6:Q, 4ly6:R, 4ly6:S, 4ly6:T, 4ly6:U, 4ly6:V, 4ly6:W, 4ly6:X, 4lzz:A, 4lzz:B, 4lzz:C, 4lzz:D, 4lzz:E, 4lzz:F, 4lzz:G, 4lzz:H, 4lzz:I, 4lzz:J, 4lzz:K, 4lzz:L, 4lzz:M, 4lzz:N, 4lzz:O, 4lzz:P, 4lzz:Q, 4lzz:R, 4lzz:S, 4lzz:T, 4lzz:U, 4lzz:V, 4lzz:W, 4lzz:X, 3m0e:A, 3m0e:B, 3m0e:C, 3m0e:D, 3m0e:E, 3m0e:F, 3m0e:G, 1ny5:A, 1ny6:A, 1ny6:B, 1ny6:C, 1ny6:D, 1ny6:E, 1ny6:F, 1ny6:G, 1ny6:H, 1ny6:I, 1ny6:J, 1ny6:K, 1ny6:L, 1ny6:M, 1ny6:N, 1zy2:A
72 5xt2:B 204 79 0.1565 0.0882 0.2278 3.75e-05 5xt2:A, 5xt2:C, 5xt2:D, 5xt2:E
73 4nic:A 117 102 0.2261 0.2222 0.2549 4.75e-05 4nic:B, 4nic:C, 4nic:D
74 4ldz:A 196 90 0.2261 0.1327 0.2889 6.22e-05 5iuk:C, 5iul:C, 5iul:F, 4ldz:B, 4le0:A, 4le0:B, 7ssj:B, 7ssj:E, 7ssj:F
75 5brj:A 140 129 0.2783 0.2286 0.2481 6.31e-05
76 5n2n:A 149 123 0.2957 0.2282 0.2764 6.40e-05 3mmn:A
77 5wq0:D 129 90 0.2435 0.2171 0.3111 7.06e-05 5wq0:B, 5wq0:A, 5wq0:C, 5wq0:E, 5wq0:F, 5wq0:G
78 5hev:F 210 84 0.2261 0.1238 0.3095 8.62e-05 5hev:A, 5hev:B, 5hev:C
79 4if4:A 208 117 0.2522 0.1394 0.2479 1.18e-04 4if4:B, 4if4:C, 4if4:D, 7ve5:B, 7ve5:A, 7ve6:A, 7ve6:B
80 7e1b:A 209 116 0.2957 0.1627 0.2931 1.22e-04 7e1b:B, 7e1b:C, 7e1b:H, 7e1b:D, 7e1b:E, 7e1b:F, 7e1b:G, 7e1h:A, 7e1h:B, 7e1h:E
81 6zxb:A 293 104 0.2435 0.0956 0.2692 5.40e-04 6zxb:B, 6zxc:A, 6zxc:B, 6zxc:C, 6zxc:D, 6zxm:A, 6zxm:B, 6zxm:C, 6zxm:D, 6zxm:E, 6zxm:F
82 5ic5:A 166 129 0.2696 0.1867 0.2403 0.001
83 1k68:A 140 124 0.3130 0.2571 0.2903 0.003 1k68:B
84 6ob8:A 307 62 0.1739 0.0651 0.3226 0.007 6oap:A, 6oap:B, 6oaq:A, 6oaq:B, 6ob8:B
85 3luf:B 246 113 0.2261 0.1057 0.2301 0.010 3luf:A, 3mf4:A, 3mf4:B
86 3luf:B 246 57 0.1565 0.0732 0.3158 0.41 3luf:A, 3mf4:A, 3mf4:B
87 4g97:A 243 116 0.2522 0.1193 0.2500 0.010
88 4yn8:A 201 82 0.1826 0.1045 0.2561 0.014
89 6xvu:D 141 126 0.2957 0.2411 0.2698 0.017 6xvu:A, 6xvu:C, 6xvu:B
90 1dck:B 125 78 0.1652 0.1520 0.2436 0.053 1dck:A, 1dcm:B
91 1jlk:A 141 75 0.2000 0.1631 0.3067 0.17
92 7pfp:A 563 34 0.1304 0.0266 0.4412 0.57 7pfp:C, 7q3n:U
93 4wrn:A 693 34 0.1304 0.0216 0.4412 0.66 7pfp:B
94 4wrn:B 663 34 0.1304 0.0226 0.4412 0.71
95 7epe:A 389 49 0.1304 0.0386 0.3061 1.6 7epf:A
96 5zkp:A 436 49 0.1304 0.0344 0.3061 1.6
97 5tgz:A 439 49 0.1304 0.0342 0.3061 1.6 7v3z:A, 5xr8:A, 5xra:A
98 6li0:A 441 49 0.1304 0.0340 0.3061 1.6 6li1:A
99 7k15:A 455 49 0.1304 0.0330 0.3061 1.7
100 5v57:A 645 49 0.1304 0.0233 0.3061 1.7 1akq:A, 1akr:A, 1akt:A, 1aku:A, 1akv:A, 1akw:A, 1azl:A, 1bu5:A, 1bu5:B, 1c7e:A, 1c7e:B, 1c7f:A, 1c7f:B, 1f4p:A, 1fx1:A, 2fx2:A, 3fx2:A, 4fx2:A, 5fx2:A, 1i1o:A, 1j8q:A, 1j9e:A, 1j9g:A, 5v56:A, 5v56:B, 5v57:B, 1wsb:A, 1wsw:A, 1xt6:A, 1xyv:A, 1xyy:A, 5yob:A, 5yoc:A, 5yoe:A, 5yog:A
101 7ddz:A 437 49 0.1304 0.0343 0.3061 1.7
102 1nui:A 242 74 0.1565 0.0744 0.2432 3.8 1nui:B
103 4bb9:A 596 97 0.2174 0.0419 0.2577 5.4 4bba:A, 4ly9:A, 4ly9:B, 4mqu:A, 4mqu:B, 4mro:A, 4mro:B, 4msu:A, 4msu:B, 4ohk:A, 4ohk:B, 4ohm:A, 4ohm:B, 4oho:A, 4oho:B, 4ohp:A, 4ohp:B, 4olh:A, 4olh:B, 4op1:A, 4op1:B, 4op2:A, 4op2:B, 4op3:A, 4op3:B, 4px2:A, 4px2:B, 4px3:A, 4px3:B, 4px5:A, 4px5:B, 4pxs:A, 4pxs:B
104 5bq2:A 425 31 0.0957 0.0259 0.3548 5.9 5bq2:B, 5bq2:C, 5bq2:D
105 6zu5:SL0 133 70 0.1826 0.1579 0.3000 6.5
106 7t4s:F 363 33 0.0783 0.0248 0.2727 9.1
107 3pzl:B 293 82 0.2000 0.0785 0.2805 9.4 3pzl:A, 3pzl:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218