Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKNNGGARVVVIGAGFVGASYVFALMNQGIADEIVLIDANESKAIGDAMDFNHGKVFAPKPVDIWHGDYDDCRDADLVVI
CAGANQKPGETRLDLVDKNIAIFRSIVESVMASGFQGLFLVATNPVDILTYATWKFSGLPHERVIGSGTILDTARFRFLL
GEYFSVAPQNVHAYIIGEHGDTELPVWSQAYIGVMPIRKLVESKGEEAQKDLERIFVNVRDAAYQIIEKKGATYYGIAMG
LARVTRAILHNENAILTVSAYLDGLYGERDVYIGVPAVINRNGIREVIEIELNDDEKNRFHHSAATLKSVLARAFT

The query sequence (length=316) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1ldn:A 316 316 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1ldn:C, 1ldn:B, 1ldn:D, 1ldn:E, 1ldn:F, 1ldn:H, 1ldn:G, 2ldb:A, 2ldb:B, 2ldb:C, 2ldb:D
2 1ldb:A 294 316 0.9272 0.9966 0.9272 0.0
3 3pqd:B 312 308 0.6677 0.6763 0.6851 3.23e-162 3pqd:A, 3pqd:C, 3pqd:D, 3pqd:F, 3pqd:H, 3pqd:E, 3pqd:G, 3pqf:C, 3pqf:D
4 4ln1:B 321 310 0.6171 0.6075 0.6290 1.89e-153 4ln1:A, 4ln1:C, 4ln1:D
5 3h3j:B 314 309 0.6424 0.6465 0.6570 1.61e-148 3d4p:A, 3d4p:B, 3h3j:A
6 3wsw:A 316 304 0.5000 0.5000 0.5197 3.96e-120 3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
7 1llc:A 320 308 0.5380 0.5312 0.5519 4.21e-119 6j9t:B, 6j9t:D, 6j9t:E, 6j9t:C, 6j9t:F, 6j9u:A, 6j9u:C, 6j9u:D
8 1ez4:B 318 304 0.5222 0.5189 0.5428 3.98e-117 1ez4:A, 1ez4:C, 1ez4:D
9 2e37:C 310 302 0.4335 0.4419 0.4536 3.28e-89 2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
10 8ab3:A 330 309 0.4335 0.4152 0.4434 1.52e-86 8ab3:B, 8ab3:C, 8ab3:D
11 6h9s:B 292 304 0.4367 0.4726 0.4539 5.56e-85 6h9s:A
12 1a5z:A 312 304 0.3987 0.4038 0.4145 4.01e-81
13 1lld:A 313 308 0.3956 0.3994 0.4058 1.12e-78 1lld:B, 1lth:T, 1lth:R
14 4qsm:A 332 302 0.3608 0.3434 0.3775 3.55e-76 4aj1:A, 4aj1:B, 4aj1:C, 4aj1:D, 4aj2:A, 4aj2:B, 4aj2:C, 4aj2:D, 4aj4:A, 4aj4:B, 4aj4:C, 4aj4:D, 4aje:A, 4aje:B, 4aje:C, 4aje:D, 4ajh:A, 4ajh:B, 4ajh:C, 4ajh:D, 4aji:A, 4aji:B, 4aji:C, 4aji:D, 4ajj:A, 4ajj:B, 4ajj:C, 4ajj:D, 4ajk:A, 4ajk:B, 4ajk:C, 4ajk:D, 4ajl:A, 4ajl:B, 4ajl:C, 4ajl:D, 4ajn:A, 4ajn:B, 4ajn:C, 4ajn:D, 4ajo:A, 4ajo:B, 4ajo:C, 4ajo:D, 4ajp:A, 4ajp:B, 4ajp:C, 4ajp:D, 4al4:A, 4al4:B, 4al4:C, 4al4:D, 6bad:A, 6bad:B, 6bad:C, 6bad:D, 6bag:A, 6bag:B, 6bag:C, 6bag:D, 6bax:A, 6bax:B, 6bax:C, 6bax:D, 6baz:A, 6baz:B, 6baz:C, 6baz:D, 6bb0:A, 6bb0:B, 6bb0:C, 6bb0:D, 6bb1:A, 6bb1:B, 6bb1:C, 6bb1:D, 6bb1:E, 6bb1:F, 6bb1:G, 6bb1:H, 6bb2:A, 6bb2:B, 6bb2:C, 6bb2:D, 6bb2:E, 6bb2:F, 6bb2:G, 6bb2:H, 6bb3:A, 6bb3:B, 6bb3:C, 6bb3:D, 9bk2:A, 9bk2:D, 9bk3:D, 8fw6:A, 8fw6:B, 3h3f:A, 3h3f:B, 3h3f:C, 3h3f:D, 3h3f:E, 3h3f:F, 3h3f:G, 3h3f:H, 1i10:A, 1i10:B, 1i10:C, 1i10:D, 1i10:E, 1i10:F, 1i10:G, 1i10:H, 4i8x:A, 4i8x:B, 4i8x:C, 4i8x:D, 4i8x:E, 4i8x:F, 4i8x:G, 4i8x:H, 4i9h:A, 4i9h:B, 4i9h:C, 4i9h:D, 4i9h:E, 4i9h:F, 4i9h:G, 4i9h:H, 4i9n:A, 4i9n:B, 4i9n:C, 4i9n:D, 4i9n:E, 4i9n:F, 4i9n:G, 4i9n:H, 4i9u:A, 4i9u:B, 4i9u:C, 4i9u:D, 4i9u:E, 4i9u:F, 4i9u:G, 4i9u:H, 5ixs:A, 5ixs:B, 5ixs:C, 5ixs:D, 5ixy:A, 5ixy:B, 5ixy:C, 5ixy:D, 4jnk:A, 4jnk:B, 4jnk:C, 4jnk:D, 5kkc:A, 5kkc:B, 5kkc:C, 5kkc:D, 4l4s:H, 4l4s:A, 9ldb:A, 9ldb:B, 9ldt:A, 9ldt:B, 7m2n:A, 7m2n:B, 7m2n:C, 7m2n:D, 4m49:A, 4m49:B, 4m49:C, 4m49:D, 6mv8:A, 6mv8:B, 6mv8:C, 6mv8:D, 6mva:A, 6mva:B, 6mva:C, 6mva:D, 5nqq:A, 5nqq:B, 5nqq:C, 5nqq:D, 4okn:A, 4okn:B, 4okn:C, 4okn:D, 4okn:E, 4okn:F, 4okn:G, 4okn:H, 6p6u:C, 6p6u:E, 6q0d:A, 6q0d:B, 6q0d:C, 6q0d:D, 6q0d:E, 6q0d:F, 6q13:A, 6q13:B, 6q13:C, 6q13:D, 4qo7:A, 4qo7:B, 4qo7:C, 4qo7:D, 4qo8:A, 4qo8:B, 4qo8:C, 4qo8:D, 4qsm:B, 4qsm:C, 4qsm:D, 4qsm:E, 4qsm:F, 4qsm:G, 4qsm:H, 4qt0:A, 4qt0:B, 4qt0:C, 4qt0:D, 4qt0:E, 4qt0:F, 4qt0:G, 4qt0:H, 4r68:A, 4r68:B, 4r68:C, 4r68:D, 4r69:A, 4r69:B, 4r69:C, 4r69:D, 4rls:A, 4rls:B, 4rls:C, 4rls:D, 6sbu:A, 6sbu:B, 6sbu:C, 6sbu:D, 6sbu:E, 6sbu:F, 6sbu:G, 6sbu:H, 6sbv:A, 6sbv:B, 6sbv:C, 6sbv:D, 6sbv:E, 6sbv:F, 6sbv:G, 6sbv:H, 5w8h:A, 5w8h:B, 5w8h:C, 5w8i:A, 5w8i:C, 5w8i:D, 5w8j:A, 5w8j:B, 5w8j:C, 5w8j:D, 5w8k:A, 5w8k:B, 5w8k:C, 5w8k:D, 5w8l:A, 5w8l:B, 5w8l:C, 5w8l:D, 5zjd:A, 5zjd:B, 5zjd:C, 5zjd:D, 5zjd:E, 5zjd:F, 5zjd:G, 5zjd:H, 5zjf:A, 5zjf:C, 4zvv:A, 4zvv:B, 4zvv:C, 4zvv:D
15 7epm:A 335 306 0.3734 0.3522 0.3856 8.64e-76 7epm:B
16 6k13:A 332 306 0.3766 0.3584 0.3889 2.44e-74 6k13:B
17 7dbj:A 333 305 0.3544 0.3363 0.3672 4.08e-73 6cep:A, 6cep:B, 6cep:C, 6cep:D, 7dbj:B, 7dbj:C, 7dbj:D, 7dbk:A, 7dbk:B, 7dbk:C, 7dbk:D, 7dbk:E, 7dbk:F, 7dbk:G, 7dbk:H, 1i0z:A, 1i0z:B, 5ldh:A, 5ldh:B, 8qde:A, 8qde:B, 8qde:C, 8qde:D, 1t2f:A, 1t2f:B, 1t2f:C, 1t2f:D, 5yta:A, 5yta:B
18 1v6a:A 332 287 0.3481 0.3313 0.3833 1.83e-70 1v6a:B
19 1ldm:A 329 301 0.3449 0.3313 0.3621 2.82e-70 6ldh:A
20 7nay:A 322 311 0.3481 0.3416 0.3537 8.73e-65
21 8rwl:A 312 314 0.4082 0.4135 0.4108 7.67e-63 9end:A, 9end:B, 8rs5:A, 8rs5:B, 8rwl:B
22 7f8d:A 313 309 0.3576 0.3610 0.3657 9.70e-61 7by9:A, 7by9:B, 7by9:C, 7by9:D, 7bya:A, 7bya:B, 7bya:C, 7bya:D, 7f8d:B, 7f8d:C, 7f8d:D, 7x1l:A, 7x1l:B, 7x1l:E, 7x1l:F, 7x1l:C, 7x1l:D
23 1guz:A 305 305 0.3228 0.3344 0.3344 8.53e-55 1guz:B, 1guz:C, 1guz:D
24 4plt:B 319 312 0.3165 0.3135 0.3205 1.70e-54 4plh:A, 4plh:B, 4plh:C, 4plh:D, 4plt:A, 4plt:C, 4plt:D, 4plv:A, 4plv:B, 4plv:C, 4plv:D, 4plw:A, 4plw:B, 4plw:C, 4plw:D, 4ply:B, 4ply:A, 4ply:C, 4ply:D, 4ply:F, 4ply:E, 4ply:G, 4ply:H
25 1d3a:A 303 291 0.3354 0.3498 0.3643 3.12e-54 1d3a:B, 1hlp:A, 1hlp:B, 2hlp:A, 1o6z:A, 1o6z:B, 1o6z:C, 1o6z:D, 2x0r:A, 2x0r:B
26 4plf:B 330 311 0.2975 0.2848 0.3023 8.04e-54 4plc:A, 4plc:B, 4plc:C, 4plc:D, 4plf:A, 4plg:A, 4plg:B, 6vdj:A
27 3gvh:A 318 308 0.3101 0.3082 0.3182 1.31e-53 3gvh:B, 3gvh:C, 3gvh:D, 3gvi:A, 3gvi:B, 3gvi:C, 3gvi:D, 3gvi:E, 3gvi:F
28 2x0i:A 294 302 0.3354 0.3605 0.3510 1.06e-52 2x0j:A
29 1gv0:A 301 305 0.3133 0.3289 0.3246 2.35e-50 1gv0:B
30 4ros:A 318 313 0.3101 0.3082 0.3131 4.35e-50 5ujk:A
31 2hjr:B 314 307 0.3038 0.3057 0.3127 2.76e-48 2hjr:A, 2hjr:C, 2hjr:D, 2hjr:E, 2hjr:F, 2hjr:G, 2hjr:H, 2hjr:I, 2hjr:J, 2hjr:K, 2hjr:L
32 3czm:B 323 304 0.2943 0.2879 0.3059 1.11e-46 3czm:A, 1sow:A, 1sow:B
33 1hyh:A 297 296 0.2975 0.3165 0.3176 1.72e-46 1hyh:B, 1hyh:C, 1hyh:D
34 1hyg:A 313 309 0.3386 0.3419 0.3463 2.33e-46 1hye:A, 1hyg:B
35 1uxg:A 308 312 0.2975 0.3052 0.3013 4.62e-45 1guy:A, 1guy:C, 1ur5:A, 1ur5:C, 1uxg:B, 1uxh:A, 1uxh:B, 1uxi:A, 1uxi:B, 1uxj:A, 1uxj:C, 1uxk:A, 1uxk:C
36 3ldh:A 329 320 0.3101 0.2979 0.3063 5.61e-45
37 2a92:C 318 311 0.2722 0.2704 0.2765 9.33e-45 2a92:A, 2a92:B, 2a92:D, 2a94:A, 2aa3:A, 2aa3:B, 2aa3:C, 2aa3:D, 4b7u:A, 5hru:A, 5hru:B, 5hto:A, 5hto:B, 5hto:D, 5hto:E, 1oc4:A, 1oc4:B, 4plz:A, 1t24:A, 1t25:A, 1t26:A, 1t2c:A, 1t2d:A, 6txr:A, 6txr:B, 6txr:C, 6txr:D, 3zh2:A, 3zh2:B, 3zh2:C, 3zh2:D
38 1t2e:A 317 308 0.2848 0.2839 0.2922 5.02e-44 4b7u:B, 4b7u:C, 4b7u:D, 1cet:A, 1ldg:A, 1u4o:A, 1u4s:A, 1u5a:A, 1u5c:A, 1xiv:A
39 6r8g:C 312 311 0.2911 0.2949 0.2958 2.37e-43 6r8g:A, 6r8g:B, 6r8g:D, 6y91:A, 6y91:B, 6y91:C, 6y91:D
40 6ct6:B 331 306 0.2627 0.2508 0.2712 7.98e-43 6ct6:A
41 2fn7:A 317 313 0.2975 0.2965 0.3003 1.69e-42 2fn7:B, 4nd1:A, 4nd1:B, 4nd2:A, 4nd2:B, 4nd3:A, 4nd3:B, 4nd4:A, 4nd4:B
42 3om9:A 329 306 0.2975 0.2857 0.3072 4.86e-34 3om9:B, 3om9:C, 3om9:D, 1pzf:A, 1pzf:B, 1pzf:C, 1pzf:D, 1pzg:A, 1pzg:B, 1pzg:C, 1pzg:D, 1pzh:A, 1pzh:B, 1pzh:C, 1pzh:D
43 6qss:A 303 305 0.2943 0.3069 0.3049 6.55e-30 6qss:D
44 6ihd:B 304 302 0.2437 0.2533 0.2550 1.27e-23 6ihd:A, 6ihe:A, 6ihe:B
45 1emd:A 312 323 0.2848 0.2885 0.2786 8.57e-13 1ib6:A, 1ib6:C, 1ib6:D, 1ie3:A, 1ie3:B, 1ie3:C, 1ie3:D, 5kka:A, 5kka:B
46 2dfd:A 314 243 0.2057 0.2070 0.2675 3.14e-12 2dfd:B, 2dfd:C, 2dfd:D, 4wlo:A, 4wlo:B, 4wlo:C, 4wlo:D, 4wlu:A, 4wlu:B, 4wlu:C, 4wlu:D, 4wlv:A, 4wlv:B, 4wlv:C, 4wlv:D
47 6itl:A 312 121 0.1329 0.1346 0.3471 2.16e-10
48 7qoz:A 323 256 0.2089 0.2043 0.2578 4.34e-07 7qoz:B, 7qoz:C, 7qoz:D, 7qoz:E, 7qoz:F, 7qoz:G, 7qoz:H
49 4i1i:A 320 162 0.1456 0.1437 0.2840 4.36e-05
50 5zi2:A 339 262 0.2120 0.1976 0.2557 3.86e-04 5zi2:B, 5zi4:A, 5zi4:B
51 4uun:B 337 236 0.1867 0.1751 0.2500 7.86e-04 5a1t:A, 5a1t:B, 4uun:A
52 5g5g:C 731 54 0.0601 0.0260 0.3519 0.11 5g5h:C
53 1civ:A 374 235 0.1709 0.1444 0.2298 0.22
54 4mdh:A 333 189 0.1361 0.1291 0.2275 0.32 4mdh:B, 5mdh:A, 5mdh:B, 7rm9:A
55 4uup:A 335 122 0.0918 0.0866 0.2377 0.41 4uup:B
56 3atq:A 452 39 0.0475 0.0332 0.3846 0.47 3atr:A, 4opc:A, 4opd:A, 4opd:B, 4opg:A, 4opi:A, 4opl:A, 4opt:A, 4opu:A
57 7mdh:B 360 235 0.1709 0.1500 0.2298 0.66 7mdh:A, 7mdh:C, 7mdh:D
58 4xr9:A 456 153 0.1203 0.0833 0.2484 0.89
59 1cdo:A 374 140 0.1108 0.0936 0.2500 1.5 1cdo:B
60 4k28:A 266 38 0.0506 0.0602 0.4211 1.5 4k28:B
61 4ail:C 750 76 0.0570 0.0240 0.2368 2.1 2jgu:A
62 2bc0:A 473 42 0.0475 0.0317 0.3571 2.2 2bc0:B, 2bc1:A, 2bc1:B, 2bcp:A, 2bcp:B
63 2bc0:A 473 38 0.0475 0.0317 0.3947 6.7 2bc0:B, 2bc1:A, 2bc1:B, 2bcp:A, 2bcp:B
64 2x6t:G 308 44 0.0475 0.0487 0.3409 3.2 1eq2:B, 1eq2:D, 1eq2:E, 1eq2:F, 1eq2:G, 1eq2:H, 1eq2:I, 1eq2:J, 2x6t:A, 2x6t:B, 2x6t:C, 2x6t:D, 2x6t:E, 2x6t:F, 2x6t:H, 2x6t:I, 2x6t:J, 2x86:A, 2x86:B, 2x86:C, 2x86:D, 2x86:E, 2x86:F, 2x86:G, 2x86:H, 2x86:I, 2x86:J, 2x86:K, 2x86:L, 2x86:M, 2x86:N, 2x86:O, 2x86:P, 2x86:Q, 2x86:R, 2x86:S, 2x86:T
65 6itk:A 318 138 0.1076 0.1069 0.2464 3.7 6itk:B
66 1eq2:A 273 44 0.0475 0.0549 0.3409 3.8 1eq2:C
67 3vyl:A 297 21 0.0348 0.0370 0.5238 3.8 3vyl:B, 3vyl:C, 3vyl:D, 3vyl:E, 3vyl:F, 3vyl:G, 3vyl:H
68 1b8u:A 327 64 0.0570 0.0550 0.2812 4.5 1b8v:A
69 3kpf:A 467 31 0.0443 0.0300 0.4516 5.4 1b37:A, 1b37:B, 1b37:C, 1b5q:A, 1b5q:B, 1b5q:C, 1h81:A, 1h81:B, 1h81:C, 1h82:A, 1h82:B, 1h82:C, 1h83:A, 1h83:B, 1h83:C, 1h84:A, 1h84:B, 1h84:C, 1h86:A, 1h86:B, 1h86:C, 3kpf:B, 3ku9:A, 3ku9:B, 3l1r:A, 3l1r:B
70 6cvq:A 180 99 0.0633 0.1111 0.2020 5.6 6cvo:A, 6cvo:B, 6cvp:A, 6cvp:B, 6cvq:B, 6cvr:A, 6cvr:B, 6cvs:A, 6cvs:B, 6cvt:A, 6cvt:B, 4ndf:A, 4ndf:B, 4ndg:A, 4ndg:B, 4ndh:A, 4ndh:B, 4ndi:A, 4ndi:B
71 4gvq:A 315 79 0.0823 0.0825 0.3291 5.8 4gvq:B, 4gvs:B
72 1pj6:A 828 54 0.0538 0.0205 0.3148 6.4 3gsi:A, 1pj5:A, 1pj7:A
73 7xhn:K 230 98 0.0791 0.1087 0.2551 7.4 7xho:K
74 4pab:B 824 38 0.0475 0.0182 0.3947 7.4 5l46:A, 5l46:B, 4p9s:A, 4p9s:B, 4paa:A, 4paa:B, 4pab:A
75 5ts5:A 483 34 0.0411 0.0269 0.3824 9.3 4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218