Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKLFYKPGACSLASHITLRESGKDFTLVSVDLMKKRLENGDDYFAVNPKGQVPALLLDDGTLLTEGVAIMQYLADSVPDR
QLLAPVNSISRYKTIEWLNYIATELHKGFTPLFRPDTPEEYKPTVRAQLEKKLQYVNEALKDEHWICGQRFTIADAYLFT
VLRWAYAVKLNLEGLEHIAAFMQRMAERPEVQDALSAEGLK

The query sequence (length=201) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4kgi:C 206 200 0.9851 0.9612 0.9900 5.52e-150 1a0f:A, 1a0f:B, 4kgi:A, 4kgi:B, 4kgi:D, 1n2a:A, 1n2a:B
2 4g9h:A 202 200 0.6020 0.5990 0.6050 6.36e-93 4g9h:B, 4gci:A, 4gci:B
3 1pmt:A 201 200 0.5373 0.5373 0.5400 2.77e-83 2pmt:A, 2pmt:B, 2pmt:C, 2pmt:D
4 2gdr:A 202 200 0.4876 0.4851 0.4900 1.55e-65 2dsa:A, 2dsa:B, 2dsa:C, 2dsa:D, 2gdr:B, 2gdr:C, 2gdr:D, 2gdr:E, 2gdr:F
5 3uar:A 203 201 0.4876 0.4828 0.4876 1.30e-64
6 6m1t:A 201 200 0.4328 0.4328 0.4350 4.51e-58 6m1t:B
7 1f2e:A 201 200 0.4179 0.4179 0.4200 8.72e-55 1f2e:B, 1f2e:C, 1f2e:D
8 2nto:A 201 203 0.3980 0.3980 0.3941 1.91e-43 2pvq:A
9 2x64:B 207 208 0.3731 0.3623 0.3606 1.94e-35 2x64:A, 2x64:C, 2x64:D, 2x64:E, 2x64:F
10 4iw9:B 215 213 0.3333 0.3116 0.3146 2.42e-30 4iw9:A, 4iw9:C
11 4gf0:A 208 198 0.2786 0.2692 0.2828 2.60e-18 4gf0:B
12 3erg:A 208 185 0.2587 0.2500 0.2811 7.55e-13 3erg:B, 3ibh:A
13 4nhz:H 246 215 0.2985 0.2439 0.2791 3.72e-12 4nhz:A, 4nhz:B, 4nhz:C, 4nhz:D, 4nhz:E, 4nhz:F, 4nhz:G, 4nhz:I, 4nhz:J, 4nhz:K, 4nhz:L, 4nhz:M, 4nhz:N, 4nhz:O, 4nhz:P
14 4zb6:D 220 200 0.2687 0.2455 0.2700 1.60e-11 4zb6:A, 4zb6:B, 4zb6:C
15 8ai8:A 183 199 0.2687 0.2951 0.2714 2.14e-11 8ai8:B, 8ai9:A, 8ai9:B, 8aib:A, 8aib:B, 7pka:A, 7pka:B
16 4xt0:A 243 104 0.1990 0.1646 0.3846 5.17e-11
17 4hz2:B 206 193 0.2537 0.2476 0.2642 2.42e-10 4hz2:A
18 4ikh:A 227 175 0.2587 0.2291 0.2971 1.89e-09
19 3m3m:A 201 193 0.2438 0.2438 0.2539 1.91e-09
20 4iel:B 206 162 0.2189 0.2136 0.2716 2.27e-09 4iel:A
21 4ivf:F 227 216 0.2687 0.2379 0.2500 8.32e-09 4ivf:A, 4ivf:B, 4ivf:C, 4ivf:D, 4ivf:E, 4ivf:G, 4ivf:H
22 4zb8:A 220 202 0.2537 0.2318 0.2525 9.52e-09 4zbd:A, 4zbd:B
23 4mf6:A 240 211 0.2786 0.2333 0.2654 1.09e-08 4mf5:A
24 4nhw:D 217 159 0.2289 0.2120 0.2893 3.90e-08 4nhw:A, 4nhw:B, 4nhw:C
25 4e8h:B 216 210 0.2537 0.2361 0.2429 4.22e-08 4e8h:A, 4e8h:C, 4e8h:D
26 3lsz:A 223 161 0.2289 0.2063 0.2857 4.88e-08 3lsz:B, 3lsz:C, 3lsz:D
27 1jlv:A 207 189 0.2338 0.2271 0.2487 1.17e-07 1jlv:B, 1jlv:C, 1jlv:D, 1jlv:E, 1jlv:F
28 6tah:B 213 187 0.2289 0.2160 0.2460 1.38e-07 4ecj:A, 4ecj:B, 6tah:AAA, 6tah:CAA, 6tah:DAA
29 5hfk:A 207 206 0.2438 0.2367 0.2379 1.38e-07 3gx0:A, 5hfk:B
30 3gh6:A 209 170 0.2189 0.2105 0.2588 1.62e-07
31 4mzw:A 270 198 0.2587 0.1926 0.2626 1.68e-07 4mzw:B
32 3wyw:B 214 208 0.2687 0.2523 0.2596 2.58e-07 3wyw:A
33 4qq7:A 204 203 0.2388 0.2353 0.2365 4.55e-07 4qq7:B
34 6gib:B 237 111 0.1493 0.1266 0.2703 6.34e-07 6gic:B, 6gic:A, 6ht6:A, 6ht6:B
35 8qll:A 237 189 0.2189 0.1857 0.2328 9.38e-07 8qll:B
36 2c3q:A 239 188 0.2836 0.2385 0.3032 9.57e-07 2c3q:B, 2c3q:C, 2c3q:D
37 3zmk:B 222 167 0.2139 0.1937 0.2575 9.88e-07 4gsn:A, 4gsn:C, 4gsn:D, 2imi:A, 2imi:B, 2imk:A, 2imk:B, 3zmk:D, 3zml:A, 3zml:B
38 4kh7:B 212 156 0.2189 0.2075 0.2821 1.13e-06 4kh7:A
39 7rhp:A 215 173 0.1891 0.1767 0.2197 1.15e-06
40 1pn9:A 209 187 0.2189 0.2105 0.2353 1.68e-06 1pn9:B
41 5a4u:A 211 181 0.2537 0.2417 0.2818 1.76e-06 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B
42 4f0b:A 220 195 0.2537 0.2318 0.2615 1.85e-06 4f0b:B
43 4pua:A 261 203 0.2438 0.1877 0.2414 2.39e-06
44 2cz2:A 212 80 0.1393 0.1321 0.3500 4.45e-06
45 4i97:A 207 173 0.2139 0.2077 0.2486 6.56e-06 4i97:B
46 5f06:A 213 217 0.2736 0.2582 0.2535 8.35e-06 5f06:B
47 1fw1:A 208 80 0.1343 0.1298 0.3375 1.70e-05
48 4l8e:A 203 215 0.2338 0.2315 0.2186 2.21e-05
49 3mak:A 208 168 0.2040 0.1971 0.2440 2.66e-05 3ein:A
50 8awz:A 241 159 0.1841 0.1535 0.2327 2.79e-05 8awz:B, 8ax0:A, 8ax0:B, 8ax1:A, 8ax1:B, 8ax2:A, 8ax2:B, 6f4b:A, 6f4b:B, 6f4f:A, 6f4f:B, 6f4k:A, 6f4k:B, 6f51:A, 6f51:B, 6f66:A, 6f66:B, 6f67:A, 6f67:B, 6f68:A, 6f68:B, 6f69:A, 6f69:B, 6f6a:A, 6f6a:B, 6hpe:A, 6hpe:B
51 3tou:A 212 184 0.2289 0.2170 0.2500 3.56e-05 3tou:B
52 4pxo:A 216 89 0.1493 0.1389 0.3371 3.90e-05 4pxo:B
53 1r5a:A 214 202 0.2289 0.2150 0.2277 3.96e-05
54 4zba:A 222 205 0.2338 0.2117 0.2293 4.10e-05 4zb9:A, 4zb9:C, 4zb9:D, 4zba:B, 4zba:C, 4zba:D, 4zbb:A, 4zbb:C, 4zbb:B, 4zbb:D
55 5zwp:A 207 165 0.1990 0.1932 0.2424 7.39e-05 5zwp:B
56 6mhc:A 244 198 0.2239 0.1844 0.2273 7.58e-05 1eem:A, 4is0:A, 3lfl:A, 3lfl:B, 3lfl:C, 6mhb:A, 6mhb:B, 6mhb:C, 6mhb:D, 6mhb:E, 6mhb:F, 6mhc:B, 6mhd:A, 6mhd:B, 6pnm:A, 6pnn:A, 6pno:A, 5ueh:A, 5v3q:A, 3vln:A, 4yqm:A, 4yqm:B, 4yqm:C, 4yqu:A, 4yqu:B, 4yqv:A, 4yqv:B, 4yqv:C, 5yvn:A, 5yvo:A
57 4f0c:A 228 170 0.2189 0.1930 0.2588 1.17e-04 5o00:A
58 3ubl:A 212 122 0.1493 0.1415 0.2459 1.45e-04 3ubl:B
59 4pnf:B 221 198 0.2438 0.2217 0.2475 2.11e-04 4pnf:A, 4pnf:C, 4pnf:D, 4pnf:E, 4pnf:F, 4pnf:G, 4pnf:H, 4yh2:A, 4yh2:B, 4yh2:C, 4yh2:D
60 8agq:A 213 215 0.2637 0.2488 0.2465 2.31e-04 5f07:A
61 3f63:A 218 198 0.2289 0.2110 0.2323 2.58e-04 3f63:B, 3f6d:A, 3f6d:B, 3g7i:B, 3g7j:A, 3g7j:B
62 5agy:A 219 194 0.2040 0.1872 0.2113 2.71e-04 5agy:B, 4chs:A, 4chs:B, 4top:A, 4top:B, 2vo4:A, 2vo4:B
63 6ezy:B 212 201 0.2537 0.2406 0.2537 2.77e-04 6f01:B, 6f05:A, 6f05:B, 6f05:C, 6f05:D, 6f05:E, 6f05:F, 6f05:G, 6f05:H, 6f05:I, 6f05:J
64 6nv6:B 207 187 0.2537 0.2464 0.2727 4.71e-04
65 4glt:A 208 153 0.1741 0.1683 0.2288 4.74e-04 4glt:B, 4glt:C, 4glt:D
66 4mk3:A 203 122 0.1542 0.1527 0.2541 5.51e-04
67 5ech:B 214 196 0.1791 0.1682 0.1837 8.99e-04 5ech:C, 5ech:E, 5ech:F, 5eci:B, 5eci:C, 5eci:E, 5eci:F, 5eck:B, 5eck:C, 5eck:E, 5eck:F, 5ecl:B, 5ecl:C, 5ecl:E, 5ecl:F, 5ecm:B, 5ecm:C, 5ecm:E, 5ecm:F, 5ecn:B, 5ecn:C, 5ecn:E, 5ecn:F, 5eco:B, 5eco:C, 5eco:E, 5eco:F, 5ecp:B, 5ecp:C, 5ecp:E, 5ecp:F, 5ecq:B, 5ecq:C, 5ecq:E, 5ecq:F, 5ecr:B, 5ecr:C, 5ecr:E, 5ecr:F, 5ecs:A, 5ecs:B
68 6srb:B 233 143 0.1592 0.1373 0.2238 0.001 6srb:A
69 5f05:C 211 185 0.2488 0.2370 0.2703 0.001 5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
70 1v2a:B 209 155 0.1990 0.1914 0.2581 0.001 1v2a:A, 1v2a:C, 1v2a:D
71 1bye:A 213 205 0.2637 0.2488 0.2585 0.001 1axd:A, 1axd:B, 1bye:B, 1bye:C, 1bye:D
72 4gsn:B 220 168 0.1990 0.1818 0.2381 0.001
73 6ep7:B 214 155 0.1642 0.1542 0.2129 0.002 6ep7:A
74 6t2t:A 229 125 0.1542 0.1354 0.2480 0.002 7dax:A, 7dax:B, 7day:A, 7day:B, 7daz:A, 7daz:B, 7db0:A, 7db0:B, 7db1:A, 7db1:B, 7db2:A, 7db2:B, 7db3:A, 7db3:B, 7db4:A, 7db4:B, 6ken:AA, 6ken:BA, 6keo:AA, 6keo:BA, 6kep:AA, 6kep:BA, 6ker:AA, 6ker:BA
75 8a0p:A 216 186 0.2040 0.1898 0.2204 0.002 8a08:A, 8a0i:A, 8a0o:A, 8a0q:A, 8a0r:A, 7zvp:A, 7zzn:A
76 4png:B 223 172 0.2139 0.1928 0.2500 0.003 4png:A
77 3vwx:C 220 197 0.2239 0.2045 0.2284 0.003 3vwx:A, 3vwx:B, 3vwx:D
78 4ri6:A 214 99 0.1443 0.1355 0.2929 0.003 4ri6:B, 4ri7:A, 4ri7:B
79 7rka:A 211 84 0.1343 0.1280 0.3214 0.004
80 4q5n:A 220 151 0.1841 0.1682 0.2450 0.006 4q5n:B
81 9f7k:A 222 188 0.2139 0.1937 0.2287 0.007 9f7k:B
82 5d9v:A 211 154 0.1741 0.1659 0.2273 0.007 5d9w:A, 5d9x:A
83 5j4u:A 218 194 0.1841 0.1697 0.1907 0.007 5j5n:A, 5j5n:B
84 1oyj:A 228 107 0.1493 0.1316 0.2804 0.014 1oyj:B, 1oyj:C, 1oyj:D
85 5ft3:B 221 158 0.1990 0.1810 0.2532 0.016 5ft3:A
86 5g5a:A 219 196 0.1990 0.1826 0.2041 0.032 5g5a:B, 5g5a:C, 5g5a:D
87 4isd:A 187 71 0.1194 0.1283 0.3380 0.032 4isd:B, 4isd:C, 4isd:D, 4isd:E
88 5f8b:A 215 136 0.1592 0.1488 0.2353 0.033 5fhi:A
89 3pr8:A 218 162 0.1940 0.1789 0.2407 0.035 3pr8:B, 3pr8:C, 3pr8:D
90 4hi7:A 220 136 0.1741 0.1591 0.2574 0.045 4hi7:B
91 3n5o:A 228 115 0.1393 0.1228 0.2435 0.053
92 3qag:A 238 76 0.1045 0.0882 0.2763 0.085 3q19:A, 3q19:B
93 3qaw:A 219 196 0.2090 0.1918 0.2143 0.088
94 5evo:A 213 80 0.0995 0.0939 0.2500 0.13
95 1fhe:A 214 143 0.1841 0.1729 0.2587 0.14
96 4ibp:A 205 27 0.0647 0.0634 0.4815 0.21 4id0:B, 4iji:A, 4iji:B, 4iji:C, 4iji:D, 4iji:E, 4iji:G
97 7aia:AAA 259 38 0.0796 0.0618 0.4211 0.25
98 2f3m:A 218 87 0.1194 0.1101 0.2759 0.28 2f3m:B, 2f3m:C, 2f3m:D, 2f3m:E, 2f3m:F, 1xw6:A, 1xw6:B, 1xw6:C, 1xw6:D, 1xwk:A, 1xwk:B, 1xwk:C, 1yj6:A, 1yj6:B, 1yj6:C
99 7p0h:A 411 124 0.1542 0.0754 0.2500 0.29 7p0h:B, 7p0h:C, 7p0h:D
100 4jbb:A 208 71 0.1244 0.1202 0.3521 0.37
101 4w66:A 236 165 0.2090 0.1780 0.2545 0.50 4w66:B
102 2wb9:A 210 128 0.1891 0.1810 0.2969 0.78 2wb9:B, 2wdu:A, 2wdu:B
103 4bvx:B 170 164 0.1791 0.2118 0.2195 1.3
104 5fwg:A 217 142 0.1542 0.1429 0.2183 1.3 5fwg:B, 3fyg:A, 3fyg:B, 2gst:A, 2gst:B, 3gst:A, 3gst:B, 4gst:A, 4gst:B, 5gst:A, 5gst:B, 6gst:A, 6gst:B, 6gsu:A, 6gsu:B, 6gsv:A, 6gsv:B, 6gsw:A, 6gsw:B, 6gsx:A, 6gsx:B, 6gsy:A, 6gsy:B, 1mtc:A, 1mtc:B
105 7y55:A 224 56 0.0597 0.0536 0.2143 2.2 7y55:B, 7y55:C, 7y55:D
106 7ebt:B 222 35 0.0746 0.0676 0.4286 2.4 7ebt:A, 7ebt:C, 7ebt:D, 7ebu:A, 7ebu:B, 7ebu:C, 7ebu:D, 7ebv:A, 7ebv:B, 7ebv:C, 7ebv:D, 7ebw:A, 7ebw:B, 7ebw:C, 7ebw:D
107 5elg:A 212 43 0.0697 0.0660 0.3256 2.7
108 1b4p:A 217 108 0.1443 0.1336 0.2685 3.1
109 3iso:A 218 142 0.1493 0.1376 0.2113 5.4 3iso:B, 4l5l:A, 4l5l:B, 4l5o:A, 4l5o:C, 4l5o:B
110 7dwe:A 212 189 0.1891 0.1792 0.2011 5.8 7dwg:A
111 5eqb:A 531 120 0.1642 0.0621 0.2750 6.7 8dl4:A, 6e8q:A, 5eab:A, 5eac:A, 5ead:A, 5eae:A, 5eaf:A, 5eaf:B, 5eag:A, 5eah:A, 5ese:A, 5esf:A, 5esg:A, 5esh:A, 5esi:A, 5esj:A, 5esk:A, 5esl:A, 5esm:A, 5esn:A, 5hs1:A, 4lxj:A, 7ry8:A, 7ry9:A, 7rya:A, 7ryb:A, 7ryx:A, 5ul0:A, 4wmz:A, 4zdy:A, 4zdz:A, 4ze0:A, 4ze1:A, 4ze2:A, 4ze3:A
112 1jzr:A 234 206 0.2239 0.1923 0.2184 6.7 1k0a:A, 1k0a:B, 1k0b:A, 1k0c:A, 1k0c:B, 1k0d:A, 1k0d:B
113 2ab6:A 217 93 0.1194 0.1106 0.2581 7.4 2ab6:B, 2ab6:C, 2ab6:D, 2c4j:A, 2c4j:B, 2c4j:C, 2c4j:D, 3gur:A, 3gur:B, 3gur:C, 3gur:D, 1hna:A, 1hnb:A, 1hnb:B, 1hnc:A, 1hnc:B, 1hnc:C, 1hnc:D, 5hwl:A, 5hwl:B, 1xw5:A, 1xw5:B, 1ykc:A, 1ykc:B
114 4jed:A 212 122 0.1642 0.1557 0.2705 7.8
115 3wd6:A 242 77 0.1045 0.0868 0.2727 7.9 3wd6:B, 3wd6:C, 3wd6:D
116 4ags:A 445 31 0.0597 0.0270 0.3871 9.6 4ags:B, 4ags:C
117 4du6:A 219 36 0.0697 0.0639 0.3889 9.9 4du6:B, 4du6:C, 4du6:D, 4du6:E

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218