BioLiP

>protein
MKLQTTYPSNNYPIYVEHGAIKYIGTYLNQFDQSFLLIDEYVNQYFANKFDNVHKVIIPAGEKTKTFEQYQETLEYILSH
HVTRNTAIIAVGGGATGDFAGFVAATLLRGVHFIQVPTTILAHDSSVGGKVGINSKQGKNLIGAFYRPTAVIYDLDFLKT
LPFKQILSGYAEVYKHALLNGESATQDIEQHFKDREILQSLNGMDKYIAKGIETKLDIVVADEKEQGVRKFLNLGHTFGH
AVEYYHKIPHGHAVMVGIIYQFIVANALFDSKHDISHYIQYLIQLGYPLDTLYQYMLGVQMVLMRQFGDIVVQHVDQLTL
QHACEQLKTY

The query sequence (length=330) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1xag:A	353	352	1.0000	0.9348	0.9375	0.0	1xah:A, 1xah:B, 1xai:A, 1xai:B, 1xaj:A, 1xaj:B, 1xal:A, 1xal:B
2	3zok:A	365	212	0.2758	0.2493	0.4292	3.65e-52	3zok:B, 3zok:C, 3zok:D
3	6lla:B	363	197	0.2818	0.2562	0.4721	6.29e-49	6lk2:A, 6lk2:B, 6lk2:C, 6lk2:D, 6lla:A, 6lla:C, 6lla:D
4	3okf:A	360	208	0.2727	0.2500	0.4327	7.02e-49	3okf:B
5	5eks:A	355	279	0.3121	0.2901	0.3692	1.11e-47	5eks:B
6	6hqv:A	1555	229	0.2788	0.0592	0.4017	1.07e-46	6hqv:B
7	1nvb:B	391	249	0.2818	0.2379	0.3735	8.47e-46	1dqs:A, 1dqs:B, 1nr5:A, 1nr5:B, 1nrx:A, 1nrx:B, 1nua:A, 1nua:B, 1nva:A, 1nva:B, 1nvb:A, 1nvd:A, 1nvd:B, 1nve:A, 1nve:B, 1nve:C, 1nve:D, 1nvf:A, 1nvf:B, 1nvf:C, 1sg6:A, 1sg6:B
8	5hvn:A	354	304	0.3061	0.2853	0.3322	4.43e-45
9	6c5c:A	385	217	0.2667	0.2286	0.4055	1.63e-43	6c5c:B
10	3qbe:A	352	266	0.2788	0.2614	0.3459	6.83e-41	3qbd:A, 3qbd:B
11	3clh:A	308	214	0.2515	0.2695	0.3879	2.28e-38	3clh:B
12	2gru:A	367	291	0.2818	0.2534	0.3196	1.20e-34	2d2x:A, 2d2x:B, 2gru:B
13	5tpr:A	400	257	0.2061	0.1700	0.2646	5.13e-23	5tpr:B
14	4p53:A	360	240	0.1909	0.1750	0.2625	1.01e-19
15	4rgq:B	333	129	0.0970	0.0961	0.2481	6.15e-04	4rfl:A, 4rfl:B, 4rfl:C, 4rfl:D, 4rgq:A, 4rgq:C, 4rgq:D, 4rgv:A, 4rgv:B
16	3ce9:A	349	189	0.1364	0.1289	0.2381	0.004	3ce9:B, 3ce9:C, 3ce9:D
17	8k1g:A	367	168	0.1212	0.1090	0.2381	0.11	8k1h:A
18	8om2:U	237	51	0.0455	0.0633	0.2941	0.84	8d8k:U, 8d8l:U, 5mrc:UU, 5mre:UU, 5mrf:UU, 8om3:U, 8om4:U
19	7f6e:B	341	71	0.0545	0.0528	0.2535	1.4	7f6e:A, 7f6e:C, 7f6f:A, 7f6f:B, 7f6n:A, 7f6n:B, 7f6n:C, 7f6o:A, 7f6o:B, 7f6q:A, 7f6r:A, 7f6s:A, 7f6u:A
20	5yvm:A	403	118	0.0970	0.0794	0.2712	2.7	5yvr:A, 5yvs:A
21	2afb:A	329	74	0.0667	0.0669	0.2973	4.0
22	3d1v:A	288	36	0.0424	0.0486	0.3889	4.7	2a0w:A, 2a0x:A, 2a0y:A, 3bgs:A, 4ear:A, 4ear:B, 4ear:C, 4eb8:A, 4eb8:B, 4eb8:C, 5etj:A, 5etj:B, 5etj:C, 5etj:D, 5etj:E, 5etj:F, 3gb9:A, 3gb9:B, 3gb9:C, 3ggs:A, 3ggs:B, 3ggs:C, 4gka:A, 4gka:B, 4gka:C, 4gka:D, 4gka:E, 4gka:F, 3iny:A, 3k8o:E, 3k8o:Q, 3k8o:S, 3k8o:T, 3k8o:U, 3k8o:Y, 3k8q:A, 2oc4:A, 2oc9:A, 2on6:A, 1pf7:E, 3phb:E, 3phb:Q, 3phb:S, 3phb:T, 3phb:U, 3phb:Y, 1pwy:E, 2q7o:E, 1rct:E, 1rfg:E, 1rr6:A, 1rsz:A, 1rt9:A, 5ugf:A, 5ugf:B, 5ugf:C, 5ugf:D, 5ugf:E, 5ugf:F, 1v2h:E, 1v3q:E, 1v41:E, 1v45:E, 1yry:E, 7zsl:A, 7zsl:B, 7zsl:C, 7zsl:D, 7zsl:E, 7zsl:F, 7zsm:A, 7zsn:A, 7zso:A, 7zso:B, 7zso:C, 7zsp:A
23	1a9o:A	289	32	0.0364	0.0415	0.3750	4.7	1a9p:A, 1a9q:A, 1a9r:A, 1a9s:A, 1a9t:A, 2ai1:A, 2ai2:A, 2ai3:A, 1b8n:A, 1b8o:A, 3fuc:A, 3fuc:B, 3fuc:C, 1fxu:A, 1lv8:A, 1lv8:B, 1lv8:C, 1lv8:D, 1lv8:E, 1lv8:F, 1lvu:A, 1lvu:B, 1lvu:C, 1lvu:D, 1lvu:E, 1lvu:F, 2qpl:A, 1v48:A, 1vfn:A
24	8a3n:B	352	66	0.0545	0.0511	0.2727	7.4	8a3n:A
25	4ivf:F	227	45	0.0515	0.0749	0.3778	8.8	4ivf:A, 4ivf:B, 4ivf:C, 4ivf:D, 4ivf:E, 4ivf:G, 4ivf:H

[Back]