Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MKQTVAAYIAKTLESAGVKRIWGVTGDSLNGLSDSLNRMGTIEWMSTRHEEVAAFAAGAEAQLSGELAVCAGSCGPGNLH
LINGLFDCHRNHVPVLAIAAHIPSSEIGSGYFQETHPQELFRECSHYCELVSSPEQIPQVLAIAMRKAVLNRGVSVVVLP
GDVALKPAPEGATMHWYHAPQPVVTPEEEELRKLAQLLRYSSNIALMCGSGCAGAHKELVEFAGKIKAPIVHALRGKEHV
EYDNPYDVGMTGLIGFSSGFHTMMNADTLVLLGTQFPYRAFYPTDAKIIQIDINPASIGAHSKVDMALVGDIKSTLRALL
PLVEEKADRKFLDKALEDYRDARKGLDDLAKPSEKAIHPQYLAQQISHFAADDAIFTCDVGTPTVWAARYLKMNGKRRLL
GSFNHGSMANAMPQALGAQATEPERQVVAMCGDGGFSMLMGDFLSVVQMKLPVKIVVFNNSVLGGTELHDTNFARIAEAC
GITGIRVEKASEVDEALQRAFSIDGPVLVDVVVAKEELA

The query sequence (length=519) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3ey9:A 571 532 0.9981 0.9072 0.9737 0.0 3ey9:B, 3eya:A, 3eya:B, 3eya:C, 3eya:D, 3eya:E, 3eya:F, 3eya:G, 3eya:H, 3eya:I, 3eya:J, 3eya:K, 3eya:L
2 9ev3:A 577 536 0.4740 0.4263 0.4590 2.14e-146 9ev5:A, 9ev5:B, 9ev5:C, 9ev5:D, 9ev6:A, 9ev6:B, 9ev6:C, 9ev6:D
3 9ev4:A 553 522 0.4682 0.4394 0.4655 8.58e-146
4 4fee:A 586 534 0.3160 0.2799 0.3071 1.04e-76 2ez4:A, 2ez4:B, 2ez8:A, 2ez8:B, 2ez9:A, 2ez9:B, 2ezt:A, 2ezt:B, 2ezu:A, 2ezu:B, 4fee:B, 4feg:A, 4feg:B, 6haf:A, 6haf:B, 4kgd:A, 4kgd:B, 1pow:A, 1pow:B, 1pox:A, 1pox:B, 1y9d:B
5 2dji:A 590 523 0.3083 0.2712 0.3059 1.80e-76 1v5e:A, 1v5f:A, 1v5g:A
6 1y9d:D 560 526 0.3141 0.2911 0.3099 9.90e-73 1y9d:A, 1y9d:C
7 5k2o:A 585 549 0.2987 0.2650 0.2823 1.67e-60 3e9y:A, 3ea4:A, 8et4:A, 8et5:A, 5k3s:A, 5k6q:A, 5k6r:A, 5k6t:A, 7stq:A, 7tzz:A, 7u1d:A, 7u1u:A, 7u25:A, 6u9h:A, 6u9h:B, 6u9h:H, 6u9h:I, 6u9h:L, 6u9h:M, 6u9h:P, 6u9h:Q, 6vz8:E, 6vz8:I, 6vz8:M, 6vz8:Q, 5wj1:A, 1ybh:A, 1yhy:A, 1yhz:A, 1yi0:A, 1yi1:A, 1z8n:A
8 6lpi:B 539 542 0.2929 0.2820 0.2804 3.85e-56 6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
9 6vz8:D 531 538 0.2871 0.2806 0.2770 1.57e-55 6vz8:H, 6vz8:L, 6vz8:P
10 6deq:A 601 536 0.2620 0.2263 0.2537 2.01e-49 6dek:A, 6del:A, 6dem:A, 6den:A, 6deo:A, 6dep:A, 6der:A, 6des:A
11 1t9b:A 583 539 0.2640 0.2350 0.2542 2.27e-47 1t9d:B, 1t9d:C
12 6u9d:B 607 547 0.2659 0.2273 0.2523 3.15e-47 6bd3:A, 6bd3:B, 6bd9:A, 6bd9:B, 5fem:A, 5fem:B, 5ims:A, 5ims:B, 1jsc:A, 1jsc:B, 1n0h:A, 1n0h:B, 1t9a:A, 1t9a:B, 1t9b:B, 1t9c:A, 1t9c:B, 1t9d:A, 1t9d:D, 6u9d:A, 6u9d:E, 6u9d:F, 6u9d:I, 6u9d:J, 6u9d:M, 6u9d:N, 6u9d:Q, 6u9d:U, 6u9d:V, 5wkc:A, 5wkc:D, 5wkc:B, 5wkc:E
13 7egv:A 590 546 0.2620 0.2305 0.2491 3.95e-43 7egv:B, 7ehe:A, 7ehe:B
14 6wo1:A 551 528 0.2370 0.2232 0.2330 1.44e-41
15 5dx6:B 557 531 0.2717 0.2531 0.2655 1.53e-41 5d6r:B, 5d6r:M, 5dx6:A, 1ozf:A, 1ozf:B, 1ozg:A, 1ozg:B, 1ozh:A, 1ozh:B, 1ozh:C, 1ozh:D, 5wdg:A, 5wdg:B
16 8i01:A 594 548 0.2620 0.2290 0.2482 7.00e-38 8beo:A, 8beo:B, 8beo:C, 8beo:E, 8beo:D, 8beo:F, 8i01:B, 8i01:C, 8i01:E, 8i01:D, 8i01:F, 8i05:A, 8i05:B, 8i05:C, 8i05:E, 8i05:D, 8i05:F, 8i07:A, 8i07:B, 8i07:C, 8i07:E, 8i07:D, 8i07:F, 8i08:A, 8i08:B, 8i08:C, 8i08:E, 8i08:D, 8i08:F, 2pan:A, 2pan:B, 2pan:C, 2pan:D, 2pan:E, 2pan:F
17 4rji:C 555 538 0.2620 0.2450 0.2528 2.38e-37 4rji:A, 4rji:B, 4rji:D, 4rjj:A, 4rjj:B, 4rjj:C, 4rjj:D, 4rjj:E, 4rjj:F, 4rjj:G, 4rjj:H, 4rjk:A, 4rjk:B, 4rjk:C, 4rjk:D, 4rjk:E, 4rjk:F, 4rjk:G, 4rjk:H
18 6xn8:A 540 549 0.2505 0.2407 0.2368 1.12e-35 6xn8:B
19 7pt4:B 584 548 0.2505 0.2226 0.2372 4.33e-31 7pt1:A, 7pt1:B, 7pt2:A, 7pt2:B, 7pt3:A, 7pt3:B, 7pt4:A
20 5ahk:A 555 477 0.2274 0.2126 0.2474 8.91e-28 5ahk:B
21 8rph:D 608 562 0.2408 0.2056 0.2224 4.24e-26 8rph:A, 8rph:B, 8rph:C, 8rph:E, 8rpi:A, 8rpi:B, 8rpi:C, 8rpi:D, 8rpi:E, 8rpi:F, 8rpj:A, 8rpj:B, 8rpj:C, 8rpj:E, 8rpj:D, 8rpj:F
22 4d5e:B 587 549 0.2408 0.2129 0.2277 3.50e-24 4d5e:A, 4d5g:A, 4d5g:B, 2pgn:A, 2pgn:B, 2pgo:A, 2pgo:B
23 2q28:A 550 540 0.2331 0.2200 0.2241 3.14e-21 2q27:A, 2q27:B, 2q28:B, 2q29:A, 2q29:B
24 4qq8:C 569 559 0.2466 0.2250 0.2290 1.60e-20 2ag0:A, 2ag0:B, 2ag0:C, 2ag0:D, 2ag1:A, 2ag1:B, 2ag1:C, 2ag1:D, 3d7k:A, 3d7k:B, 3iae:A, 3iae:B, 3iaf:A, 3iaf:B, 3iaf:C, 3iaf:D, 4qpz:A, 4qpz:B, 4qpz:C, 4qpz:D, 4qpz:E, 4qpz:F, 4qpz:G, 4qpz:H, 4qq8:A, 4qq8:B, 4qq8:D, 2uz1:A, 2uz1:B, 2uz1:C, 2uz1:D
25 7orx:CCC 531 549 0.2351 0.2298 0.2222 1.59e-19 7orx:AAA, 7orx:BBB, 7orx:DDD
26 6a50:A 527 354 0.1676 0.1651 0.2458 6.17e-18 6a50:B, 1bfd:A, 5dei:A, 5dei:C, 5dei:D, 5dei:B, 5dgd:A, 5dgt:A, 3f6b:X, 3f6e:X, 2fn3:A, 3fsj:X, 2fwn:A, 3fzn:A, 3fzn:B, 3fzn:D, 3fzn:C, 4gg1:A, 4gm0:A, 4gm1:A, 4gm4:A, 4gp9:A, 4gpe:A, 4jd5:A, 4ju8:A, 4ju9:A, 4jua:A, 4jub:A, 4jub:D, 4jub:B, 4jub:C, 4juc:A, 4juc:C, 4juc:B, 4juc:D, 4jud:X, 4juf:A, 4juf:C, 4juf:B, 4juf:D, 4k9k:A, 4k9l:A, 4k9m:A, 4k9n:A, 4k9n:C, 4k9n:B, 4k9n:D, 4k9o:A, 4k9o:C, 4k9o:B, 4k9o:D, 4k9p:A, 4k9p:C, 4k9p:B, 4k9p:D, 6m2y:A, 6m2z:A, 1mcz:A, 1mcz:B, 1mcz:C, 1mcz:D, 1mcz:E, 1mcz:F, 1mcz:G, 1mcz:H, 1mcz:I, 1mcz:J, 1mcz:K, 1mcz:L, 1mcz:M, 1mcz:N, 1mcz:O, 1mcz:P, 4mpj:A, 4mpp:A, 4mpr:A, 4mq5:A, 4mzx:A, 1pi3:A, 1po7:A, 1q6z:A, 4qel:A, 2v3w:A, 2v3w:C, 2v3w:B, 2v3w:D, 1yno:A
27 5npu:A 547 552 0.2408 0.2285 0.2264 1.73e-16 5npu:B, 5npu:C, 5npu:D
28 6qsi:A 525 499 0.2235 0.2210 0.2325 2.63e-16 6qsi:B
29 6vgs:BBB 543 514 0.2197 0.2099 0.2218 3.12e-16 6vgs:AAA, 6vgs:CCC, 6vgs:DDD
30 2vbf:B 546 515 0.2139 0.2033 0.2155 6.27e-16 2vbf:A, 2vbg:A, 2vbg:B
31 2ji6:A 559 542 0.2389 0.2218 0.2288 6.92e-15 2c31:A, 2c31:B, 2ji6:B, 2ji7:A, 2ji7:B, 2ji8:A, 2ji8:B, 2ji9:A, 2ji9:B, 2jib:A, 2jib:B
32 2ihv:A 563 527 0.2370 0.2185 0.2334 1.16e-14 2iht:A, 2iht:B, 2iht:C, 2iht:D, 2ihu:A, 2ihu:B, 2ihu:C, 2ihu:D, 2ihv:B, 2ihv:C, 2ihv:D, 1upa:A, 1upa:B, 1upa:C, 1upa:D, 1upb:A, 1upb:B, 1upb:C, 1upb:D, 1upc:A, 1upc:B, 1upc:C, 1upc:D, 1upc:E, 1upc:F
33 2q5l:A 538 523 0.2139 0.2063 0.2122 5.40e-14 2nxw:A, 2nxw:B, 2q5j:A, 2q5j:B, 2q5l:B, 2q5o:A, 2q5o:B, 2q5q:A, 2q5q:B
34 5tma:A 567 560 0.2370 0.2169 0.2196 8.25e-14 3oe1:A, 3oe1:B, 3oe1:C, 3oe1:D, 5tma:B, 2wva:A, 2wva:B, 2wva:E, 2wva:F, 2wva:V, 2wva:Z, 2wva:X, 2wva:Y, 2wvg:A, 2wvg:B, 2wvg:E, 2wvg:F, 1zpd:A, 1zpd:B, 1zpd:E, 1zpd:F, 4zp1:A, 4zp1:B, 4zp1:C, 4zp1:D
35 6u9d:R 416 346 0.1484 0.1851 0.2225 1.01e-13
36 6u9d:R 416 33 0.0250 0.0312 0.3939 2.8
37 4q9d:B 519 486 0.2216 0.2216 0.2366 2.53e-13 4q9d:A
38 8hp4:A 540 453 0.1792 0.1722 0.2053 6.73e-12 8hp4:B
39 8rph:F 520 184 0.0867 0.0865 0.2446 1.84e-11
40 8rph:F 520 193 0.0809 0.0808 0.2176 7.40e-05
41 5euj:E 556 550 0.2197 0.2050 0.2073 1.24e-10 5euj:A, 5euj:B, 5euj:C, 5euj:D, 5euj:F, 5euj:G, 5euj:H, 5euj:I, 5euj:J, 5euj:K, 5euj:L, 5euj:M, 5euj:N, 5euj:O, 5euj:P, 5euj:Q, 5euj:R, 5euj:S, 5euj:T, 5euj:U, 5euj:V, 5euj:W, 5euj:X
42 1ovm:A 535 560 0.2351 0.2280 0.2179 5.03e-10 1ovm:B, 1ovm:C, 1ovm:D
43 7b2e:A 548 548 0.2486 0.2354 0.2354 1.27e-09 7ayg:A, 7ayg:B, 7ayg:C, 7ayg:D, 7ayg:E, 7ayg:F, 7ayg:G, 7ayg:H, 7b2e:B, 7b2e:C, 7b2e:D, 7b2e:E, 7b2e:F, 7b2e:G, 7b2e:H
44 6efg:D 537 491 0.1946 0.1881 0.2057 7.87e-09 6efg:A, 6efg:B
45 4k9q:A 531 360 0.1561 0.1525 0.2250 1.51e-08 4k9q:B
46 2vjy:A 562 501 0.1965 0.1815 0.2036 4.58e-08 6efg:E, 6efh:A, 6efh:B, 2vjy:B, 2vjy:C, 2vjy:D, 2vk4:A, 2vk4:B, 2vk4:C, 2vk4:D
47 2vbi:A 554 564 0.2274 0.2130 0.2092 1.11e-06 2vbi:B, 2vbi:C, 2vbi:D, 2vbi:E, 2vbi:F, 2vbi:G, 2vbi:H
48 4cok:B 549 174 0.0848 0.0801 0.2529 8.69e-06 4cok:A
49 2vk1:A 562 503 0.1811 0.1673 0.1869 8.53e-04 1pvd:A, 1pvd:B, 1pyd:A, 1pyd:B, 1qpb:A, 1qpb:B, 2vk1:B, 2vk1:C, 2vk1:D, 2vk8:A, 2vk8:B, 2vk8:C, 2vk8:D, 2w93:A, 2w93:B, 2w93:C, 2w93:D
50 3dv0:E 344 119 0.0674 0.1017 0.2941 0.042 1w88:A, 1w88:C, 1w88:E, 1w88:G
51 5b47:B 275 112 0.0597 0.1127 0.2768 0.043
52 5b46:B 301 54 0.0328 0.0565 0.3148 0.29
53 7tuv:A 672 44 0.0328 0.0253 0.3864 2.2
54 3fzx:A 212 17 0.0231 0.0566 0.7059 2.3
55 6rxt:CT 131 40 0.0270 0.1069 0.3500 2.5 5oql:k, 6rxu:CT, 6rxv:CT, 6rxx:CT, 6rxy:CT, 6rxz:CT
56 7t5a:A 230 49 0.0347 0.0783 0.3673 3.4 7t50:A, 7t50:B, 7t51:A, 7t51:B, 7t5a:B
57 6xxg:BBB 539 114 0.0578 0.0557 0.2632 3.8 2o1x:C, 2o1x:D
58 6xxg:AAA 560 114 0.0520 0.0482 0.2368 5.2 6ouw:A
59 3eu9:A 232 74 0.0366 0.0819 0.2568 5.4 5w7i:A, 5w7i:C, 5w7j:A, 5w7j:C
60 8bie:A 318 64 0.0270 0.0440 0.2188 5.9 8bie:B, 8bij:A, 8bij:B
61 8jjr:F 225 76 0.0443 0.1022 0.3026 7.3
62 2wpb:A 302 55 0.0328 0.0563 0.3091 7.4 4bwl:A, 4bwl:B, 4bwl:C, 4bwl:D, 1fdy:A, 1fdy:B, 1fdy:C, 1fdy:D, 1fdz:A, 1fdz:B, 1fdz:C, 1fdz:D, 1hl2:A, 1hl2:B, 1hl2:C, 1hl2:D, 3lbc:D, 3lcw:A, 3lcw:B, 3lcw:C, 3lcw:D, 4uui:A, 4uui:B, 4uui:C, 4uui:D, 2wkj:C, 2wkj:D, 2wpb:B, 2wpb:C, 2wpb:D, 2xfw:A, 2xfw:B, 2xfw:C, 2xfw:D
63 3of1:A 246 52 0.0289 0.0610 0.2885 7.8
64 7yzi:A 378 101 0.0462 0.0635 0.2376 8.3 4p2x:A, 7yz9:A, 7yzi:B, 7yzk:A, 7yzk:B
65 5z99:A 485 60 0.0347 0.0371 0.3000 8.6 5yyb:A, 5yyb:B
66 8ppt:A 447 45 0.0366 0.0425 0.4222 8.7 6hmf:A, 6hmf:B, 5ihe:A, 5ihe:B, 8ppu:A, 8ppv:A, 6t8h:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218