BioLiP

>protein
MKMKEFLDLLNESRLTVTLTGAGISTPSGIPDFNVFDIDFFYSHPEEFYRFAKEGIFPMLQAKPNLAHVLLAKLEEKGLI
EAVITQNIDRLHQRAGSKKVIELHGNVEEYYCVRCEKKYTVEDVIKKLESSDVPLCDDCNSLIRPNIVFFGENLPQDALR
EAIGLSSRASLMIVLGSSLVVYPAAELPLITVRSGGKLVIVNLGETPFDDIATLKYNMDVVEFARRVMEEGGI

The query sequence (length=233) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2h59:A	246	245	0.9957	0.9431	0.9469	1.90e-168	4buz:A, 4bv2:A, 4bv2:B, 3d4b:A, 3d81:A, 2h2d:A, 2h2f:A, 2h2g:A, 2h2h:A, 2h2i:A, 2h4f:A, 2h4h:A, 2h4j:A, 2h59:B, 3jr3:A, 3pdh:A, 1yc5:A
2	1s7g:A	252	243	0.4163	0.3849	0.3992	1.47e-54	1ma3:A, 1s7g:B, 1s7g:C, 1s7g:D, 1s7g:E, 4twj:A, 1yc2:A, 1yc2:B, 1yc2:C, 1yc2:D, 1yc2:E
3	1ici:A	256	222	0.3820	0.3477	0.4009	2.49e-50	1ici:B, 1m2g:A, 1m2h:A, 1m2j:A, 1m2k:A, 1m2n:A, 1m2n:B, 4twi:A
4	5y5n:A	288	218	0.3519	0.2847	0.3761	1.28e-36	7bot:A, 5fyq:B, 4rmi:A, 8tgp:A, 4y6l:A, 4y6l:B, 4y6o:A, 4y6o:B, 4y6q:D
5	8bbk:A	274	208	0.3262	0.2774	0.3654	8.20e-36	8bbk:B, 8bbk:C, 8bbk:D, 8bbk:E, 8bbk:F, 4bn4:A, 4bn5:A, 4bn5:B, 4bn5:C, 4bn5:D, 4bn5:E, 4bn5:F, 4bn5:G, 4bn5:H, 4bn5:I, 4bn5:J, 4bn5:K, 4bn5:L, 4bv3:A, 4bvb:A, 4bve:A, 4bvf:A, 4bvg:A, 4bvh:A, 4bvh:B, 4bvh:C, 5bwn:A, 5bwo:A, 4c78:A, 4c7b:A, 9cbt:A, 9cbt:B, 8ccw:A, 8ccz:A, 8ccz:B, 5d7n:A, 5d7n:B, 5d7n:C, 5d7n:D, 5d7n:E, 5d7n:F, 4fvt:A, 4fz3:A, 3glr:A, 3gls:A, 3gls:B, 3gls:C, 3gls:D, 3gls:E, 3gls:F, 3glt:A, 3glu:A, 5h4d:H, 5h4d:A, 4hd8:A, 8hlw:A, 8hly:A, 8hn9:A, 8hn9:B, 6iso:A, 6iso:B, 6iso:E, 6iso:G, 4jsr:A, 4jt8:A, 4jt9:A, 4o8z:A, 8v15:A, 8v15:C, 8v2n:A, 5y4h:A, 5ytk:A, 5ytk:D, 5ytk:E, 5ytk:F, 5ytk:B, 5ytk:C, 5z93:A, 5z94:A, 5z94:B, 5zgc:A, 5zgc:B, 5zgc:C, 5zgc:E, 5zgc:D
6	5y2f:A	297	248	0.3691	0.2896	0.3468	8.83e-35	8ak5:A, 8ak5:B, 8ak6:A, 8ak6:B, 8ak7:A, 8ak7:B, 8ak8:A, 8ak8:B, 8ak9:A, 8ak9:B, 8aka:A, 8aka:B, 8akb:A, 8akb:B, 8akc:A, 8akc:B, 8akd:A, 8akd:B, 8ake:A, 8ake:B, 8akf:A, 8akf:B, 8akg:A, 8akg:B, 8bl0:A, 8bl0:B, 8bl1:A, 8bl1:B, 7cl0:A, 7cl1:A, 8cnm:A, 8cnm:B, 8cno:A, 8cno:B, 8f86:K, 8g57:K, 9g7h:A, 9g7h:B, 6hoy:A, 6hoy:B, 8i2b:A, 8i2b:B, 3k35:A, 3k35:B, 3k35:C, 3k35:D, 3k35:E, 3k35:F, 5mf6:A, 5mf6:B, 5mfp:A, 5mfp:B, 5mfz:A, 5mfz:B, 5mgn:A, 5mgn:B, 3pki:A, 3pki:B, 3pki:C, 3pki:D, 3pki:E, 3pki:F, 3pkj:A, 3pkj:B, 3pkj:C, 3pkj:D, 3pkj:E, 3pkj:F, 6qcd:A, 6qcd:B, 6qce:A, 6qce:B, 6qch:A, 6qch:B, 6qcj:A, 6qcj:B, 5x16:A, 6xuy:A, 6xuy:B, 6xv1:A, 6xv1:B, 6xv6:A, 6xv6:B, 6xv6:C, 6xv6:D, 6xv6:E, 6xv6:F, 6xvg:A, 6xvg:B, 6xvg:C, 6xvg:D, 6xvg:E, 6xvg:F, 3zg6:A, 6zu4:A, 6zu4:B
7	6iso:I	248	188	0.3047	0.2863	0.3777	1.04e-34
8	1q17:C	295	263	0.4163	0.3288	0.3688	2.49e-34	7f4e:A, 7f51:A, 2od2:A, 2od7:A, 2od9:A, 1q14:A, 1q17:A, 1q17:B, 1q1a:A, 2qqf:A, 2qqg:A, 1szc:A, 1szd:A
9	5btr:A	370	212	0.3305	0.2081	0.3632	9.82e-34	5btr:B, 4i5i:A, 4i5i:B, 4if6:A, 4ig9:A, 4ig9:E, 4ig9:C, 4ig9:G, 4kxq:A, 4zzh:A, 4zzi:A, 4zzj:A
10	3zgo:A	318	208	0.3262	0.2390	0.3654	5.14e-33	7bos:A, 5d7o:A, 5d7o:B, 5d7p:A, 5d7p:B, 5d7q:A, 5d7q:B, 5dy4:A, 5dy5:A, 5fyq:A, 5g4c:B, 5g4c:A, 1j8f:A, 1j8f:B, 1j8f:C, 4l3o:A, 4l3o:B, 4l3o:C, 4l3o:D, 6l65:A, 6l66:A, 6l71:A, 6l72:A, 5mar:A, 5mar:B, 5mat:A, 5mat:C, 6nr0:A, 6nr0:B, 8owz:A, 8py3:A, 6qcn:A, 6qcn:B, 4r8m:A, 4r8m:B, 4rmg:A, 4rmh:A, 4rmj:A, 4rmj:B, 7t1d:A, 7t1d:B, 4x3o:A, 4x3p:A, 8xe7:A, 5y0z:A, 5y0z:B, 4y6q:A, 4y6q:B, 4y6q:C, 5yql:A, 5yqm:A, 5yqn:A, 5yqo:A, 3zgo:B, 3zgo:C, 3zgv:A, 3zgv:B
11	5ol0:B	263	192	0.2833	0.2510	0.3438	2.09e-30
12	3u31:A	263	224	0.2961	0.2624	0.3080	1.16e-29	3jwp:A, 3u3d:A
13	8of4:L	237	243	0.3519	0.3460	0.3374	4.75e-29
14	5btr:C	322	190	0.3004	0.2174	0.3684	5.30e-28
15	5ol0:A	283	211	0.2833	0.2332	0.3128	2.01e-27
16	5oj7:A	286	257	0.2918	0.2378	0.2646	3.17e-26	5ojn:A
17	6eo0:B	275	244	0.3090	0.2618	0.2951	5.97e-25	6enx:A, 6eo0:A, 6eo0:C, 6eo0:D, 6fky:A, 6fky:B, 6fkz:A, 6fkz:B, 6flg:A, 6flg:B, 5ojo:A, 5ojo:B, 4utn:A, 4utn:B, 4utr:A, 4utr:B, 4utv:A, 4utv:B, 4utx:A, 4utx:B, 4utz:A, 4utz:B, 4uu7:A, 4uu7:B, 4uu8:A, 4uu8:B, 4uua:A, 4uua:B, 4uub:A, 4uub:B
18	6eqs:D	275	234	0.2961	0.2509	0.2949	2.90e-23	6ace:A, 6acl:A, 6aco:A, 6acp:A, 2b4y:A, 2b4y:B, 2b4y:C, 2b4y:D, 5bwl:A, 6eqs:A, 6eqs:B, 6eqs:C, 4f4u:A, 4f4u:B, 4f56:A, 4f56:B, 4g1c:A, 4g1c:B, 8gbl:A, 8gbl:B, 8gbn:A, 8gbn:B, 4hda:A, 4hda:B, 6ljk:A, 6ljm:A, 6ljn:A, 2nyr:A, 2nyr:B, 3rig:A, 3rig:B, 3riy:B, 3riy:A, 7x3p:A, 5xhs:A
19	6rxs:A	218	191	0.3004	0.3211	0.3665	6.83e-21
20	6rxj:A	235	205	0.3090	0.3064	0.3512	1.10e-20	6rxj:B, 6rxk:A, 6rxl:A, 6rxm:A, 6rxm:B, 6rxm:C, 6rxm:D, 6rxm:E, 6rxm:F, 6rxo:A, 6rxo:B, 6rxp:A, 6rxp:B, 6rxq:A, 6rxq:B, 6rxq:C, 6rxq:D, 6rxr:A, 6rxr:B, 6rxr:C, 6rxr:D, 1s5p:A
21	4iao:B	429	244	0.2961	0.1608	0.2828	3.08e-19	2hjh:A, 2hjh:B, 4iao:A
22	5zgc:F	212	188	0.2833	0.3113	0.3511	2.02e-17	6iso:K
23	5vn6:A	273	79	0.0944	0.0806	0.2785	0.19	5vn6:B
24	5k1s:A	358	106	0.1202	0.0782	0.2642	0.55	5k1s:C, 5k1s:B, 5k1s:D
25	7omi:AAA	661	42	0.0644	0.0227	0.3571	0.83	7omi:BBB, 7omi:CCC, 7omi:DDD, 7omi:EEE, 7omi:FFF, 7oms:AAA, 7oms:DDD, 7oms:CCC, 7oms:BBB, 7oms:FFF, 7oms:EEE, 6t6g:AAA, 6t6g:DDD, 6t6g:CCC, 6t6g:BBB, 6t6g:FFF, 6t6g:EEE, 6t75:AAA, 6t75:DDD, 6t75:CCC, 6t75:BBB, 6t75:FFF, 6t75:EEE, 6t7g:AAA, 6t7g:DDD, 6t7g:CCC, 6t7g:BBB, 6t7g:FFF, 6t7g:EEE
26	5t5h:O	202	73	0.0987	0.1139	0.3151	2.0
27	7co7:D	329	75	0.0901	0.0638	0.2800	2.5	7co2:A, 7co3:A, 7co5:H, 7co5:B, 7co5:D, 7co5:F, 7co5:J, 7co5:L
28	5e72:A	323	86	0.1030	0.0743	0.2791	4.4
29	5ot1:A	572	32	0.0515	0.0210	0.3750	5.6
30	1a8h:A	500	35	0.0601	0.0280	0.4000	6.3	2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
31	2ihm:B	336	45	0.0687	0.0476	0.3556	6.5	2ihm:A
32	5l7v:A	563	42	0.0515	0.0213	0.2857	8.3	5l7v:B
33	4o8c:B	255	130	0.1502	0.1373	0.2692	8.4
34	1glc:F	161	98	0.1245	0.1801	0.2959	9.4	1f3z:A, 1gle:F, 2mp0:B, 1o2f:A
35	6raw:6	601	32	0.0515	0.0200	0.3750	9.7	6raz:6
36	6rax:6	628	32	0.0515	0.0191	0.3750	9.8	6ray:6

[Back]