Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MKNNGGARVVVIGAGFVGASYVFALMNQGIADEIVLIDANESKAIGDAMDFNHGKVFAPKPVDIWDYDDCRDADLVVICA
GANDLVDKNIAIFRSIVESVMASGFQGLFLVATNPVDILTYATWKFSGLPHERVIGSGTILDTARFRFLLGEYFSVAPQN
VHAYIIGEHGDTELPVWSQAYIGVMPIDLERIFVNVRDAAYQIIEKKGATYYGIAMGLARVTRAILHNENAILTVSAYLD
GLYGERDVYIGVPAVINRNGIREVIEIELNDDEKNRFHHSAATLKSVLARAFTR

The query sequence (length=294) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1ldb:A 294 294 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 1ldn:A 316 316 0.9966 0.9272 0.9272 0.0 1ldn:C, 1ldn:B, 1ldn:D, 1ldn:E, 1ldn:F, 1ldn:H, 1ldn:G, 2ldb:A, 2ldb:B, 2ldb:C, 2ldb:D
3 3pqd:B 312 308 0.6735 0.6346 0.6429 4.10e-144 3pqd:A, 3pqd:C, 3pqd:D, 3pqd:F, 3pqd:H, 3pqd:E, 3pqd:G, 3pqf:C, 3pqf:D
4 4ln1:B 321 310 0.6224 0.5701 0.5903 7.89e-136 4ln1:A, 4ln1:C, 4ln1:D
5 3h3j:B 314 308 0.6497 0.6083 0.6201 6.10e-132 3d4p:A, 3d4p:B, 3h3j:A
6 1llc:A 320 309 0.5510 0.5062 0.5243 1.88e-106 6j9t:B, 6j9t:D, 6j9t:E, 6j9t:C, 6j9t:F, 6j9u:A, 6j9u:C, 6j9u:D
7 3wsw:A 316 304 0.5034 0.4684 0.4868 7.64e-105 3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
8 1ez4:B 318 302 0.5306 0.4906 0.5166 4.77e-104 1ez4:A, 1ez4:C, 1ez4:D
9 6h9s:B 292 290 0.4490 0.4521 0.4552 1.23e-80 6h9s:A
10 8ab3:A 330 306 0.4354 0.3879 0.4183 5.15e-76 8ab3:B, 8ab3:C, 8ab3:D
11 2e37:C 310 301 0.4320 0.4097 0.4219 1.02e-74 2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
12 1lld:A 313 309 0.4116 0.3866 0.3916 4.43e-69 1lld:B, 1lth:T, 1lth:R
13 1a5z:A 312 304 0.3946 0.3718 0.3816 4.59e-66
14 4qsm:A 332 302 0.3741 0.3313 0.3642 1.08e-65 4aj1:A, 4aj1:B, 4aj1:C, 4aj1:D, 4aj2:A, 4aj2:B, 4aj2:C, 4aj2:D, 4aj4:A, 4aj4:B, 4aj4:C, 4aj4:D, 4aje:A, 4aje:B, 4aje:C, 4aje:D, 4ajh:A, 4ajh:B, 4ajh:C, 4ajh:D, 4aji:A, 4aji:B, 4aji:C, 4aji:D, 4ajj:A, 4ajj:B, 4ajj:C, 4ajj:D, 4ajk:A, 4ajk:B, 4ajk:C, 4ajk:D, 4ajl:A, 4ajl:B, 4ajl:C, 4ajl:D, 4ajn:A, 4ajn:B, 4ajn:C, 4ajn:D, 4ajo:A, 4ajo:B, 4ajo:C, 4ajo:D, 4ajp:A, 4ajp:B, 4ajp:C, 4ajp:D, 4al4:A, 4al4:B, 4al4:C, 4al4:D, 6bad:A, 6bad:B, 6bad:C, 6bad:D, 6bag:A, 6bag:B, 6bag:C, 6bag:D, 6bax:A, 6bax:B, 6bax:C, 6bax:D, 6baz:A, 6baz:B, 6baz:C, 6baz:D, 6bb0:A, 6bb0:B, 6bb0:C, 6bb0:D, 6bb1:A, 6bb1:B, 6bb1:C, 6bb1:D, 6bb1:E, 6bb1:F, 6bb1:G, 6bb1:H, 6bb2:A, 6bb2:B, 6bb2:C, 6bb2:D, 6bb2:E, 6bb2:F, 6bb2:G, 6bb2:H, 6bb3:A, 6bb3:B, 6bb3:C, 6bb3:D, 9bk2:A, 9bk2:D, 9bk3:D, 8fw6:A, 8fw6:B, 3h3f:A, 3h3f:B, 3h3f:C, 3h3f:D, 3h3f:E, 3h3f:F, 3h3f:G, 3h3f:H, 1i10:A, 1i10:B, 1i10:C, 1i10:D, 1i10:E, 1i10:F, 1i10:G, 1i10:H, 4i8x:A, 4i8x:B, 4i8x:C, 4i8x:D, 4i8x:E, 4i8x:F, 4i8x:G, 4i8x:H, 4i9h:A, 4i9h:B, 4i9h:C, 4i9h:D, 4i9h:E, 4i9h:F, 4i9h:G, 4i9h:H, 4i9n:A, 4i9n:B, 4i9n:C, 4i9n:D, 4i9n:E, 4i9n:F, 4i9n:G, 4i9n:H, 4i9u:A, 4i9u:B, 4i9u:C, 4i9u:D, 4i9u:E, 4i9u:F, 4i9u:G, 4i9u:H, 5ixs:A, 5ixs:B, 5ixs:C, 5ixs:D, 5ixy:A, 5ixy:B, 5ixy:C, 5ixy:D, 4jnk:A, 4jnk:B, 4jnk:C, 4jnk:D, 5kkc:A, 5kkc:B, 5kkc:C, 5kkc:D, 4l4s:H, 4l4s:A, 9ldb:A, 9ldb:B, 9ldt:A, 9ldt:B, 7m2n:A, 7m2n:B, 7m2n:C, 7m2n:D, 4m49:A, 4m49:B, 4m49:C, 4m49:D, 6mv8:A, 6mv8:B, 6mv8:C, 6mv8:D, 6mva:A, 6mva:B, 6mva:C, 6mva:D, 5nqq:A, 5nqq:B, 5nqq:C, 5nqq:D, 4okn:A, 4okn:B, 4okn:C, 4okn:D, 4okn:E, 4okn:F, 4okn:G, 4okn:H, 6p6u:C, 6p6u:E, 6q0d:A, 6q0d:B, 6q0d:C, 6q0d:D, 6q0d:E, 6q0d:F, 6q13:A, 6q13:B, 6q13:C, 6q13:D, 4qo7:A, 4qo7:B, 4qo7:C, 4qo7:D, 4qo8:A, 4qo8:B, 4qo8:C, 4qo8:D, 4qsm:B, 4qsm:C, 4qsm:D, 4qsm:E, 4qsm:F, 4qsm:G, 4qsm:H, 4qt0:A, 4qt0:B, 4qt0:C, 4qt0:D, 4qt0:E, 4qt0:F, 4qt0:G, 4qt0:H, 4r68:A, 4r68:B, 4r68:C, 4r68:D, 4r69:A, 4r69:B, 4r69:C, 4r69:D, 4rls:A, 4rls:B, 4rls:C, 4rls:D, 6sbu:A, 6sbu:B, 6sbu:C, 6sbu:D, 6sbu:E, 6sbu:F, 6sbu:G, 6sbu:H, 6sbv:A, 6sbv:B, 6sbv:C, 6sbv:D, 6sbv:E, 6sbv:F, 6sbv:G, 6sbv:H, 5w8h:A, 5w8h:B, 5w8h:C, 5w8i:A, 5w8i:C, 5w8i:D, 5w8j:A, 5w8j:B, 5w8j:C, 5w8j:D, 5w8k:A, 5w8k:B, 5w8k:C, 5w8k:D, 5w8l:A, 5w8l:B, 5w8l:C, 5w8l:D, 5zjd:A, 5zjd:B, 5zjd:C, 5zjd:D, 5zjd:E, 5zjd:F, 5zjd:G, 5zjd:H, 5zjf:A, 5zjf:C, 4zvv:A, 4zvv:B, 4zvv:C, 4zvv:D
15 6k13:A 332 306 0.3844 0.3404 0.3693 3.42e-65 6k13:B
16 7epm:A 335 306 0.3810 0.3343 0.3660 9.83e-65 7epm:B
17 7dbj:A 333 302 0.3673 0.3243 0.3576 1.82e-62 6cep:A, 6cep:B, 6cep:C, 6cep:D, 7dbj:B, 7dbj:C, 7dbj:D, 7dbk:A, 7dbk:B, 7dbk:C, 7dbk:D, 7dbk:E, 7dbk:F, 7dbk:G, 7dbk:H, 1i0z:A, 1i0z:B, 5ldh:A, 5ldh:B, 8qde:A, 8qde:B, 8qde:C, 8qde:D, 1t2f:A, 1t2f:B, 1t2f:C, 1t2f:D, 5yta:A, 5yta:B
18 1ldm:A 329 299 0.3673 0.3283 0.3612 3.50e-62 6ldh:A
19 1v6a:A 332 287 0.3605 0.3193 0.3693 1.53e-60 1v6a:B
20 8rwl:A 312 308 0.4116 0.3878 0.3929 6.30e-58 9end:A, 9end:B, 8rs5:A, 8rs5:B, 8rwl:B
21 7nay:A 322 314 0.3537 0.3230 0.3312 4.65e-56
22 7f8d:A 313 303 0.3605 0.3387 0.3498 2.48e-54 7by9:A, 7by9:B, 7by9:C, 7by9:D, 7bya:A, 7bya:B, 7bya:C, 7bya:D, 7f8d:B, 7f8d:C, 7f8d:D, 7x1l:A, 7x1l:B, 7x1l:E, 7x1l:F, 7x1l:C, 7x1l:D
23 1guz:A 305 294 0.3197 0.3082 0.3197 2.12e-48 1guz:B, 1guz:C, 1guz:D
24 4plt:B 319 311 0.3197 0.2947 0.3023 3.16e-47 4plh:A, 4plh:B, 4plh:C, 4plh:D, 4plt:A, 4plt:C, 4plt:D, 4plv:A, 4plv:B, 4plv:C, 4plv:D, 4plw:A, 4plw:B, 4plw:C, 4plw:D, 4ply:B, 4ply:A, 4ply:C, 4ply:D, 4ply:F, 4ply:E, 4ply:G, 4ply:H
25 1hyh:A 297 284 0.3299 0.3266 0.3415 5.54e-47 1hyh:B, 1hyh:C, 1hyh:D
26 1gv0:A 301 290 0.3299 0.3223 0.3345 1.20e-46 1gv0:B
27 2x0i:A 294 290 0.3469 0.3469 0.3517 1.21e-46 2x0j:A
28 4plf:B 330 310 0.2993 0.2667 0.2839 5.39e-46 4plc:A, 4plc:B, 4plc:C, 4plc:D, 4plf:A, 4plg:A, 4plg:B, 6vdj:A
29 1d3a:A 303 280 0.3367 0.3267 0.3536 8.28e-46 1d3a:B, 1hlp:A, 1hlp:B, 2hlp:A, 1o6z:A, 1o6z:B, 1o6z:C, 1o6z:D, 2x0r:A, 2x0r:B
30 3gvh:A 318 302 0.3027 0.2799 0.2947 8.61e-45 3gvh:B, 3gvh:C, 3gvh:D, 3gvi:A, 3gvi:B, 3gvi:C, 3gvi:D, 3gvi:E, 3gvi:F
31 4ros:A 318 307 0.3027 0.2799 0.2899 1.28e-40 5ujk:A
32 3ldh:A 329 307 0.3231 0.2888 0.3094 3.99e-40
33 2hjr:B 314 306 0.3095 0.2898 0.2974 1.33e-39 2hjr:A, 2hjr:C, 2hjr:D, 2hjr:E, 2hjr:F, 2hjr:G, 2hjr:H, 2hjr:I, 2hjr:J, 2hjr:K, 2hjr:L
34 1uxg:A 308 306 0.3061 0.2922 0.2941 1.66e-39 1guy:A, 1guy:C, 1ur5:A, 1ur5:C, 1uxg:B, 1uxh:A, 1uxh:B, 1uxi:A, 1uxi:B, 1uxj:A, 1uxj:C, 1uxk:A, 1uxk:C
35 1hyg:A 313 305 0.3469 0.3259 0.3344 3.02e-39 1hye:A, 1hyg:B
36 3czm:B 323 303 0.2993 0.2724 0.2904 6.41e-39 3czm:A, 1sow:A, 1sow:B
37 2a92:C 318 310 0.2789 0.2579 0.2645 2.01e-38 2a92:A, 2a92:B, 2a92:D, 2a94:A, 2aa3:A, 2aa3:B, 2aa3:C, 2aa3:D, 4b7u:A, 5hru:A, 5hru:B, 5hto:A, 5hto:B, 5hto:D, 5hto:E, 1oc4:A, 1oc4:B, 4plz:A, 1t24:A, 1t25:A, 1t26:A, 1t2c:A, 1t2d:A, 6txr:A, 6txr:B, 6txr:C, 6txr:D, 3zh2:A, 3zh2:B, 3zh2:C, 3zh2:D
38 1t2e:A 317 307 0.2925 0.2713 0.2801 2.43e-38 4b7u:B, 4b7u:C, 4b7u:D, 1cet:A, 1ldg:A, 1u4o:A, 1u4s:A, 1u5a:A, 1u5c:A, 1xiv:A
39 2fn7:A 317 312 0.3027 0.2808 0.2853 3.65e-35 2fn7:B, 4nd1:A, 4nd1:B, 4nd2:A, 4nd2:B, 4nd3:A, 4nd3:B, 4nd4:A, 4nd4:B
40 6ct6:B 331 305 0.2653 0.2356 0.2557 6.26e-35 6ct6:A
41 6r8g:C 312 310 0.2925 0.2756 0.2774 6.62e-35 6r8g:A, 6r8g:B, 6r8g:D, 6y91:A, 6y91:B, 6y91:C, 6y91:D
42 6qss:A 303 299 0.3095 0.3003 0.3043 1.37e-29 6qss:D
43 3om9:A 329 304 0.3027 0.2705 0.2928 7.35e-28 3om9:B, 3om9:C, 3om9:D, 1pzf:A, 1pzf:B, 1pzf:C, 1pzf:D, 1pzg:A, 1pzg:B, 1pzg:C, 1pzg:D, 1pzh:A, 1pzh:B, 1pzh:C, 1pzh:D
44 6ihd:B 304 294 0.2449 0.2368 0.2449 1.88e-18 6ihd:A, 6ihe:A, 6ihe:B
45 1emd:A 312 311 0.2687 0.2532 0.2540 2.34e-08 1ib6:A, 1ib6:C, 1ib6:D, 1ie3:A, 1ie3:B, 1ie3:C, 1ie3:D, 5kka:A, 5kka:B
46 6itl:A 312 121 0.1259 0.1186 0.3058 1.60e-04
47 7qoz:A 323 262 0.2177 0.1981 0.2443 0.001 7qoz:B, 7qoz:C, 7qoz:D, 7qoz:E, 7qoz:F, 7qoz:G, 7qoz:H
48 1cdo:A 374 135 0.1259 0.0989 0.2741 0.019 1cdo:B
49 5g5g:C 731 54 0.0646 0.0260 0.3519 0.090 5g5h:C
50 3atq:A 452 39 0.0510 0.0332 0.3846 0.45 3atr:A, 4opc:A, 4opd:A, 4opd:B, 4opg:A, 4opi:A, 4opl:A, 4opt:A, 4opu:A
51 4xr9:A 456 151 0.1259 0.0811 0.2450 0.78
52 5zi2:A 339 315 0.2551 0.2212 0.2381 1.1 5zi2:B, 5zi4:A, 5zi4:B
53 4k28:A 266 38 0.0544 0.0602 0.4211 1.4 4k28:B
54 2x6t:G 308 73 0.0816 0.0779 0.3288 1.6 1eq2:B, 1eq2:D, 1eq2:E, 1eq2:F, 1eq2:G, 1eq2:H, 1eq2:I, 1eq2:J, 2x6t:A, 2x6t:B, 2x6t:C, 2x6t:D, 2x6t:E, 2x6t:F, 2x6t:H, 2x6t:I, 2x6t:J, 2x86:A, 2x86:B, 2x86:C, 2x86:D, 2x86:E, 2x86:F, 2x86:G, 2x86:H, 2x86:I, 2x86:J, 2x86:K, 2x86:L, 2x86:M, 2x86:N, 2x86:O, 2x86:P, 2x86:Q, 2x86:R, 2x86:S, 2x86:T
55 2bc0:A 473 42 0.0510 0.0317 0.3571 2.2 2bc0:B, 2bc1:A, 2bc1:B, 2bcp:A, 2bcp:B
56 2bc0:A 473 38 0.0510 0.0317 0.3947 5.3 2bc0:B, 2bc1:A, 2bc1:B, 2bcp:A, 2bcp:B
57 1eq2:A 273 73 0.0816 0.0879 0.3288 2.3 1eq2:C
58 1qlm:A 316 52 0.0578 0.0538 0.3269 2.7
59 6gjc:A 2770 27 0.0476 0.0051 0.5185 3.8 6gjc:B, 6gjc:C, 6gjc:D, 6gjc:E, 6gjc:F
60 3kpf:A 467 31 0.0476 0.0300 0.4516 4.9 1b37:A, 1b37:B, 1b37:C, 1b5q:A, 1b5q:B, 1b5q:C, 1h81:A, 1h81:B, 1h81:C, 1h82:A, 1h82:B, 1h82:C, 1h83:A, 1h83:B, 1h83:C, 1h84:A, 1h84:B, 1h84:C, 1h86:A, 1h86:B, 1h86:C, 3kpf:B, 3ku9:A, 3ku9:B, 3l1r:A, 3l1r:B
61 8c3a:l 361 73 0.0714 0.0582 0.2877 5.4 8c3a:AY, 8cq7:l, 8cq7:AY, 8cqw:l, 8cqw:AY, 8cre:l, 8cre:AY, 8oeq:l, 8oeq:AY, 7pzy:l, 7q08:l, 7q0f:l, 7q0p:l, 7q0r:l, 8q5i:l
62 3x2f:A 406 149 0.1395 0.1010 0.2752 6.0 5tov:B, 5tow:B, 3x2e:A, 3x2e:B, 3x2e:C, 3x2e:D, 3x2f:B
63 1pj6:A 828 54 0.0578 0.0205 0.3148 6.5 3gsi:A, 1pj5:A, 1pj7:A
64 4pab:B 824 38 0.0510 0.0182 0.3947 6.7 5l46:A, 5l46:B, 4p9s:A, 4p9s:B, 4paa:A, 4paa:B, 4pab:A
65 6itk:A 318 48 0.0544 0.0503 0.3333 8.2 6itk:B
66 5a0t:A 454 41 0.0442 0.0286 0.3171 8.4 5a0t:B, 5a0v:A, 5a0v:B
67 5ts5:A 483 34 0.0442 0.0269 0.3824 8.7 4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
68 6cvq:A 180 71 0.0612 0.1000 0.2535 9.1 6cvo:A, 6cvo:B, 6cvp:A, 6cvp:B, 6cvq:B, 6cvr:A, 6cvr:B, 6cvs:A, 6cvs:B, 6cvt:A, 6cvt:B, 4ndf:A, 4ndf:B, 4ndg:A, 4ndg:B, 4ndh:A, 4ndh:B, 4ndi:A, 4ndi:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218