BioLiP

>protein
MKPVTLYDVAEYAGVSYQTVSRVVNQASHVSAKTREKVEAAMAELNYIPNRCAQQLAGKQSL

The query sequence (length=62) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1lbg:A	357	62	0.9839	0.1709	0.9839	5.85e-37	2bjc:A, 2bjc:B, 1cjg:A, 1cjg:B, 1efa:A, 1efa:B, 1efa:C, 1jwl:B, 1jwl:A, 1jwl:C, 2kei:A, 2kei:B, 2kej:A, 2kej:B, 2kek:A, 2kek:B, 1l1m:A, 1l1m:B, 1lbg:D, 1lbh:A, 1lbh:B, 1lbh:C, 1lbh:D, 1lcc:A, 1lcd:A, 1osl:A, 1osl:B, 2p9h:A, 2p9h:B, 2paf:A, 2paf:B, 2pe5:A, 2pe5:B, 2pe5:C, 4rzt:A, 4rzt:B, 4rzt:C, 4rzt:D, 1tlf:A, 1tlf:B, 1tlf:C, 1tlf:D
2	3oqo:A	333	58	0.4677	0.0871	0.5000	2.10e-10	3oqm:A, 3oqm:C, 3oqn:A, 3oqn:C, 3oqo:C
3	1rzr:G	332	58	0.4677	0.0873	0.5000	6.26e-10	2jcg:A, 2nzu:G, 2nzv:G, 1rzr:C, 1rzr:A, 1rzr:D, 1sxg:B, 1zvv:A, 1zvv:B, 1zvv:G
4	5ysz:A	327	53	0.4355	0.0826	0.5094	1.43e-09
5	1jft:A	340	52	0.3871	0.0706	0.4615	4.94e-07	1bdh:A, 1bdi:A, 1jfs:A, 1jh9:A, 1pnr:A, 2pua:A, 2pub:A, 2puc:A, 2pud:A, 2pue:A, 2puf:A, 2pug:A, 1qp0:A, 1qp4:A, 1qp7:A, 1qpz:A, 1qqa:A, 1qqb:A, 1vpw:A, 1wet:A, 1zay:A
6	7ce1:S	259	52	0.2903	0.0695	0.3462	1.46e-04
7	7ce1:T	292	52	0.2903	0.0616	0.3462	1.53e-04
8	7ce1:K	333	52	0.2903	0.0541	0.3462	1.54e-04	7cdx:A, 7cdx:B, 7ce1:A, 7ce1:B, 7ce1:C, 7ce1:D, 7ce1:G, 7ce1:H, 7ce1:L, 7ce1:O, 7ce1:P
9	3tw1:A	222	43	0.2258	0.0631	0.3256	0.10
10	5ui5:V	323	25	0.1774	0.0341	0.4400	0.72	2o8k:A, 2o9l:A, 5ui5:I
11	5nss:M	388	26	0.1774	0.0284	0.4231	1.1	6gfw:M, 6gh5:M, 5nsr:M
12	7qv9:M	417	26	0.1774	0.0264	0.4231	1.4	8f1i:M, 8f1j:M, 8f1k:M, 7qwp:M, 7qxi:M, 8re4:M, 8rea:M
13	8reb:M	350	26	0.1774	0.0314	0.4231	1.9	8rec:M, 8red:M, 8ree:M
14	4i2o:A	198	24	0.1452	0.0455	0.3750	2.1	4i2o:B
15	6gh6:M	315	26	0.1774	0.0349	0.4231	3.1
16	6iub:A	264	26	0.1290	0.0303	0.3077	3.5	6iub:B, 6iuc:A, 6iuc:B, 6iuc:C, 6iuc:D, 6iud:B, 6iud:C, 6iud:D, 6iud:A, 8jmj:A, 8jmj:B, 8jmj:C, 8jmj:D, 8jmk:A, 8jmk:B, 8jmk:C, 8jmk:D, 8jml:A, 8jml:B
17	4axs:A	291	39	0.1935	0.0412	0.3077	5.3
18	6sga:Fd	96	28	0.1613	0.1042	0.3571	6.3	7pua:Fd, 6sgb:Fd
19	2iie:A	204	32	0.1774	0.0539	0.3438	7.2	2ht0:A, 1ihf:A, 2iif:A, 5j0n:I, 5j0n:K, 1ouz:A, 1owf:A, 1owg:A, 5wfe:K
20	3uk6:L	233	27	0.1452	0.0386	0.3333	7.8
21	3wnb:A	361	16	0.1613	0.0277	0.6250	7.9	3wnc:A
22	6qex:A	1182	54	0.2419	0.0127	0.2778	8.0	7a65:A, 7a69:A, 7a6c:A, 7a6e:A, 7a6f:A, 6c0v:A, 7o9w:A
23	5gmd:A	325	38	0.1774	0.0338	0.2895	8.5	5gme:A

[Back]